Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F87 I1 R1
|
22 |
84.3 |
3290658 |
97.6% |
3211682 |
138.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC |
NC_000913 |
2,720,868 |
(CGCTGG)2→3 |
coding (916/2661 nt) |
pka → |
protein lysine acetyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 2720855 | 2 (0.020) | 71 (0.770)
+GCGCTG |
58/236 |
0.4 |
97.2% |
coding (903/2661 nt) |
pka |
protein lysine acetyltransferase |
| ? | NC_000913 |
2720856 = |
2 (0.020) | coding (904/2661 nt) |
pka |
protein lysine acetyltransferase |
CATGGGATGCGGCTATTCAGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2720713‑2720855
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCGATCTACGCGATGACGCCAGCAGTGAGCACT > NC_000913/2720856‑2721003
||||||
CATGGGATGCGGCTATTCAGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTG < 2:321212/149‑1
ATGGGATGCGGCTATTCAGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGG > 1:355218/1‑149
TGGGATGCGGCTATTCAGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCT > 2:350227/1‑146
TGGGATGCGGCTATTCAGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCT < 1:350227/146‑1
ATGCGGCTATTCAGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACATGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTG < 4:238312/149‑1
GGCTATTCAGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGC > 6:82711/1‑149
GGCTATTCAGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGC > 3:177205/1‑149
GCTATTCAGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCT > 6:222764/1‑149
AGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCC > 8:64132/1‑149
AGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCC > 1:407800/1‑149
AGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGC < 6:335904/148‑1
GCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCT < 3:231573/149‑1
GCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCT < 5:82711/149‑1
GCGTGCAGGTTTGTTGCGGGTACAGGACCCCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACACTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCT > 6:319635/1‑149
GTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTA > 6:176604/1‑149
GTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTA < 5:222764/149‑1
GCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATG > 6:35799/1‑149
CCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTG > 5:90995/1‑137
CCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTG < 6:90995/137‑1
CGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGT > 8:321917/1‑149
CGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGA > 2:100027/1‑138
CGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGA < 1:100027/138‑1
GGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGT > 8:386731/1‑148
TTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCAC < 7:57626/149‑1
TTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAA > 2:257570/1‑149
CGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATG < 7:321917/148‑1
GGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCC > 6:136830/1‑131
GGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCC < 5:136830/131‑1
GTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAA < 8:287714/149‑1
AGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTG > 4:336836/1‑149
GGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGG < 1:196036/149‑1
CCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGC > 1:49856/1‑149
CCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGC > 6:47290/1‑130
CCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGC < 5:47290/130‑1
CCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATG > 6:251144/1‑123
CCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATG < 5:251144/123‑1
CACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGC > 3:17763/1‑148
GAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAG < 2:49856/149‑1
AGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGC < 2:407800/149‑1
TTTTCGGCGGTGTAAACCCTTAGCCATATGCTCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCATCAACTGTGCTGCTCCTTCCGCGCTGGCTCTGTCTCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGAAAGCTGTCAACGCTAAGCGAAG > 4:267456/1‑148
TTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAA < 2:355218/147‑1
GGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCT < 7:64132/149‑1
GCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTG < 3:348496/149‑1
GTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCA < 1:257570/149‑1
GTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGC > 1:93912/1‑147
GAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGA > 8:85882/1‑148
AACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAAC < 7:386731/149‑1
CCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTAACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTG > 7:395518/1‑149
TTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGC > 6:182199/1‑149
AGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCG < 4:17763/148‑1
CATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTAGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATG > 8:367074/1‑148
CGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTAGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCC < 7:367074/149‑1
CCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGATACTGCGCGATGCACTGCCAG > 1:274726/1‑148
GCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAA > 1:414658/1‑148
CGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGT < 5:182199/149‑1
CGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGT < 5:319635/149‑1
CGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACAT > 3:267964/1‑147
CGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACAT < 4:267964/147‑1
CGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACAT < 2:414658/147‑1
TGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGC < 2:294538/115‑1
TGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGC > 1:294538/1‑115
TGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTAACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGG < 8:395518/149‑1
GGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATC > 5:392295/1‑148
TTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTC < 1:195198/149‑1
TATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTC > 5:327239/1‑148
TATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCT > 7:255546/1‑139
TATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCT < 8:255546/139‑1
ATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTTCGCGATGCACTGCCAGAACATTTGGCAAAATCTAACCCGCTCGA > 2:342605/1‑149
ATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCGA > 6:163518/1‑149
ATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCG < 5:35799/148‑1
GCAACGGTGCTGCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCGATCTA > 4:25040/1‑149
GCGCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCGATCTACGCGATGACGC > 5:234426/1‑149
GCCTGCCGCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCGATCTACGCGATGACGCCA < 3:25040/149‑1
GCGCTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCGATCTACGCGATGACGCCAGCAGT > 1:6148/1‑147
CTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCGAT < 6:7204/123‑1
CTGGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCGAT > 5:7204/1‑123
TGGCGCTGGCGCTGGATGACTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCGATCTACGCGATGACGCCAGCAGTGAGCA > 2:302065/1‑148
GGCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCGATCTACGCGATGACGCCAGCAGTGAGCACT < 6:327239/149‑1
||||||
CATGGGATGCGGCTATTCAGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2720713‑2720855
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCGCTGGCGCTGGATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCGATCTACGCGATGACGCCAGCAGTGAGCACT > NC_000913/2720856‑2721003
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGCTATTCAGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCC‑‑‑‑‑‑GCGCTGGCGCTG‑‑‑‑‑‑GATGCCTTATGGTCACGCAATGGCAAGCTGGCAACGCTAAGCGAAGAAACCTGCCAGAAACTGCGCGATGCACTGCCAGAACATGTGGCAATATCTAACCCGCTCGATCTACGCGATGACGCCAGCAGTGAGCACTATATTAAAACGCTGG > NC_000913/2720722‑2721018
|
CGGCTATTCAGCGTGCCGGTTTGTTGCGGGTACAGGACACCCACGAGCTGTTTTCGGCGGTGGAAACCCTTAGCCATATGCGCCCGCTACGTGGCGACCGGCTGATGATTATCAGCAACGGTGCTGCGCCTGCC‑‑‑‑‑‑GCGCTGGCGCTG‑‑‑‑‑‑Gcgct > NB501016:230:HFVJLAFXY:2:11310:20094:4752/1‑147 (MQ=60)
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
