Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F9 I0 R1
|
131 |
136.1 |
2723430 |
98.1% |
2671684 |
229.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,536,214 |
G→A |
16.3% |
intergenic (+182/+401) |
yjhR → / ← nanS |
pseudogene, helicase family, putative frameshift suppressor/9‑O‑acetyl N‑acetylneuraminic acid esterase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,536,214 | 0 | G | A | 16.3%
| 164.1
/ 3.9
| 71 | intergenic (+182/+401) | yjhR/nanS | pseudogene, helicase family, putative frameshift suppressor/9‑O‑acetyl N‑acetylneuraminic acid esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (12/45); new base A (10/2); total (24/47) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.31e-05 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTAAAAAATGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAATAA > NC_000913/4535979‑4536448
|
gTAAAAAATGAAATAAAGTCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgca < 1:26337/238‑1 (MQ=255)
aaaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgcaa‑gca < 1:1069433/239‑1 (MQ=255)
aaaaTGAAATGAAGGCAATAAATGGGAGTCTGGAGCAACGGCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTGACCAATGTTAAGTCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCACCTTTCCTGATTATAAATCTTACTGTTTTCCTAATCATTTTGCTTTACATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TGTTAGGACTG‑AAAGAAAATgcaa‑acaa < 2:1274836/239‑1 (MQ=255)
aaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgcaa‑gcaa < 1:630128/239‑1 (MQ=255)
aaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgcaa‑gcaa < 2:469431/239‑1 (MQ=255)
aaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgcaa‑gcaa < 1:1146796/239‑1 (MQ=255)
aaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgcaa‑gcaa < 1:952703/239‑1 (MQ=255)
aaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTGACTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCaat < 2:256208/239‑1 (MQ=255)
gAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAataata < 2:639793/239‑1 (MQ=255)
aaaTGCAATATAGGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTTATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGTCTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAAtaatataata < 1:3960/239‑1 (MQ=255)
gCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgcaa‑gcaa < 1:1224707/225‑1 (MQ=255)
gCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgcaa‑gcaa < 1:1270000/225‑1 (MQ=255)
aaTATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgcaa‑gcaa < 1:252653/223‑1 (MQ=255)
tatatGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgca < 1:278039/216‑1 (MQ=255)
tatGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgcaa‑gcaa < 1:1252782/219‑1 (MQ=255)
tatGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAAtaatataata < 1:377107/229‑1 (MQ=255)
ggTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GT‑TTTTTTGTTTT‑GTAGCAAATATAT‑GCAAAAATATaataatcgggttatttt > 2:466653/1‑228 (MQ=255)
gTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGGG‑TTTTTGGATTT‑AAAAAAAATG‑AA‑ACAAAAAAAaaataaaattttctttatt > 2:1224707/1‑226 (MQ=255)
gTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GG‑TTTTTGTTATT‑AAAGAAAAAGAAA‑GCAATAAAAtaataaatgtttcttttaa > 2:1270000/1‑226 (MQ=255)
gTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTTGTTATG‑TAAGAAAATGCAA‑ACAATAATATaataattgtctttttttt > 1:537540/1‑227 (MQ=255)
aGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GC‑GTTTTGGTCTG‑AAAGAAAATAGAA‑GCAAaaaaataaaaattgttttttatgacc > 2:252653/1‑225 (MQ=255)
tCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGTG‑GC‑TTTTTGGTATG‑TAAAAAAATACAA‑GAAATAATATAATAATAGCCTAATtttttttt > 2:191298/1‑237 (MQ=255)
tCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GG‑TTTTTTGTATT‑ACATAAAATGCAATCCATTAATAAAAAAATGCACTATTTTCttta > 2:291815/1‑238 (MQ=255)
tCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTTTTAATG‑AAAGAAAAAAGAA‑GCAataatatttgtctctttttcacatatgta > 2:278039/1‑217 (MQ=255)
cTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑aa < 2:64510/239‑1 (MQ=255)
cTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑aa < 1:1284914/239‑1 (MQ=255)
cTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑aa < 2:1030807/239‑1 (MQ=255)
cTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑aa < 1:971343/239‑1 (MQ=255)
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cTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCACTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑aa < 1:377101/239‑1 (MQ=255)
cTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGGTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑aa < 2:79736/239‑1 (MQ=255)
cTGGATCAACGGCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTCTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑aa < 2:980212/239‑1 (MQ=255)
tGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GT‑TTTTTTTTATT‑TAAGAAAAATCAA‑GCAATAAATTAATAAAGTGCTAATtttttttctt > 2:377107/1‑235 (MQ=255)
tGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GCGTTTTTGGATTG‑‑AAGAAAATACAA‑ACAAAAAAAtaaaaaatttttcttttatacata > 2:1252782/1‑220 (MQ=255)
tGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTTTTGTTGTAAAAAAAATG‑AA‑GAAATAATATAATAAATGACTAATttttttttaa > 2:882913/1‑235 (MQ=255)
tGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTTTGAATG‑AAAGAAAAAGCAA‑AACATAATATAAATATTGCCTAATtttttttata > 2:377101/1‑235 (MQ=255)
tGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑aa < 2:1236499/238‑1 (MQ=255)
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aCGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTa < 1:291815/239‑1 (MQ=255)
cAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCa < 1:466653/239‑1 (MQ=255)
tgtgATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATatcatcatc < 1:993977/239‑1 (MQ=255)
ttCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GT‑TTTTTTGTATG‑AAAAAAAAAAAAACACAAAAAAAAAAAAATAG‑CTTATTTTTTTG‑TAAATCATTAAACATATAATCATCGACTtttttttc > 2:14928/1‑235 (MQ=255)
aCAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGt < 1:882913/239‑1 (MQ=255)
aaaGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTtata < 1:720842/237‑1 (MQ=255)
aaGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTTTGAATT‑AAAAAAAAAACAA‑ACAATAAAATAAAAATAGCCTAATTTTTTTT‑CACATAATTAAACATAAAATCATCGTCTATTTTCCAGAATCTCTCGACATTTAAt > 2:684727/1‑238 (MQ=255)
ggCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTc < 1:397727/225‑1 (MQ=255)
ggCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GG‑TTTTTTTGATG‑TAAGAAAAAACAA‑ACAATAATATTAAAATGGCCGTATTTTTTTT‑ATAATCATTTAAACTAACATCATATTCTATTTTCTATAATCAGTCGACTTTTAAtacc > 2:700906/1‑235 (MQ=255)
ggCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GCTTTTTTGGATTG‑AAA‑AAAAAACAA‑GCAATAATATAAAAAAATGCATATTTTTTTT‑AACAACATTAATAAAATAATATTCATCAATTTTTCAGAAACCGTCGGCtttaatatcc > 2:987877/1‑230 (MQ=255)
cATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GG‑TTTTTGGGATT‑GAAGAAAAAGTAA‑GGCATAATATAAAAAAGGCCCAATTTTTTTT‑TAAATCATTAAACATATAATCCTTTTCTATTTTCCACAATCCGTCCACTTATAAttaccca > 2:565185/1‑233 (MQ=255)
cATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GG‑TTTTTTGAATG‑AAAAAAAATGAAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTTTTTT‑TAAAACATTAAGAATATCATCATCGTCTTTTTTTCAGAATCCGTCGACTTATaaaagacag > 1:1088230/1‑232 (MQ=255)
atatTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAg < 1:684727/238‑1 (MQ=255)
tAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGa < 1:1314110/238‑1 (MQ=255)
tAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGa < 1:1209704/238‑1 (MQ=255)
aCTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTTGGAATG‑AAAGAAAATGCTA‑GAAATAAAATAATAATAGGCGAATTTTTTTG‑GAAATCATTAAAAATATAATAAACGTCTATTTTTCAGAAACCGTCGACTTATTATTGCCAGAACACAATATCAGGACgtggcg > 1:1028264/1‑233 (MQ=255)
tttCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCg < 2:1065766/239‑1 (MQ=255)
tttATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCt < 1:14928/238‑1 (MQ=255)
tttATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCt < 1:82167/238‑1 (MQ=255)
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cGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACg < 1:80727/239‑1 (MQ=255)
cGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACg < 1:1285743/239‑1 (MQ=255)
ttCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCa < 1:472205/239‑1 (MQ=255)
gATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:1075502/239‑1 (MQ=255)
gATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:322089/239‑1 (MQ=255)
gATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:565185/239‑1 (MQ=255)
tataAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:794419/236‑1 (MQ=255)
aaTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTa < 1:538077/239‑1 (MQ=255)
tCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgcaa‑gcaa < 1:650997/88‑1 (MQ=255)
tCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgca < 1:722087/83‑1 (MQ=255)
cTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATgcaa‑gc < 1:620320/85‑1 (MQ=255)
tATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GC‑TTTTTTGAATT‑AAAAAAAAATAAA‑GCAATAAAAAAATAAAGACCTTATTTTTTTT‑TACAACATTAAGCATATAAATATCCTCTTTTTTTCAGAATCCCTCGACATATAATTCCCACAACGGCCTATTAGGAAGGGGTCTCGAA‑CGCTGGTGCCCAAAAAGTTCCCGCAAACCGTGTAGgtgt > 2:770888/1‑239 (MQ=255)
aTTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑TG‑TTTTTGGGATT‑AAAGAAAAAGAAA‑GAAATAAAAATATAATGGGATAATTTTTTTG‑GAAAACATTAAAAAAATAATCATCGTCTATTTTCCAGAATACGACGAATTATTATCGCCAGGAAAGCATATTAGGAGGGGGCTGCGAACCGCT‑TGGCCCCAAAAGAACCAGGAAAAAGTTGAGATGt > 1:197966/1‑238 (MQ=255)
aTTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTTGGAATG‑AAAAAAAAAACAA‑GCAAAAATATAAAAAAAGCCTAATTTTTTTT‑AAAATCATTAAGCATATCATCATTGGCTATTTTCCAGAATCCGTCGACTTTTAATATCCAGAACGGCATATCTAGAAGGGGCTTCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACATTTCAGAAAACATTGTAGATGtt > 1:1026374/1‑239 (MQ=255)
cTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAAt < 1:203622/130‑1 (MQ=255)
tGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGG‑GG‑TTTTTGGAATG‑GAAGAAAATGCAA‑GCAATAAAATAATAAAGGGCTAATTTTTTTT‑TAAATCATTAAAAAAAACATAATCGTCTTTTTTTCCAAATACGTCCACTTATAATCTCCCAAACCGCACATTAGGAAGGGGTTGCGGA‑AGCTGTGGCCCACAAACATCCACTAAAACTTGTAGGTGTTCGTAGGTTTCCGGGcccaaaacga > 2:604503/1‑231 (MQ=255)
aTAATGCGCTGGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAAAAAATGCAA‑GCAAAAATATAAGAATGGCCTAATTGCTTTG‑AACATCATTAAGCATATAATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATAAGGACGGTGCGGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGaaa < 1:210882/238‑1 (MQ=255)
tgggcCAGGAATAAATGGCGGGT‑GC‑TTGTAGAAATG‑AAAAAAAATGAAA‑GCAAAAATATAATAATGGCTTAATTTCTTTA‑AAAAACATAAAACATATCATCATCGTCTATTTGCCAAAATCCGTCGACTTAAAATCGCCAGAACGAAATACAAGGAGGGTGCTGCAAA‑CGCTGTGGCCAAAAAGGTTCCAGTAAACTGTGTAGAGGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGgcg < 2:1183074/236‑1 (MQ=255)
cTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGAt < 1:277243/239‑1 (MQ=255)
tGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAACCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTCCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATg < 1:700906/239‑1 (MQ=255)
ggggATAAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAAAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATg < 1:987877/238‑1 (MQ=255)
gATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:710665/186‑1 (MQ=255)
gggT‑GC‑TTTGAGGAATA‑AAAGAAAATACAA‑GAAAAAATATAAAAATGGCCTAATTTCCTGG‑AATATAATTAAGCATAGCATCACCGTCATTTTGCCAGAACCCGTCGACTTATAAGCGCGAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCGATAAAACTGTGTGGATGTTCGTGGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCa < 2:1203606/238‑1 (MQ=255)
c‑TTTTTGGAATG‑AAAGAAAAAGCAA‑ACAAAAATATAAAAAAGGCCTAATTTTTTTT‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCCTCGACTTATAATAGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGGA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAAATGTGTAGATGTTTGTAGATTTCCGAGCCATAATCCAAAAGGCGCGGGTGTCTATTAAGGCATcccg > 2:708034/1‑236 (MQ=255)
tttaAGGAATG‑AAAAAAAATACAA‑ACATAAATAGAATAA‑GGGCTAATTTTTTTGTAACACCTTAAAGCAATACATCACGTTCGTTTTACCATAATTCGTCTATTTATAAGCGCAAAAACGGCATACCAGGTCGGGGCTGCAAA‑CGCTGTGCCCCAAAACTTTCAGGTAAACTGTGTAGATGTCGGTAGATTCCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCt < 2:7096/239‑1 (MQ=255)
aaaTGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAGCGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAAt < 1:764276/237‑1 (MQ=255)
aaaTGCAA‑GCAATAAAATAATATGGGCCTATTTTCTTTG‑ACCATCATTAAGCATATCATCATCGTTTATTTGCAAGATCCCGTCGACTTATAATCGCAAGAACGGCATACCAGGCCGGTGCTACGAG‑CGCTGGGGCACAAACCGTGCCATAAAACTGTGTATATGTTCTTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAATaa < 2:197966/239‑1 (MQ=255)
aaaTGCAA‑GAAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTA‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAAt < 1:124493/237‑1 (MQ=255)
|
GTAAAAAATGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGT‑GC‑TTTTAGGAATG‑AAAGAAAATGCAA‑GCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTG‑AACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAA‑CGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAATAA > NC_000913/4535979‑4536448
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
