Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F1 I2 R1
|
766 |
55.6 |
2631458 |
94.7% |
2491990 |
109.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,789,352 |
G→A |
R244C (CGC→TGC) |
waaH ← |
LPS(HepIII)‑glucuronic acid glycosyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,789,352 | 0 | G | A | 100.0%
| 244.9
/ NA
| 77 | R244C (CGC→TGC) | waaH | LPS(HepIII)‑glucuronic acid glycosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (29/48); total (29/48) |
GTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAAC > NC_000913/3789217‑3789485
|
gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:1201745/139‑1 (MQ=255)
gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:85595/139‑1 (MQ=255)
gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:496082/139‑1 (MQ=255)
gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:384478/139‑1 (MQ=255)
gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:1032468/139‑1 (MQ=255)
gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:220601/139‑1 (MQ=255)
gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:973678/139‑1 (MQ=255)
tGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTaa < 2:440354/139‑1 (MQ=255)
gggCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTaa < 2:317426/138‑1 (MQ=255)
cGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCt < 1:468666/139‑1 (MQ=255)
gggTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt > 2:765000/1‑133 (MQ=255)
gggTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:765000/133‑1 (MQ=255)
atCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTGCAGCAGGCAGGt > 1:790033/1‑123 (MQ=255)
tCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGAc < 2:536124/139‑1 (MQ=255)
tCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGAc > 2:48998/1‑139 (MQ=255)
ccGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt > 2:240010/1‑121 (MQ=255)
ccGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:240010/121‑1 (MQ=255)
ccGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACg > 2:297267/1‑139 (MQ=255)
gCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTg > 1:963288/1‑139 (MQ=255)
ctctTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGa > 1:947962/1‑139 (MQ=255)
tctTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt > 2:251602/1‑116 (MQ=255)
tctTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:251602/116‑1 (MQ=255)
tctTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGAt > 1:1040034/1‑139 (MQ=255)
tttGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATaa > 2:8247/1‑139 (MQ=255)
cgcACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTaa < 2:256528/139‑1 (MQ=255)
cGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:1027695/105‑1 (MQ=255)
cGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt > 2:1027695/1‑105 (MQ=255)
gCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCt < 1:606645/109‑1 (MQ=255)
gCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCt > 2:606645/1‑109 (MQ=255)
cATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATACTTAAGGttttt > 1:852469/1‑139 (MQ=255)
cATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGttttt > 1:575518/1‑139 (MQ=255)
cATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGttttt < 1:297267/139‑1 (MQ=255)
cATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGttttt < 2:1040034/139‑1 (MQ=255)
aTGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTa < 1:392894/139‑1 (MQ=255)
cAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc < 2:575518/139‑1 (MQ=255)
cAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc < 2:169810/139‑1 (MQ=255)
aaaCACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTccc < 2:1302600/139‑1 (MQ=255)
acacGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCtt > 2:1140896/1‑139 (MQ=255)
acacGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCtt > 2:1091359/1‑139 (MQ=255)
cTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAAc < 1:1091359/139‑1 (MQ=255)
tCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATGATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt > 1:221686/1‑83 (MQ=255)
tCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:221686/83‑1 (MQ=255)
cGTCAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAAGCAGGTAATCTTAATATCGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCg > 2:846058/1‑139 (MQ=255)
gTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGa < 2:104493/139‑1 (MQ=255)
gTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGa > 1:678253/1‑139 (MQ=255)
aaGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACt < 1:8247/139‑1 (MQ=255)
gtgagttGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCTTAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATTGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTGGTCTATGCAACCGACTCa < 2:212645/134‑1 (MQ=255)
gTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCa < 2:994555/139‑1 (MQ=255)
gTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCa < 2:1087069/139‑1 (MQ=255)
tATTTGTTGTTGAAATT‑CGGGTTAATTATAATTTTTGCCGCAATATTTTGGATTTAATTCTCCCAGAGGGCAGTTATTCTT‑ATATTGTTGCCTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 2:123447/139‑1 (MQ=255)
aTTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 1:846058/139‑1 (MQ=255)
tttGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt > 2:226441/1‑73 (MQ=255)
tttGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:226441/73‑1 (MQ=255)
cTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGta < 2:947962/139‑1 (MQ=255)
tgatgaAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTc > 2:415787/1‑108 (MQ=255)
tgatgaAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTc < 1:415787/108‑1 (MQ=255)
tCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGat < 2:1204914/139‑1 (MQ=255)
ccGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGata > 1:414328/1‑139 (MQ=255)
cGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGataa < 2:414328/139‑1 (MQ=255)
ggATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGataat < 1:1179587/139‑1 (MQ=255)
aTAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAatat < 1:1203353/139‑1 (MQ=255)
ttttGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGa < 1:203454/139‑1 (MQ=255)
tGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCTAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 2:943033/105‑1 (MQ=255)
tGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAAc > 1:427128/1‑95 (MQ=255)
tGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAAc < 2:427128/95‑1 (MQ=255)
tGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg > 1:943033/1‑105 (MQ=255)
tGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTg > 1:1033082/1‑139 (MQ=255)
gTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGAAGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTTACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGc < 2:692820/139‑1 (MQ=255)
aTTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTatat < 1:48998/139‑1 (MQ=255)
gATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCt < 2:1037416/68‑1 (MQ=255)
gATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCt > 1:1037416/1‑68 (MQ=255)
aaTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGAtt < 1:833873/118‑1 (MQ=255)
aaTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGAtt > 2:833873/1‑118 (MQ=255)
aTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc > 1:751360/1‑60 (MQ=255)
aTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc < 2:751360/60‑1 (MQ=255)
aTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGAtt > 1:918354/1‑117 (MQ=255)
aTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGAtt < 2:918354/117‑1 (MQ=255)
caggcaggTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAAc < 2:1033082/139‑1 (MQ=255)
|
GTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAAC > NC_000913/3789217‑3789485
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
