Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F9 I0 R1
|
131 |
136.1 |
2723430 |
98.1% |
2671684 |
229.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
827,507 |
T→G |
31.8% |
D492A (GAC→GCC) |
ybhF ← |
putative ABC transporter ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 827,507 | 0 | T | G | 31.8%
| 178.7
/ 16.2
| 98 | D492A (GAC→GCC) | ybhF | putative ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (9/53); new base G (34/2); total (43/55) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.05e-15 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGTCGTGGATCAACTGAATAAAGGCTTGCTCCATGGTGGGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGAAAAAGCGTAAATTCTGTTCGACCGTCAGGTTACCGTAGA > NC_000913/827271‑827744
|
aGTCGTGGATCAACTGAATAAAGGCTTGCTCCATGGTGGGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGGGGGGGTCa > 1:256452/1‑239 (MQ=255)
aGTCGTGGATCAACTGAATAAAGGCTTGCTCCATGGTGGGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCa > 1:425103/1‑239 (MQ=255)
aCTGAATAAAGGCTTGCTCCATGGTGGGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGGGGGGGGGAACCGCCGGAAgc > 2:1159676/1‑238 (MQ=255)
aCTGAATAAAGGCTTGCTCCATGGTGGGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATAACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCAAGGC‑GGGCGGGGGGGGCAA‑cggcggtaacg > 2:1140478/1‑234 (MQ=255)
aaGGCTTGCTCCATGGTGGGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTtcgtc < 1:1323883/239‑1 (MQ=255)
ttGCTCCATGGTGGGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGaa < 1:1256049/239‑1 (MQ=255)
tGCTCCATGGTGGGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGCGGGGGGGGGGGGGCAC‑CGCC‑GAAGTCGGGtcgggggggaa > 2:171138/1‑231 (MQ=255)
tGCTCCATGGTGGGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGGGGGGGGCCA‑AGCCGCAGGCCGGGGCGTCGAGaaa > 2:523404/1‑239 (MQ=255)
tGCTCCATGGTGGGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGAGGGGGGGAA‑CGCCGGGAGGAGGTtcgtctggaac > 1:150994/1‑233 (MQ=255)
ccATGGTGGGAGCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGa < 1:121370/239‑1 (MQ=255)
tggGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTc < 2:425103/238‑1 (MQ=255)
tggGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTc < 2:846497/238‑1 (MQ=255)
tggGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTc < 2:297417/238‑1 (MQ=255)
ggATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGAGGGGGGGAA‑CGGCGGCAGGCGGGTCGTCGAGAAAAAGAATGTACgg > 2:1187695/1‑239 (MQ=255)
tCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGGGGGGGTCAA‑AGCCGGAAGTCCGTTCGGCGGGAAACAGAATTGCCgggt > 1:1126818/1‑236 (MQ=255)
gggTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGAGGGGGTCAA‑AGCCGTGAGTAGCTTCGTCGGGAAACAGAATGTCACGTTCaa > 1:850270/1‑238 (MQ=255)
gTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATg < 2:1024164/238‑1 (MQ=255)
cTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGGGGGGGGCCA‑CACCGGAAGTCGGGTCGTTGGGAAACAGAATGGCCGGGTCAttcctaa > 1:227682/1‑233 (MQ=255)
cTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCAA‑CGCCGGAAGACGGTTCGTCGAGAAACAAGATGGACGGTTCATGCATCa > 1:1212831/1‑239 (MQ=255)
tCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCa < 1:172421/238‑1 (MQ=255)
tCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCa < 2:562774/238‑1 (MQ=255)
cGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑aa < 1:523404/239‑1 (MQ=255)
gTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCAA‑CGCCCGGAGGCGGGCTGTCGCGAAACACAAAGTCCGGGTCATTCATTAGCG‑CAc > 2:1100146/1‑239 (MQ=255)
gTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AAc > 1:1158570/1‑239 (MQ=255)
gCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGGGGGGGTCAA‑CCCCCGGAGTCGGTTTGTCTCGAACCAACATCTCCGGTTCATTCCTCAGCG‑CACAgg > 1:1332062/1‑238 (MQ=255)
gCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGGGGGGGGCAA‑CGCCGGGAGGCGGGTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑GACAgg > 1:1325426/1‑238 (MQ=255)
gCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCAA‑CGCCCGAAGTCGGTTCGTCGAGAACCAAAATGTCCGGGTCATGCATCAGCG‑ACCAgg > 2:111381/1‑238 (MQ=255)
cTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGCGGGGGGCAC‑CGCCGGACATCGGTTCGTCGTGAAACAGAAAGTCCGGGTCCTGCATCCTCG‑CACAGgccacc > 2:1178227/1‑236 (MQ=255)
cTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGAGGGGGGCAA‑CGCCGGGAGGCGGTTCGTCGGGAAAAAGAATGTCCGGGTCATGCCTCAGCG‑AACAGgcccac > 1:669398/1‑235 (MQ=255)
tgCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGGGGGGGGCAA‑CGCCGGGAGTCGGTTCGTCGAGAAAAAGAATGTCCGGGTCCTTGATCAGCG‑AACAGgccagcgcc > 2:937437/1‑238 (MQ=255)
ttCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCg < 1:1159676/239‑1 (MQ=255)
ttCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCg < 2:717362/239‑1 (MQ=255)
ttCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCg < 1:1106710/239‑1 (MQ=255)
tCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGc < 1:1178227/239‑1 (MQ=255)
aaTCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGACGGGGGGGTGCC‑AGCCCGGAGTCAGTTCCCCGGGGGACAGAGTGGCCCGTGCCCGCACCAGCC‑AACAGgccggcgcccccccccct > 2:382847/1‑230 (MQ=255)
gTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTaa < 1:96381/239‑1 (MQ=255)
gTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTaa < 1:182556/239‑1 (MQ=255)
gTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTaa < 1:107925/239‑1 (MQ=255)
gTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTaa < 1:687651/239‑1 (MQ=255)
gTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAAACGAATGTCCGGTTCATGCATCCGCC‑AACAGACCCGCGACAGCCGCAGTTTaa > 2:638328/1‑239 (MQ=255)
cGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATgg < 2:600/238‑1 (MQ=255)
cGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGGGGGGGGCAA‑CCCCCGAAGTCGGTTCGTCCAGAAAAAGAAAGTACGGGTCCTGCATCAGCG‑AGAAGGCCAGCGCCCGCCGCTGGTTAAAACCTCAttga > 2:999096/1‑236 (MQ=255)
tGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAg < 1:685094/238‑1 (MQ=255)
ccGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTg < 1:1100146/239‑1 (MQ=255)
gTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGGGGGGGGCAA‑CGCCGGAAGGCGGGTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGGTCATGCATCAGCG‑GACAAGCCAGCGCCCGCCGCTGTTTTAAAACTAATTGCCGTTCATCGGTGGC‑GGGGGAgg > 1:1008200/1‑239 (MQ=255)
tACACCAGGCCGATGCGGTCGCCATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTCGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCGAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAgg < 2:922179/238‑1 (MQ=255)
tACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAgg < 1:1187695/238‑1 (MQ=255)
gCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGGTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAAAGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACttt > 1:802350/1‑239 (MQ=255)
gCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGAGGGGGGCAA‑CGCCGGAAGTCGGGTCGTCGGGAAACAGAAATGCCGGTTCATGCATCCACG‑GAAATGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTTAAAACTAATGGACGGTCATCGGGGGG‑GTGGGGGGGGGA‑ACttt > 2:888965/1‑239 (MQ=255)
cGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGGGGGGGGCAA‑CGCCCGAAGGCGGGTCGTCGAGGAACAGAATGTCCGGGTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCCGCGCCCGCCCCTGTTTATAACCCAATTTGAGATCATCGGTGGG‑GGGGGGGGCGGT‑ACttttt > 2:402076/1‑238 (MQ=255)
aTGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCAA‑CGCCGGGAGTCGGGTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGGTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCCGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATTGCAGGTCATCGGTGGC‑GGGGGGGGCGGT‑ACtttttcg > 1:1125950/1‑236 (MQ=255)
aTGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGGGGGGGTGCA‑CCCCGGGAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAAAGTGCGGTTCATACCACACCG‑AAAAGGCCCGCGCCCGCCGCCGTTTTATACACAATCGCACGTCATCCGGGGC‑gggtggggaggtagtgttctc > 2:1033893/1‑219 (MQ=255)
aTGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGGGGGGGGCAA‑CGCCGGAAGGCGGTTCGTCGAGAAAAAGAATGTCCGGGTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTTAAAACTAAAGGCAGTTTATCGGTGGC‑GGGGGAGGCGAT‑ACtttttcg > 1:1012948/1‑236 (MQ=255)
gCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGAGGGGGGCAA‑AGCCCGAAGTCGGGTTGTCGAGAAAAAGAATGTCCCGGTCATGGATCAGCG‑AACAGGCGCGCGCCAGCCGCCGTTTAAAACATAATAGCAGGTCATCGGGCGC‑GCGGGGGGGGGG‑ACATTTCAgg > 2:373633/1‑238 (MQ=255)
gTCGCAATATTCCGCTTCACCCATAAAGTGGGTGGGGACCATCACCGTGACGCCTTTCGCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCg < 2:992822/238‑1 (MQ=255)
cGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGaa < 1:236400/238‑1 (MQ=255)
aaTATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAg < 1:507803/196‑1 (MQ=255)
atatTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCt < 1:1033893/239‑1 (MQ=255)
cATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGTGGGGGGCCA‑CGACGGAAGGAGGGTCGTCGAGGAACAGAATGGTCGGGTCATGCCGCAGCG‑AACAGGCCAGCCGCCGCCGCTGCTTAAAACCGCATTGCACTTTCTGGGGGGCGGGGGGGGGCGGT‑‑CTTTTCAAGGCGCACGCGTCGCGCGTGC‑gg > 2:762919/1‑239 (MQ=255)
cATCCAGAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑gg < 1:946012/239‑1 (MQ=255)
tCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGGGGGGGGCCA‑CGCCGGAAGTCGGTTTGTCCAGCAACAGGAAGTCGCGCTCATGCCCCAGCG‑AACAGGGCAACGCCAGCCACCCTTTTACACCCAATAGCTGTGCCACGGTGGC‑GGGGGAGGCGATAACTTTTC‑GGCCGAAAGCCTCGCCCCTTC‑gggg > 2:1076434/1‑238 (MQ=255)
ggtggtGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCCA‑CACCCGGAGATGGTTCGGCGTGAAAAAGAAAGTTCGGTTTATTGATCAGCG‑AACAAGCCCCGGCCAGACGCCGTTTATAACCTAATGGCAGTTCACCGGTGGG‑AGGGGCGGGGCG‑AGTTTTTGAGGCGCACGCCGCGCTCGTGC‑GGGGGA‑GATTTTTGt > 2:191628/1‑239 (MQ=255)
ggtggtGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGGGGGGGTCAA‑AGCCGGAAGTCGGGTCGTCGGGAAACAGAATGGTCGGGTCATGCATCAGCG‑AAAAGGCCGCCGCCCCCCGCTGGTTTAAACCTAATGTCAGTTTTTCGGGGGG‑GGGGGGGGCGGG‑ATTTTTTAGGCCCAAAGCCCCGCTCaccggggggggttttttgt > 2:745613/1‑221 (MQ=255)
aCCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCAA‑CGCCGGAAGTCGGGTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGGTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGGTTATCGGTGGC‑GTGGGGGGCGAT‑ACTTTTTAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑g‑cg > 1:1113921/1‑238 (MQ=255)
aTCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCg < 1:638328/239‑1 (MQ=255)
tCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGa < 1:385330/239‑1 (MQ=255)
ggACGCCTTCCTCTACCGTGTTGTTGATGTGCAGCAAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGt < 1:1254630/238‑1 (MQ=255)
gtcGCCTTTCGCTCCCAGGCTGTAGATGGGGAGCCAAAAGTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCGA‑CGCCGGAAGTCGGGTCGTCGAGAAACAGAAAGGCCGCTTCAGGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTGTAAAACCTAAGGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑TGGAGA‑GTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCTCGt < 2:328404/236‑1 (MQ=255)
gACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGt < 1:111381/238‑1 (MQ=255)
gACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGt < 2:256452/238‑1 (MQ=255)
gACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGt < 1:1140890/238‑1 (MQ=255)
gACGCCTTTCGCTTCCATGCCGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAACGTCCGGTTCATGCAGCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGATGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCTACCGCGt < 2:363223/238‑1 (MQ=255)
cGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAg < 1:999096/239‑1 (MQ=255)
cGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAg < 1:1140478/239‑1 (MQ=255)
gCCTTTCTCTACCATGCTGGTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAg < 2:58620/238‑1 (MQ=255)
cTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGcc < 1:171138/238‑1 (MQ=255)
ttCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATGCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATa < 2:53665/239‑1 (MQ=255)
ttCACTACCATGCTGTTGACGTGCATCCAAAATTCGCGGC‑GGGTGAGGGGGGCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAACCCGAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCCCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATa < 2:272700/239‑1 (MQ=255)
ctctACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATaca < 1:882090/239‑1 (MQ=255)
cATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGGGGGGGGGGCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAAAAGAATGTCCGGGTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTTAAAACTAATGGCAGTTTATCGGTGGG‑GGGGGGGGGGAG‑ACTTTTTAAGCCGCAAGCCCCGCTCATGC‑GGGGGA‑TTTTTTCGTTTT‑G‑CGCCCGGCCGCGTGAGCCCTACACACCaa > 2:170642/1‑238 (MQ=255)
tGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGATGTGGGGGGCAA‑AGTCGGGAGGCGGGTCGTAGAGAAACAGAATGTGCGGTTCATGAATTATCGAAACAGGCAGGGGCCCG‑CGCACTTTAACACCCAAATGCAGGTTAACGGGTGC‑GGGGGGGACGGT‑CCTTTTTCAGCCGACCGCCCCGCCCCTGCGGGGGGG‑TTTTTTGTTTCT‑C‑CCCCCG‑CCGCGCTAGCGATacacacacgac > 2:199390/1‑234 (MQ=255)
gCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCAt < 1:330546/90‑1 (MQ=255)
cTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCCA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAAAAACAAAAAGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGGCCCCGCCAGCCCCCGTTTTAAACCTAATGGCCGTTCATCGGCGGG‑GTGGGGGGCGGT‑ACTTTTCATGCCGAAAGCCACGCTCCTGT‑GGGGGA‑TTTTTTATGTTT‑C‑CGCCCGACCGCGTAAGCCCTACAACCCCGAGaa > 2:810424/1‑239 (MQ=255)
cTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCAA‑CGCCGGGAGTCGGGTCCTCGAGAAAAAGAATGTCCGGGTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCACCGCCCGACGCCGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCCGGGGC‑GGGGGAGGGGGT‑AATTTTCTGGGCCGACGCCCCCCTCCTGC‑GGGGGA‑ATTTTTCGTTTT‑GTCTCCGGACC‑CGCTCGACATACACACCagagga > 2:1148645/1‑237 (MQ=255)
tGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAg < 1:27191/221‑1 (MQ=255)
gTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCAAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGaaaa < 1:593272/239‑1 (MQ=255)
gATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGGAA‑CCCCGGAAGTCGGGTCCGCGAGAAACAGAAAGTCCGGGTCACGCATCAACG‑GACAAGCCCGCGGCCGACGCTGTTTTAAAACCAAAGGGAGTTCATCGGGGGG‑GGGGGAGGGGAG‑ACTTTTTCGGCCGCAAGCCCCCCTCCTGC‑GGGGGA‑TTCTTTCGTTCTCG‑CGCCC‑CGCGCGTCAGCCACTCACACCAGTGaaaaaa > 2:1287407/1‑237 (MQ=255)
gtgCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCAA‑CGCCGGAAGGCGGGTCGTCGAGAAAAAGAATGTCCGGTTCATGCCTCAGCG‑AACAAGCCCGCGCCCGCCGCTGTTTAAAACCAAATGGGCGGTCCTCGGGGGC‑GCGGGGGGGGAG‑TCTTTTCAGGCCGAACGCCCCGCCCATGC‑GGGGGATTTTTTTTGTTTT‑G‑C‑CCCCACCCCCGAAGCCATACACACCACGGaaaaacagga > 2:1229073/1‑234 (MQ=255)
aaggacaaaTTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTAAA‑CGCCGGAAGTCGGAGCGACGAGAAACAGAATGTCCGGTTCAGGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTACT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGAAAAAGCGTaaa < 2:574449/232‑1 (MQ=255)
gCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGGCCA‑CGCCGGAAGTCGGGTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGGTCATGCATCAGCG‑GACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGGTCATCGGGGGC‑GTGGGGGGGGCT‑ACTTTTCAGGCCGAACCCCTCCCTCCTGC‑GGGGGG‑TTTTTTTTTTCT‑G‑CGCCCGCCCCCGTAAACCCACCACACCCGAGAAAAAAAGGAAAttt > 2:1202289/1‑238 (MQ=255)
aaaTTCACGGC‑GGGTGAGGGTCTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGAAAAAGCGTAAATTCTGtt < 1:463273/239‑1 (MQ=255)
aaaTTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGAAAAAGCGTAAATTCTGtt < 1:888965/239‑1 (MQ=255)
aaaTTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGACGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGAAAAAGCGTAAATTCTGtt < 1:946121/239‑1 (MQ=255)
aTTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGAAAAAGCGTAAATTCTGTTCg < 1:417437/239‑1 (MQ=255)
cggc‑ggGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGAAAAAGCGTAAATTCTGTTCGACCGt < 2:1325426/239‑1 (MQ=255)
cggc‑ggGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GGGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGAAAAAGCGTAAATTCTGTTCGACCGt < 2:227682/239‑1 (MQ=255)
c‑ggGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGAAAAAGCGTAAATTCTGTTCGACCGTCa < 1:937437/238‑1 (MQ=255)
gggtggggggTCAA‑CGCCGGAAGTCGGGTCGTCGAGAAACAGAATGGCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGAAAAAGCGTAAATTCTGTTCGACCGTCAgg < 2:1308590/233‑1 (MQ=255)
tCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGAAAAAGCGTAAATTCTGTTCGACCGTCAGGTTACCGTaga > 1:1189384/1‑238 (MQ=255)
|
AGTCGTGGATCAACTGAATAAAGGCTTGCTCCATGGTGGGATCGGGTTGCTCATCGTTAGCCGACTGTGCTTTCAAATCGTCCGGCGTGCCGCTGGCGATTAATTTCCCGCGGTACACCAGGCCGATGCGGTCGCAATATTCCGCTTCATCCATAAAGTGGGTGGTGACCATCACCGTGACGCCTTTCTCTACCATGCTGTTGATGTGCAGCCAAAATTCACGGC‑GGGTGAGGGGGTCAA‑CGCCGGAAGTCGGTTCGTCGAGAAACAGAATGTCCGGTTCATGCATCAGCG‑AACAGGCCAGCGCCAGCCGCTGTTTAAAACCTAATGGCAGTTCATCGGTGGC‑GTGGGAGGCGAT‑ACTTTTCAGGCCGAACGCCTCGCTCATGC‑GGGAGA‑TTTTTTCGTTCT‑G‑CGCCCGACCGCGTAAGCCATACACACCAGAGAAAAAGCGTAAATTCTGTTCGACCGTCAGGTTACCGTAGA > NC_000913/827271‑827744
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
