Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I3 R1
|
143 |
109.6 |
3434427 |
98.5% |
3382910 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,767,140 |
T→C |
L53L (TTG→CTG) |
rnlB → |
CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,767,140 | 0 | T | C | 99.2%
| 475.2
/ ‑4.4
| 122 | L53L (TTG→CTG) | rnlB | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (61/60); total (61/61) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.31e-01 |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
CACCGGAATTAACGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCTTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTAATC > NC_000913/2766995‑2767284
|
cACCGGAATTAACGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTgc < 1:601568/151‑1 (MQ=255)
cACCGGAATTAACGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTgc > 2:550039/1‑151 (MQ=255)
cGGAATTAACGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCt > 2:210666/1‑151 (MQ=255)
aaTTAACGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAAc < 2:789077/151‑1 (MQ=255)
aaCGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTc > 1:637490/1‑151 (MQ=255)
aaCGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTc > 2:68147/1‑151 (MQ=255)
cGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTcc > 2:908125/1‑150 (MQ=255)
tcAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCagag > 1:495040/1‑150 (MQ=255)
tcAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCagag > 2:1445107/1‑150 (MQ=255)
tcAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCagag > 2:246065/1‑150 (MQ=255)
cAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTg > 2:1062347/1‑151 (MQ=255)
aGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTgg > 1:367038/1‑151 (MQ=255)
ggggCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTgg > 2:308961/1‑150 (MQ=255)
ggCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAAc < 2:1016536/151‑1 (MQ=255)
tctAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCg > 2:1280266/1‑150 (MQ=255)
aaaaGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCt < 1:1435566/149‑1 (MQ=255)
aaaaGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTc > 1:1269932/1‑151 (MQ=255)
aaaaGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTc > 2:1058747/1‑151 (MQ=255)
aaaGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCg < 1:1314970/151‑1 (MQ=255)
aaGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGt > 2:1390552/1‑151 (MQ=255)
aaGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGt > 2:669993/1‑151 (MQ=255)
gCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGtt > 2:1567273/1‑150 (MQ=255)
gCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTa < 1:345657/151‑1 (MQ=255)
tCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCt > 1:1239810/1‑151 (MQ=255)
cGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCt < 2:1161387/150‑1 (MQ=255)
cGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCt < 1:763267/150‑1 (MQ=255)
gTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCTTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTgg < 1:70776/151‑1 (MQ=255)
gTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTgg > 1:273929/1‑151 (MQ=255)
ttATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTgg > 2:1463464/1‑150 (MQ=255)
tATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGga > 2:1186629/1‑150 (MQ=255)
ccGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAata < 1:767134/151‑1 (MQ=255)
ttCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGcc > 1:613968/1‑151 (MQ=255)
tCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCg > 2:753931/1‑151 (MQ=255)
cGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCgg > 2:658429/1‑151 (MQ=255)
cGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCgg < 1:953224/151‑1 (MQ=255)
gagaACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCgg > 2:1716189/1‑150 (MQ=255)
gaACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATc > 2:235340/1‑151 (MQ=255)
aCCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCAt < 2:68166/151‑1 (MQ=255)
cccTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATg < 1:1415299/151‑1 (MQ=255)
ttGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCt < 2:1669773/149‑1 (MQ=255)
gTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGAt > 2:730847/1‑151 (MQ=255)
ccTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATAc > 2:1138185/1‑151 (MQ=255)
ccTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATAc < 2:1647570/151‑1 (MQ=255)
tCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACgg > 2:139051/1‑151 (MQ=255)
aGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGcc > 2:1676622/1‑151 (MQ=255)
aGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGcc > 2:692598/1‑151 (MQ=255)
gTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCa < 1:1284876/151‑1 (MQ=255)
ttAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCa > 2:456312/1‑150 (MQ=255)
ttAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCa > 2:1416586/1‑150 (MQ=255)
tAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCaa > 1:65324/1‑150 (MQ=255)
gAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAatta < 2:1678169/151‑1 (MQ=255)
aaaTTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAattat < 1:1590128/151‑1 (MQ=255)
aaTTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAattatt > 1:1431930/1‑151 (MQ=255)
aTTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATtg > 2:760907/1‑151 (MQ=255)
aTTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATtg < 2:1239907/151‑1 (MQ=255)
tagaCGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATtgat > 1:321107/2‑150 (MQ=255)
agaCGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATtgatga < 2:1491515/151‑1 (MQ=255)
agaCGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATtgatg < 1:1445009/150‑1 (MQ=255)
gaCGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAg < 1:128889/151‑1 (MQ=255)
aCGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGc < 1:1709635/151‑1 (MQ=255)
aCTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGAc > 2:839241/1‑151 (MQ=255)
cTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACg > 2:1380075/1‑151 (MQ=255)
tttCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGt > 2:1710828/1‑151 (MQ=255)
ttCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGtt > 1:796746/1‑151 (MQ=255)
tGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCg > 1:1366828/1‑151 (MQ=255)
gCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTcc < 1:1482645/149‑1 (MQ=255)
gCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTc < 1:587033/148‑1 (MQ=255)
gCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTc < 2:173646/148‑1 (MQ=255)
gCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTc < 2:612371/148‑1 (MQ=255)
aCTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGAcaca < 2:1626052/150‑1 (MQ=255)
aGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACGCATATCCTGa < 1:444541/151‑1 (MQ=255)
gagaCCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCa < 1:1160255/151‑1 (MQ=255)
gaCCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCaaa < 2:1246373/151‑1 (MQ=255)
ccACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAAc < 2:1525295/150‑1 (MQ=255)
ccACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACt > 1:1582359/1‑151 (MQ=255)
ccACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACt > 1:158903/1‑151 (MQ=255)
ccACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACt < 2:1716963/151‑1 (MQ=255)
cACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTg > 2:1310228/1‑151 (MQ=255)
ggTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACtt < 1:730988/151‑1 (MQ=255)
gTGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACttt < 1:549989/151‑1 (MQ=255)
tGAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACt < 1:392860/148‑1 (MQ=255)
gAAATCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACtttt < 2:186687/150‑1 (MQ=255)
aaaTCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTtttac < 1:456274/151‑1 (MQ=255)
aaTCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTtttact < 1:436212/151‑1 (MQ=255)
aaTCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTtttact < 2:633120/151‑1 (MQ=255)
aTCCTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTtttactt < 1:908057/151‑1 (MQ=255)
ccTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTtttacttt > 1:1285997/1‑150 (MQ=255)
cTTTTTGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTtttactttac > 2:769081/1‑151 (MQ=255)
ttttGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACg < 2:202032/150‑1 (MQ=255)
ttttGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGt > 1:690549/1‑151 (MQ=255)
tttGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGt > 2:1314016/1‑150 (MQ=255)
ttGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTa < 2:1189016/150‑1 (MQ=255)
ttGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTa < 1:1008484/150‑1 (MQ=255)
ttGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTa > 2:900037/1‑150 (MQ=255)
tGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTaa < 1:677660/150‑1 (MQ=255)
tGACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTAat > 2:302096/1‑151 (MQ=255)
agACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTAat > 2:514997/2‑151 (MQ=255)
gACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTAatc < 2:614022/151‑1 (MQ=255)
gACCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTAat < 2:61097/150‑1 (MQ=255)
aCCTCCTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTAatc > 1:1051100/1‑150 (MQ=255)
|
CACCGGAATTAACGTCTCAGGGGCTCTAAAAGCTGTCGTTATGGCGACCGGCTTCGAGAACCCTTTGTCCTCAGTTAATGAAATTGAGACGAAACTTTCTGCCCTACTGGGTAGTGAGACCACTGGTGAAATCCTTTTTGACCTCTTGTGCGCTAACGGTCCAGAGTGGAACCGCTTCGTTACGCTGGAAATGAAATATGGCCGGATCATGCTGGATACGGCCAAAATTATTGATGAGCAGGACGTTCCGACACATATCCTGAGCAAACTGACTTTTACTTTACGTAATC > NC_000913/2766995‑2767284
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
