Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
283 |
58.3 |
1819865 |
98.8% |
1798026 |
150.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,212,088 |
(C)8→9 |
intergenic (‑85/+615) |
iraM ← / ← ycgX |
RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor/DUF1398 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,212,080 | 1 | . | C | 88.9%
| 223.9
/ 19.0
| 72 | intergenic (‑77/+623) | iraM/ycgX | RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor/DUF1398 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/5); new base C (31/33); total (34/38) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.14e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTAT > NC_000913/1211932‑1212224
|
atTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑c‑c < 2:860720/151‑1 (MQ=255)
tACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑c‑cc < 1:575893/150‑1 (MQ=255)
aCCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑c‑cccc > 1:674088/1‑151 (MQ=255)
aCCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑c‑ccc < 1:241754/150‑1 (MQ=255)
ccccATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGGATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑c‑ccccc > 2:530792/1‑151 (MQ=255)
cccATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑c‑ccccc‑c > 1:710687/1‑151 (MQ=255)
atatGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑c‑ccccc‑ccct < 1:712316/151‑3 (MQ=255)
atatGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑c‑ccccc‑ccct < 2:693062/151‑3 (MQ=255)
atGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑c‑ccccc‑ccctca < 1:468907/151‑5 (MQ=255)
atGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑c‑ccccc‑ccctc < 1:578500/150‑4 (MQ=255)
gAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCaaaaa < 2:881789/149‑1 (MQ=255)
gAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCaaaaa < 2:674040/149‑1 (MQ=255)
aaaaaGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAaaat > 2:903432/1‑151 (MQ=255)
aaaaaGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAaaat < 1:261066/151‑1 (MQ=255)
aaaaaGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAaaata < 1:400958/151‑1 (MQ=255)
tataCCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAaatta > 1:608968/1‑150 (MQ=255)
tataCCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAaatta > 1:424590/1‑150 (MQ=255)
aCCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAattaatta < 2:296043/151‑1 (MQ=255)
cacaTGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTCC‑‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTaaa < 1:895021/151‑1 (MQ=255)
cacaTGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTaaa < 1:278318/151‑1 (MQ=255)
acttGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTCTATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑ACATAAAAATAAattattta > 2:577325/4‑148 (MQ=255)
acaTGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTaaa > 2:144946/1‑150 (MQ=255)
caTGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAat < 2:763047/151‑1 (MQ=255)
aTGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGATATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTAGCACATGAGTATATT‑A‑‑CGCCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAatg < 2:773475/151‑1 (MQ=255)
gTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAatga > 2:42204/1‑150 (MQ=255)
gTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAatga < 1:770725/150‑1 (MQ=255)
ggTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGc > 1:338153/1‑151 (MQ=255)
gTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCt < 1:606861/151‑1 (MQ=255)
gTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCt > 2:580968/1‑151 (MQ=255)
tGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTtat > 1:682772/1‑151 (MQ=255)
aaTTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTtat < 1:458422/150‑1 (MQ=255)
aaTTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTtat > 2:838579/1‑150 (MQ=255)
aCCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATataa > 1:604869/1‑150 (MQ=255)
aCCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATataa < 2:24383/150‑1 (MQ=255)
cGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATataaaat < 1:42016/151‑1 (MQ=255)
gtCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATataaaataa < 1:806802/150‑1 (MQ=255)
tACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTa > 2:17217/1‑150 (MQ=255)
aCTATCCTCTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATTGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑C‑CCCCCACC‑TAAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTa < 2:124318/149‑1 (MQ=255)
tATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGAATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGAATATT‑A‑‑C‑CCCCC‑CCACCAAAAAAATAAATTAATTAAATTGATGGCTTATATAAattaaaattaaa > 2:455193/1‑148 (MQ=255)
aTCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGc > 2:152300/1‑150 (MQ=255)
tCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAg < 1:588343/148‑1 (MQ=255)
cACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAgg > 1:322183/1‑151 (MQ=255)
cTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGa > 1:283267/1‑150 (MQ=255)
tCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAAt < 2:338127/150‑1 (MQ=255)
tCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAAt < 1:743064/150‑1 (MQ=255)
tCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑C‑CCCCC‑CC‑TTAAAAAAATTAATTTATTTAAATTAAGGGTTTAATTAAATTAAAATTAAAACAAAGaa > 2:774369/1‑148 (MQ=255)
aTTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAAtctc > 2:678502/1‑151 (MQ=255)
tATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATgg < 1:888773/150‑1 (MQ=255)
tGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATg > 1:854373/1‑151 (MQ=255)
tCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGtt > 2:27781/1‑151 (MQ=255)
tATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTaa < 1:728045/150‑1 (MQ=255)
aTCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAAc > 1:599534/1‑151 (MQ=255)
cccACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACa > 2:799569/1‑150 (MQ=255)
cGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑CACCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAAt < 2:594938/150‑1 (MQ=255)
ggTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATga < 1:52335/151‑1 (MQ=255)
aTTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑ACCC‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAAAAAATTAATTAAAATAATGGTTTATATAAAATAAAATTTAAAGAAAGAAATTTCAATGGATGTTAAACaaa > 1:140160/1‑145 (MQ=255)
ttAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGAttt > 1:875470/1‑151 (MQ=255)
aaTATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGAtttt < 1:384458/150‑1 (MQ=255)
aaTATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTtg < 2:136916/151‑1 (MQ=255)
atGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTtgtg > 2:390519/1‑150 (MQ=255)
atGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTtgtg > 1:271615/1‑150 (MQ=255)
tGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGa < 2:710638/150‑1 (MQ=255)
cATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCaa < 1:114454/151‑1 (MQ=255)
ttAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAAt > 2:889780/1‑150 (MQ=255)
ttAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAAt > 1:20320/1‑150 (MQ=255)
ggATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAat < 1:120824/151‑1 (MQ=255)
aTGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAatta < 2:719053/151‑1 (MQ=255)
aTGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAatt > 2:332501/1‑150 (MQ=255)
gTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAattatt < 2:334393/151‑1 (MQ=255)
tttATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAattatt < 2:734546/150‑1 (MQ=255)
ttATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTg > 2:665508/1‑150 (MQ=255)
ttATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTg > 1:292954/1‑150 (MQ=255)
tATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGAc > 1:888457/1‑151 (MQ=255)
ttCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACtt < 2:376243/150‑1 (MQ=255)
ttCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACtt < 2:599485/150‑1 (MQ=255)
tGCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGAt < 1:669393/150‑1 (MQ=255)
gCATATGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑CCAAAAAAATAAATTTATTAAAAAGATTGCTTATATTAAAAAAAATTTTAAGCCAAGGATCTCCATTGGTGTTAAAAAAAATTAGATTTTTGGAAAACAAAAAATTATTTGCTTTGTTTTTGGttt > 1:670756/1‑151 (MQ=255)
atatGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGt < 1:721982/151‑1 (MQ=255)
atGAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGtt < 1:32104/150‑1 (MQ=255)
gAGTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAg < 1:418093/151‑1 (MQ=255)
gTATATT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCt < 1:343490/151‑1 (MQ=255)
tatT‑AC‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCtat > 2:615193/1‑150 (MQ=255)
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ATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATT‑A‑‑C‑CCCCC‑CC‑TCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTAT > NC_000913/1211932‑1212224
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
