Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
230,858 |
G→T |
L8L (CTC→CTA) |
yafC ← |
putative LysR family transcriptional regulator YafC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 230,858 | 0 | G | T | 99.1%
| 380.5
/ ‑3.8
| 112 | L8L (CTC→CTA) | yafC | putative LysR family transcriptional regulator YafC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (54/57); total (55/57) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TGGTCCGATTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGA > NC_000913/230722‑230994
|
tGGTCCGATTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGt > 2:1768806/1‑140 (MQ=255)
tGGTCCGATTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGt > 2:243434/1‑140 (MQ=255)
gTCCGATTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGttt > 2:911020/1‑139 (MQ=255)
gTCCGATTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGttc > 1:132750/1‑140 (MQ=255)
aTTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCg > 1:5867/1‑140 (MQ=255)
gCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTg > 2:876549/1‑140 (MQ=255)
cAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTgg > 1:1862430/1‑140 (MQ=255)
cAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTgg > 2:710928/1‑140 (MQ=255)
cAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTgg > 1:152079/1‑140 (MQ=255)
aGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGc < 1:1082328/140‑1 (MQ=255)
ggCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCt > 2:2127548/1‑140 (MQ=255)
ggCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCt < 2:1229558/140‑1 (MQ=255)
gCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCtt > 1:421703/1‑140 (MQ=255)
cTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCttt < 2:1617324/140‑1 (MQ=255)
cTAACGCCAAGTTTCATCTACAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCttt < 1:1872759/140‑1 (MQ=255)
cTAACGCCAAATTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCttt < 2:1354572/140‑1 (MQ=255)
tAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTc > 1:1112115/1‑140 (MQ=255)
tAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCCTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCtttt > 2:238701/1‑139 (MQ=255)
aGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGc > 1:1374668/1‑140 (MQ=255)
aGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGc < 1:1318626/140‑1 (MQ=255)
aGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGc < 1:1317139/140‑1 (MQ=255)
aGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGc < 2:553693/140‑1 (MQ=255)
aGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGc > 2:1215563/1‑140 (MQ=255)
aGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGc > 1:699194/1‑140 (MQ=255)
tttCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTc < 2:1104291/140‑1 (MQ=255)
ttCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTcc < 2:676130/140‑1 (MQ=255)
ttCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTcc < 1:1996506/140‑1 (MQ=255)
aTCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGt > 1:103037/1‑140 (MQ=255)
aTCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGt > 1:1564554/1‑140 (MQ=255)
ctcCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTg < 2:905165/140‑1 (MQ=255)
ctcCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTg < 2:30736/140‑1 (MQ=255)
ctcCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTg < 2:699194/140‑1 (MQ=255)
ccAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCa < 1:1728121/140‑1 (MQ=255)
cAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCaa > 1:1865266/1‑140 (MQ=255)
gCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCaaaa < 2:2133778/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAatat > 1:998529/1‑140 (MQ=255)
ttttCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATag > 2:2000129/1‑140 (MQ=255)
tCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATagaag > 1:412727/1‑140 (MQ=255)
tCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATagaa > 2:168188/1‑139 (MQ=255)
tCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATagaa < 1:168188/139‑1 (MQ=255)
aCCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAagag > 1:441454/1‑140 (MQ=255)
aCCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAagag < 2:1865266/140‑1 (MQ=255)
cccGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCATAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCGTGTTGCAAAATAGAAGAGatat > 1:1792302/1‑140 (MQ=255)
ccGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATAtt < 1:238701/140‑1 (MQ=255)
cGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATAttt > 1:827925/1‑140 (MQ=255)
cGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAatttt > 2:14277/1‑139 (MQ=255)
cTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAatttatt < 1:437409/140‑1 (MQ=255)
cTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAatttatt < 2:1374668/140‑1 (MQ=255)
tGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAatttattt < 1:96989/140‑1 (MQ=255)
tGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAatttattt < 1:1768806/140‑1 (MQ=255)
aGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGATATATTTTGaa < 2:722060/131‑1 (MQ=255)
aGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGATATATTTTGaa > 1:722060/1‑131 (MQ=255)
aGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGt > 2:521635/1‑140 (MQ=255)
aGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGt > 1:1097400/1‑140 (MQ=255)
aGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTCTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGt > 2:544952/1‑140 (MQ=255)
ttgcttgcCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCAt < 1:641823/140‑1 (MQ=255)
gcttgcCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTa < 2:412727/140‑1 (MQ=255)
gcttgcCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTa < 1:712209/140‑1 (MQ=255)
gcttgcCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTCCGACGCGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTa > 2:144790/1‑140 (MQ=255)
ttgcCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTaaa < 2:1016385/140‑1 (MQ=255)
ttgcCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTaaa < 2:1564554/140‑1 (MQ=255)
cccTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCa > 2:2078597/1‑140 (MQ=255)
cccTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCa > 1:1001854/1‑140 (MQ=255)
cccTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCa > 1:694383/1‑140 (MQ=255)
cccTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCa > 1:1713324/1‑140 (MQ=255)
cccTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCa > 2:515851/1‑140 (MQ=255)
ccTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCAt < 1:911020/140‑1 (MQ=255)
aaaTTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCa < 2:256433/139‑1 (MQ=255)
aaTTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAg < 2:103037/140‑1 (MQ=255)
ttGTTCAGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGCTGCAAAATAGAACAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGa < 1:2020557/140‑1 (MQ=255)
atGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGa < 2:90229/139‑1 (MQ=255)
tGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGAt < 2:1097400/140‑1 (MQ=255)
tGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGAt < 2:1667947/140‑1 (MQ=255)
gCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGa > 2:1225044/1‑140 (MQ=255)
gCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGa > 1:1148060/1‑140 (MQ=255)
cccGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGatatt > 2:1953162/1‑139 (MQ=255)
cccGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATg < 1:1215563/140‑1 (MQ=255)
cccGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATg > 2:1907299/1‑140 (MQ=255)
cGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAGTGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGTATGCGTGATATGTc > 2:1669861/1‑140 (MQ=255)
cGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTc > 2:1868407/1‑140 (MQ=255)
gCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCAt < 2:1386408/140‑1 (MQ=255)
gCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCAt < 1:2000129/140‑1 (MQ=255)
cTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATg < 1:1430988/140‑1 (MQ=255)
atAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATg < 2:152079/139‑1 (MQ=255)
aaaGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCg < 1:14277/140‑1 (MQ=255)
aGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGAt < 1:973175/140‑1 (MQ=255)
gCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGAtt > 2:1772993/1‑140 (MQ=255)
tGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTa < 1:1775726/140‑1 (MQ=255)
tGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTa < 2:1803038/140‑1 (MQ=255)
ccGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAAt < 2:1148060/140‑1 (MQ=255)
ccGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAAt < 1:1404046/140‑1 (MQ=255)
ccGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAAt < 1:701660/140‑1 (MQ=255)
ccGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAAt < 1:521635/140‑1 (MQ=255)
tCGACGACCGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTtctt > 2:438087/1‑139 (MQ=255)
cGAAACAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGa > 2:1114457/1‑140 (MQ=255)
aaCAAAAATGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCa < 1:2053174/140‑1 (MQ=255)
aaaTGGCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAAtt > 1:996082/1‑140 (MQ=255)
ggCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGa < 2:421703/140‑1 (MQ=255)
ggCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGa < 1:1114457/140‑1 (MQ=255)
ggCTAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGa < 1:1590072/140‑1 (MQ=255)
|
TGGTCCGATTAAGCAGGCTAACGCCAAGTTTCATCTCCAGCTTTTTCACCGCCCGGCTTACCGCTGAGTTTGCTTGCCCTAATTGTTCCGCTGCCCGGCTAAAGCTGCCGCTTTCGACGACCGAAACAAAAATGGCGAGTTCTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGA > NC_000913/230722‑230994
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
