Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
637,053 |
G→T |
T189N (ACT→AAT) |
ybdO ← |
putative LysR family DNA‑binding transcriptional regulator YbdO |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 637,053 | 0 | G | T | 100.0%
| 613.8
/ NA
| 175 | T189N (ACT→AAT) | ybdO | putative LysR family DNA‑binding transcriptional regulator YbdO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (79/96); total (79/96) |
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
ATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAA > NC_000913/636918‑637189
|
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aTTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCt < 2:1497256/140‑1 (MQ=255)
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ttGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTa > 1:263510/1‑140 (MQ=255)
tGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTAt > 2:1333598/1‑140 (MQ=255)
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tGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTAt > 1:2008070/1‑140 (MQ=255)
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tCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTAttt > 2:923808/1‑139 (MQ=255)
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tCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTg > 1:1394669/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTg > 1:1555288/1‑140 (MQ=255)
aGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTc > 2:1676186/1‑140 (MQ=255)
aGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTc > 2:1233126/1‑140 (MQ=255)
aGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTc > 1:940028/1‑140 (MQ=255)
cAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAg < 1:425138/140‑1 (MQ=255)
cAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAg < 1:748503/140‑1 (MQ=255)
cAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAg < 1:135291/140‑1 (MQ=255)
aaaaGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAg < 2:89340/139‑1 (MQ=255)
aaGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTa > 2:1329813/1‑140 (MQ=255)
agagGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTaa > 1:1752557/1‑140 (MQ=255)
agagGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTaa > 2:1033555/1‑140 (MQ=255)
ggAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCACCCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTc < 1:607911/140‑1 (MQ=255)
ccACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTgg < 1:1330165/140‑1 (MQ=255)
ccACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTgg < 2:1058434/140‑1 (MQ=255)
ccACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTgg < 2:370339/140‑1 (MQ=255)
ccACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTgg < 1:123027/140‑1 (MQ=255)
ccACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTgg < 2:1591787/140‑1 (MQ=255)
ccACGAAATGAGATTCAGCGATGCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTgg < 2:1275928/140‑1 (MQ=255)
acACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAACTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTgg < 2:1615188/139‑1 (MQ=255)
aCGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGAt < 1:1042681/140‑1 (MQ=255)
aCGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGAt < 1:907974/140‑1 (MQ=255)
cGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATg < 1:1846974/140‑1 (MQ=255)
tGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTAt < 2:2109857/140‑1 (MQ=255)
tGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTAt < 1:519095/140‑1 (MQ=255)
tGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTAt < 1:1640907/140‑1 (MQ=255)
aTTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATtact > 1:1682574/1‑140 (MQ=255)
ttttGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATtacta < 2:13522/140‑1 (MQ=255)
ttttGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATtacta < 1:1864366/140‑1 (MQ=255)
ttttGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATtacta < 1:89561/140‑1 (MQ=255)
ttGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACa < 1:787839/140‑1 (MQ=255)
ttGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACa < 2:1454433/140‑1 (MQ=255)
aTTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTa < 2:1408201/140‑1 (MQ=255)
aTCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTAttt > 2:234052/1‑139 (MQ=255)
ctcGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGaa < 2:102786/140‑1 (MQ=255)
tcGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAAt > 2:1380922/1‑140 (MQ=255)
tcGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAAt > 1:1754220/1‑140 (MQ=255)
cGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATc < 2:1139923/140‑1 (MQ=255)
tCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGt > 1:1091974/1‑140 (MQ=255)
tATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTAt > 2:2097079/1‑140 (MQ=255)
tttCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGc > 2:519488/1‑140 (MQ=255)
cATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATg < 2:1968517/140‑1 (MQ=255)
cATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATg < 1:234052/140‑1 (MQ=255)
aTTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATgg < 2:1750721/140‑1 (MQ=255)
aTTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATgg > 1:1629098/1‑140 (MQ=255)
tttGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGc > 1:406933/1‑140 (MQ=255)
atatCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCa < 2:2095931/140‑1 (MQ=255)
atcaACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGTACTTTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGTTATTTTCAGTAATTCGTGGTTGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGATTCGTATTCAATGGCATGCAAATgt > 2:1086450/1‑139 (MQ=255)
aaCCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACgg < 2:108439/140‑1 (MQ=255)
aCCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGa > 1:436556/1‑140 (MQ=255)
aCCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGa > 1:934427/1‑140 (MQ=255)
tgctgATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGc > 2:299601/1‑140 (MQ=255)
gctgATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCt < 2:1754220/140‑1 (MQ=255)
ctgATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTg > 1:1979898/1‑140 (MQ=255)
aTTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATc > 2:1252867/1‑140 (MQ=255)
ttAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCAc < 1:334046/140‑1 (MQ=255)
ttAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCAc < 2:1905500/140‑1 (MQ=255)
ttAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCAc < 1:1259372/140‑1 (MQ=255)
ttAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCAc < 1:1248362/140‑1 (MQ=255)
tAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCAttt > 1:638379/1‑140 (MQ=255)
aTTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTgg > 2:678826/1‑140 (MQ=255)
aTTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTgg > 2:104962/1‑140 (MQ=255)
aTTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTgg < 2:491853/140‑1 (MQ=255)
aTTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTgg < 2:186404/140‑1 (MQ=255)
tGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGt < 1:299601/140‑1 (MQ=255)
ggTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGa > 1:581929/1‑140 (MQ=255)
tGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATc > 2:1169549/1‑140 (MQ=255)
aaCTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCAc > 2:1713403/1‑140 (MQ=255)
aCTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCAcc > 2:1952056/1‑140 (MQ=255)
ttctGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGAt < 1:1089600/140‑1 (MQ=255)
ttctGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGAt < 1:1057198/140‑1 (MQ=255)
ttctGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGAt < 2:1629098/140‑1 (MQ=255)
tctGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATc > 2:1308637/1‑140 (MQ=255)
tctGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATc > 2:1014720/1‑140 (MQ=255)
ctGCCATAATTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCg > 1:2104739/1‑140 (MQ=255)
aaTTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGc < 2:636881/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCg > 2:2125180/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCg > 2:1219993/1‑140 (MQ=255)
tttGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCgg < 1:1169549/140‑1 (MQ=255)
tGTTCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTg < 1:2143579/140‑1 (MQ=255)
ttCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGaa > 1:1234952/1‑140 (MQ=255)
ttCATAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGaa > 1:1086423/1‑140 (MQ=255)
aaTAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAAcc < 2:220023/139‑1 (MQ=255)
tAATTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCaa < 1:236324/140‑1 (MQ=255)
|
ATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCTGATTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAA > NC_000913/636918‑637189
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
