Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F50 I1 R1
|
121 |
119.5 |
3777739 |
97.6% |
3687073 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,747,020 |
G→A |
A259V (GCG→GTG) |
ffh ← |
Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs) |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,747,020 | 0 | G | A | 99.0%
| 345.9
/ NA
| 99 | A259V (GCG→GTG) | ffh | Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (54/44); minor base C (0/1); total (54/45) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TCGATATCTTCGATCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCGCCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCAACCGGGTTAATCG > NC_000913/2746873‑2747164
|
tCGATATCTTCGATCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGcaccg > 1:182572/1‑151 (MQ=255)
atatCTTCGATCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCAc > 3:612427/1‑151 (MQ=255)
tatCTTCGATCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAgcaccgcacc > 2:1050871/1‑151 (MQ=255)
ttCGATCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCAccgccg > 4:222707/1‑151 (MQ=255)
tCGATCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCTATCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGGCGAATGGAGAGcaccgcaccg < 4:351014/147‑1 (MQ=255)
tCGATCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCAccgcc < 1:348444/149‑1 (MQ=255)
gATCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCgg > 3:744653/1‑151 (MQ=255)
aTCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCggg > 2:761640/1‑151 (MQ=255)
tCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGc > 3:13650/1‑151 (MQ=255)
cAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGc > 4:292429/1‑150 (MQ=255)
cAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGc > 3:772236/1‑150 (MQ=255)
gCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATc < 2:393308/151‑1 (MQ=255)
gACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGc > 3:944164/1‑151 (MQ=255)
aCAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGcc < 3:1019050/151‑1 (MQ=255)
aGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGt < 4:319161/151‑1 (MQ=255)
aGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGt < 3:670963/151‑1 (MQ=255)
tACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTcc > 1:314192/1‑151 (MQ=255)
tCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACtt > 3:197401/1‑151 (MQ=255)
cATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTc > 2:899592/1‑151 (MQ=255)
cATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTc < 1:423130/151‑1 (MQ=255)
aTGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTc > 2:380534/1‑150 (MQ=255)
aTGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTc > 3:1151822/1‑150 (MQ=255)
aTGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCa < 3:245210/151‑1 (MQ=255)
tGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCa > 3:1027953/1‑150 (MQ=255)
cGAGAATACGCGACGGGATGCGGTCCGGGTGGAACGGGTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACCCCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTgg < 3:1287431/144‑1 (MQ=255)
aaTACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACg < 3:1168306/151‑1 (MQ=255)
aaTACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACg > 2:105280/1‑151 (MQ=255)
tACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGcc > 3:335185/1‑151 (MQ=255)
cgcgacgcgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCg < 2:1232420/150‑1 (MQ=255)
gcgacgcgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGt < 3:392107/151‑1 (MQ=255)
gcgacgcgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGt < 2:1231009/151‑1 (MQ=255)
cgacgcgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGt > 2:287978/1‑150 (MQ=255)
cgacgcgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGt > 2:960040/1‑150 (MQ=255)
cgacgcgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTa < 3:1401401/151‑1 (MQ=255)
acgcgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTaa < 3:1156080/150‑1 (MQ=255)
acgcgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAg < 1:146698/151‑1 (MQ=255)
acgcgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAg < 1:81203/151‑1 (MQ=255)
cgcgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGc < 1:95127/151‑1 (MQ=255)
gcgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCg > 4:318891/1‑151 (MQ=255)
cgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCgg < 3:1313506/151‑1 (MQ=255)
cgaTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACAGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCgg > 2:95809/1‑151 (MQ=255)
aTGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTa < 2:544162/151‑1 (MQ=255)
gCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTaa < 2:164749/150‑1 (MQ=255)
gCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTaa < 3:899628/150‑1 (MQ=255)
cGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACg < 4:228215/151‑1 (MQ=255)
ggTCCGGATGGACCGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGGCGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGc < 1:419022/151‑1 (MQ=255)
ggTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGc > 4:154530/1‑151 (MQ=255)
gTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCGGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCt < 3:380281/151‑1 (MQ=255)
gTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCt < 1:221209/151‑1 (MQ=255)
gTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCt > 2:375787/1‑151 (MQ=255)
ccGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTc > 2:230344/1‑151 (MQ=255)
gATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCAtt > 2:1029242/1‑151 (MQ=255)
ggAACGGCTCCAGCGCCTCTGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGa > 4:421251/1‑150 (MQ=255)
ggAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGa > 1:438182/1‑150 (MQ=255)
aaCGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATg > 2:1330244/1‑151 (MQ=255)
aCGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGc > 2:1374519/1‑151 (MQ=255)
aCGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGc < 3:34735/151‑1 (MQ=255)
ggCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCtt > 2:19962/1‑151 (MQ=255)
ggCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCGTCATTGAATGCtt < 2:81815/151‑1 (MQ=255)
cTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCtttt > 3:16839/1‑151 (MQ=255)
ccAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCtttt < 3:626281/149‑1 (MQ=255)
ccAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTg < 4:296867/150‑1 (MQ=255)
gcgcCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGt < 2:677015/151‑1 (MQ=255)
cgcCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTa < 4:156569/151‑1 (MQ=255)
gcCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTAt < 2:1305018/151‑1 (MQ=255)
gcCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTAt > 1:271430/1‑151 (MQ=255)
ccTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTAtt > 3:143258/1‑151 (MQ=255)
aGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGcc > 3:485571/1‑151 (MQ=255)
gTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCg < 3:1359527/151‑1 (MQ=255)
tttCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCg > 2:319279/1‑149 (MQ=255)
tttCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGc > 1:454923/1‑150 (MQ=255)
tctcGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATc > 3:483123/1‑151 (MQ=255)
tcGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCt > 3:527553/1‑151 (MQ=255)
cGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTg < 3:848908/151‑1 (MQ=255)
ccAACCCCGAGGAACTTGACCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGACCCCCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCt < 3:568102/148‑1 (MQ=255)
aaCACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCg < 2:797847/151‑1 (MQ=255)
ccGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCa < 3:90736/151‑1 (MQ=255)
cGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGCGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCAt > 1:221019/1‑151 (MQ=255)
gAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATg > 2:1322593/1‑151 (MQ=255)
ggAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATTTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGc < 3:1050917/151‑1 (MQ=255)
ggAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGc < 3:1059850/151‑1 (MQ=255)
gAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCg > 3:236672/1‑151 (MQ=255)
aaCTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGt > 2:28807/1‑151 (MQ=255)
aCTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTc > 3:769786/1‑151 (MQ=255)
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tGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAAc > 3:999572/1‑151 (MQ=255)
gATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCa < 3:931176/148‑1 (MQ=255)
gATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAAcc < 3:1150116/151‑1 (MQ=255)
cGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACcac > 1:402933/1‑150 (MQ=255)
tGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAAc > 3:1151396/1‑149 (MQ=255)
gCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAgg > 2:485488/1‑151 (MQ=255)
aGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGt < 2:772201/150‑1 (MQ=255)
aGTGATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCAACGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGtt < 3:1080977/151‑1 (MQ=255)
gATGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAATGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTc < 2:13645/150‑1 (MQ=255)
aTGTGACGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCa > 3:482221/1‑150 (MQ=255)
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cGAATAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCAACCGGGt > 4:429065/1‑151 (MQ=255)
aaTAGAGAGCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCAACCGGGtt > 4:319286/1‑150 (MQ=255)
agagagCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCAACCGGGTTAAt < 3:319309/150‑1 (MQ=255)
gagagCACCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCAACCGGGTTAATCg > 2:1370312/1‑151 (MQ=255)
|
TCGATATCTTCGATCAGCGACAGTACGTCGCCCATGCCGAGAATACGCGACGCGATGCGGTCCGGATGGAACGGCTCCAGCGCCTCAGTTTTCTCGCCAACACCGAGGAACTTGATCGGTTTGCCAGTGATGTGACGAATAGAGAGCGCCGCACCGCCGCGGGCATCGCCGTCCACTTTGGTCAACACTACGCCGGTAAGCGGTAACGCTTCATTGAATGCTTTTGCCGTATTGGCCGCATCCTGACCGGTCATGGCGTCAACCACAAACAGGGTTTCAACCGGGTTAATCG > NC_000913/2746873‑2747164
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
