Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
205,377 |
G→T |
L84L (CTG→CTT) |
dnaE → |
DNA polymerase III subunit alpha |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 205,377 | 0 | G | T | 100.0%
| 330.5
/ NA
| 95 | L84L (CTG→CTT) | dnaE | DNA polymerase III subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (45/50); total (45/50) |
GCGATCACCGATTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGA > NC_000913/205243‑205510
|
gCGATCACCGATTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGt > 2:885477/1‑140 (MQ=255)
gCGATCACCGATTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGt > 2:752682/1‑140 (MQ=255)
gCGATCACCGATTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGt > 2:295095/1‑140 (MQ=255)
gCGATCACCGATTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGt > 2:567539/1‑140 (MQ=255)
gATCACCGATTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTAc < 2:1941720/140‑1 (MQ=255)
gATCACCGATTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTAc < 2:530269/140‑1 (MQ=255)
aCCGATTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTggc > 1:294232/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTggcg < 1:1204771/140‑1 (MQ=255)
ccGATTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTggcg < 2:1760257/140‑1 (MQ=255)
acGATTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTggcg < 2:429596/139‑1 (MQ=255)
aTTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGgcggcg > 1:1814357/1‑140 (MQ=255)
aTTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGgcggcg < 1:815269/140‑1 (MQ=255)
tttCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGa < 1:1280643/140‑1 (MQ=255)
tttCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGa < 2:470350/140‑1 (MQ=255)
ttCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTCCGGTACTGGCGGCGaa < 1:532543/140‑1 (MQ=255)
ttCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGaa < 2:294232/140‑1 (MQ=255)
ttCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGaa < 1:752682/140‑1 (MQ=255)
cAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATa < 1:885477/140‑1 (MQ=255)
cTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCgg < 1:295095/140‑1 (MQ=255)
tgtgGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGcga > 2:353818/1‑138 (MQ=255)
tgtgGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTa > 2:1420904/1‑140 (MQ=255)
tgtgGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTa > 1:1643692/1‑140 (MQ=255)
tGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCg > 1:684271/1‑129 (MQ=255)
tGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCg < 2:684271/129‑1 (MQ=255)
tGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAAt > 2:1196711/1‑140 (MQ=255)
tGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAAt > 1:202407/1‑140 (MQ=255)
tGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAAt > 2:736197/1‑140 (MQ=255)
gTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCt > 2:187328/1‑140 (MQ=255)
gTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCt > 2:131624/1‑140 (MQ=255)
gAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGa < 1:598268/140‑1 (MQ=255)
gAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGa < 2:306106/140‑1 (MQ=255)
aGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACg < 2:1087282/140‑1 (MQ=255)
tCTACGGAGCGGGTCATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAGCGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTg < 2:1957766/140‑1 (MQ=255)
tCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTg < 1:1420904/140‑1 (MQ=255)
tACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCGCCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCt < 2:1814357/140‑1 (MQ=255)
tACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCt < 1:508087/140‑1 (MQ=255)
tACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCt < 1:1196711/140‑1 (MQ=255)
aCGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCtt > 2:1630382/1‑139 (MQ=255)
aCGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTg > 2:1458483/1‑140 (MQ=255)
aCGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTg > 1:2129592/1‑140 (MQ=255)
aCGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTg > 1:799062/1‑140 (MQ=255)
aCGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTg < 2:1177932/140‑1 (MQ=255)
ggAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGAt < 1:1579865/140‑1 (MQ=255)
aGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGAtct > 2:503127/1‑140 (MQ=255)
gggACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCaa < 1:1190024/140‑1 (MQ=255)
ggACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCaaa > 2:1065771/1‑140 (MQ=255)
ggCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTa > 2:173434/1‑140 (MQ=255)
ggCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTa > 1:1105328/1‑140 (MQ=255)
ggCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTa > 2:239528/1‑140 (MQ=255)
gcgcAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTAt < 2:340747/140‑1 (MQ=255)
cAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTTCGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAg < 2:1438349/140‑1 (MQ=255)
aGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTAAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTAGCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAgc > 2:773281/1‑140 (MQ=255)
gggATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAgcg < 1:1217055/140‑1 (MQ=255)
ggATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACTGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGTTCTCAAAAGCGTATCAgcgc > 2:383516/1‑140 (MQ=255)
ggATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAgcgc > 1:1390351/1‑140 (MQ=255)
aaGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGtt > 2:1407768/1‑139 (MQ=255)
aaGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTa < 1:1519208/140‑1 (MQ=255)
ccTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACgg < 1:173434/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTg < 1:383516/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTg > 2:1485217/1‑140 (MQ=255)
aTCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTgc > 1:470696/1‑140 (MQ=255)
tcgtcgGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAACGTATCAGCGCGGGTACGGTgcc > 2:1893187/1‑140 (MQ=255)
tcgGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTgccgcc < 2:1390351/140‑1 (MQ=255)
tcgGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTgccgcc < 1:1893187/140‑1 (MQ=255)
cgGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGccgccg > 1:23348/1‑140 (MQ=255)
ggggCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATTAGCGCGGGTACGGTGCCGCCgg > 1:139225/1‑140 (MQ=255)
ggggCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCgg < 1:503127/140‑1 (MQ=255)
ggggCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCgg > 1:1582480/1‑140 (MQ=255)
gggCAGATTTTAACGTCCAGAGCGACCTGCTGGGTGATGAGGTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGCATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCggg > 1:1284946/1‑140 (MQ=255)
gATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGat < 2:1105328/140‑1 (MQ=255)
tAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCTGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCatcg > 1:626494/1‑140 (MQ=255)
aCGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCatcgat < 1:1065771/140‑1 (MQ=255)
aCGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCatcgat < 1:1630382/140‑1 (MQ=255)
ccAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATcgcg < 2:2129592/140‑1 (MQ=255)
ccAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATcgcg > 1:1792272/1‑140 (MQ=255)
cAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGa < 1:1485217/140‑1 (MQ=255)
cAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGa > 2:1632332/1‑140 (MQ=255)
ctgctgGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTAt < 1:648495/140‑1 (MQ=255)
tgctgGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATc > 1:1928758/1‑140 (MQ=255)
ctgGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGa > 2:117330/1‑140 (MQ=255)
ctgGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGa > 2:2128030/1‑140 (MQ=255)
tgGGTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGaa < 1:1632332/140‑1 (MQ=255)
gggTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAAt < 2:1284946/140‑1 (MQ=255)
ggTGATGAGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAAtt > 2:610438/1‑140 (MQ=255)
tgatgaGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTaa > 1:2075861/1‑140 (MQ=255)
tgaGTTAACCCCCCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACg < 1:117330/140‑1 (MQ=255)
tgaGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACg < 2:2075861/140‑1 (MQ=255)
tgaGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGACCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACg < 1:1407768/140‑1 (MQ=255)
agaGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCTGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACg < 2:626494/139‑1 (MQ=255)
agaGTTAACCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACg < 1:1906294/139‑1 (MQ=255)
aaCCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGt < 1:239528/140‑1 (MQ=255)
aCCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGtt > 2:1290412/1‑140 (MQ=255)
aCCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGtt > 2:1805363/1‑140 (MQ=255)
aCCCACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGtt > 2:2131685/1‑140 (MQ=255)
cccACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTg < 2:1792272/140‑1 (MQ=255)
ccACCTTACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGa < 2:1643692/140‑1 (MQ=255)
|
GCGATCACCGATTTCACCAACCTTTGTGGTCTGGTGAAGTTCTACGGAGCGGGACATGGCGCAGGGATTAAGCCTATCGTCGGGGCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGA > NC_000913/205243‑205510
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
