Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F210 I1 R1
|
4930 |
262.8 |
3829204 |
96.6% |
3699011 |
272.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,612,491 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,612,491 | 0 | A | T | 99.3%
| 644.9
/ NA
| 275 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (133/139); minor base G (1/1); total (135/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,612,492 | 0 | G | C | 99.6%
| 645.8
/ NA
| 275 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (134/139); total (135/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
| * | CP042583 | 1,612,493 | 0 | T | A | 98.9%
| 637.6
/ NA
| 275 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/3); new base A (133/137); total (135/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.48e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
CCCTGCTAACCGTCAGCGCGGTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCAGTGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACA > CP042583/1612213‑1612771
|||
ccTGCTAACCGTCAGCGCGGTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGcc < 1:755414/289‑1 (MQ=255)
cTAACCGTCAGCGCGGTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTTAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGc > 1:10128/1‑289 (MQ=255)
aGCGCGGTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGGTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCGCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGt > 1:976986/1‑288 (MQ=255)
gcgcGGTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTg > 1:159787/1‑288 (MQ=255)
gcgcGGTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTg > 1:1253193/1‑288 (MQ=255)
agcgGTGGATGGCGTCTGTTGATGTGCACGAGAAGGTCATAGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGGAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGc < 2:110588/287‑1 (MQ=255)
gcgGTGGATGGAGTCCATTGCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAGTACGGCGACTACCGTGAATCCGGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCTAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCACTCGTCCACATGTTACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTg < 2:1126966/286‑1 (MQ=255)
gTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTc > 2:1069575/1‑288 (MQ=255)
gCACCGGTAGGTCATCGCAAGGAAGATGGGGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGa < 2:1262655/289‑1 (MQ=255)
gCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGa < 2:464632/289‑1 (MQ=255)
cACCAGTAGGTCCTCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGa < 2:689103/288‑1 (MQ=255)
cACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGa < 2:199550/288‑1 (MQ=255)
gTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTc > 1:710714/1‑289 (MQ=255)
ggTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGt > 1:456883/1‑289 (MQ=255)
tCAACGCCAGGGAGCTGGCGACTACCGTGAATCCGGGCACCCACAGACAATGGTCACGCTTGATCCTGAACTTGGGCAGGAGATGGCCGGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTACGTGTCGAGCTACTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGGTTTTCAGTGAGTTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGGTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGAGTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTa < 2:1233828/288‑1 (MQ=255)
tCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATgg > 2:1868563/1‑288 (MQ=255)
tCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATgg > 1:568649/1‑288 (MQ=255)
tCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATgg > 1:1885092/1‑288 (MQ=255)
tCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATgg > 1:1785409/1‑288 (MQ=255)
tCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGGTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTAGTTGTCAGT‑GGTGATGAGGTGGTTTTCAGTGAGGTCTTCTCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGTCGGTGATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTTCATGTACGTGGCTTCCTCGGACTTCTGGTTGGCGGGATCCGTCGGTATTGt > 2:552167/1‑289 (MQ=255)
cGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGa < 2:1613503/274‑1 (MQ=255)
cAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCt > 1:16124/1‑288 (MQ=255)
gAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTa > 1:962524/1‑278 (MQ=255)
gCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTg > 1:260304/1‑288 (MQ=255)
aCCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTAt < 1:64134/289‑1 (MQ=255)
aCCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTAt < 2:1253193/289‑1 (MQ=255)
cGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGCAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGTTGAGGTGATTTTCAGTTAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCTGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGAACTCTCAGAGCTTGCCCGGCATGTACGTGACTTCGTCGGACTCCCTCTTGGCGGTCTCCGTCAGTATGCTCTTGCAGCTTCTGCTGttct > 2:1531145/1‑285 (MQ=255)
ccTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTTCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCCGTATGGTCCTGCAGCTTCTTCCGTTAGTCTGCcaca > 2:939381/1‑289 (MQ=255)
aaCCGCCGCAAAGGGGCCCGAGTGCCCTTGAGCGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGAc < 2:1318841/289‑1 (MQ=255)
aaCCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGa < 1:76829/288‑1 (MQ=255)
aaaTGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTc < 1:1850602/285‑1 (MQ=255)
gAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTc < 2:877406/289‑1 (MQ=255)
ttGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTg < 2:1199702/288‑1 (MQ=255)
ttGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTCCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTg < 1:1911772/288‑1 (MQ=255)
gCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATa < 1:621312/289‑1 (MQ=255)
cccTGGGACGTGCGCAGGAGTTTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGGCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATa < 2:539405/288‑1 (MQ=255)
ccTTGGACGTTCGCAGGAGTTTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGATTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACATGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAAt < 2:368126/289‑1 (MQ=255)
gTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGaa < 2:1013706/289‑1 (MQ=255)
tGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGCCATATTGTCCCGTTTGTTATGTTGCAGAAt > 2:1393312/1‑289 (MQ=255)
tGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAAt > 1:1383311/1‑268 (MQ=255)
gTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTgg < 2:291457/184‑1 (MQ=255)
gTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGAttt > 1:880533/1‑289 (MQ=255)
tAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTc > 2:1795964/1‑224 (MQ=255)
aaaGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTg < 2:1385534/288‑1 (MQ=255)
gtgCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGAGTTGCAGATTc > 1:1402459/1‑289 (MQ=255)
ggCACTTGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTa < 1:552167/289‑1 (MQ=255)
gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGCCTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATATTGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTCGt > 2:56494/1‑289 (MQ=255)
gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCCCGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTCGCAGATTCGTTTATTTGGt > 2:1481841/1‑289 (MQ=255)
gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGt > 1:1912534/1‑289 (MQ=255)
gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGt > 2:1845428/1‑289 (MQ=255)
ggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTa > 2:1912166/1‑289 (MQ=255)
gTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGa > 2:591175/1‑270 (MQ=255)
gTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGa < 1:591175/270‑1 (MQ=255)
gtgttgtgTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGCGGTGTTTTTCTGTCAGGTCTCGCCTCGTCCACAGGATACCTGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCTGACTTCCGGTTGGCGGGATCCTTCAGTATGTTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGaaa < 2:145842/287‑1 (MQ=255)
tttGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATg > 1:1555565/1‑289 (MQ=255)
tttGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGAGTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATg > 2:410248/1‑289 (MQ=255)
tttGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAAGGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTCTTTGGTAATCAGGAAATTGATg > 2:1724597/1‑289 (MQ=255)
tttGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGAACAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGAAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGagg > 1:145842/1‑287 (MQ=255)
gtCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCGGCATGTACGTTCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTTCCGTTTGATAATGTGCAGACTGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTCTTTGGTCAGCAGGAAATTTATGGCatc > 2:826403/1‑286 (MQ=255)
cgtgCTATTTGT‑TGTGGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCcg < 2:1548545/285‑1 (MQ=255)
cGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATTAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACGGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCcg < 1:1125687/288‑1 (MQ=255)
cGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCcg < 2:1885092/288‑1 (MQ=255)
aGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGa > 1:499112/1‑144 (MQ=255)
tttGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCATAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTgg > 1:919900/1‑289 (MQ=255)
gt‑ggtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGgcg > 1:1324116/1‑225 (MQ=255)
gt‑ggggATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATg < 2:864836/192‑1 (MQ=255)
gtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGTTGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGc > 2:503501/1‑286 (MQ=255)
gtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGc > 2:586899/1‑286 (MQ=255)
ggatgaGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACt < 1:1233842/287‑1 (MQ=255)
gatgaGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTgg < 1:1198700/289‑1 (MQ=255)
gtgaGGTGATTTTCAGTGAGGTTTCCCCTCGGCAACATGTGACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCTGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTgg < 2:1682078/287‑1 (MQ=255)
atgaGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAAAGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTgg < 2:964953/288‑1 (MQ=255)
tgaGGGTATTTGCAGGGATGCCTCCCCTCGTCCACATGATCCCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGCTCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGAGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGc < 2:764285/288‑1 (MQ=255)
gttgttttCCGTGAGGTCTCCCCTCGGCCAAATTATTCCCGGATTGGTG‑CGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACt < 1:401881/284‑1 (MQ=255)
gTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACt > 1:1484929/1‑288 (MQ=255)
gTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCGTGGGGGGGTACTGGCTACt > 2:1428316/1‑288 (MQ=255)
gATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCa < 1:347268/289‑1 (MQ=255)
aTTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCag > 1:1699391/1‑289 (MQ=255)
gTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTATGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAgtgt > 1:1277387/1‑289 (MQ=255)
tGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGtgtt > 1:1733150/1‑289 (MQ=255)
aGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGtgttgt > 2:494593/1‑289 (MQ=255)
gTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGTTAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGttgttg > 2:660906/1‑289 (MQ=255)
ctcCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGa < 1:1069575/288‑1 (MQ=255)
tcCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGa > 1:51955/1‑208 (MQ=255)
cgaccagaggATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTGCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTg < 1:1812984/280‑1 (MQ=255)
gTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCt > 2:350299/1‑244 (MQ=255)
gTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGa > 1:1031532/1‑289 (MQ=255)
caTTATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCACGAGCTCTCAGCGTTGGCCCGGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCGGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAAcgcg < 2:710714/289‑1 (MQ=255)
caTGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGt > 1:352336/1‑201 (MQ=255)
tACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGaa > 1:304815/1‑288 (MQ=255)
aCCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGGGAGGGTTGTTGACGCCATTTAAcgcgcgcggc > 2:1770704/1‑285 (MQ=255)
gggA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCAcg < 1:1173224/289‑1 (MQ=255)
ggA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTc > 1:1873791/1‑117 (MQ=255)
ggA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCATCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGAAcg > 1:1639138/1‑288 (MQ=255)
gA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTCGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCAcgc > 2:275497/1‑288 (MQ=255)
gTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGAATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATACTGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGGCTGGGGGTGGCACTGGCTCCTGCAGAGACTGTTGTCGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGcccccg > 2:1326401/1‑289 (MQ=255)
tAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGt < 1:1845428/289‑1 (MQ=255)
aTTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa < 1:1428316/289‑1 (MQ=255)
tcAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 2:1484929/289‑1 (MQ=255)
cAAGATCTCTCAGAGTTAGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAc > 1:1221892/1‑289 (MQ=255)
|||
CCCTGCTAACCGTCAGCGCGGTGGATGGCGTCCATTTCTGTGCACCAGTAGGTCATCGCCAGGAAGATGGCGACTACCGTGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGT‑GGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGA‑TGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCAGTGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACA > CP042583/1612213‑1612771
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
