Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I1 R1
|
300 |
54.7 |
1718999 |
98.4% |
1691495 |
149.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,212,088 |
(C)8→9 |
intergenic (‑85/+615) |
iraM ← / ← ycgX |
RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor/DUF1398 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,212,080 | 1 | . | C | 89.4%
| 193.9
/ 17.7
| 66 | intergenic (‑77/+623) | iraM/ycgX | RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor/DUF1398 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/7); new base C (22/37); total (22/44) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.56e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 |
ATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTAT > NC_000913/1211930‑1212224
|
atatTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTa < 1:529301/151‑1 (MQ=255)
tACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑cc‑c‑c > 1:542580/1‑151 (MQ=255)
cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑cc‑c‑c‑c‑ccc > 2:604707/1‑150 (MQ=255)
atatGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATAAGTATATTA‑‑cc‑c‑c‑c‑cccct < 2:447410/151‑3 (MQ=255)
tGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑cc‑c‑c‑c‑cccctca < 1:333273/150‑5 (MQ=255)
ggCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCaaa < 2:484600/151‑1 (MQ=255)
ggCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑cc‑c‑c‑c‑cccctcaa < 2:152403/150‑6 (MQ=255)
gCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCaaa > 1:570337/1‑150 (MQ=255)
tGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCaaaaa > 1:500985/1‑150 (MQ=255)
gAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCaaaaa < 2:550315/149‑1 (MQ=255)
aaaGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAaaataa < 1:625183/151‑1 (MQ=255)
aaaGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAaaataa < 2:362864/151‑1 (MQ=255)
ataCCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCAGTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAaatta < 1:674955/149‑1 (MQ=255)
cacaTGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTaaa < 1:48260/151‑1 (MQ=255)
aTGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAatg > 2:613534/1‑151 (MQ=255)
aTGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAatg < 1:338272/151‑1 (MQ=255)
aGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAatgat < 1:488145/149‑1 (MQ=255)
gTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCt < 1:576753/151‑1 (MQ=255)
gAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTta < 1:574700/150‑1 (MQ=255)
gAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTta < 1:414036/150‑1 (MQ=255)
aaTTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTtata < 2:192660/151‑1 (MQ=255)
tACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTtatata < 2:466250/150‑1 (MQ=255)
cGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCCCGGTATTTAATATGGTTTATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATataaaa < 2:570375/150‑1 (MQ=255)
tgtCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATataaaata > 1:791717/1‑150 (MQ=255)
gtCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATataaaataa < 2:377592/150‑1 (MQ=255)
atttatATTCACTTCATTTGTTATTTCTTATCCTACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTATAAATCTTGATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑CC‑CAC‑A‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATataaaataaa < 1:176532/142‑1 (MQ=255)
tACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTAATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑CC‑CAC‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTa < 1:589682/150‑1 (MQ=255)
aCTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTaaa < 2:467354/151‑1 (MQ=255)
atATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTaa > 1:859163/2‑149 (MQ=255)
aTCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCa < 2:246720/151‑1 (MQ=255)
ccACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCCCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCa > 2:490335/1‑149 (MQ=255)
cACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑CC‑C‑C‑CAACATCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAgg < 1:284413/151‑1 (MQ=255)
tCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGaa < 2:649865/149‑1 (MQ=255)
tCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAAt < 1:706434/150‑1 (MQ=255)
aTTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAAtctc > 2:276188/1‑151 (MQ=255)
ttGTTATGTCTTATCCCTCGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTGTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑CCAC‑C‑C‑GCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCa < 1:655106/150‑1 (MQ=255)
gTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAAt < 2:542617/150‑1 (MQ=255)
gTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAAt < 1:565472/150‑1 (MQ=255)
ttATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATg < 2:732903/150‑1 (MQ=255)
aTGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGAt < 2:343614/151‑1 (MQ=255)
gTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATg < 2:152900/150‑1 (MQ=255)
tATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTaa > 1:121570/1‑150 (MQ=255)
tATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTa < 2:359713/149‑1 (MQ=255)
aTCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTaaa > 2:36639/1‑150 (MQ=255)
cccACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACa < 2:574370/150‑1 (MQ=255)
ccACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACaaa < 2:447879/151‑1 (MQ=255)
aCGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAAt > 2:605429/1‑151 (MQ=255)
aCGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑CC‑C‑CAC‑CCAACAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAAt < 1:375791/151‑1 (MQ=255)
cGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATg > 1:820256/1‑151 (MQ=255)
ggTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATga < 2:314299/151‑1 (MQ=255)
tATTAAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATTAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATACAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAAt > 1:116188/1‑147 (MQ=255)
ttAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGAttt > 1:611884/1‑151 (MQ=255)
ttAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑CC‑C‑CAC‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGAtt < 1:639594/150‑1 (MQ=255)
tAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGAttt < 2:4115/150‑1 (MQ=255)
aaTATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGAtttt < 1:8403/150‑1 (MQ=255)
aaTATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGAtttt < 2:163934/150‑1 (MQ=255)
atatGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTtgt < 2:651935/151‑1 (MQ=255)
tGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGa > 2:87371/1‑150 (MQ=255)
ggTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGaa < 1:785929/150‑1 (MQ=255)
cATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCaa < 1:336723/151‑1 (MQ=255)
tAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATa > 2:669783/1‑150 (MQ=255)
aGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATaaa < 1:357235/151‑1 (MQ=255)
aGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATaa > 1:282448/1‑150 (MQ=255)
aTTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACt > 1:755975/1‑151 (MQ=255)
aTTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑CC‑T‑T‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACtt < 1:391065/151‑1 (MQ=255)
cTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCg > 1:347500/1‑151 (MQ=255)
aTTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGtttt > 1:658310/1‑150 (MQ=255)
aTTTTGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTa < 2:375955/151‑1 (MQ=255)
tttGCATATGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGtttt > 2:532243/1‑148 (MQ=255)
tGAGTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGttt > 1:246824/1‑150 (MQ=255)
gTATATTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCt < 2:30128/151‑1 (MQ=255)
tatTAC‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCtat > 1:677413/1‑150 (MQ=255)
|
ATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTA‑‑CC‑C‑C‑C‑CCCTCAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTAT > NC_000913/1211930‑1212224
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
