Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F50 I1 R1
|
121 |
119.5 |
3777739 |
97.6% |
3687073 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,505,884 |
A→G |
L46P (CTG→CCG) |
yhfS ← |
FNR‑regulated pyridoxal phosphate‑dependent aminotransferase family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,505,884 | 0 | A | G | 99.1%
| 350.2
/ ‑3.8
| 107 | L46P (CTG→CCG) | yhfS | FNR‑regulated pyridoxal phosphate‑dependent aminotransferase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (54/51); total (55/52) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.81e-01 |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CCAGAAGACGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCAGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCTTCATAGGTGCCTTC > NC_000913/3505738‑3506030
|
ccAGAAGACGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTc < 2:570678/150‑1 (MQ=255)
aagaCGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGCAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGc > 2:368937/1‑151 (MQ=255)
gaCGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGt < 2:383774/151‑1 (MQ=255)
aCGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTTGGTCCTGGCGtt < 1:379289/151‑1 (MQ=255)
aCGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGtt > 2:1205596/1‑151 (MQ=255)
aCGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGtt < 2:1261241/151‑1 (MQ=255)
aCGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGtt < 1:203937/151‑1 (MQ=255)
gCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAg < 1:439557/149‑1 (MQ=255)
gCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGcc > 1:313867/1‑151 (MQ=255)
ccccGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCt < 3:277300/151‑1 (MQ=255)
cGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTaaa < 1:238898/151‑1 (MQ=255)
cGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTAAAGCCTaaa < 1:433407/151‑1 (MQ=255)
ggTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAAt < 2:13952/151‑1 (MQ=255)
tGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCGGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAATTCAcc > 3:177103/1‑151 (MQ=255)
gAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCg < 2:1241574/151‑1 (MQ=255)
aaaGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAg < 1:66947/151‑1 (MQ=255)
aGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGt > 2:248539/1‑150 (MQ=255)
ccgccAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTa > 4:339084/1‑149 (MQ=255)
cgccAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTa > 2:1020760/1‑148 (MQ=255)
cgccAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTa > 3:536281/1‑148 (MQ=255)
cAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGaaa > 2:942796/1‑150 (MQ=255)
aGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACt > 2:644249/1‑151 (MQ=255)
cccGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCCCCTGTCCCACCCGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCTGGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCg < 2:968143/151‑1 (MQ=255)
cccGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCg > 2:878659/1‑151 (MQ=255)
ggCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTg > 2:1343146/1‑151 (MQ=255)
gAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCggg > 2:897820/1‑151 (MQ=255)
aaccgcgCCAGCCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTCCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCg < 2:125632/145‑1 (MQ=255)
aaccgcccctccccccGCGCCTTGCACCAGCGCCGCAGCTTGTTCGTAAATTCCATCACCTAACACCTGTCCCACACGCGGGTTAA‑CGCGCGGTTGTTTCGGTCTTGGCTTTAACCGTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCgg < 2:182452/137‑1 (MQ=255)
aaTCGCGCCAGTCCCCGCCCCCTGCCCCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCCCCTGTCCCACACGCTGGGTAC‑CGCGGGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCAAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCggg < 2:302382/150‑1 (MQ=255)
aTCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACATGTTCCACACGCTGCGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGACGTTAAACCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCggg > 3:848401/1‑149 (MQ=255)
aTCGCGCAAGCCCCCGCGCCCTGCCCCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTAAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCCCACGCGGGGTAA‑CGCGCGTTGGATTCGGTCCTGGGGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGa < 1:19881/151‑1 (MQ=255)
cgcgCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGaa > 3:410826/1‑150 (MQ=255)
cgcgCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGaa > 2:1380238/1‑150 (MQ=255)
ccAGCCCCCGCCCCCTGCCCCAGCGCCGCGGCCTGGGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACCCGCTGGTTAA‑CGCGGGGTTGATTGGGTCCGGGCGTTAAGCCAAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGaaa < 1:220379/147‑1 (MQ=255)
cccccGCCCCCGGCCCCGGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCCCTTTTTCCCCACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTGGTTCCTGGCGTAAAGCTAAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACa < 3:615825/150‑1 (MQ=255)
ccccGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACa > 2:708097/1‑150 (MQ=255)
cgcgCCCTGCCCCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCCCCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATg < 1:59212/151‑1 (MQ=255)
gcCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCt > 1:282406/1‑150 (MQ=255)
gcCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCt > 2:423037/1‑150 (MQ=255)
ccctcaaCCAGCCCCGAAGCCTGTGCGTGAAGTCCATATGCCACCCCCTGTCCCACTGGCTGGGTAG‑CGCGCGTTTGTTTCGTCCCTGGGGATAAGCCAAAATCGCCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTAt < 2:410796/145‑1 (MQ=255)
cccTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTAt > 2:911401/1‑151 (MQ=255)
gCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATccac > 3:1074524/1‑151 (MQ=255)
aCCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATccacc > 2:826140/1‑150 (MQ=255)
aCCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATccacc > 2:770906/1‑150 (MQ=255)
ccAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATccacc > 1:355945/1‑149 (MQ=255)
aGCCCCGCGGCCTGTGCGTGAAATCCTTCGCCCAGCCCCTTTCCCACACGC‑GGGTAACCGCGCGTTTGTTTGGGTCCGGGCGTAAAGCAAAATTCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATccacca < 3:1132767/148‑1 (MQ=255)
cgccgcAGCTTGTGCGTGAAATGCCTCAGCCAGCCCCTGTTCCACACGCTGGGTAC‑CGCGCGGTTGATTCGGTCTTGGCGTAAAGCCTAAACCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAgcgc < 4:368670/150‑1 (MQ=255)
ccgcGGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCCCCTGTTCCACACGCGGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAgcg < 2:824454/147‑1 (MQ=255)
ccgcAGCCTGCGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCaa > 3:1011612/1‑150 (MQ=255)
cgcAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCCCCTGTCCCCCACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAACCCTAAACCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAAc < 2:382040/151‑1 (MQ=255)
cgcAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAAc > 3:758370/1‑151 (MQ=255)
cgcAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAAc > 2:760899/1‑151 (MQ=255)
ccccgccggggCGTGAAGTGCCCCGCCCAGCTCTTTTTCCACCGGATGGCCAA‑CGCGCGGTTTATTCGGTCCTGGGGTGACGCCAAAACCTCCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCaa < 3:868841/139‑1 (MQ=255)
cAGCCTGGGCGTGAAATGCCCCACCCAGCCCCTGTCCCCCCCGCGGGGTAC‑CGCGCGGTTGATCGGGTCCGGGCGTTAAGCCAAAACCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAAc < 3:418331/149‑1 (MQ=255)
gCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCt > 1:188528/1‑151 (MQ=255)
cgcgcgggtaataTGCATCAGCAACCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGGGCGGGTTGTTGTGTCCCGGGGTTAAGCCTAAAACGCCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAAc < 4:265401/134‑1 (MQ=255)
ccTGGGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCAAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCt < 3:533416/150‑1 (MQ=255)
cTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCttt > 3:285946/1‑151 (MQ=255)
gtgCGTAAAATGCATCAGCCAGCCCCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCttt < 1:133701/149‑1 (MQ=255)
gtgCGTAAAATCAATCACCAAGCACCTGTACCACCCGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGCCCGGGCGTAACGCTAAAACCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCtttt < 3:124288/150‑1 (MQ=255)
tgCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTtgc > 2:724720/1‑151 (MQ=255)
tgCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTtgc > 2:587694/1‑151 (MQ=255)
gCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTtgct > 3:707784/1‑151 (MQ=255)
gCGTAAAATGCATCAGCCAGCCCCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCGGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTtgct < 2:536247/151‑1 (MQ=255)
