Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F210 I1 R1
|
4927 |
250.2 |
4002508 |
96.7% |
3870425 |
266.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,494,181 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,494,181 | 0 | A | T | 98.9%
| 649.5
/ NA
| 279 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (123/153); minor base C (3/0); total (126/153) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.09e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,494,182 | 0 | G | C | 99.6%
| 653.6
/ NA
| 279 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (125/152); total (126/153) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.53e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 |
| * | CP042583 | 1,494,183 | 0 | C | G | 99.6%
| 649.4
/ NA
| 279 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (125/152); total (126/153) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.53e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
AACCATTGGTCAGAACGGCTGCGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CAGCATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACACTCTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCAAACTATGTGCCTGTAGGCTGAAGCTTAAAACCTCATA > CP042583/1493901‑1494456
|||
tttGGTCGGAGCGGCTGCGCTGTTTTGTTGCGGGCGATGCTGGCGGGTATGGTGGCCCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTg < 2:1945408/288‑1 (MQ=255)
gagactggCTGTGCCGTTTGTTATCCGGCAAGGCTGTGGGTGATGGTTGCGCCTCCGTTTGGCATTACCCCGCTGGACCCGATGTGGGTTGCGACGCTGGTCGGTGTTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGc < 2:365546/283‑1 (MQ=255)
cAGAACGGCTGCGCCGTTTTGTATCCGGCAAGGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGc < 2:762539/289‑1 (MQ=255)
cAGAACGGCTGCGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACg < 1:1534441/288‑1 (MQ=255)
tGCGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACCGCTGGCACGCTGAccagcc > 2:982556/1‑289 (MQ=255)
tgcCGGTTGGTGTCCGGCAAGGCGGGCGGGGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGAccagcca < 2:190406/287‑1 (MQ=255)
cgcCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGAccagccag > 1:461505/1‑289 (MQ=255)
ccGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTg > 2:919244/1‑289 (MQ=255)
cGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGGTTGGGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTGCCGCAGGCGTGGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTgg < 1:206777/289‑1 (MQ=255)
tttCCGGCAATGCTGGCGTTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGAGTGCGACGCTGGTCGGTATGGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAg < 1:1967137/286‑1 (MQ=255)
tATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTTGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACTTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCGGACCAGCCAGGGGCGGCAGc > 2:1148366/1‑289 (MQ=255)
aaTGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGa < 1:982556/288‑1 (MQ=255)
gCTGGCGGTGGTGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGAt < 2:461505/286‑1 (MQ=255)
tGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGCGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAg < 2:1011083/288‑1 (MQ=255)
tGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGa < 1:1356903/289‑1 (MQ=255)
cgcCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGa > 1:1629720/1‑289 (MQ=255)
aCGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGTTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGGGGCGCTGGTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGGTCAACGTTAGTGG‑CTCGATTACAGCTGGCCAGCTGACCAGCCAGGGACCGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGccttcctt > 2:1799758/1‑282 (MQ=255)
ggCATTGCCCCGCTGGCCCCGGTGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTGGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCg < 2:1540347/289‑1 (MQ=255)
ggCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAg < 2:608091/262‑1 (MQ=255)
cccGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGca < 1:1708497/289‑1 (MQ=255)
cTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCAATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAAATGGcacaa > 2:213743/1‑287 (MQ=255)
ttgACGCGATGGGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGTTGGTGCAACTTGCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGTCCTGCCAGTAAGCCTGGTGGCGCTGTTAAGCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCTCGCTGACCAGCCAGTGGCTTAAGCAAACCGATCAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACAcc < 1:488671/286‑1 (MQ=255)
tgtgGATTGCGACGCAGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACAGCTTATCGACATGCACCGTACGGCGTTATACGTTAGTGGACCGC‑TGCAAGCTGGCACGCGGAACAGCAAGCGTCTGGAGGAAAGCGACAAAGCCATTCTGGATAGCAAACACGAGGCCGAACTGGCACACCACTAAttat > 2:7964/1‑286 (MQ=255)
aTTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCGGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTAt > 2:575460/1‑286 (MQ=255)
cGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCa > 2:559459/1‑289 (MQ=255)
tGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGt < 2:964048/288‑1 (MQ=255)
tGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGt < 1:183112/288‑1 (MQ=255)
tGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGt < 1:1176609/288‑1 (MQ=255)
ggTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGttt < 1:32781/289‑1 (MQ=255)
gTATTTTTACCGTTAGTGCCCGAGGCGTTGCCGGGTTCGGGGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTATTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGttt < 2:1106632/288‑1 (MQ=255)
tGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGcac > 1:446200/1‑251 (MQ=255)
ttACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCCAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACCGGCCAACCATTAAGTCCTATTCTGGCAACGGTCCGTTTTGtatat > 2:1059132/1‑288 (MQ=255)
tACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCt < 1:1796949/219‑1 (MQ=255)
tACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCg > 1:1428059/1‑278 (MQ=255)
tACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCg < 2:1428059/278‑1 (MQ=255)
gtgtaggagacagggCGTTGCCGGTGTCGGGGGTGGTGCAACTTTGGCCGCACTTGTTGTACTGCCTGCGATGGGCCGGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAgggg < 2:1267259/275‑1 (MQ=255)
gTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAg > 2:18581/1‑208 (MQ=255)
gTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAga < 2:819474/227‑1 (MQ=255)
gTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAga > 1:819474/1‑227 (MQ=255)
gTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAggg > 1:1050127/1‑286 (MQ=255)
gTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGcc > 1:180101/1‑289 (MQ=255)
gTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGcc > 2:725672/1‑289 (MQ=255)
gTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGcc > 1:1202531/1‑289 (MQ=255)
ttCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTg > 1:1281051/1‑288 (MQ=255)
ccGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAg < 1:1089713/201‑1 (MQ=255)
gCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTTGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGcac < 1:1118466/231‑1 (MQ=255)
ttGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGc < 2:1701545/272‑1 (MQ=255)
gtGCCGGTGTCGGGGGGGGTGCAACTGTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACttttt < 2:500935/287‑1 (MQ=255)
ccGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACttttt < 1:1471103/285‑1 (MQ=255)
tgtCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGc < 2:1562059/265‑1 (MQ=255)
tgtCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCtt > 1:1267259/1‑274 (MQ=255)
tCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCa > 1:1645068/1‑289 (MQ=255)
tgggggggaaaCTTTCGCGGCACGGTTTGTACTGCCGGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTCATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATcg < 2:659228/279‑1 (MQ=255)
ggtggtgCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATcgcg < 1:479873/289‑1 (MQ=255)
gtgttgCAACTTTCGCCGACCTGATTGTCCTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAGCCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACAGGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATcgcg < 1:1742406/288‑1 (MQ=255)
gtggtgCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATcgcg < 1:919244/288‑1 (MQ=255)
gtggggaacatttCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGTTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATcgcg < 2:1804340/278‑1 (MQ=255)
tggtgCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCgcggc > 1:1583225/1‑289 (MQ=255)
tggtgCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCgcgg < 1:559459/288‑1 (MQ=255)
tgCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGa < 1:1779278/288‑1 (MQ=255)
cAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGcac > 1:1377896/1‑207 (MQ=255)
cAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGcac < 2:1377896/207‑1 (MQ=255)
ttCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCTTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACTGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATact < 1:7964/289‑2 (MQ=255)
ttCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCAt > 1:845197/1‑286 (MQ=255)
cgcACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATactgact < 2:1598069/288‑6 (MQ=255)
tGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCAtt > 1:893426/1‑198 (MQ=255)
tGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTaaa < 1:725672/289‑1 (MQ=255)
aCTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGGGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATTGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAAGTCTTATGCTGGACAAGGTCCTTGTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTTCTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGAATACTGACTCATATTGAAACat > 2:439248/1‑288 (MQ=255)
gcctgcGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATcgcg < 2:485222/257‑1 (MQ=255)
gcctgcGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATTGCTGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATc > 1:1900238/1‑289 (MQ=255)
gcctgcGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATc > 1:1408500/1‑289 (MQ=255)
ctgcGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGcac > 2:1985655/1‑180 (MQ=255)
ctgcGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGcac < 1:620781/180‑1 (MQ=255)
ctgcGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATa < 2:1644121/265‑1 (MQ=255)
ctgcGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCg > 2:598201/1‑288 (MQ=255)
ctgcGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCg > 1:1010185/1‑288 (MQ=255)
gcGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCAtt > 1:637692/1‑147 (MQ=255)
gcGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCa > 1:1301755/1‑289 (MQ=255)
aTGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGt > 2:1461020/1‑202 (MQ=255)
aCCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGAGAGCGGCCGTACGGCGGTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGAGAAAGCGAGGGTGGATAGCGAAGAAGGCGCCGAACTGGCACAAAGTTAATTCTTAGGCTggaa < 1:295969/182‑3 (MQ=255)
aCCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAAc < 1:60534/289‑1 (MQ=255)
gtggtggCGCTTTTAATCCCCGTGAAACCGTTTATGAACAGGGGCCGAACGGGGTTAAACGTTAGTGG‑TTCGATGAAAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTa < 2:361223/288‑1 (MQ=255)
ggtggCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATc > 1:1862905/1‑289 (MQ=255)
gtggCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATactgact > 2:1782561/1‑240 (MQ=255)
tggCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCaa > 2:1305346/1‑289 (MQ=255)
cgcTGTTACTCTCCGTTGAACCGCTTACAGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATa < 2:1202531/288‑1 (MQ=255)
cTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTcc > 2:411971/1‑274 (MQ=255)
ccGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCa < 1:430707/289‑1 (MQ=255)
cGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGtt > 2:1178452/1‑169 (MQ=255)
cGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGaaaaaa < 1:399521/257‑1 (MQ=255)
ttGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCaa > 1:964621/1‑263 (MQ=255)
ttGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCaatg > 2:26116/1‑287 (MQ=255)
cTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTaaa > 1:1937859/1‑228 (MQ=255)
cTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTaaa < 2:1937859/228‑1 (MQ=255)
aTGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCAATGAATGTGCCTGTAgcgag < 1:576934/289‑5 (MQ=255)
tACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCAATGAATGTGCCTGTAGCGTGAAGCTTaa > 1:259150/1‑289 (MQ=255)
tACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCAATGAATGTGCCTGTAGCGAGAAGCTTaa > 1:13072/1‑289 (MQ=255)
aCGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCAATGAATGTGCCTGTAGCGAGAAGCTTaaa > 1:1443190/1‑289 (MQ=255)
cGTTAAACGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACAATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATCTACCCCGCCCGCCACAGCAACAAATGTCCAACTTTTCAATACATTCCTGGCTCAATGAATGTGCCAGTAGCGAGAAGCTTAacact > 2:626826/1‑287 (MQ=255)
aaCGTTAGTGG‑CTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCAATGAATGTGCCTGTAGCGAGAAGCTTAAAACCTCATa > 1:1161873/1‑288 (MQ=255)
|||
AACCATTGGTCAGAACGGCTGCGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGG‑CAGCATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCACACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGTATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACACTCTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCAAACTATGTGCCTGTAGGCTGAAGCTTAAAACCTCATA > CP042583/1493901‑1494456
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
