Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
601,449 |
C→A |
I912I (ATC→ATA) |
cusA → |
copper/silver export system RND permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 601,449 | 0 | C | A | 100.0%
| 501.9
/ NA
| 145 | I912I (ATC→ATA) | cusA | copper/silver export system RND permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (76/69); total (76/69) |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
GCGCCAACCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATCT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTCACGCCATAGAGGCCGTGCCGTCG > NC_000913/601313‑601584
|
gcgcCAACCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑gg < 2:325984/140‑1 (MQ=255)
cgcCAACCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGt > 2:2138197/1‑140 (MQ=255)
cgcCAACCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGt > 1:721112/1‑140 (MQ=255)
ccAACCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTg < 1:2096732/140‑1 (MQ=255)
ccAACCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTg > 1:1223633/1‑140 (MQ=255)
ccAACCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTg < 1:642154/140‑1 (MQ=255)
ccAACCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTg < 1:1499347/140‑1 (MQ=255)
cAACCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGc > 1:1737293/1‑140 (MQ=255)
aCCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCtt > 2:619813/1‑139 (MQ=255)
aCCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCtg < 1:1296638/140‑1 (MQ=255)
aCCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCtg > 2:1351193/1‑140 (MQ=255)
aCCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCtg < 2:657345/140‑1 (MQ=255)
ccATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCtgt < 1:1070694/140‑1 (MQ=255)
cATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCtgtg < 1:656105/140‑1 (MQ=255)
aaGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTgtggtg > 1:1547502/1‑140 (MQ=255)
cTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGAt < 2:1136453/140‑1 (MQ=255)
cTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGAt < 2:1538206/140‑1 (MQ=255)
aaCTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGc > 2:1020222/1‑140 (MQ=255)
aaCTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGc > 2:1586547/1‑140 (MQ=255)
aTGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTct > 2:149896/1‑139 (MQ=255)
aTGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCa > 1:1589111/1‑140 (MQ=255)
tGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCAt > 2:122385/1‑140 (MQ=255)
tGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCAt > 2:856767/1‑140 (MQ=255)
ggTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCAtt > 2:1140225/1‑139 (MQ=255)
cGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATATGGGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTc > 2:685084/1‑140 (MQ=255)
gATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCg < 1:2138197/140‑1 (MQ=255)
gATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCg > 2:1500241/1‑140 (MQ=255)
tGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTg < 1:1140225/140‑1 (MQ=255)
tGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTg > 2:44901/1‑140 (MQ=255)
tGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTg < 2:1708707/140‑1 (MQ=255)
gTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGa < 2:1589111/140‑1 (MQ=255)
gTTGAGGATTATCTCAGTCCTGTTGTATCTAGCGTTCCGCCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATAAGCTGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAC‑GGTTGCGGTGGTGGATGGGCATTCATCTTTCCGTGGCgc < 2:1089415/140‑2 (MQ=255)
tATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTg > 2:1731184/1‑140 (MQ=255)
tATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTg > 1:907794/1‑140 (MQ=255)
tCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGc > 2:230029/1‑140 (MQ=255)
tCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCttt > 2:349239/1‑140 (MQ=255)
tCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCttt > 1:657755/1‑140 (MQ=255)
tCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCttt > 2:683276/1‑140 (MQ=255)
cGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTa > 1:739896/1‑140 (MQ=255)
cGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTa < 1:184512/140‑1 (MQ=255)
cGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTa < 1:2053372/140‑1 (MQ=255)
tGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATc > 1:1352347/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATc > 2:1873827/1‑140 (MQ=255)
tgttgtATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGcc < 1:856767/140‑1 (MQ=255)
ttgtATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCt > 2:303559/1‑140 (MQ=255)
tgtATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTc > 1:2071136/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATATGGGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGcc < 1:685084/140‑1 (MQ=255)
cGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCCTAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCCCCgtgtac > 2:1193799/1‑135 (MQ=255)
cGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTc > 1:17739/1‑140 (MQ=255)
cGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTc > 1:606567/1‑140 (MQ=255)
cGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTc > 2:1688482/1‑140 (MQ=255)
cGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTc > 2:1434932/1‑140 (MQ=255)
cGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTc > 1:1298393/1‑140 (MQ=255)
cGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGACACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTc > 2:1557100/1‑140 (MQ=255)
gTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTcg < 2:907794/140‑1 (MQ=255)
cGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTcgccgc < 1:1710728/140‑1 (MQ=255)
ggTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAAt < 1:349239/140‑1 (MQ=255)
ggCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTgg < 1:1873827/140‑1 (MQ=255)
ggAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCg < 2:753773/139‑1 (MQ=255)
cGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCg < 1:1859429/140‑1 (MQ=255)
cGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTCGGCg < 1:574268/140‑1 (MQ=255)
aGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCgtgg < 1:230029/140‑1 (MQ=255)
aGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCgtgg < 1:303559/140‑1 (MQ=255)
aGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAC‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCgtgg < 1:1708839/140‑1 (MQ=255)
aGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGCACCGTTTGCGCTGGGGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCgtgg > 1:1662510/1‑140 (MQ=255)
cGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCgtggtt > 2:953639/1‑139 (MQ=255)
cGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCgtggtg < 2:1298393/140‑1 (MQ=255)
ttGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGAt < 2:171884/140‑1 (MQ=255)
tGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATg < 1:1586547/140‑1 (MQ=255)
tGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATg < 1:1187965/140‑1 (MQ=255)
tGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATg < 2:2094445/140‑1 (MQ=255)
cTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCt < 2:594581/140‑1 (MQ=255)
cTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCt < 2:657755/140‑1 (MQ=255)
aTTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGAt < 1:2000890/140‑1 (MQ=255)
aTTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGAt < 2:241216/140‑1 (MQ=255)
cagcagCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTAtt > 1:1344318/1‑140 (MQ=255)
cagcagCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTAtt > 1:438368/1‑140 (MQ=255)
cagcGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTAc > 2:1422214/1‑140 (MQ=255)
agcGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACg < 2:1344318/140‑1 (MQ=255)
agcGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACg < 1:1731184/140‑1 (MQ=255)
agcGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACg < 1:328797/140‑1 (MQ=255)
agcGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACg < 1:683276/140‑1 (MQ=255)
gcGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGt < 2:1746945/140‑1 (MQ=255)
gcGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGt < 1:1800527/140‑1 (MQ=255)
gcGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGt > 2:1190992/1‑140 (MQ=255)
gcGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGACGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGt < 1:819704/140‑1 (MQ=255)
cGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTc < 1:1405817/140‑1 (MQ=255)
cGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTc > 1:913217/1‑140 (MQ=255)
cGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTc > 1:163931/1‑140 (MQ=255)
tACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTCAc > 2:82931/1‑140 (MQ=255)
tACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTCAc < 1:100437/140‑1 (MQ=255)
tACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTCAc < 1:953639/140‑1 (MQ=255)
tttGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACg > 1:287103/1‑131 (MQ=255)
tttGCGCTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACg < 2:287103/131‑1 (MQ=255)
gcgcTGGTGGGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTCACGCCATaga > 1:233671/1‑140 (MQ=255)
ggtggGCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTCACGCCATAGAGgccg > 2:1981380/1‑140 (MQ=255)
ttggcggcATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTCACGCCATAGAGgccgtg < 2:438164/138‑1 (MQ=255)
gggCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTCACGCCATAGAGgccgtgc < 1:1434932/140‑1 (MQ=255)
gggCGGCATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTCACGCCATAGAGgccgtgc < 2:766645/140‑1 (MQ=255)
gcATAT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCAAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTCACGCCATAGAGGCCGTGCcgtcg < 2:1798558/140‑1 (MQ=255)
|
GCGCCAACCATAAGCTTAAACTCATGGTGCCGATGACGTTGATGATTATCTTCGTGCTGTTGTATCTGGCGTTCCGTCGGGTGGGCGAAGCGTTGCTGATTATCAGCAGCGTACCGTTTGCGCTGGTGGGCGGCATCT‑GGTTGCTGTGGTGGATGGGCTTTCATCTTTCCGTGGCGACGGGCACTGGCTTTATCGCCCTCGCCGGGGTCGCCGCCGAATTTGGCGTGGTGATGCTGATGTATTTACGTCACGCCATAGAGGCCGTGCCGTCG > NC_000913/601313‑601584
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