cGTGAAATGCATCAGCCAGCCCCTGTCCCACACGCTGGGAAA‑CGCGCGGTGGATTGGGTCCTGGCTTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCtttt < 3:354427/147‑1 (MQ=255)
gTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTtgctgc > 1:247970/1‑151 (MQ=255)
aaaTGCATCAGCCAGCACCTTTCCCACCCGCGGGTTAA‑CGCGGGTTTGATCGGGTCCGGGCTTAAAGCTAAAACCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTtgct < 3:1128902/146‑1 (MQ=255)
aaaTGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGcc > 3:29423/1‑151 (MQ=255)
aTGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTc > 3:1088726/1‑151 (MQ=255)
cATCAGCCAGCCCCTGTCCCCCACGCTGGGTAC‑CGCGGGGTTGATGCGGTCCGGGCGTAAACCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCa < 3:248564/149‑1 (MQ=255)
cATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCaat > 3:624876/1‑151 (MQ=255)
aTCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCaat > 2:494227/1‑150 (MQ=255)
tCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCaata > 1:306367/1‑150 (MQ=255)
agccagcACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATc > 3:1234580/1‑151 (MQ=255)
gcACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTc > 3:1210494/1‑149 (MQ=255)
ccTGTCCCCCCCGCTGGGTAC‑GGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGGGTGAAGCATAAACCCCCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGc < 3:651010/150‑1 (MQ=255)
ttCCACCCGCGGGGTAC‑CGCGCGGTTGATTCGGTCTTGGCGTAAAGCAAAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCtt < 3:691344/148‑1 (MQ=255)
ttCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGc > 1:182287/1‑151 (MQ=255)
tCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCACCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGc > 2:1240346/1‑150 (MQ=255)
ccccacccggggAAA‑CGCGGGTTTTATTCGGGCCTGGGGTTAACCCAAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCa < 3:368969/141‑1 (MQ=255)
acacGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCag > 2:324958/1‑149 (MQ=255)
cacGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAgg > 1:111945/1‑151 (MQ=255)
acGCTGGGTAC‑CGGGGGTTTGTTCCGGTCCTGGGGTTAAGCTAAAAACACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCaga < 2:544992/148‑1 (MQ=255)
gCTGGGAAA‑CGCGCGGTTTATTGGGCCCGGGCGTTAAGCCTAAACCCCCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCagag < 2:177077/147‑1 (MQ=255)
tGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACg > 1:196616/1‑151 (MQ=255)
gggTAA‑CGCGGGGTTGATTCGGTCCGGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGaaa < 2:49419/148‑1 (MQ=255)
gggTAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGt > 2:819947/1‑151 (MQ=255)
tAA‑CGCGCGGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCtt > 4:28536/1‑151 (MQ=255)
accgcgggTTTGATTCGGTCCTGGCTTTAAGCCAAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCt < 1:85178/147‑1 (MQ=255)
accgcgcgGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAACCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCtt < 3:43765/148‑1 (MQ=255)
ggggTTGATTGGGTCCGGGCGTTAAGCCAAAACCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCTTCAt < 3:1371816/146‑1 (MQ=255)
gcgGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAACCCTAAACCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCTTCATAgg < 2:1234521/151‑1 (MQ=255)
gcgGTTGATTCGGTCCTGGCGTAAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCTTCATAg < 2:1011569/150‑1 (MQ=255)
cgGTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCTTCATAGGt > 2:456488/1‑151 (MQ=255)
ggTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCTTCATAGGTg > 3:508091/1‑151 (MQ=255)
ggTTGATTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCTTCATAGGTg > 2:1364259/1‑151 (MQ=255)
ggTTGATTCGGTCCGGGCGTAAAGCCAAAACCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCTTCa < 3:897856/145‑1 (MQ=255)
ggTTGATCCGGTCGTGGCGTTAAGCCTAAACCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCTTCATAgg < 3:1205657/149‑1 (MQ=255)
gATTCGGTCCGGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCTTCATAGGTGcct < 1:257472/150‑1 (MQ=255)
aTTCGGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCTTCATAGGTGccttc > 4:281124/1‑151 (MQ=255)
|
CCAGAAGACGCTGCCCCGGTTTGAGCAAAGCCGCCAGCCCGGCGCGAATCGCGCCAGTCCCCGCGCCCTGCACCAGCGCCGCAGCCTGTGCGTGAAATGCATCAGCCAGCACCTGTTCCACACGCTGGGTAA‑CGCGCGGTTGATTCAGTCCTGGCGTTAAGCCTAAATCACCGCCAGTAAGAAACTCGCTGCCGGGGAAATGGCGACAAATGCTATCCACCAGCGCAAACTGCTTTTGCTGCGCCTCAATAATCGTCAGGCTTTGCAGAGGAAACGTCTTCATAGGTGCCTTC > NC_000913/3505738‑3506030
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
