Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F48 I1 R1
|
61 |
74.3 |
2613450 |
99.1% |
2589928 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
574,267 |
C→A |
G104G (GGC→GGA) |
ybcQ → |
DLP12 prophage; putative antitermination protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 574,267 | 0 | C | A | 100.0%
| 387.9
/ NA
| 112 | G104G (GGC→GGA) | ybcQ | DLP12 prophage; putative antitermination protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (59/53); total (59/53) |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
TCTGAAAAAGAACAACAGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAGGG > NC_000913/574132‑574403
|
tCTGAAAAAGAACAACAGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATaa > 1:1013084/1‑140 (MQ=255)
tCTGAAAAAGAACAACAGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATaa > 1:899579/1‑140 (MQ=255)
tCTGAAAAAGAACAACAGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATaa > 1:220658/1‑140 (MQ=255)
aaaaaGAACAACAGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGa < 2:641243/140‑1 (MQ=255)
aaaaaGAACAACAGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGa < 1:217541/140‑1 (MQ=255)
aaaaGAACAACAGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGaa < 1:926998/140‑1 (MQ=255)
aGAACAACAGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAggg < 2:1013084/140‑1 (MQ=255)
aGAACAACAGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAggg < 2:602892/140‑1 (MQ=255)
acaGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTa > 1:281731/1‑140 (MQ=255)
caGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTTCTTTTCTGATTGTTATATCGGGAAAAGGGTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAATGGATGttta > 2:380817/1‑138 (MQ=255)
caGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTaa < 2:1284238/140‑1 (MQ=255)
caGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACACTCATGTCACTGGCAGGTACGCATTGCTGCTCTCATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGCGAATAATTGAAGGGATGTTaa < 2:1225836/140‑1 (MQ=255)
aaGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTaa < 2:412500/139‑1 (MQ=255)
aaGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTaa < 2:45529/139‑1 (MQ=255)
gCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATg < 1:1035195/140‑1 (MQ=255)
gATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGatat < 1:380817/140‑1 (MQ=255)
gATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGatat < 1:669471/140‑1 (MQ=255)
tagATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTagag > 1:469466/1‑140 (MQ=255)
gATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGAt > 1:432137/1‑140 (MQ=255)
gATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGAt > 1:1196771/1‑140 (MQ=255)
gATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGAt > 1:799065/1‑140 (MQ=255)
gATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGGAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGAt > 2:1304234/1‑140 (MQ=255)
attattATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTTCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATg > 2:1089661/1‑140 (MQ=255)
ttatGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGata < 2:278649/140‑1 (MQ=255)
ttatGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGata < 1:747515/140‑1 (MQ=255)
tatGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGGAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGatat > 2:842759/1‑140 (MQ=255)
tGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCg > 1:152880/1‑140 (MQ=255)
aGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgttg > 1:529946/1‑140 (MQ=255)
aGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCg < 1:312153/137‑1 (MQ=255)
aGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCg > 2:312153/1‑137 (MQ=255)
tCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTTCAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgttgtt > 2:838161/1‑140 (MQ=255)
tCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGTTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgttgtt > 1:773642/1‑140 (MQ=255)
tCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGGGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATTGCATTAGGTATCCGGTTAGAGATGGATATCgttgtt > 1:1228219/1‑140 (MQ=255)
tCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATTCGGTTAGAGATGGATATCgttgtt > 1:102199/1‑140 (MQ=255)
tCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgttgtt > 1:709033/1‑140 (MQ=255)
tCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgttgtt > 2:1057956/1‑140 (MQ=255)
tCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgttgtt > 1:9465/1‑140 (MQ=255)
tCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgttgtt > 1:1139580/1‑140 (MQ=255)
ggTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTtaa < 2:152880/140‑1 (MQ=255)
ggTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCGCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTtaa > 1:1086809/1‑140 (MQ=255)
gTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTtaat < 1:1057956/140‑1 (MQ=255)
gTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTtaat < 1:838161/140‑1 (MQ=255)
tGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAAc < 1:397136/140‑1 (MQ=255)
tCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaat > 2:879408/1‑140 (MQ=255)
aTGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaatta > 2:1208225/1‑140 (MQ=255)
aTGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaatta > 1:8869/1‑140 (MQ=255)
tGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaattaa < 2:709033/140‑1 (MQ=255)
tGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaattaa < 2:799065/140‑1 (MQ=255)
gTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaattaat < 1:1089661/140‑1 (MQ=255)
gTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaattaat > 2:924194/1‑140 (MQ=255)
tGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGcc > 1:168601/1‑140 (MQ=255)
gTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGt > 2:368013/1‑140 (MQ=255)
cATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACt < 2:1150290/140‑1 (MQ=255)
ctgctCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTaaaaa > 2:732584/1‑140 (MQ=255)
ctGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAattatt > 1:692436/1‑140 (MQ=255)
aTGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTaaa > 2:1083344/1‑140 (MQ=255)
aTGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTaaa > 2:331786/1‑140 (MQ=255)
aTGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTaaa > 1:1009395/1‑140 (MQ=255)
gTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAAt < 1:1304234/140‑1 (MQ=255)
ttATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATg < 1:392317/140‑1 (MQ=255)
ttATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATg < 2:432137/140‑1 (MQ=255)
atatCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATggg < 2:123043/140‑1 (MQ=255)
atatCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATggg < 2:168601/140‑1 (MQ=255)
atCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGc > 1:1303671/1‑140 (MQ=255)
atCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGc > 1:1283803/1‑140 (MQ=255)
cGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGt > 2:109216/1‑140 (MQ=255)
cGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGt > 1:1282916/1‑140 (MQ=255)
cGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGt > 1:1304948/1‑140 (MQ=255)
ggAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTg > 1:754590/1‑140 (MQ=255)
gAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTga > 2:624718/1‑140 (MQ=255)
gAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTga > 2:1234935/1‑140 (MQ=255)
gAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTga > 2:716292/1‑140 (MQ=255)
aGGTTACAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACg < 2:51522/140‑1 (MQ=255)
aCAGAAGGCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGccccc < 1:842759/140‑1 (MQ=255)
gCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATa < 1:957127/140‑1 (MQ=255)
gCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATa < 2:1282916/140‑1 (MQ=255)
gCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATa < 1:1208225/140‑1 (MQ=255)
gCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATa > 1:1259966/1‑140 (MQ=255)
gCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATa > 2:1120508/1‑140 (MQ=255)
gCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATa < 1:233814/140‑1 (MQ=255)
gCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATa < 2:873475/140‑1 (MQ=255)
gCTGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATa < 1:716292/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATaaa < 1:1246893/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATaaa < 1:1234935/140‑1 (MQ=255)
aGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGTCGTTTAGACGCCCCCATAAATAAAgg > 2:343086/1‑140 (MQ=255)
aGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAgg > 1:413719/1‑140 (MQ=255)
aGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAgg > 2:719215/1‑140 (MQ=255)
aGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAgg > 2:494353/1‑140 (MQ=255)
aGGGAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAgg > 1:274237/1‑140 (MQ=255)
gggAATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAggg < 2:529946/140‑1 (MQ=255)
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TCTGAAAAAGAACAACAGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAGGG > NC_000913/574132‑574403
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
