Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F83 I5 R1
|
8 |
66.5 |
3267118 |
94.3% |
3080892 |
133.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_002947 |
1,851,242 |
G→T |
E96* (GAG→TAG) |
relA → |
ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_002947 | 1,851,242 | 0 | G | T | 96.8%
| 185.2
/ ‑6.8
| 63 | E96* (GAG→TAG) | relA | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base T (33/28); total (34/29) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
GTAGAGAAAAAGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCGAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTCGCAGGCGCAGGTAGAG > NC_002947/1851095‑1851388
|
gTAGAGAAAAAGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAg < 2:1397316/150‑1 (MQ=255)
tAGAGCAAAAGGGGAACCCGTCCAAGCGTTCCTGGGCGGATGGTACGTCGAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGCAATTCTGTCTGACCTCAAGCTCGACCAGCACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTCCCGCTCGGTGCGCTAgg > 2:514543/1‑150 (MQ=255)
aaaGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGt > 2:360116/1‑150 (MQ=255)
ggCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCAcc < 2:162951/150‑1 (MQ=255)
ggCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCAcc > 1:991231/1‑150 (MQ=255)
ggCAACCCGGCCAAGCATTACTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCAcc > 2:292756/1‑150 (MQ=255)
gCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCAccc > 1:645543/1‑150 (MQ=255)
gCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCAccc > 2:1589194/1‑150 (MQ=255)
cccGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGc < 2:645543/150‑1 (MQ=255)
ccAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAgg > 1:309112/1‑150 (MQ=255)
cATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTcagc < 2:896761/150‑1 (MQ=255)
cTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATGTACTTCTCTGGGTTTTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCg < 1:31713/150‑1 (MQ=255)
cTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCg > 1:318130/1‑150 (MQ=255)
cTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCg > 1:445806/1‑150 (MQ=255)
tGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCgg > 2:841178/1‑150 (MQ=255)
gCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGttt < 2:991231/150‑1 (MQ=255)
gTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTCGATGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCTCGAGAGCAAGGTCACCCTCGCCGAGATCAGCCAGCGGTTTGGcacag < 2:393109/150‑5 (MQ=255)
tCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCAcc < 1:336817/114‑1 (MQ=255)
tCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCAcc > 2:336817/1‑114 (MQ=255)
cAGCTTCCAGGGAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTc < 2:309112/150‑1 (MQ=255)
aggcaggcCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTCCGCTAGCGCAAGGCAACCCTCGCCGAGGTCAGGGAGCGGTTTGGCTCGGTGGGGTCCAAGCTGa < 2:429998/150‑1 (MQ=255)
cTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAg > 1:552523/1‑105 (MQ=255)
cTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAg < 2:552523/105‑1 (MQ=255)
tGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGGCTCCCCGGTGGCTGGGGGCACCTAACTAGTGTGGCGTTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGgtg < 2:792084/150‑1 (MQ=255)
tGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAgg > 1:139172/1‑105 (MQ=255)
tGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAgg < 2:139172/105‑1 (MQ=255)
tGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGgtg < 1:440221/150‑1 (MQ=255)
aaaTCGCCGAAATGCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGtgc < 1:841178/150‑1 (MQ=255)
aaTCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGttt > 1:1382813/1‑115 (MQ=255)
aaTCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGttt < 2:1382813/115‑1 (MQ=255)
gCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTgcgt < 1:542165/150‑2 (MQ=255)
ccGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCa > 1:723599/1‑150 (MQ=255)
ccGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCa > 1:1282337/1‑150 (MQ=255)
gCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGcc < 1:1449516/81‑1 (MQ=255)
gCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGcc > 2:1449516/1‑81 (MQ=255)
cAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCa < 1:409813/131‑1 (MQ=255)
cAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCa > 2:409813/1‑131 (MQ=255)
tCGACCAGGACCCCCTGGTGGCTGCTGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCCAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCa < 2:196601/150‑1 (MQ=255)
gACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGc > 1:1022468/1‑150 (MQ=255)
aCCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGgtg < 1:580336/114‑1 (MQ=255)
aCCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGgtg > 2:580336/1‑114 (MQ=255)
cAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGAt > 2:1316769/1‑104 (MQ=255)
cAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCa < 2:1282337/150‑1 (MQ=255)
cAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGCTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGAt < 1:1316769/104‑1 (MQ=255)
tCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAg > 1:743791/1‑150 (MQ=255)
ccTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAg < 2:1331652/138‑1 (MQ=255)
ccTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAg > 1:1331652/1‑138 (MQ=255)
ccTGGAGGCGGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCGAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCGAGCGGTTTGGCGAGGTGATGTCCAAGCTGATCGACGGTGGGCTGCGCGTGGACGCCATCCGTGCCATCATAAACCCGCGGCAGTc > 2:931337/1‑150 (MQ=255)
cTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCaa < 1:1073416/41‑1 (MQ=255)
cTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCaa > 2:1073416/1‑41 (MQ=255)
tggtggCTGCGGTCATCTACCGCCCGGTGCGCTAGGGCAAGTTCACCCTCGCCGAGGGCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCGTCAATGCCAGCCTGAGCCCACGCCAGTCGc > 2:1425194/1‑150 (MQ=255)
ggtggCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCt < 2:1022468/150‑1 (MQ=255)
gtggCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTg > 2:421428/1‑150 (MQ=255)
ggTCATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTggg > 2:88587/1‑150 (MQ=255)
cATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGc < 2:599767/148‑1 (MQ=255)
cATCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGc > 1:599767/1‑148 (MQ=255)
aTCTACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcg > 1:1131007/1‑150 (MQ=255)
tACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTggcag > 1:241745/1‑150 (MQ=255)
tACCGCTCGGTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCCGAGCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcgcag > 1:922675/1‑150 (MQ=255)
aaggTGCGCTAGGCAAAACTCACCCTCGCGGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGAACCTCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTcgcaggcgcag < 1:514543/148‑1 (MQ=255)
ggTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCTGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTCGCAGGCGCAGGt < 1:1589194/150‑1 (MQ=255)
gTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTCGCAGGCGCAGGTa > 2:117797/1‑150 (MQ=255)
gTGCGCTAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTCGCAGGCGCAGGTa > 2:708469/1‑150 (MQ=255)
cgctAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTCGCAGGCGCAGGTagag < 1:88587/150‑1 (MQ=255)
|
GTAGAGAAAAAGGGCAACCCGGCCAAGCATTCCTGGGCGGATGGTACGTCCAGCTTCCAGGCAGGCCTGGAAATCGCCGAAATTCTGGCTGACCTCAAGCTCGACCAGGACTCCCTGGTGGCTGCGGTCATCTACCGCTCGGTGCGCGAGGGCAAGGTCACCCTCGCCGAGGTCAGCCAGCGGTTTGGCCCGGTGGTGTCCAAGCTGATCGACGGTGTGCTGCGCATGGCCGCCATCAGTGCCAGCCTCAGCCCACGACAGTCGCTGGTGCTGGGCTCGCAGGCGCAGGTAGAG > NC_002947/1851095‑1851388
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
