Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A28 F56 I1 R1
|
120 |
79.0 |
2973134 |
95.3% |
2833396 |
126.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP006881 |
3,723,118 |
C→T |
intergenic (‑232/‑69) |
U712_19190 ← / → U712_19195 |
PTS system sucrose‑specific EIIBC component/putative transporter ywcJ |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP006881 | 3,723,118 | 0 | C | T | 100.0%
| 280.9
/ NA
| 84 | intergenic (‑232/‑69) | U712_19190/U712_19195 | PTS system sucrose‑specific EIIBC component/putative transporter ywcJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (35/49); total (35/49) |
GCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTGAGAATACGCTTTCATCATAAATTATGATAGCGTTTTCGTCAACT‑GT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATAAAACTTTTAGACAAAAATTCGTAAAAACTATTTGTGAAAAACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAACCATCAAAGAAAGCAGGAAAAAACAATGGAAACTCAAGCATTGCAAAAAGTTGAACAGTACGCTTTGAACAAACTAAACATATTTGTTT > CP006881/3722985‑3723250
|
gCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATATTTTTATATAAAATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTaat > 6:207002/1‑137 (MQ=255)
gCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTaat > 5:81845/1‑137 (MQ=255)
gCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTaa < 1:123563/138‑2 (MQ=255)
gCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTaa < 6:132669/138‑2 (MQ=255)
gCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTaa < 8:124217/138‑2 (MQ=255)
gCCTGCTTTACAAGTCACAATCCCGCTAATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATACCGTTTTCGTCAACT‑ATATTAT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTaat > 4:218361/1‑137 (MQ=255)
cTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTTATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATtgtg > 3:193839/1‑138 (MQ=255)
cTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATtgtg < 5:157871/138‑1 (MQ=255)
cTTTACCAGTCACAATCCCGCATATTCAGATTAAGAATAAGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATtgtg < 2:129027/138‑1 (MQ=255)
tACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaa < 5:28321/137‑1 (MQ=255)
tACCAGTCACAATCCCGCATATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaa < 6:28021/138‑1 (MQ=255)
ccAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaata < 7:253747/138‑3 (MQ=255)
gTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACtt > 8:304629/1‑138 (MQ=255)
tCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTca < 5:255628/139‑1 (MQ=255)
tCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTca < 4:352789/139‑1 (MQ=255)
cacaATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTca > 1:134043/1‑138 (MQ=255)
cacaATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACT‑AT‑TTTTATAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATAGTGAAATACtttc > 6:255628/1‑136 (MQ=255)
acaATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTcaca < 8:64825/139‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTTATTCAGATTAAGACTACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 6:338324/139‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 7:270484/139‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 7:310102/139‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 3:164042/139‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 1:165625/139‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 1:107999/139‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 1:127838/139‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 7:100576/139‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 6:83431/139‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTATTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTATACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 5:264657/139‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCATTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTATATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 3:105568/139‑1 (MQ=255)
aTCCCACTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 4:92503/139‑1 (MQ=255)
tCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGAGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATTTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata > 1:57595/1‑138 (MQ=255)
ccGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATc < 2:305959/138‑1 (MQ=255)
cagCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTAGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATc < 1:278359/136‑1 (MQ=255)
cGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TATTTAAATATTTTGATATAACATTTAGACAAAAATACGTAAAAATTAATTGTGATATACTTCACAataaggt > 3:257578/1‑135 (MQ=255)
gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata > 1:263562/1‑134 (MQ=255)
gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata > 1:310993/1‑134 (MQ=255)
gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 2:310993/134‑1 (MQ=255)
gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 2:263562/134‑1 (MQ=255)
gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTg < 7:304629/139‑1 (MQ=255)
gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTg < 6:364596/139‑1 (MQ=255)
gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTg < 8:341688/139‑1 (MQ=255)
gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGGTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTg < 6:47472/139‑1 (MQ=255)
attATTCATATTAAGAATAATATTTCATCATTAATAATGATAGAGTTTTAGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAAAATTTAGTCAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTg < 2:134043/137‑1 (MQ=255)
aTTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCt < 1:69233/137‑1 (MQ=255)
ttCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCtata < 4:48731/139‑1 (MQ=255)
aGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACt < 6:81845/138‑1 (MQ=255)
aTTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaata < 7:199013/114‑3 (MQ=255)
aTTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaata > 8:199013/1‑112 (MQ=255)
aTTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaata > 8:194478/1‑112 (MQ=255)
aTTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaata < 7:194478/114‑3 (MQ=255)
aTTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 2:17858/124‑1 (MQ=255)
aTTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata > 1:17858/1‑124 (MQ=255)
aTTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATg > 1:87316/1‑139 (MQ=255)
aTTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATg > 8:161162/1‑139 (MQ=255)
ttaagaATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGc > 3:70744/4‑139 (MQ=255)
cGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCAt > 8:138125/1‑138 (MQ=255)
cGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCAt > 1:274451/1‑138 (MQ=255)
atcatAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGaaagaa < 6:328454/138‑1 (MQ=255)
tAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTATTTAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCTTAAAAATTAATTGTGATATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAg > 2:97765/1‑139 (MQ=255)
aTGATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGaa > 6:231667/1‑136 (MQ=255)
gATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTATACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATc > 7:250073/1‑97 (MQ=255)
gATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATc < 8:250073/97‑1 (MQ=255)
gATAGCGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTTTACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGaaaaga > 2:186308/1‑136 (MQ=255)
cGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATg > 5:104385/1‑138 (MQ=255)
cGTTTTCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATg > 1:49510/1‑138 (MQ=255)
tCGTCAACTATT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACt > 1:364571/1‑139 (MQ=255)
aactatt‑tttt‑tAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGc < 2:87316/133‑1 (MQ=255)
tttt‑tAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAATAAAGCAGGAAAAGACAATTGAAACTCAAGCATTACa < 2:57595/138‑1 (MQ=255)
gTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGtt < 5:166792/139‑1 (MQ=255)
catgtAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAATTACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTCAACAGTATGCTTTGaaa > 2:141214/5‑137 (MQ=255)
catgtAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGaaa > 3:233257/5‑137 (MQ=255)
tAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAATAGGTTGAACAGTATGCTTTGAAAAAAc > 2:113030/1‑138 (MQ=255)
tAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGAAAAAAc > 8:87801/1‑138 (MQ=255)
tAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGAAAAAAc < 2:274451/138‑1 (MQ=255)
gACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATAATTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGAAAAAAcaa < 4:193839/138‑3 (MQ=255)
aCAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGAAAAAACaaaa < 1:186308/139‑1 (MQ=255)
aaaaaTTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGAAAaaacaaaaca > 8:318361/1‑139 (MQ=255)
aaaTTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAg < 5:175136/95‑1 (MQ=255)
aaaTTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAg > 6:175136/1‑95 (MQ=255)
aaaTTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGtt > 3:249483/1‑109 (MQ=255)
aaaTTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGtt < 4:249483/109‑1 (MQ=255)
aaaTTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGAAAAAACAAAACata > 6:66239/1‑139 (MQ=255)
cGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGAAAAAACAAAACATAttcgc > 6:365244/1‑136 (MQ=255)
tAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGAAAAAACAAAACATAttcgctt < 5:231667/139‑6 (MQ=255)
|
GCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTGAGAATACGCTTTCATCATAAATTATGATAGCGTTTTCGTCAACT‑GT‑TTTT‑TAGTTAAATAGTTTGATAAAACTTTTAGACAAAAATTCGTAAAAACTATTTGTGAAAAACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAACCATCAAAGAAAGCAGGAAAAAACAATGGAAACTCAAGCATTGCAAAAAGTTGAACAGTACGCTTTGAACAAACTAAACATATTTGTTT > CP006881/3722985‑3723250
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
