Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A35 F60 I1 R1
|
16 |
64.9 |
2210988 |
99.0% |
2188878 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,560,455 |
+G |
pseudogene (151/758 nt) |
glpR ← |
DNA‑binding transcriptional repressor GlpR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,560,455 | 1 | . | G | 100.0%
| 250.7
/ NA
| 70 | pseudogene (151/758 nt) | glpR | DNA‑binding transcriptional repressor GlpR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (35/35); total (35/35) |
GATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGC‑CAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGT > NC_000913/3560316‑3560586
|
aaaaaaCGGCGCCGACCCTTGGGGGTTTTCCCCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGCCCTTGCGATCGTGCCCCGGCGTGTTAC‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGc < 2:1086960/137‑1 (MQ=255)
aTAAACGGGGTCGAGCCTTGGGGGATTTGCCCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGcg < 2:42853/140‑2 (MQ=255)
aaaCAGCGTCGGGCCATTGGGGATTTGCTCCCCCAGTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGcgca < 2:407977/140‑4 (MQ=255)
aCAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGTACTGGAAAGCAACGGCGCACCGCCATGATGGcgcctg > 1:420797/1‑135 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATc > 2:1081129/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGCAGGAAGCGCCGCCCCGCCATGATGGCGAAGGATCa > 2:467266/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGcg > 2:820482/1‑131 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGcg < 1:820482/132‑2 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCa > 1:669374/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCa > 2:172484/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCa > 1:443875/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTCTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGGTAA‑CCGAAGTGGAAGGGAGCGCCGCGCCGCAATGATGGCGCAGGATCa > 2:293810/1‑140 (MQ=255)
cGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGt > 1:608649/1‑140 (MQ=255)
taTTGGGGTTTGGCCCCCCCACGTTGCGGGCGATGGGCTGTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGc < 2:443478/139‑1 (MQ=255)
ggggTTTTGCTCCGCCACTTTGTGGGCGATGTGCTCTTTCTCTTCGGTTTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCg < 2:373345/140‑1 (MQ=255)
ttGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCt > 2:11748/1‑140 (MQ=255)
ttGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGAAGGATCAGGGTTTGCTCCGCCAGCt > 1:524432/1‑140 (MQ=255)
ttGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATCGCGAAGAATCAGGGTTTGCTCCGCCAGCt > 1:428901/1‑140 (MQ=255)
cTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCAt > 1:155003/1‑140 (MQ=255)
ccGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑g < 1:77921/140‑1 (MQ=255)
ccGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑g > 1:1103946/1‑140 (MQ=255)
ccGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑g > 2:77921/1‑140 (MQ=255)
ccTTTGCGGGCGATGCGCTTTTTTTCTTCGGCCTGCGTGCCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGAAGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTc < 2:428901/139‑1 (MQ=255)
tttGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTcgc > 2:204557/1‑140 (MQ=255)
cGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCgcggcg > 1:791104/1‑140 (MQ=255)
cgttttttttCTTCGGTTGGGGTGGCATTGCGATCGTGCAAGGGGGTGTTAC‑CCGAACTGGAAGGCGGCACCGAACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTg < 2:647974/135‑1 (MQ=255)
ttttCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCt < 2:791104/140‑1 (MQ=255)
tttCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGTGGGCTg > 1:948076/1‑140 (MQ=255)
cGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGgag < 1:1064534/140‑1 (MQ=255)
gTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAGTAGTCTGCGGGCTGACGgaga < 1:831926/139‑1 (MQ=255)
gTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAGTAGTCTGCGGGCTGACGgaga > 2:831926/1‑139 (MQ=255)
gTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGa < 1:791665/133‑1 (MQ=255)
gTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGa > 2:791665/1‑133 (MQ=255)
gTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGaa > 2:925409/1‑140 (MQ=255)
gTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGaa > 1:908830/1‑140 (MQ=255)
gTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGaa < 2:711207/140‑1 (MQ=255)
ggggTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGGGTAAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATg < 2:779149/139‑1 (MQ=255)
ggTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGct > 1:969341/1‑140 (MQ=255)
ggTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCAAATCGTATGCGGGCTGACGGAGAAATGct > 1:514114/1‑140 (MQ=255)
ttGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAg < 1:125648/140‑1 (MQ=255)
ttGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACCGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAg < 1:970241/140‑1 (MQ=255)
gCGATCGTGCCACGGCGTGTTAC‑CCGAACTGGAAGGCCGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAg < 1:293810/140‑1 (MQ=255)
cGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGATTAGTCTGTGGGCTGACGGAGACATGCTCTACCAGctc > 1:475794/1‑140 (MQ=255)
cGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGctc > 2:49396/1‑140 (MQ=255)
aTCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAATTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCtt < 1:390421/140‑1 (MQ=255)
aTCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCtt < 2:608649/140‑1 (MQ=255)
tCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGCACTGGAAATCAGGGCCACACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTc < 2:514114/140‑1 (MQ=255)
tCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTc < 2:969341/140‑1 (MQ=255)
tCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTc < 2:155003/140‑1 (MQ=255)
gTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCgg > 2:207822/1‑140 (MQ=255)
gTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCgg > 1:240289/1‑140 (MQ=255)
tGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGt > 1:219274/1‑140 (MQ=255)
gCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTCGAAGGCAGGGCCCCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa < 2:443875/140‑1 (MQ=255)
ccACGGCGTGTTAACCCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa < 1:1081129/140‑1 (MQ=255)
ccACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTAc < 1:204557/140‑1 (MQ=255)
gCGTGTTAA‑CCGAGTTGGAAGGCGCCGCCGTCCCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGTTGACGGAGAAATGCTCTGCCAGCTCTTCGGTACTGACa < 2:812787/140‑1 (MQ=255)
cGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTAc < 2:884169/134‑1 (MQ=255)
cGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTAc > 1:884169/1‑134 (MQ=255)
tttaacccGAACTGGAGGGCGGTGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATaa < 2:797563/134‑1 (MQ=255)
ttAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa > 1:17545/1‑129 (MQ=255)
ttAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa < 2:17545/129‑1 (MQ=255)
aa‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCTCACCGCCAGGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:422618/140‑1 (MQ=255)
aa‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 1:1000801/140‑1 (MQ=255)
acccGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCct < 2:1088117/138‑1 (MQ=255)
aCTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGtt > 1:836005/1‑140 (MQ=255)
tGGAAGGCGGCACCCACCCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTa < 2:240289/140‑1 (MQ=255)
tGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTa > 1:793151/1‑140 (MQ=255)
ggCAGCGCCGCACCGCCTTGATTGCGCAGGATCTGGTTTTGCTCCGCCCGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAg < 2:475794/140‑1 (MQ=255)
ggCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAg < 1:49396/140‑1 (MQ=255)
ggCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAg < 1:925409/140‑1 (MQ=255)
ggCAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAg < 2:908830/140‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGCACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGtt > 1:1093372/1‑140 (MQ=255)
cgccgcACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCGTCGGTACAGACGTATCCCTGCTGTTTAACCAGTTCGa > 1:338775/1‑140 (MQ=255)
cgccgcACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCGCTTGGGTGCTGACATAGCCCTGCTGTTTAACCAGTTCGa > 2:291196/1‑140 (MQ=255)
ccgcACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGTCATAACGCTGCTGTTTAACCAGTTCGata > 1:430259/1‑140 (MQ=255)
cgcACCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGataa < 1:172484/140‑1 (MQ=255)
aCCGCCATGATGGCGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATAc > 1:213542/1‑140 (MQ=255)
atgatgGCGCAGGATCACGTTTGGCTCCGCCGGCTGATT‑‑TAGGTCGCGCCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTtgt < 2:430259/140‑1 (MQ=255)
|
GATAAACAGCGTCGAGCCATTGGGGATTTGCTCCGCCACTTTGCGGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAA‑CCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATGGC‑CAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATT‑‑GAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGACATAACCCTGCTGTTTAACCAGTTCGATAATACCGTTGT > NC_000913/3560316‑3560586
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
