Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
954,667 |
C→A |
intergenic (‑201/+205) |
focA ← / ← ycaO |
formate channel FocA/ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor YcaO |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 954,667 | 0 | C | A | 100.0%
| 633.4
/ NA
| 181 | intergenic (‑201/+205) | focA/ycaO | formate channel FocA/ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor YcaO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (78/103); total (78/103) |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
ATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTAAAGCGGGGC > NC_000913/954532‑954803
|
ataGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTa < 2:1329441/140‑1 (MQ=255)
gATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTaaaa > 2:1472813/1‑140 (MQ=255)
aTCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAAc > 2:426382/1‑140 (MQ=255)
aTCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAAc < 2:1146237/140‑1 (MQ=255)
aTCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAAc > 1:215513/1‑140 (MQ=255)
tCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACa > 1:1432752/1‑140 (MQ=255)
cATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAg < 1:467725/140‑1 (MQ=255)
tatCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGtt > 1:385165/1‑140 (MQ=255)
tatCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGtt > 1:2052245/1‑140 (MQ=255)
tatCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGtt > 1:1703813/1‑140 (MQ=255)
aatCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGtt < 2:1701701/139‑1 (MQ=255)
atCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGtta > 1:1005840/1‑140 (MQ=255)
atCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGtta > 1:642732/1‑140 (MQ=255)
ctcGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGttaat > 1:338242/1‑140 (MQ=255)
cGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGttaatta < 2:1674645/140‑1 (MQ=255)
gCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGttaattaa > 2:273398/1‑140 (MQ=255)
gCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGttaattaa > 2:391767/1‑140 (MQ=255)
gCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGttaattaa > 2:1873260/1‑140 (MQ=255)
gCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGttaattaa > 2:1396821/1‑140 (MQ=255)
ccTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTaaa < 2:872431/140‑1 (MQ=255)
ccTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTaaa < 2:1296416/140‑1 (MQ=255)
cTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTaaaa > 1:1989094/1‑140 (MQ=255)
tGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAg < 2:1005840/140‑1 (MQ=255)
ggCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAgg < 1:1920991/140‑1 (MQ=255)
gCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGtt > 1:120514/1‑129 (MQ=255)
gCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAggg > 1:210651/1‑140 (MQ=255)
gCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAggg > 2:1259226/1‑140 (MQ=255)
gCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAggg > 1:964883/1‑140 (MQ=255)
gCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAggg > 1:743519/1‑140 (MQ=255)
taGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCAt < 1:1779703/140‑1 (MQ=255)
taGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCAt < 2:215513/140‑1 (MQ=255)
gCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAg < 2:1920101/140‑1 (MQ=255)
cgaatcTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTGGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGACg > 2:742407/6‑140 (MQ=255)
cGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCg > 2:1786288/1‑140 (MQ=255)
cGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCg > 1:1364797/1‑140 (MQ=255)
cGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCg > 2:1061620/1‑140 (MQ=255)
tAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGaa < 1:1083161/140‑1 (MQ=255)
tAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGaa > 1:1743642/1‑140 (MQ=255)
cTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATaa < 2:306145/140‑1 (MQ=255)
tCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATaaa < 1:1630695/140‑1 (MQ=255)
gCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGt < 2:557074/140‑1 (MQ=255)
gCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGt > 1:682329/1‑140 (MQ=255)
cATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTa > 2:828306/1‑140 (MQ=255)
aTGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTaa < 1:1305265/140‑1 (MQ=255)
aTGGTTTTTATGCAAATACGGAGT‑AATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAAc < 1:1933653/140‑1 (MQ=255)
tttATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAatat < 1:1795215/140‑1 (MQ=255)
tttATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAatat < 1:1396821/140‑1 (MQ=255)
aTGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATatcga < 1:921187/140‑1 (MQ=255)
aaTACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGta > 1:1853394/1‑140 (MQ=255)
aaTACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGta > 1:505108/1‑140 (MQ=255)
aatcGGAGTAAATATTTGATTACCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAACGAGATGAATTTTTTTCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGtat < 1:273398/137‑1 (MQ=255)
aTACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGtat < 1:1881428/140‑1 (MQ=255)
gAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGtatttatt < 2:1484423/140‑1 (MQ=255)
aGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATttatta > 2:492774/1‑140 (MQ=255)
tAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTaaa < 1:1689912/140‑1 (MQ=255)
aaaTATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAAt > 1:2094686/1‑140 (MQ=255)
atatTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATAc > 2:375725/1‑140 (MQ=255)
tGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAAtt > 2:1483890/1‑140 (MQ=255)
tGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAAtt > 2:587952/1‑140 (MQ=255)
tGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAAtt > 1:859495/1‑140 (MQ=255)
tGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAAtt > 2:1950509/1‑140 (MQ=255)
tGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAAtt > 2:700656/1‑140 (MQ=255)
aTTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTAc < 1:1466495/140‑1 (MQ=255)
aTTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTAc > 2:1842274/1‑140 (MQ=255)
aTTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTAc < 1:8456/140‑1 (MQ=255)
aTTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTAc < 1:828306/140‑1 (MQ=255)
ttATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTAcc < 1:1662299/140‑1 (MQ=255)
ttATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTAcc < 1:1494415/140‑1 (MQ=255)
ttATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTAcc < 1:627922/140‑1 (MQ=255)
atATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTAcc < 2:949243/139‑1 (MQ=255)
tCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGat > 2:642684/1‑140 (MQ=255)
tCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGat > 1:1765744/1‑140 (MQ=255)
aaataaaaataaATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATAtt < 2:1432752/140‑1 (MQ=255)
aataaaaataaaTTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATAttt < 2:1482235/140‑1 (MQ=255)
atTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAAt < 1:66120/140‑1 (MQ=255)
atTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAAt < 1:1483890/140‑1 (MQ=255)
tAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACa < 1:298769/140‑1 (MQ=255)
tAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACa < 2:333690/140‑1 (MQ=255)
aTTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAattat < 1:123551/140‑1 (MQ=255)
cAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATAAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAAttattttat < 1:563199/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAAttattttatt < 2:1364797/140‑1 (MQ=255)
tGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAAt < 2:2094686/140‑1 (MQ=255)
tGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAAt < 1:1287454/140‑1 (MQ=255)
gAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATg < 2:964883/140‑1 (MQ=255)
gAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATg < 2:120420/140‑1 (MQ=255)
gAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATg < 1:700656/140‑1 (MQ=255)
gAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATg < 1:1011712/140‑1 (MQ=255)
gTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCa < 2:1307142/140‑1 (MQ=255)
gTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCa < 1:1290675/140‑1 (MQ=255)
gTTGAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCa < 1:1061620/140‑1 (MQ=255)
gAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAat < 2:225524/140‑1 (MQ=255)
gAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAat < 2:2052245/140‑1 (MQ=255)
gAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAat < 2:1765744/140‑1 (MQ=255)
gAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAat < 2:1336642/140‑1 (MQ=255)
gAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAat < 2:505108/140‑1 (MQ=255)
gAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAat < 2:104239/140‑1 (MQ=255)
gAATTTTTTCCGCATCCTCAGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAat < 2:694350/140‑1 (MQ=255)
cctcaGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTAAAGCgggg < 2:1992825/140‑1 (MQ=255)
ctcaGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTAAAGCGGGGc < 1:325791/140‑1 (MQ=255)
ctcaGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTAAAGCGGGGc > 1:1486494/1‑140 (MQ=255)
|
ATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTAAAGCGGGGC > NC_000913/954532‑954803
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
