Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F48 I1 R1
|
61 |
74.3 |
2613450 |
99.1% |
2589928 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
765,914 |
C→A |
intergenic (‑39/‑70) |
mngR ← / → mngA |
DNA‑binding transcriptional repressor MngR/2‑O‑alpha‑mannosyl‑D‑glycerate specific PTS enzyme II |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 765,914 | 0 | C | A | 100.0%
| 426.4
/ NA
| 117 | intergenic (‑39/‑70) | mngR/mngA | DNA‑binding transcriptional repressor MngR/2‑O‑alpha‑mannosyl‑D‑glycerate specific PTS enzyme II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (61/56); total (61/56) |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TGATTCAGTGGGTAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCCGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCATGATGAAT > NC_000913/765777‑766049
|
tGATTCAGTGGGTAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGa > 2:900997/1‑140 (MQ=255)
aTTCAGTGGGTAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATa > 1:460899/1‑140 (MQ=255)
aTTCAGTGGGTAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATa > 2:1044142/1‑140 (MQ=255)
aGTGGGTAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAAtt < 1:288699/140‑1 (MQ=255)
gTGGGTAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTc < 1:748118/140‑1 (MQ=255)
tGGGTAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCa > 1:323287/1‑140 (MQ=255)
ggTAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATc > 2:628992/1‑140 (MQ=255)
ggTAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATc < 1:164785/140‑1 (MQ=255)
tAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCt < 1:628992/140‑1 (MQ=255)
tAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCt < 2:1115824/140‑1 (MQ=255)
tAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCt > 2:430693/1‑140 (MQ=255)
tAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCt > 2:56981/1‑140 (MQ=255)
tAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCt < 2:69428/140‑1 (MQ=255)
aaaCGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGAGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCt < 2:801376/139‑1 (MQ=255)
aaCGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTg > 1:961231/1‑140 (MQ=255)
aCGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCt > 2:894213/1‑138 (MQ=255)
cGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTa < 1:766902/140‑1 (MQ=255)
gCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTaa > 1:1082532/1‑140 (MQ=255)
aTCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAaat < 2:451209/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAaat < 2:659208/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAaat < 2:217468/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAaat > 1:1117336/1‑140 (MQ=255)
aTCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAaat < 1:1165717/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAaat > 2:727616/1‑140 (MQ=255)
aTCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAaat < 1:743273/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAaat < 1:401246/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAaat < 1:900997/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAaat < 1:439461/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAaat < 2:507368/140‑1 (MQ=255)
gCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAaataat > 2:193998/1‑140 (MQ=255)
cAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATaatac < 2:563595/140‑1 (MQ=255)
cAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATaatac < 2:455461/140‑1 (MQ=255)
tAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATaatacaaatac < 1:1005268/140‑1 (MQ=255)
cGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAatacaataca > 1:1084059/1‑140 (MQ=255)
gCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCTATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGCATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAAtacaatacaa > 1:618778/1‑140 (MQ=255)
gCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAAtacaatacaa > 1:668973/1‑140 (MQ=255)
gCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAAtacaatacaa > 1:183859/1‑140 (MQ=255)
gCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAAtacaatacaa > 2:728425/1‑140 (MQ=255)
gCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAAtacaatacaa > 2:915002/1‑140 (MQ=255)
ccACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACaaa > 2:86588/1‑140 (MQ=255)
cgcAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAAtt > 1:1012826/1‑140 (MQ=255)
ttCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAg < 1:193998/140‑1 (MQ=255)
aaTGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAAt > 1:337907/1‑140 (MQ=255)
tGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTg > 2:235176/1‑140 (MQ=255)
gCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGa < 1:1055081/140‑1 (MQ=255)
gCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGa < 1:86588/140‑1 (MQ=255)
cGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGAt < 1:727616/140‑1 (MQ=255)
cGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGAt < 1:121245/140‑1 (MQ=255)
cGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGAt < 1:56981/140‑1 (MQ=255)
aTCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATca < 2:1012826/140‑1 (MQ=255)
aTCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATca < 1:359866/140‑1 (MQ=255)
aTCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTCTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATca < 2:668973/140‑1 (MQ=255)
cGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATcaca < 1:1044142/140‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGt < 2:402038/140‑1 (MQ=255)
gTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGa < 2:1084016/122‑1 (MQ=255)
gTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGtt > 1:681239/1‑140 (MQ=255)
aGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATc > 2:745730/1‑140 (MQ=255)
gCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCggg < 2:209630/140‑1 (MQ=255)
tgtgTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGcac > 2:596482/1‑140 (MQ=255)
tgtgTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGcac > 1:491674/1‑140 (MQ=255)
tgtgTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGcac > 2:613088/1‑140 (MQ=255)
tgtgTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGcac > 2:53192/1‑140 (MQ=255)
tgtgTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGcac > 1:1266272/1‑140 (MQ=255)
tgtgTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGcac > 1:265539/1‑140 (MQ=255)
tgtgTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGcac > 2:234938/1‑140 (MQ=255)
tgtgTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGcac > 1:799687/1‑140 (MQ=255)
tgtgTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGcac > 1:393047/1‑140 (MQ=255)
tgtgTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGcac < 2:691120/140‑1 (MQ=255)
tgtgTCCAATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGcac > 1:850238/1‑140 (MQ=255)
tgtCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCAAATAATGGTATTGTTTTATCGGGCacac > 1:1136114/1‑140 (MQ=255)
cATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGgcg > 2:909274/1‑140 (MQ=255)
cATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGgcg > 2:768252/1‑140 (MQ=255)
tATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACCTAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATaa < 1:915002/140‑1 (MQ=255)
aTCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATaaa > 2:318133/1‑140 (MQ=255)
tctcATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATaaaa < 2:337907/140‑1 (MQ=255)
ctcATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATaaaaa > 2:2433/1‑140 (MQ=255)
ctcATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATaaaaa > 2:130573/1‑140 (MQ=255)
cATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACg > 2:159484/1‑140 (MQ=255)
cATTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACg > 1:1256866/1‑140 (MQ=255)
aTTAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGa < 1:159484/140‑1 (MQ=255)
ttAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGAt < 1:768252/140‑1 (MQ=255)
ttAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGAt < 2:1136114/140‑1 (MQ=255)
ttAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGAt < 2:393047/140‑1 (MQ=255)
ttAATACGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGAt < 1:876849/140‑1 (MQ=255)
aCGAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGt < 2:1117336/140‑1 (MQ=255)
gAATTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGa < 1:745730/140‑1 (MQ=255)
aTTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAgg > 1:344191/1‑140 (MQ=255)
aTTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAgg > 2:1151356/1‑140 (MQ=255)
aTTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAgg > 2:160386/1‑140 (MQ=255)
aTTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAgg > 2:183807/1‑140 (MQ=255)
aTTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAgg > 1:795499/1‑140 (MQ=255)
aTTTAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAgg > 2:621858/1‑140 (MQ=255)
ttAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGAt < 2:1086167/140‑1 (MQ=255)
ttAACCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGAt < 2:799687/140‑1 (MQ=255)
aaCCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTAAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCa > 1:759651/1‑140 (MQ=255)
aCCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCat > 1:794284/1‑140 (MQ=255)
aCCATTATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCat > 1:405895/1‑140 (MQ=255)
tATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCAtgatga > 1:1124491/1‑140 (MQ=255)
tATGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCAtgatga > 1:1000654/1‑140 (MQ=255)
tGCCAGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCATGATGAAt > 2:372990/1‑140 (MQ=255)
|
TGATTCAGTGGGTAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCCGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCATGATGAAT > NC_000913/765777‑766049
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
