Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A30 F60 I1 R1
|
15 |
109.5 |
3730058 |
99.1% |
3696487 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,560,455 |
+G |
pseudogene (151/758 nt) |
glpR ← |
DNA‑binding transcriptional repressor GlpR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,560,455 | 1 | . | G | 99.2%
| 460.1
/ ‑4.0
| 129 | pseudogene (151/758 nt) | glpR | DNA‑binding transcriptional repressor GlpR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base G (59/69); total (59/70) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑C‑CAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGT > NC_000913/3560317‑3560586
|
aTAACCGGCGTCGACCTCTGGGCGTTTT‑GCCCCGCAACTCTGCGGGCGATGCTCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCCCGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCGCCGCCATGATGG‑cg < 2:512855/140‑2 (MQ=255)
aTAAACGGCGTCGACCCATGGGGGATTT‑GCTCCGCAACTTTGCGGGCGATGCGCTTTTTTTCTTCGGTCTGGGGGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑cg < 2:785682/140‑2 (MQ=255)
aTAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑cg < 1:296141/140‑2 (MQ=255)
tAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑cgc > 2:288185/1‑138 (MQ=255)
aCAGCGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑cgcagg > 2:247881/1‑135 (MQ=255)
aggCGTCGGGCC‑TTGAGGATTTGGCACCGCCCCTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGa < 1:827651/138‑1 (MQ=255)
aagctgcGAGCATTTGGCGTTTG‑GCCCCGCCACTTTGCGAGGGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCTTT‑GCGATCGGGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGa < 2:477824/134‑1 (MQ=255)
gCGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATc > 1:1768928/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑cg < 1:388925/132‑2 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑cg > 2:388925/1‑131 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCa > 2:1242501/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCa > 1:66267/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCa > 2:1182316/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCa > 1:1472350/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCa > 2:151448/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGGTAACCGAACTGGGA‑TGAAGCGCCGCCCCGCCATGATGG‑CGCAGGATCa > 2:827651/1‑140 (MQ=255)
gTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAg > 1:248116/1‑140 (MQ=255)
tCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAgg > 2:94974/1‑140 (MQ=255)
gAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGAt < 1:1528918/134‑1 (MQ=255)
gAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGAt > 2:1528918/1‑134 (MQ=255)
aGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGttt > 1:1309083/1‑140 (MQ=255)
gCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGtttt < 1:288999/140‑1 (MQ=255)
ggggATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCg < 1:1540553/140‑1 (MQ=255)
ggggATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCg > 2:1198252/1‑140 (MQ=255)
ggggATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCg < 1:56481/140‑1 (MQ=255)
gATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCa < 2:1472350/140‑1 (MQ=255)
aTTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAg < 2:1097161/140‑1 (MQ=255)
aTTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAg < 1:94974/140‑1 (MQ=255)
aTTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAg < 1:151448/140‑1 (MQ=255)
tt‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCt > 2:1553599/1‑140 (MQ=255)
tt‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATAG‑CGGAGGATCAGGGTTTGCTCCGCCAGCt > 1:510527/1‑140 (MQ=255)
cTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCGTGATGG‑CGCAGAATAAGGTTTGGCTCCGCCAGCTCAt > 1:654935/1‑140 (MQ=255)
cGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCACGATCG‑CGCAGGATCAGTTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGa > 2:731639/1‑140 (MQ=255)
cTTTGCGGGCGATGCCCTCTTTCTCTTCGCTCTGGGTCGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTACCCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTcg < 1:493528/140‑1 (MQ=255)
ttggCGGGGGATGCGCT‑TTTTTCTTTGGGTCGGGGGGCCTTGGGGATGGGGCCAGGGGGTG‑TAACCGAAACGGAAGGGCGGCGCCGCCCCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCCCCGCCAGCTCATTGAGGTcgc < 2:1348881/137‑1 (MQ=255)
tGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCgcgg > 2:1501540/1‑140 (MQ=255)
cGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATTAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCgcggcg > 2:742056/1‑140 (MQ=255)
aTGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAgc > 2:1258410/1‑139 (MQ=255)
aTGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGt > 2:144035/1‑140 (MQ=255)
cgcTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTg < 1:1102901/140‑1 (MQ=255)
ttcttcGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGa < 1:1182316/140‑1 (MQ=255)
ttcttcGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGa < 1:937931/140‑1 (MQ=255)
ttcttcGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGCGGTATTAACCGATCTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGa < 2:510527/140‑1 (MQ=255)
cGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGTTCATTCAGGTCGCGGCAAATACTCTGCGGGCTGACGgag > 2:842249/1‑140 (MQ=255)
cGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGTTCACTGAGGTCGCGGCCAATAATCTGCGGGCTGACGgag > 2:581797/1‑140 (MQ=255)
cGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGgag < 1:1047904/140‑1 (MQ=255)
ggTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGgaga < 1:1211760/140‑1 (MQ=255)
gTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGaa > 1:1043780/1‑140 (MQ=255)
cTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAAt > 2:1631443/1‑140 (MQ=255)
tGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATg < 1:1501540/140‑1 (MQ=255)
gggTGGCCTT‑GCGATTGTGCCACGGCGTGTTAACCGACCTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGc < 1:581797/140‑1 (MQ=255)
gggTGGCCTT‑GCGATGGTGCCGCGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGc < 1:842249/140‑1 (MQ=255)
ggTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGct > 1:432204/1‑140 (MQ=255)
ggTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGATCGCGGCAAATTGTGTGCGGGGTGACGGAGAAATGct > 1:501600/1‑140 (MQ=255)
gCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAAt < 1:69880/133‑1 (MQ=255)
gCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAAt > 2:69880/1‑133 (MQ=255)
tt‑GCGTTCGTGCCACGGCGTGTTACCCGAATTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAg < 1:1804450/140‑1 (MQ=255)
tt‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAg < 1:1650931/140‑1 (MQ=255)
cGATCGTGTCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGATTAGTCTGCGGGATGCCGGAGATATGCTCTACCAGctc > 1:784331/1‑140 (MQ=255)
cGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAg > 2:1361095/1‑137 (MQ=255)
cGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGctc > 2:1040937/1‑140 (MQ=255)
cGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGAGGGGTGCCGGAGAAATGCTCTACCAGctc > 1:724747/1‑140 (MQ=255)
tGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGt > 1:1275069/1‑140 (MQ=255)
gCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa < 2:925200/140‑1 (MQ=255)
gCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa < 1:247881/140‑1 (MQ=255)
gCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa < 1:1631443/140‑1 (MQ=255)
gCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa < 2:1768928/140‑1 (MQ=255)
ccACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCCCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTTCCAGCTCTTCGGTAc < 2:1309083/140‑1 (MQ=255)
ccACGGCGTGTTAACCGAACTGAAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTAc < 1:1242501/140‑1 (MQ=255)
tAACCGAACTGGAA‑GGCCGCGCAGCACCGCCATGATGGCC‑CAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAAccc < 2:654935/140‑1 (MQ=255)
accggAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:1424589/136‑1 (MQ=255)
aaCCGAACTGGAA‑GGCGTCGCCTCACCGCCATGATAG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:634593/140‑1 (MQ=255)
aaCCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:66267/140‑1 (MQ=255)
aaCCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:432204/140‑1 (MQ=255)
aaCCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:1043780/140‑1 (MQ=255)
aaCCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:50013/140‑1 (MQ=255)
aaCCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCACACCGCCATGATTG‑CGTAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:724747/140‑1 (MQ=255)
aaCCGAACTGGAA‑GGCACCGCCACACCGCCACGATCG‑CGCAGGATCAGTTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:501600/140‑1 (MQ=255)
aaCCCAGCTGAAG‑GGCAGCGCCGCGCCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:2090/140‑1 (MQ=255)
aCTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGtt > 1:1299897/1‑140 (MQ=255)
aCTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGtt > 2:426261/1‑140 (MQ=255)
cTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGttt > 2:1800209/1‑140 (MQ=255)
cTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGttt > 2:1479288/1‑140 (MQ=255)
gAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATCATGG‑CGCACGATGAGGTTTTGCTCCCCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAAc < 2:784331/140‑1 (MQ=255)
ggCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAg < 1:144035/140‑1 (MQ=255)
ggCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAg < 1:141041/140‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGtt > 2:1594294/1‑140 (MQ=255)
cgccgcACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGa < 1:426261/140‑1 (MQ=255)
cgccgcACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGa > 1:25655/1‑140 (MQ=255)
cgccgcACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGa > 1:37203/1‑140 (MQ=255)
cgccgcACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGa < 1:742056/140‑1 (MQ=255)
ccgcACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTTATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTAGGTACTGTCATGACTCTGCTGCTTAACCAGTTCGata > 1:847321/1‑140 (MQ=255)
ccgcACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCGTCGGTACGGACATAACTCTGCTGTTTAACCAGTTCGata > 2:718752/1‑140 (MQ=255)
ccgcACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCAACCAGCTCATCGGTACTGACATAACCCTGCAGTTTAACCAGTTCGata > 2:560744/1‑140 (MQ=255)
cgcACCGCCATGATGG‑CGCAGGGTCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGataa < 1:721768/140‑1 (MQ=255)
gcACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGataat < 2:1111425/140‑1 (MQ=255)
cACCGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGataata < 2:1077693/140‑1 (MQ=255)
cGCCATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCg < 2:313865/140‑1 (MQ=255)
ccATGATGG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGtt < 2:1548497/140‑1 (MQ=255)
atgatgG‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTtgt < 1:1040937/140‑1 (MQ=255)
|
ATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTT‑GCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTT‑GCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAA‑GGCAGCGCCGCACCGCCATGATGG‑C‑CAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGT > NC_000913/3560317‑3560586
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
