Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
255 |
512.9 |
22377240 |
99.2% |
22198222 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
1,271,763 |
Δ1 bp |
intergenic (+20/+69) |
PA14_RS05965 → / ← PA14_RS05970 |
YidB family protein/aldo/keto reductase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 1,271,761 | 0 | G | . | 99.6%
| 2267.6
/ 1.6
| 461 | intergenic (+18/+71) | PA14_RS05965/PA14_RS05970 | YidB family protein/aldo/keto reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base . (223/236); total (225/236) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.38e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 476 total aligned reads displayed.
GGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCGGGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGGTC > NC_008463/1271612‑1271906
|
ggAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCg < 1:5400237/150‑1 (MQ=255)
gAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCgg > 1:8525869/1‑150 (MQ=255)
aGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCgga < 1:2573074/150‑2 (MQ=255)
aGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCgg > 2:8665179/1‑150 (MQ=255)
aGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCgg > 1:2814879/1‑150 (MQ=255)
ccAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGAt > 1:3705902/1‑150 (MQ=255)
aGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAg < 1:66491/150‑1 (MQ=255)
gggCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGc < 1:7105334/150‑1 (MQ=255)
ggCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGcc < 2:7454426/150‑1 (MQ=255)
ggCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGcc < 2:9854637/150‑1 (MQ=255)
gCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcg < 2:8998270/150‑1 (MQ=255)
gCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcg < 2:3805327/150‑1 (MQ=255)
gCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcg < 2:6876518/150‑1 (MQ=255)
cGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcgc > 2:5352351/1‑150 (MQ=255)
gAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcgcg > 2:2481149/1‑150 (MQ=255)
aGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGa > 1:2716115/1‑150 (MQ=255)
cggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCACCAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATAc < 2:4739727/150‑1 (MQ=255)
cggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATAc < 2:7718629/150‑1 (MQ=255)
ggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACg > 1:3374069/1‑150 (MQ=255)
cGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGtt > 1:643053/1‑150 (MQ=255)
cGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGtg > 1:6924347/1‑149 (MQ=255)
gAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTa > 1:9711582/1‑150 (MQ=255)
aaCACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTAt > 2:2942038/1‑150 (MQ=255)
cacCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATcc > 1:3049659/1‑150 (MQ=255)
cacCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCGGCCGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGCCCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTACGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATcc < 2:9226046/150‑1 (MQ=255)
gAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTcc < 2:3026201/150‑1 (MQ=255)
gAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTcc < 1:11127834/150‑1 (MQ=255)
gcagcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCAc > 1:5143879/1‑150 (MQ=255)
ctgctgCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAAc < 1:1973033/150‑1 (MQ=255)
ctgctgCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAAc > 1:8708907/1‑150 (MQ=255)
tgctgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACg > 2:5085220/1‑150 (MQ=255)
tgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACgggg < 2:7012479/150‑1 (MQ=255)
cGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGa > 1:7367720/1‑150 (MQ=255)
cGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGa > 1:3851045/1‑150 (MQ=255)
ggAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAg > 2:2452178/1‑150 (MQ=255)
aaCTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGAGGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgc > 2:10870793/1‑150 (MQ=255)
aCTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgcc > 1:994346/1‑150 (MQ=255)
gTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCGAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCCACGGGGCGAGGCCGccc > 2:8754678/1‑150 (MQ=255)
gTCAACAAGCAGACGCCGGCCGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGccc < 2:3950374/150‑1 (MQ=255)
aacaaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCg < 2:2797540/150‑1 (MQ=255)
accaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGa < 2:1229260/147‑1 (MQ=255)
caaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGAc > 2:8325461/1‑150 (MQ=255)
cTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACAGCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGCTAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCa > 2:1665553/1‑150 (MQ=255)
aCGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggt < 1:9327430/150‑1 (MQ=255)
aCGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggt < 2:4065809/150‑1 (MQ=255)
ccGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggtcgg > 1:10119035/1‑150 (MQ=255)
gtcGGCCAGGCGCCGCTGGGCGTCCTGGACATCGGTTCGCTGCGGGCGCGCTTCAGCTCAGGTGTTCCCGGCGAGGC‑GGAGCGGATAGCCGCGAGACGGTTATCCGCTCCACGCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGGCGGTCa > 2:6342113/3‑150 (MQ=255)
aCGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCGGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCaa > 2:11113953/1‑150 (MQ=255)
aCGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCaa < 1:5884603/150‑1 (MQ=255)
cGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAAt < 1:3268401/150‑1 (MQ=255)
gCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAg > 2:950497/1‑150 (MQ=255)
cgccgcAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctg < 1:603426/150‑1 (MQ=255)
gccgcAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctgg < 2:10465887/150‑1 (MQ=255)
gcAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctggcgc < 2:5567794/150‑1 (MQ=255)
cAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctggcgct < 1:4592291/150‑1 (MQ=255)
aGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGgcgctggcgctg < 2:2605242/150‑1 (MQ=255)
aGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGgcgctggcgctg > 1:10622239/1‑150 (MQ=255)
gggCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGt > 1:669876/1‑150 (MQ=255)
gCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTcc < 1:10184404/150‑1 (MQ=255)
gCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTGCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATCCGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTcc < 2:5714476/150‑1 (MQ=255)
tGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCgg < 1:7952614/150‑1 (MQ=255)
ggACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGt < 1:7224176/150‑1 (MQ=255)
aCATCGCTTCGCTGCTGGCGCGCTTCATCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGAGAGCCGCGATACGGTTATCCTCTCCACTCAACGGGTCGAGGCCGCCCTCGACGTCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTgg < 2:7245452/150‑1 (MQ=255)
cATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGa < 2:4828854/150‑1 (MQ=255)
cGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCg < 1:2218296/150‑1 (MQ=255)
cGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTGTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCg < 1:7805732/150‑1 (MQ=255)
gTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGcc > 1:882992/1‑150 (MQ=255)
tCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTATGCTAATCCCGTCGTTGC‑GGAACGGATAGCCGCGGTACGCGAATCACCGCAACTCATCAGGTCTAGGACGCCCACGACGCCTGTAAGGTCAATGGGCGCGGGCGCTGTCGAGGGGGGGGAGCGCGTg > 2:8043368/1‑150 (MQ=255)
tCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTg > 1:8320006/1‑150 (MQ=255)
gctgctGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGtt > 1:9140318/1‑150 (MQ=255)
gctgctGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGtt < 1:8121967/150‑1 (MQ=255)
ctgctgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtc > 1:6225689/1‑150 (MQ=255)
tgGCGCGCTGCAGCTATGGCTGTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCACCGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtcgtcg < 2:8517634/150‑1 (MQ=255)
gcgcgcTTCTGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGTTACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAg > 1:3651668/1‑150 (MQ=255)
cgcgcTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGc > 2:4143552/1‑150 (MQ=255)
gcgcTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCt > 1:4990902/1‑150 (MQ=255)
gcTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTc > 1:5676255/1‑150 (MQ=255)
ttCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAg > 2:7760633/1‑150 (MQ=255)
cAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggt > 1:1672947/1‑150 (MQ=255)
aGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggtg > 1:4292102/1‑150 (MQ=255)
aGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggtg > 1:7588481/1‑150 (MQ=255)
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tAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAggtgggt < 1:10683080/150‑1 (MQ=255)
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GTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCGGGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGGTCGTCGAG > NC_008463/1271615‑1271912
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |