Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
254 |
498.2 |
21552474 |
99.3% |
21401606 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
1,271,763 |
Δ1 bp |
intergenic (+20/+69) |
PA14_RS05965 → / ← PA14_RS05970 |
YidB family protein/aldo/keto reductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 1,271,761 | 0 | G | . | 99.8%
| 2067.0
/ ‑0.5
| 420 | intergenic (+18/+71) | PA14_RS05965/PA14_RS05970 | YidB family protein/aldo/keto reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (216/202); minor base C (0/1); total (217/203) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.84e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 445 total aligned reads displayed.
CGGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCGGGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGGTCG > NC_008463/1271611‑1271907
|
cgGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCg > 1:9836635/1‑151 (MQ=255)
cgGAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCg < 2:2469506/151‑1 (MQ=255)
gTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCggagc < 1:7792184/151‑4 (MQ=255)
aGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGACCTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATgc‑ggagcgga < 2:2149737/151‑1 (MQ=255)
aGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATgc‑ggagcgga < 2:10261170/151‑1 (MQ=255)
aGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATgc‑ggagcgga < 2:3920186/151‑1 (MQ=255)
ccAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATa < 1:3074252/151‑1 (MQ=255)
cAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGTCGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGAT‑CCGGAGCGGATAg < 2:1311802/151‑1 (MQ=255)
aGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGc > 1:4044813/1‑151 (MQ=255)
aGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGc > 1:6169973/1‑151 (MQ=255)
ggCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcg < 2:2840765/151‑1 (MQ=255)
cGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCGTCAGCTAAGGTTGTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCcgcg > 2:6839719/1‑151 (MQ=255)
gAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGGTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGa > 1:571088/1‑151 (MQ=255)
ggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACgg > 1:1158805/1‑151 (MQ=255)
ggcCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTACCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACgg > 2:9742737/1‑151 (MQ=255)
ccGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGtt > 2:864388/1‑151 (MQ=255)
cGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTa > 2:1004717/1‑151 (MQ=255)
aaCACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATc < 2:7176217/151‑1 (MQ=255)
acacCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATcc < 2:6929529/151‑1 (MQ=255)
acacCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATcc < 1:10699214/151‑1 (MQ=255)
cacCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCg < 2:1043737/151‑1 (MQ=255)
cacCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCg > 1:7958673/1‑151 (MQ=255)
acCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGc > 2:5435871/1‑151 (MQ=255)
tGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGACAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTGCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTcc < 2:6150222/151‑1 (MQ=255)
agcagcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCAc > 1:5503234/1‑151 (MQ=255)
gcagcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACt > 1:5152580/1‑151 (MQ=255)
gcCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTGATCCGCTCCACTCaa < 2:4517358/151‑1 (MQ=255)
ccTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAAc > 1:8775909/1‑151 (MQ=255)
ctgctgCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACg < 1:4470848/151‑1 (MQ=255)
ctgctgCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACg < 1:6646663/151‑1 (MQ=255)
ctgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACgggg > 1:8499904/1‑151 (MQ=255)
tgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGc > 2:3813865/1‑151 (MQ=255)
tgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGc > 1:3410409/1‑151 (MQ=255)
tgcCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGc < 1:8969525/151‑1 (MQ=255)
ccGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGa < 2:3343912/151‑1 (MQ=255)
cGGAACTGGTCAACAAGCTGACGACGGACGGCCATGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGac < 1:7190617/151‑2 (MQ=255)
aaCTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgcc < 2:5089046/151‑1 (MQ=255)
aCTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGgccg > 1:3767801/1‑151 (MQ=255)
gTCACCAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCt < 2:7547828/151‑1 (MQ=255)
tCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTc < 2:3229849/151‑1 (MQ=255)
tCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTc < 2:2618980/151‑1 (MQ=255)
tCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTAGCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTc < 2:4144929/151‑1 (MQ=255)
caacaaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCg < 1:3593824/151‑1 (MQ=255)
acaaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGAc < 2:6477556/151‑1 (MQ=255)
acaaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGAc < 1:9610377/151‑1 (MQ=255)
caaGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACg < 2:1226128/151‑1 (MQ=255)
cTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAg > 1:4621221/1‑151 (MQ=255)
cTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAg < 2:1919001/151‑1 (MQ=255)
tGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAgg < 1:10050887/151‑1 (MQ=255)
aCGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggtc < 1:2626244/151‑1 (MQ=255)
ccGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggtcggt > 1:9318286/1‑151 (MQ=255)
ccGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggtcggg > 2:4195692/1‑150 (MQ=255)
ggACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCa < 2:5349644/151‑1 (MQ=255)
ggACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCa < 2:4399203/151‑1 (MQ=255)
ggACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGCTATTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGAAAGCCGCGATACTGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAggacgggcc > 2:3103845/1‑148 (MQ=255)
cGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGTCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATa > 1:8705618/1‑151 (MQ=255)
cGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATa < 1:2276276/151‑1 (MQ=255)
ggCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAg < 2:6752526/151‑1 (MQ=255)
ggCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAg > 1:9465118/1‑151 (MQ=255)
ggCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAg > 2:992232/1‑151 (MQ=255)
cAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcg < 2:7848351/151‑1 (MQ=255)
gcgcCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctg < 2:833425/151‑1 (MQ=255)
cgccgcAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctgg > 1:7622698/1‑151 (MQ=255)
cgccgcAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctgg > 2:10678646/1‑151 (MQ=255)
gccgcAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAggcgctggc > 1:10286367/1‑151 (MQ=255)
gggCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTc > 1:221837/1‑151 (MQ=255)
ggCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTcc > 2:9201184/1‑151 (MQ=255)
ggCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTcc < 1:1020005/151‑1 (MQ=255)
ggCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTcc < 1:10415455/151‑1 (MQ=255)
cGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAg < 2:9325579/151‑1 (MQ=255)
aCCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGc > 2:700124/1‑151 (MQ=255)
ccTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCg < 1:4384710/151‑1 (MQ=255)
ccTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCg < 1:6261167/151‑1 (MQ=255)
ccTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCg > 1:644380/1‑151 (MQ=255)
ggACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTg < 1:1246853/151‑1 (MQ=255)
gACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACTGCAGGTCGGTAAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTgg > 2:4944567/1‑151 (MQ=255)
aTCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCCCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATc < 1:241918/151‑1 (MQ=255)
cGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGGCGGTCAATTGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGAgcgc > 1:5285848/1‑151 (MQ=255)
ggTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGcc < 1:3909215/151‑1 (MQ=255)
ttCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTg > 1:4805843/1‑151 (MQ=255)
gctgctGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTtc < 1:906966/151‑1 (MQ=255)
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tgGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCACCGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGa < 2:8716235/151‑1 (MQ=255)
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ATGC‑GGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGGTCGT > SRR18135094.8444128/1‑151 (MQ=60)
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GAGTCAGCCAGGGCGAGGCGGCCGAACACCTGAGCAGCCTGCTGCCGGAACTGGTCAACAAGCTGACGCCGGACGGCCAGGCGCCGCAGGGCGACCTGGACATCGGTTCGCTGCTGGCGCGCTTCAGCTAAGGTTTTCCCGTCGATGCGGGAGCGGATAGCCGCGATACGGTTATCCGCTCCACTCAACGGGGCGAGGCCGCCCTCGACGGCAGGTCGGTCAATAGGCGCTGGCGCTGTCCAGGCGGTGGATCGCCTGTTCGTCGAGCTTCAGGTGGGTGGCGGCGATCAGGTCGTCGAGC > NC_008463/1271613‑1271913
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
