Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R3
|
46 |
423.2 |
7875468 |
99.1% |
7804588 |
124.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 1431 total aligned reads displayed.
CCCGTTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTT > AssemblyC74_contig_12/58913‑59210
|
cccccgcgcgcccgcgctactaccacctgagaccccccacgccctaatcctgcaataggcagcttgggatctgagatgtgtttaagagccgtCTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCC < SRR22894673.683037/59‑1 (MQ=7)
CAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGT > SRR22894673.516435/1‑150 (MQ=60)
AGCTGATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCA > SRR22894673.3538794/1‑151 (MQ=5)
GCTGATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAA > SRR22894673.3224165/1‑151 (MQ=8)
CTGATATGCTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAA > SRR22894673.1824714/1‑150 (MQ=60)
CTGATATGCTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAA > SRR22894673.3467342/1‑150 (MQ=60)
CTGATATGCTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAA > SRR22894673.4015906/1‑150 (MQ=60)
GATATGCTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACA > SRR22894673.45345/1‑150 (MQ=60)
GATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACA > SRR22894673.1131805/1‑150 (MQ=21)
GATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACA > SRR22894673.620143/1‑150 (MQ=21)
atacaCTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTC < SRR22894673.3154984/140‑1 (MQ=16)
ttgctggtggttatattctgtgtgttgcgtttttttcttattcacattgagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGAC < SRR22894673.1740160/65‑1 (MQ=60)
ACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACAC < SRR22894673.3108779/151‑1 (MQ=43)
ttcctggtgctaaaccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACAC > SRR22894673.2063176/84‑150 (MQ=60)
ctcctggtgctaaaccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACAC < SRR22894673.825910/67‑1 (MQ=60)
CTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACAC > SRR22894673.3981801/1‑150 (MQ=46)
CTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACAC > SRR22894673.3357413/1‑150 (MQ=60)
CTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACAC < SRR22894673.641392/150‑1 (MQ=60)
cctggtgctaaaccgtcaattgctagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCG > SRR22894673.1891507/82‑150 (MQ=60)
tggtgctaaaccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCT < SRR22894673.2401593/72‑1 (MQ=60)
TGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCT < SRR22894673.2430697/151‑1 (MQ=56)
gtgctaaaccgtcaattgctagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGG > SRR22894673.2783637/78‑151 (MQ=60)
gtgctaaaccgtcaattgctagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACAC > SRR22894673.2099791/78‑144 (MQ=60)
gtgctaaaccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGG > SRR22894673.3804940/78‑151 (MQ=60)
gtgctaaaccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGG > SRR22894673.2757681/78‑151 (MQ=60)
gtgctaaaccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGG > SRR22894673.3698941/78‑151 (MQ=60)
gtgctaaaccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGG > SRR22894673.1221711/78‑151 (MQ=60)
GTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGG > SRR22894673.2689049/1‑151 (MQ=60)
GTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGG > SRR22894673.2649065/1‑151 (MQ=60)
GTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGG > SRR22894673.3680558/1‑151 (MQ=60)
GTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTATGTCAACACGACACCGCCTGG > SRR22894673.2198605/1‑151 (MQ=60)
TGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACAC < SRR22894673.877986/143‑1 (MQ=60)
ctaaaccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTG < SRR22894673.3075212/76‑1 (MQ=60)
CTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGT < SRR22894673.1694436/151‑1 (MQ=60)
taaaccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTA < SRR22894673.3336364/78‑1 (MQ=60)
accgtcaattgctagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGT > SRR22894673.568007/71‑151 (MQ=60)
accgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCC‑TGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTC < SRR22894673.2867497/81‑1 (MQ=60)
ccgtcaattgctagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTC < SRR22894673.3049738/82‑1 (MQ=60)
ccgtcaattgctagttttccatcgtctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCATAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTC < SRR22894673.3209888/82‑1 (MQ=60)
ccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTC < SRR22894673.1947892/82‑1 (MQ=60)
ccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTC < SRR22894673.1925618/82‑1 (MQ=60)
ccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTC < SRR22894673.586964/82‑1 (MQ=60)
ccgtcaattgccagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTC < SRR22894673.1324358/82‑1 (MQ=60)
ccgcccagcgccagcctaccaactgctcctgtggttattcctgactgctgtacggttgaattggtatcgtgttaatgtatatgtgcttattgcacgtCTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTC < SRR22894673.1628141/54‑1 (MQ=60)
CCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTC < SRR22894673.769594/151‑1 (MQ=60)
CCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTC < SRR22894673.3406470/151‑1 (MQ=60)
CCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGT < SRR22894673.2935093/150‑1 (MQ=60)
gaataagtctcgtgggctcggtgatgtgttttagagacaggggtttgaccgtttttccttcgcggttatgttacacaaaaacatccaCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTC < SRR22894673.406104/63‑1 (MQ=60)
ctagttttccatcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTT < SRR22894673.1874153/92‑1 (MQ=60)
GTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGT > SRR22894673.507019/1‑151 (MQ=60)
catcttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTC < SRR22894673.1422539/101‑1 (MQ=60)
CATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATT > SRR22894673.1204505/1‑150 (MQ=60)
ttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACC < SRR22894673.1234261/105‑1 (MQ=60)
ttctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACC < SRR22894673.1600287/105‑1 (MQ=60)
tctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCC‑TGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCAC < SRR22894673.312802/106‑1 (MQ=60)
tctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCACCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCA < SRR22894673.3998900/106‑1 (MQ=60)
ctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCAC < SRR22894673.1177533/107‑1 (MQ=60)
ctcctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCA > SRR22894673.2611751/45‑150 (MQ=60)
CTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCAC < SRR22894673.2730233/151‑1 (MQ=60)
cctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.1079616/43‑151 (MQ=60)
cctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.1301760/43‑151 (MQ=60)
cctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.2241736/43‑151 (MQ=60)
cctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTGTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.1479058/43‑151 (MQ=60)
cctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCC‑TGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCG > SRR22894673.2448664/43‑150 (MQ=60)
cctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCC‑TGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCG > SRR22894673.2541777/43‑150 (MQ=60)
cctgtagttagaccggtttgtagcgtttctccttctcgggtcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.3240999/43‑151 (MQ=60)
cttccggcattcgtgatggtggattacgtctcgtgggctcggttttgtgtataagagacagTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATATTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGC < SRR22894673.3260270/90‑1 (MQ=60)
agttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.218778/38‑146 (MQ=60)
agttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.3960008/38‑146 (MQ=60)
agttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.2792679/38‑146 (MQ=60)
agttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCAC > SRR22894673.2156042/38‑144 (MQ=60)
agttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCAC > SRR22894673.3036073/38‑144 (MQ=60)
GGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.2986626/1‑146 (MQ=60)
GGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.2555044/1‑146 (MQ=60)
GGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG < SRR22894673.2716627/146‑1 (MQ=60)
GGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.1312921/1‑146 (MQ=60)
GGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.862781/1‑146 (MQ=60)
GGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.3649063/1‑146 (MQ=60)
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AGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCG > SRR22894673.3720417/1‑146 (MQ=60)
ttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCT < SRR22894673.1956730/115‑1 (MQ=60)
ttagaccggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCT < SRR22894673.3664541/115‑1 (MQ=60)
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accggtttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGAC < SRR22894673.373836/118‑1 (MQ=60)
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ttgtagcgtttctccttctcggttcTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCG > SRR22894673.2532114/26‑151 (MQ=60)
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CCTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCtattg > SRR22894673.231696/1‑146 (MQ=60)
CCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCtattg > SRR22894673.2594123/1‑146 (MQ=60)
CCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTAATACCCtattt > SRR22894673.3170989/1‑146 (MQ=60)
CTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTTAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGG < SRR22894673.376059/151‑1 (MQ=60)
CTTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGG < SRR22894673.1537566/151‑1 (MQ=60)
CCTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGG > SRR22894673.351694/1‑151 (MQ=60)
TTGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGG > SRR22894673.3308001/1‑150 (MQ=60)
TTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTT < SRR22894673.727350/104‑1 (MQ=60)
TTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCAT > SRR22894673.1810516/1‑131 (MQ=60)
TTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCgggacgaataataacaaaaactatcacaagcgaagtcgaagcccatacagtagctattgga > SRR22894673.329611/1‑90 (MQ=60)
TTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGG > SRR22894673.1007879/1‑150 (MQ=60)
TGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCG < SRR22894673.1246108/151‑1 (MQ=60)
TGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCG < SRR22894673.3946441/151‑1 (MQ=60)
TGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCG < SRR22894673.2227542/151‑1 (MQ=60)
TGCAGGATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCG < SRR22894673.2146911/151‑1 (MQ=60)
TGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCG < SRR22894673.3560048/151‑1 (MQ=60)
TGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCG < SRR22894673.2885809/151‑1 (MQ=60)
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GGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGG < SRR22894673.2959004/145‑1 (MQ=60)
ATTTCCCCGCTTTTGTCATCGATCTTTGTCAACTCTACACCGCCTGGTGTAAGTCTGTTTTCTTTAGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTAAATCTCGATTGTTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAG < SRR22894673.3900309/151‑1 (MQ=60)
ATTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAG < SRR22894673.963069/151‑1 (MQ=60)
CTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGCTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCAAATTCATACCCaattggcgctgtcga > SRR22894673.1387216/1‑136 (MQ=60)
TTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTT > SRR22894673.1722353/1‑151 (MQ=60)
TCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTA > SRR22894673.2459321/1‑151 (MQ=60)
TCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTT > SRR22894673.2250458/1‑151 (MQ=60)
TCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTT > SRR22894673.281054/1‑151 (MQ=60)
TCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAAC < SRR22894673.798809/105‑1 (MQ=60)
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CCCGTTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTT > AssemblyC74_contig_12/58913‑59210
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
