Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
157 |
93.7 |
2947622 |
98.1% |
2891617 |
150.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,767,140 |
T→C |
L53L (TTG→CTG) |
rnlB → |
CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,767,140 | 0 | T | C | 98.8%
| 304.7
/ ‑4.2
| 80 | L53L (TTG→CTG) | rnlB | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (42/37); total (42/38) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.94e-01 |
CCGGAATTAACGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCTTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTAATCAT > NC_000913/2766997‑2767286
|
ccGGAATTAACGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGGGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTgcg < 2:715609/150‑1 (MQ=255)
cGGAATTAACGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCt > 2:849940/1‑151 (MQ=255)
cGGAATTAACGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCt > 2:314189/1‑151 (MQ=255)
aaTTAACGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAAc < 1:1218877/151‑1 (MQ=255)
aaCGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTc > 2:409852/1‑151 (MQ=255)
aaCGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTc < 2:284591/151‑1 (MQ=255)
gTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCag < 2:646089/151‑1 (MQ=255)
ctcAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCag > 2:553762/1‑149 (MQ=255)
tcAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGt > 1:694041/1‑151 (MQ=255)
cAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGt < 2:251968/150‑1 (MQ=255)
cAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTg > 1:810580/1‑151 (MQ=255)
ggggCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGa < 1:13902/151‑1 (MQ=255)
gCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAAcc < 1:981153/151‑1 (MQ=255)
gCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAAcc > 2:1168672/1‑151 (MQ=255)
tctAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGc > 1:625216/1‑151 (MQ=255)
tctAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGc > 1:1016570/1‑151 (MQ=255)
ctAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCt > 2:589489/1‑151 (MQ=255)
aaaaGCTTGCGTTATGGCGACCGGCTTCGACAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTGTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTc < 2:385894/151‑1 (MQ=255)
aaaaGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGc < 2:148948/148‑1 (MQ=255)
aaaaGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGc < 1:606156/148‑1 (MQ=255)
aaaaGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTc < 1:998932/151‑1 (MQ=255)
aaaaGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTc > 1:811664/1‑151 (MQ=255)
aGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGtt > 2:774450/1‑151 (MQ=255)
gCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGtt > 2:359708/1‑150 (MQ=255)
cTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTAc > 2:919057/1‑151 (MQ=255)
gTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACg < 1:1017908/150‑1 (MQ=255)
gTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACg > 2:1045915/1‑150 (MQ=255)
gTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACg < 2:82384/150‑1 (MQ=255)
tATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCTTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGga < 1:1211386/150‑1 (MQ=255)
aTGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCACTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGgaa > 1:931530/1‑150 (MQ=255)
aTGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTCTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGgaa > 1:1028879/1‑150 (MQ=255)
gACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGgaaatgaa > 1:652247/1‑150 (MQ=255)
aCCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGgaaatgaaat < 2:375204/151‑1 (MQ=255)
ccGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGga < 1:503809/142‑1 (MQ=255)
ccGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGga > 2:503751/1‑142 (MQ=255)
ttCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGcc > 2:1083927/1‑151 (MQ=255)
gagaACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGCAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCgg > 1:221494/1‑150 (MQ=255)
aCCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCAt < 2:1185484/151‑1 (MQ=255)
ttGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCt < 1:200196/149‑1 (MQ=255)
tGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTgg > 2:865248/1‑150 (MQ=255)
gTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGa < 2:4470/150‑1 (MQ=255)
gTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGAt < 1:1384358/151‑1 (MQ=255)
gTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGAt < 2:696013/151‑1 (MQ=255)
ccTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATAc < 1:937805/151‑1 (MQ=255)
cTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACg > 2:519854/1‑151 (MQ=255)
aGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGcc < 1:323517/151‑1 (MQ=255)
ttAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCa > 1:659405/1‑150 (MQ=255)
tGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAatt > 2:1147697/1‑151 (MQ=255)
gAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAatt > 2:356157/1‑150 (MQ=255)
aTTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATtg > 2:255341/1‑151 (MQ=255)
gagaCGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATtgatg < 2:1329888/151‑1 (MQ=255)
agaCGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATtgatg < 1:1046011/150‑1 (MQ=255)
agaCGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATtgatg > 1:947061/1‑150 (MQ=255)
gaCGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAg < 2:124617/151‑1 (MQ=255)
aCGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGc > 1:422082/1‑151 (MQ=255)
aaaCTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAgg > 2:130678/1‑151 (MQ=255)
aaaCTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAgg < 1:845273/151‑1 (MQ=255)
aaCTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGa < 2:634907/151‑1 (MQ=255)
aCTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGAc > 1:1384592/1‑151 (MQ=255)
cTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACg > 1:908047/1‑151 (MQ=255)
cTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGAGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGCTCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTc > 1:1151781/1‑150 (MQ=255)
gCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTcc < 1:8833/149‑1 (MQ=255)
gCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCg < 1:1082873/150‑1 (MQ=255)
gCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGa < 1:1121339/151‑1 (MQ=255)
cccTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGac > 2:519885/1‑151 (MQ=255)
aCTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGAcaca < 1:163905/150‑1 (MQ=255)
tGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACatat > 2:205970/1‑151 (MQ=255)
aGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGa < 2:48937/151‑1 (MQ=255)
aGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGa < 1:850026/151‑1 (MQ=255)
agaCCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCa > 1:1003248/1‑150 (MQ=255)
aCCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAAc > 1:1120380/1‑151 (MQ=255)
tGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACt > 2:1197333/1‑151 (MQ=255)
gAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACtttt > 2:1270568/1‑150 (MQ=255)
aaaTCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTtttac > 1:227374/1‑151 (MQ=255)
aaTCCTTTTTGAGCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGACGGATCATGCTGGAGACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTtttact > 2:104231/1‑151 (MQ=255)
ccTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTtttacttt < 2:1037218/150‑1 (MQ=255)
tttGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGt > 2:374379/1‑150 (MQ=255)
tttGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGt < 1:1221691/150‑1 (MQ=255)
ttGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTa < 1:1168769/150‑1 (MQ=255)
gACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTAat < 2:1028781/150‑1 (MQ=255)
cctcctGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTAatcat < 2:693963/151‑1 (MQ=255)
cctcctGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTAatcat > 1:838804/1‑151 (MQ=255)
|
CCGGAATTAACGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCTTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTAATCAT > NC_000913/2766997‑2767286
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
