Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
260 |
537.2 |
23268138 |
99.2% |
23081992 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
4,075,127 |
G→A |
R419C (CGC→TGC) |
PA14_RS18615 ← |
sensor histidine kinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 4,075,127 | 0 | G | A | 99.8%
| 2111.8
/ NA
| 492 | R419C (CGC→TGC) | PA14_RS18615 | sensor histidine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (276/215); minor base C (1/0); total (277/215) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 502 total aligned reads displayed.
CCGGACCCGCGTCGCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCGCGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCACTTCGTCGCCACGCCGCTCGACGCCGACCCGCAGCGTGCCGCCGGCGGCGGTGTGCTG > NC_008463/4074979‑4075274
|
ccGGACCCGCGTCGCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTgcacg > 1:7077068/1‑151 (MQ=255)
cGGACCCGCGTCGCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCGTCGCTGTTGCTgcacgc > 2:2120706/1‑151 (MQ=255)
cGGACCCGCGTCGCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTgcacgc > 1:1345681/1‑151 (MQ=255)
ggACCCGCGTCGCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCAcgcc < 1:10664377/151‑1 (MQ=255)
ggACCCGCGTCGCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCAcgcc < 1:4829759/151‑1 (MQ=255)
cgcgTCGCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTc < 2:5114875/151‑1 (MQ=255)
gcgTCGCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCg < 1:4178406/151‑1 (MQ=255)
gcgTCGCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCg < 2:11218845/151‑1 (MQ=255)
gTCGCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGAc < 1:2173075/151‑1 (MQ=255)
gCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCg < 2:3675994/151‑1 (MQ=255)
gCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCg < 2:7906211/151‑1 (MQ=255)
tCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGAt < 1:5136391/151‑1 (MQ=255)
gggCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGCTAGa > 2:11070096/1‑151 (MQ=255)
gggCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGa > 1:7262401/1‑151 (MQ=255)
gCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAg < 2:7384221/151‑1 (MQ=255)
gCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAg > 1:3731015/1‑151 (MQ=255)
gCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTc < 1:8195553/151‑1 (MQ=255)
gCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTc < 2:6268116/151‑1 (MQ=255)
ggTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAAc < 1:4961411/151‑1 (MQ=255)
ggTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAAc < 2:2862443/151‑1 (MQ=255)
ggTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAAc < 2:4488903/151‑1 (MQ=255)
tGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAg > 2:8695984/1‑151 (MQ=255)
gAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAgg > 1:9088386/1‑151 (MQ=255)
aaGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGt > 2:10130365/1‑151 (MQ=255)
aGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTg < 1:2599703/151‑1 (MQ=255)
aGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTg < 1:150293/151‑1 (MQ=255)
gCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGc > 2:4638408/1‑151 (MQ=255)
ccGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGATCAGGTGcc > 2:8195478/1‑151 (MQ=255)
cGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCt > 2:1189324/1‑151 (MQ=255)
aaGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGc < 1:3593330/151‑1 (MQ=255)
aaGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGc > 2:9133861/1‑151 (MQ=255)
aaGGTGGTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGc > 2:3132561/1‑151 (MQ=255)
gtgtTCCAGCCGTCCTCTCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACTATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTTCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGt < 1:2772255/151‑1 (MQ=255)
tgtTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTg > 2:5500148/1‑151 (MQ=255)
ttCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCt > 1:10077604/1‑151 (MQ=255)
tCCAGCCGTCCGCGCAGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCtc < 1:1628423/151‑1 (MQ=255)
cAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCGTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACCGGTGCCTGCGGTGCtcgt > 2:6953115/1‑151 (MQ=255)
aGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCtcgtc > 2:7793722/1‑151 (MQ=255)
ccGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCgg < 2:5721238/151‑1 (MQ=255)
cGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGc < 2:8057118/151‑1 (MQ=255)
gTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCCTGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGATCAGGTGCCTGCGGGGCTCGTCGGCg > 2:5910158/1‑151 (MQ=255)
gTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCg < 1:9220755/151‑1 (MQ=255)
tCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGa < 1:6393294/151‑1 (MQ=255)
ccGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGAt < 2:11554707/151‑1 (MQ=255)
cgcgCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATc > 1:5346432/1‑151 (MQ=255)
cgcgCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATc > 2:4941467/1‑151 (MQ=255)
cgcgCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATc > 1:11538568/1‑151 (MQ=255)
gcgcTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGAGGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCg > 2:3412227/1‑151 (MQ=255)
gcTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGc > 1:696823/1‑151 (MQ=255)
tCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGc > 1:8427077/1‑151 (MQ=255)
tCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGc > 1:9853037/1‑151 (MQ=255)
gacgaACACCGAACCGCCGGGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCg < 1:4385230/151‑1 (MQ=255)
acgaACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCgg < 2:4274176/151‑1 (MQ=255)
cgaACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCggg > 1:9385114/1‑151 (MQ=255)
gaACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCgggg > 1:8788228/1‑151 (MQ=255)
acCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGc > 2:10273214/1‑151 (MQ=255)
cGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTc < 1:9561091/151‑1 (MQ=255)
cGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTc > 1:3213525/1‑151 (MQ=255)
cGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTc > 2:1340019/1‑151 (MQ=255)
aCCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCAcc < 2:8905684/151‑1 (MQ=255)
aCCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTAGACGAGGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATCGACGCGCTCGACCAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCAcc < 1:3927132/151‑1 (MQ=255)
cgccgTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGc > 1:7803757/1‑151 (MQ=255)
gTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCAcc > 1:4496324/1‑151 (MQ=255)
cATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATCGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGc > 2:2553824/1‑151 (MQ=255)
cATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCAGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGc < 2:10612398/151‑1 (MQ=255)
aTGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCa > 2:2246581/1‑151 (MQ=255)
aTGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCa > 2:8489300/1‑151 (MQ=255)
tGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCAc > 1:1133446/1‑151 (MQ=255)
tGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCAc > 1:3367388/1‑151 (MQ=255)
gCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCACTtcgt < 1:8515392/151‑1 (MQ=255)
ccACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCACTtcgtc > 2:7470103/1‑151 (MQ=255)
ccACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCACTtcgtc > 1:8096366/1‑151 (MQ=255)
cGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCACTTCGTCGCCa > 1:9255140/1‑151 (MQ=255)
cGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCACTTCGTCGCCa > 1:657939/1‑151 (MQ=255)
cGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCACTTCGTCGCCa > 2:10867351/1‑151 (MQ=255)
gCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCACTTCGTCGCCAc > 1:5540556/1‑151 (MQ=255)
gCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCACTTCGTCGCCAc > 2:7070440/1‑151 (MQ=255)
ccTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCACTTCGTCGCCAcg > 1:6151942/1‑151 (MQ=255)
ttGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCACTTCGTCGCCAcgcc < 2:7219330/151‑1 (MQ=255)
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AGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTC < SRR18135096.5407682/151‑1 (MQ=60)
GTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCG < SRR18135096.9260663/151‑1 (MQ=60)
GTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCG > SRR18135096.2470087/1‑151 (MQ=60)
CCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGAT > SRR18135096.3394522/1‑151 (MQ=60)
CGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATC > SRR18135096.5371130/1‑151 (MQ=60)
CGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATC > SRR18135096.11587431/1‑151 (MQ=60)
CGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATC < SRR18135096.10890339/151‑1 (MQ=60)
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GTCGACGACCCCCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCACGCCGCGTCGACCCGAAAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACG < SRR18135096.5462008/151‑1 (MQ=60)
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CGCCGGACCCGCGTCGCTCGGGGCTCAGCACGGTGAAGCCGAAGGTGTTCCAGCCGTCCGCGCTGTCGACGAACACCGAACCGCCGTGCATGCTCGCCACCGCCTTGACGATGGACAGGCCGAGGCCATGGTTGGCCTCGCTGTTGCTGCGCGCCGCGTCGACCCGATAGAAGCGCTCGAACAGGTGCCTGCGGTGCTCGTCGGCGATCGGCACGCCGGGGTTGCTCACCGCCACCCGCACTTCGTCGCCACGCCGCTCGACGCCGACCCGCAGCGTGCCGCCGGCGGCGGTGTGCTGGGC > NC_008463/4074977‑4075277
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
