Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
238,152 |
G→A |
intergenic (+32/+105) |
yafT → / ← ykfM |
lipoprotein YafT/uncharacterized protein YkfM |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 238,152 | 0 | G | A | 99.4%
| 577.2
/ ‑4.6
| 166 | intergenic (+32/+105) | yafT/ykfM | lipoprotein YafT/uncharacterized protein YkfM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (96/69); total (97/69) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
CAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAA > NC_000913/238015‑238287
|
cAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTggcagc > 1:171999/1‑140 (MQ=255)
aaTGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCaata < 2:1845821/140‑1 (MQ=255)
gTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAAtt > 1:216497/1‑140 (MQ=255)
gTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAAtt > 1:2073626/1‑140 (MQ=255)
gTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAAtt > 1:25235/1‑140 (MQ=255)
tACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTc > 1:539248/1‑140 (MQ=255)
cTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGc > 2:344095/1‑140 (MQ=255)
tGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCa > 1:2144161/1‑140 (MQ=255)
atGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAg > 1:1530984/1‑140 (MQ=255)
atGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTGAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAg > 2:1502563/1‑140 (MQ=255)
aCAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGaaa < 1:1954355/140‑1 (MQ=255)
agagCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAAtt > 1:56318/1‑140 (MQ=255)
gagCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAAttt > 1:725203/1‑140 (MQ=255)
gagCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAAttt > 1:244894/1‑140 (MQ=255)
agcagcAAATCATGCAACTTAAGCAAACGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAAtttt > 2:482130/1‑140 (MQ=255)
agcagcAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAAtttt > 2:53636/1‑140 (MQ=255)
agcagcAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAAtttt > 1:728811/1‑140 (MQ=255)
gcagcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGTATAAGAAAttttt > 2:2035925/1‑140 (MQ=255)
gcagcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAAttttt > 2:1642469/1‑140 (MQ=255)
gcagcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAAttttt > 2:1526693/1‑140 (MQ=255)
gcagcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAAttttt > 2:725968/1‑140 (MQ=255)
gcagcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAAttttt > 1:895629/1‑140 (MQ=255)
gcagcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAAttttt > 2:776620/1‑140 (MQ=255)
cagcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTc < 1:1807067/140‑1 (MQ=255)
cagcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTc > 1:1892798/1‑140 (MQ=255)
cagcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTc < 1:1846609/140‑1 (MQ=255)
cagcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTc < 2:1474031/140‑1 (MQ=255)
agcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCt > 2:1072161/1‑140 (MQ=255)
caAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTg > 2:1271668/1‑140 (MQ=255)
aaTCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGAc < 1:983311/140‑1 (MQ=255)
aTGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGA‑GGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGa < 1:1265985/140‑1 (MQ=255)
tGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGa < 2:1056747/140‑1 (MQ=255)
tGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGa < 1:959148/140‑1 (MQ=255)
tGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGa > 1:977245/1‑140 (MQ=255)
tGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGa < 2:1947014/140‑1 (MQ=255)
tGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGa < 2:25235/140‑1 (MQ=255)
tGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGa > 2:982396/1‑140 (MQ=255)
tGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGa < 1:12097/140‑1 (MQ=255)
tGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGa < 1:389962/140‑1 (MQ=255)
tGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGa < 1:1358810/140‑1 (MQ=255)
tGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGa < 1:1433884/140‑1 (MQ=255)
gCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGa < 1:2136397/140‑1 (MQ=255)
gCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGa > 1:102401/1‑140 (MQ=255)
acAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGa < 2:1832847/139‑1 (MQ=255)
cAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGaa < 2:964902/140‑1 (MQ=255)
aGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACa > 1:671924/1‑127 (MQ=255)
aGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACa < 2:671924/127‑1 (MQ=255)
aGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGa > 2:721864/1‑140 (MQ=255)
ataAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATTAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGa > 2:828835/1‑140 (MQ=255)
ataAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGa > 1:692826/1‑140 (MQ=255)
cGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCgg > 1:39121/1‑140 (MQ=255)
cGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCgg > 1:1732986/1‑140 (MQ=255)
cGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCgg > 1:587103/1‑140 (MQ=255)
gATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGa > 2:1002430/1‑140 (MQ=255)
aTGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATACTAAATTATATCTGCCGCCAGGACTTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAg > 2:1533531/1‑140 (MQ=255)
aTGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGat > 2:1966742/1‑139 (MQ=255)
tGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGt > 2:586836/1‑140 (MQ=255)
aaGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTaaaaa < 2:932033/140‑1 (MQ=255)
tttGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgt < 1:191846/140‑1 (MQ=255)
tttGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgt < 1:2121307/140‑1 (MQ=255)
ttGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgtt < 2:1295775/140‑1 (MQ=255)
ggTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgtttt > 2:157987/1‑139 (MQ=255)
aCCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTa < 2:1403584/140‑1 (MQ=255)
ccGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAg > 2:1803300/1‑140 (MQ=255)
cGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGTAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGa > 1:1470566/1‑140 (MQ=255)
aTCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAatat > 2:1972391/1‑140 (MQ=255)
cAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATAttt < 1:2076764/140‑1 (MQ=255)
cAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATAttt < 2:2109091/140‑1 (MQ=255)
aaataatAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATAttt < 2:587103/139‑1 (MQ=255)
ataataAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTaa > 1:1595442/1‑140 (MQ=255)
taataaATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAat < 1:482130/140‑1 (MQ=255)
aTTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTa < 2:162725/140‑1 (MQ=255)
aTTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTa > 2:802242/1‑140 (MQ=255)
aTTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTa > 2:421357/1‑140 (MQ=255)
aTTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTa > 1:2030646/1‑140 (MQ=255)
aTTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTa > 1:855393/1‑140 (MQ=255)
aTTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTa > 1:1496096/1‑140 (MQ=255)
tataTCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAAc > 2:1853619/1‑140 (MQ=255)
tataTCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAAc > 2:1592022/1‑140 (MQ=255)
atatCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAAct < 2:244894/140‑1 (MQ=255)
tatCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAActg > 1:184560/1‑140 (MQ=255)
gccgccAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGaa > 1:1136544/1‑140 (MQ=255)
gccgccAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGaa > 1:2144076/1‑140 (MQ=255)
gccgccAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGaa > 1:1512763/1‑140 (MQ=255)
ccgccAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAAt > 1:293245/1‑140 (MQ=255)
cgccAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAAtt > 2:107484/1‑139 (MQ=255)
cgccAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATc > 1:759948/1‑140 (MQ=255)
cgccAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATc > 1:1550351/1‑140 (MQ=255)
cgccAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATc > 1:1089983/1‑140 (MQ=255)
gccAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCt > 2:42538/1‑140 (MQ=255)
cAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAG‑AAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTcc > 1:1071433/1‑140 (MQ=255)
aGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTcc < 1:1629319/140‑1 (MQ=255)
gAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCtt < 2:1530984/140‑1 (MQ=255)
tttCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCg < 2:113202/140‑1 (MQ=255)
tttCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCg < 1:1362117/140‑1 (MQ=255)
ttCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCga < 2:2067012/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCgag < 1:959771/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCgag < 2:1259872/140‑1 (MQ=255)
cTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCgaga > 2:84048/1‑140 (MQ=255)
tGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGaa < 2:923462/140‑1 (MQ=255)
|
CAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAA > NC_000913/238015‑238287
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
