Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
895,847 |
C→A |
S286* (TCG→TAG) |
potG → |
putrescine ABC transporter ATP binding subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 895,847 | 0 | C | A | 100.0%
| 328.7
/ NA
| 103 | S286* (TCG→TAG) | potG | putrescine ABC transporter ATP binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (57/46); total (57/46) |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCTTTCGGT > NC_000913/895710‑895982
|
tCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAgg < 1:261644/140‑1 (MQ=255)
tCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAgg > 1:1279435/1‑140 (MQ=255)
tCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAgg > 1:1337973/1‑140 (MQ=255)
tCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAgg > 2:1353742/1‑140 (MQ=255)
tCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAgg > 1:982861/1‑140 (MQ=255)
tCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAgg > 1:1501432/1‑140 (MQ=255)
ccGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAggg > 1:87696/1‑139 (MQ=255)
ccGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGGAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTACATCCACTGCAAGTCGACGCGGATGCCTAggt > 1:997333/1‑140 (MQ=255)
tACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTct > 2:590721/1‑139 (MQ=255)
gCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAAc > 2:764862/1‑140 (MQ=255)
cTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACg < 1:1100236/140‑1 (MQ=255)
tataGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGt < 2:1889940/140‑1 (MQ=255)
ataGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCTAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTg < 2:1271377/140‑1 (MQ=255)
ataGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTg < 1:98126/140‑1 (MQ=255)
aGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTAGTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACg > 2:1023269/1‑136 (MQ=255)
aGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTAGTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACg < 1:1023269/136‑1 (MQ=255)
aGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGcc < 2:1337973/140‑1 (MQ=255)
cgcCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCgg > 1:2071691/1‑140 (MQ=255)
cgcCGAATTTATTGGCTCGGGAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCgg > 2:1225116/1‑140 (MQ=255)
gcCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGt < 1:68688/140‑1 (MQ=255)
cGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTAc > 1:1063804/1‑140 (MQ=255)
aaTTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACAt > 2:357657/1‑140 (MQ=255)
aaTTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACAt > 1:2054831/1‑140 (MQ=255)
aTTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACAtg < 1:271068/140‑1 (MQ=255)
aTTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACAtg < 1:896189/140‑1 (MQ=255)
tttATTGGCTCCGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCCGTACAtgt > 2:1905576/1‑140 (MQ=255)
ttGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGgcg < 2:22992/140‑1 (MQ=255)
gTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGccc > 2:1234562/1‑140 (MQ=255)
cGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGaaa < 1:1905576/140‑1 (MQ=255)
tttGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAAt > 2:1549930/1‑140 (MQ=255)
tttGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAAt > 2:96070/1‑140 (MQ=255)
tttGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAAt > 1:1831443/1‑140 (MQ=255)
tttGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAAt > 1:308115/1‑140 (MQ=255)
tGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCa > 2:1984391/1‑140 (MQ=255)
tGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCa > 2:1112039/1‑140 (MQ=255)
tGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCa > 2:83655/1‑140 (MQ=255)
tGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCa > 2:497864/1‑140 (MQ=255)
gAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCAt < 1:1112039/140‑1 (MQ=255)
cGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCttt > 1:408072/1‑140 (MQ=255)
gTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTg > 2:1065550/1‑140 (MQ=255)
aCTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCg > 1:550441/1‑140 (MQ=255)
tCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGaa < 1:357657/140‑1 (MQ=255)
aaaGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAaga > 1:599267/1‑140 (MQ=255)
agagCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGTATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAgc > 2:436150/1‑140 (MQ=255)
gagCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAagagtc > 1:892669/1‑138 (MQ=255)
gCGTAAGGAAGATGGCCTGGTGTTTGATTCGCGGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTGGGGGGTCGAAAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAgccgc < 2:781106/140‑1 (MQ=255)
gCGTAAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCGGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGAAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAgccgc < 2:1497132/140‑1 (MQ=255)
cGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAgccgcc > 2:609415/1‑140 (MQ=255)
cGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAgccgcc > 2:306044/1‑140 (MQ=255)
cGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAgccgcc > 1:233612/1‑140 (MQ=255)
cGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAgccgcc > 2:1232282/1‑140 (MQ=255)
cGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAgccgcc > 2:856810/1‑140 (MQ=255)
cGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAgccgcc > 2:4493/1‑140 (MQ=255)
cGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAgccgcc > 2:2035845/1‑140 (MQ=255)
cGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAgccgcc > 1:662446/1‑140 (MQ=255)
ggAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCa < 1:590721/140‑1 (MQ=255)
ggAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCa < 1:1232282/140‑1 (MQ=255)
ggAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGAAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCa < 2:982861/140‑1 (MQ=255)
aaGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAAt < 2:1452370/140‑1 (MQ=255)
aaGATGGCCGGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTCCAACCACTGAAAGCCGAAGCGGATGCCTAGGTGGTCGATACCGTGCCGGTACATGTGGCGTTGCGACCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAAt < 2:408072/140‑1 (MQ=255)
gATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATgg > 1:635434/1‑140 (MQ=255)
ggCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTg < 1:431227/140‑1 (MQ=255)
ggTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACt > 2:280304/1‑140 (MQ=255)
tGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTc > 1:516969/1‑140 (MQ=255)
tGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCgg > 1:1460687/1‑140 (MQ=255)
tGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCgg > 1:1432965/1‑140 (MQ=255)
tCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTggg < 1:96070/140‑1 (MQ=255)
tCGCCGGGGCTGGTGCACCCCCTAAAAGTCGACGCGGATGCTTAGGTGGTCGATACTGTGCCGGAACATGGGGCGCAGAGCCCGGAAAAAACCATGCTTGGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTggg < 2:308115/140‑1 (MQ=255)
gcgggggCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCGGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTggggg < 2:1689109/137‑1 (MQ=255)
gCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTggggg > 2:454026/1‑140 (MQ=255)
gCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTggggg < 1:1488518/140‑1 (MQ=255)
gCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTggggg < 1:306044/140‑1 (MQ=255)
gCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTggggg < 1:575498/140‑1 (MQ=255)
cGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAg < 1:2113874/140‑1 (MQ=255)
cGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAg < 1:856810/140‑1 (MQ=255)
cGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAg < 1:1549930/140‑1 (MQ=255)
cGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAg < 1:454026/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGTGGTGGGGGAGGTGa < 1:609415/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATATGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAg > 2:971603/1‑136 (MQ=255)
gCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATATGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAg < 1:971603/136‑1 (MQ=255)
cTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGAt < 1:1353742/140‑1 (MQ=255)
cTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGAt < 2:1460687/140‑1 (MQ=255)
tGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATacac > 2:133951/1‑140 (MQ=255)
gCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATAcaca < 1:133951/140‑1 (MQ=255)
aTCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACAtt < 1:835599/140‑1 (MQ=255)
ccACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGc > 2:530109/1‑140 (MQ=255)
aCTGAAAGTCTACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGCGGGGTAGGTGATACACATTGCCt > 2:136705/1‑140 (MQ=255)
tGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTAt > 2:1373498/1‑140 (MQ=255)
tGAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTAt > 2:885086/1‑140 (MQ=255)
gAAAGTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTAtc > 1:187639/1‑140 (MQ=255)
gTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCgg < 1:1234562/140‑1 (MQ=255)
gTCGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCgg < 2:918211/140‑1 (MQ=255)
gTCGACGCGGATGCATAGGTGGTGGATAACGTGCCGTTACATGGGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTGGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCgg < 2:687581/140‑1 (MQ=255)
cGACGCGGATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCg > 1:353069/1‑140 (MQ=255)
ggATGCCTGGGGGGTCGATAACGGGCCGGTACATGGGGCGGTGCGCCGGGAAAAAATCAGGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCttt < 2:187639/140‑1 (MQ=255)
gATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCTTTc < 1:588784/140‑1 (MQ=255)
gATGCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCTTTc > 1:671857/1‑140 (MQ=255)
aagCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGGGGCGCTGCGCCCGAAAAAAATCATGTTTTGCGAGGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCTTTCg < 2:319854/138‑1 (MQ=255)
gCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCTTTCGgt < 1:83655/140‑1 (MQ=255)
gCCTAGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCTTTCGgt < 2:1432965/140‑1 (MQ=255)
|
TCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGTAAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCGAAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCTTTCGGT > NC_000913/895710‑895982
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
