Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F81 I0 R1
|
263 |
75.1 |
3021180 |
96.0% |
2900332 |
137.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,722,492 |
C→A |
75.4% |
T847K (ACG→AAG) |
pka → |
protein lysine acetyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,722,492 | 0 | C | A | 75.4%
| 162.4
/ 63.3
| 97 | T847K (ACG→AAG) | pka | protein lysine acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (11/13); new base A (35/38); total (46/51) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
GATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGAC > NC_000913/2722349‑2722635
|
gATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGc < 6:65672/149‑1 (MQ=255)
gATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGc < 1:87915/149‑1 (MQ=255)
ccGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCaaa < 3:319046/148‑1 (MQ=255)
cTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGt < 4:71272/149‑1 (MQ=255)
aCATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAAt < 5:173443/140‑1 (MQ=255)
aCATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAAt > 6:173443/1‑140 (MQ=255)
aCATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtg < 8:121984/149‑1 (MQ=255)
aCATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAt < 5:188598/148‑1 (MQ=255)
tGCCGAATTTTCTGTTCTGGTTCGCTGGGATCTCTAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGgcgc < 3:160549/149‑1 (MQ=255)
cGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAATGGTTAGTCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTCCCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTa < 3:242357/148‑1 (MQ=255)
cGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAg < 1:207195/149‑1 (MQ=255)
tGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGc > 8:210579/1‑149 (MQ=255)
tGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGc > 3:179600/1‑149 (MQ=255)
tACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTc > 3:77673/1‑149 (MQ=255)
tACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCATAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACATATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTAATACGATGCCAAACAAACGTGCCATGGTGGCGCTACCCCGCAAGCTc > 6:357698/1‑149 (MQ=255)
cTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCgg < 1:179734/149‑1 (MQ=255)
cTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCgg < 8:137290/149‑1 (MQ=255)
gTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACTATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGtt < 4:51637/149‑1 (MQ=255)
gTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTgg < 7:370396/119‑1 (MQ=255)
gTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTgg > 8:370396/1‑119 (MQ=255)
gCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAAc > 2:188138/1‑149 (MQ=255)
cTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACg > 3:161472/1‑149 (MQ=255)
tCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGCCGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGt > 7:270664/1‑149 (MQ=255)
tCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGGATTAAGATGCCAACCAATCGTGGAATGTTGGCGCTAGACCGCAAGCTCGGGGTTAACGt > 6:234897/1‑149 (MQ=255)
ggATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGtt > 5:7452/1‑148 (MQ=255)
ggATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGtt < 6:8169/148‑1 (MQ=255)
ggATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGtt > 5:246066/1‑148 (MQ=255)
gATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATc > 5:223429/1‑106 (MQ=255)
gATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATc < 6:223429/106‑1 (MQ=255)
tcAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATc > 6:251276/1‑149 (MQ=255)
aaaGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGCTTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAAGGGTATTAAGATGCCAAACAATCGCGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTAGGGTTTACCGTTGATATc > 2:318750/1‑147 (MQ=255)
aaaGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTGCGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATc > 1:15474/1‑147 (MQ=255)
aaaGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGt > 3:251610/1‑102 (MQ=255)
aaaGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGt < 4:251610/102‑1 (MQ=255)
aaaGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGACAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATc > 4:5797/1‑147 (MQ=255)
aaaGGG‑TAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtggtg < 1:220055/110‑1 (MQ=255)
aaaGGG‑TAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtggtg > 2:220055/1‑110 (MQ=255)
aGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg < 4:77673/147‑1 (MQ=255)
aGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg < 5:251276/147‑1 (MQ=255)
aGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACAGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg < 6:7452/147‑1 (MQ=255)
gACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtggtg < 8:365225/92‑1 (MQ=255)
gACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtggtg > 7:365225/1‑92 (MQ=255)
cGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTgg < 1:188138/149‑1 (MQ=255)
gCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGTTCGTTggg > 1:76136/1‑149 (MQ=255)
cTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTGCGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGc < 2:15474/149‑1 (MQ=255)
ttAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCaa < 5:188897/101‑1 (MQ=255)
ttAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCaa > 6:188897/1‑101 (MQ=255)
ttAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCt > 3:69704/1‑149 (MQ=255)
ttAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCt > 5:260174/1‑149 (MQ=255)
attgAAAAGTTGAGTACCTATACGCGAGATCACTGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTAc < 6:120707/146‑1 (MQ=255)
ggAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGc > 2:384483/1‑149 (MQ=255)
aaaaGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCt > 5:351847/1‑148 (MQ=255)
gTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCggg > 7:46057/1‑97 (MQ=255)
gTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCggg < 8:46057/97‑1 (MQ=255)
aTTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGTGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTg < 4:84831/148‑1 (MQ=255)
ccTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTAc < 4:203102/133‑1 (MQ=255)
ccTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTAc > 3:203102/1‑133 (MQ=255)
cTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATTCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCAAGCTCGAagagt > 6:292685/1‑115 (MQ=255)
cTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCTAAGAgg < 5:292685/116‑1 (MQ=255)
tataCGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAgcg > 4:193218/1‑149 (MQ=255)
cgcgAGATCACGGACTACAACGTCTGATTGGTATTAAGAGGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGa < 4:200807/148‑1 (MQ=255)
cgcgAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGa < 4:161472/148‑1 (MQ=255)
tCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCAt < 2:189170/149‑1 (MQ=255)
cagttcTACAACGTCTTAATTGAATAAATAAGCCAAACAATCGTGTCATGGTTGCGCTAGCCAGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTTCCCAGCGCGAGTAATCAt < 4:91564/142‑1 (MQ=255)
aCGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCAt > 8:222224/1‑147 (MQ=255)
aCGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGa < 4:179600/149‑1 (MQ=255)
ggACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGc < 5:320933/112‑1 (MQ=255)
ggACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGc > 6:320933/1‑112 (MQ=255)
aCAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAgg > 6:59787/1‑148 (MQ=255)
cAACGTCTTAATGGTATTAAGATGACAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTAGGGTTTAACGTTGATATAAAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGTGCTTACGCTAAATATTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAgagggga > 3:91564/1‑142 (MQ=255)
aaCGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGtt > 5:80270/1‑74 (MQ=255)
aaCGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGtt < 6:80270/74‑1 (MQ=255)
aaCGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTGGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATcc < 7:225514/81‑1 (MQ=255)
aaCGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTGGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATcc > 8:225514/1‑81 (MQ=255)
aaCGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTAc > 8:46039/1‑149 (MQ=255)
aCGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACt < 3:5797/149‑1 (MQ=255)
cGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTg < 6:260174/149‑1 (MQ=255)
cGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTg < 3:193218/149‑1 (MQ=255)
gTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTg > 7:191892/1‑148 (MQ=255)
tCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTgg > 7:238404/1‑148 (MQ=255)
tGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGaaa > 4:261681/1‑149 (MQ=255)
aaTGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAgg > 4:87053/1‑138 (MQ=255)
aaTGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAgg < 3:87053/138‑1 (MQ=255)
aaTGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGANATg > 5:36455/1‑149 (MQ=255)
aaTGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATg < 4:69704/149‑1 (MQ=255)
aaTGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATg > 8:209137/1‑149 (MQ=255)
aTGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGt < 6:351847/149‑1 (MQ=255)
tGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGTAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGtt < 5:357698/149‑1 (MQ=255)
tGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGATCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGtt < 5:234897/149‑1 (MQ=255)
tGGTATTAAGATGCCAAACAATCGNTGCNTGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGtt < 6:36455/149‑1 (MQ=255)
gTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAACTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAgg > 6:337657/1‑81 (MQ=255)
gTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAACTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAgg < 5:337657/81‑1 (MQ=255)
tATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGAc < 8:238404/149‑1 (MQ=255)
aTTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGa > 4:34668/1‑116 (MQ=255)
aTTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGa < 3:34668/116‑1 (MQ=255)
ttAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGa < 5:292196/81‑1 (MQ=255)
ttAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGa > 6:292196/1‑81 (MQ=255)
|
GATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGAC > NC_000913/2722349‑2722635
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTG > NC_000913/2722348‑2722633
|
CGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCC < NB501016:230:HFVJLAFXY:1:11204:14123:18739/151‑1 (MQ=60)
TCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAAC < NB501016:230:HFVJLAFXY:2:21306:17060:2281/150‑1 (MQ=60)
AACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATC < NB501016:230:HFVJLAFXY:3:11609:5746:15950/142‑1 (MQ=60)
AACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATG < NB501016:230:HFVJLAFXY:3:11612:26774:11834/150‑1 (MQ=60)
ATGCCGAATTTTCTGTTCTGGTTCGCTGGGATCTCTAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCT < NB501016:230:HFVJLAFXY:2:11309:25974:16389/151‑1 (MQ=60)
CCGAATTTGCTGTCCTGGTGCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAcgattgtttggcatcttaataccatt < NB501016:230:HFVJLAFXY:4:21406:25598:19551/151‑27 (MQ=60)
CCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAATGGTTAGTCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTCCCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAG < NB501016:230:HFVJLAFXY:2:21202:9632:11393/150‑1 (MQ=60)
CCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGC < NB501016:230:HFVJLAFXY:1:21103:7419:8043/151‑1 (MQ=60)
CTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCT > NB501016:230:HFVJLAFXY:2:21101:23694:9508/1‑151 (MQ=60)
GTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCG > NB501016:230:HFVJLAFXY:2:11205:18682:3494/1‑151 (MQ=60)
ACTGGTGCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGG < NB501016:230:HFVJLAFXY:1:11310:6358:10882/151‑1 (MQ=60)
GGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGC < NB501016:230:HFVJLAFXY:4:21609:14014:6819/121‑1 (MQ=60)
GCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGT > NB501016:230:HFVJLAFXY:2:11309:21416:19746/1‑151 (MQ=60)
CTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGCCGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTT > NB501016:230:HFVJLAFXY:4:21502:9964:6449/1‑151 (MQ=60)
CTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGA < NB501016:230:HFVJLAFXY:4:21507:10425:5250/98‑1 (MQ=60)
CGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTG > NB501016:230:HFVJLAFXY:3:11402:23863:8845/1‑150 (MQ=60)
CGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTG > NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21411:25548:10561/1‑150 (MQ=60)
GGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCG > NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21407:10873:5358/1‑108 (MQ=60)
CAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTGCGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCC > NB501016:230:HFVJLAFXY:1:11103:11458:12713/1‑149 (MQ=60)
CAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTG > NB501016:230:HFVJLAFXY:2:21204:3370:10418/1‑104 (MQ=60)
CAAAGGG‑TAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGG < NB501016:230:HFVJLAFXY:1:21105:23257:11898/112‑1 (MQ=60)
TAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTTATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGG < NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21412:26219:10049/149‑1 (MQ=60)
CGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATAACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGG > NB501016:230:HFVJLAFXY:4:21608:19455:6410/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGG < NB501016:230:HFVJLAFXY:1:11312:15231:2537/151‑1 (MQ=60)
CGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGTTCGTTGGGG > NB501016:230:HFVJLAFXY:1:11202:2788:13710/1‑151 (MQ=60)
CTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTT > NB501016:230:HFVJLAFXY:2:11203:13647:9725/1‑151 (MQ=60)
CTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTT > NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21503:15293:3387/1‑151 (MQ=60)
CTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAG < NB501016:230:HFVJLAFXY:3:11612:26642:12921/103‑1 (MQ=60)
GAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTA > NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21608:21789:7964/1‑150 (MQ=60)
AGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGT > NB501016:230:HFVJLAFXY:4:11409:8599:2976/1‑99 (MQ=60)
ACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACG > NB501016:230:HFVJLAFXY:2:21106:9480:6758/1‑135 (MQ=60)
CCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCTAAGAGGG < NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21509:26571:7403/118‑1 (MQ=60)
ACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGTCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGG < NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21410:25425:13203/151‑1 (MQ=60)
CGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCC > NB501016:230:HFVJLAFXY:1:11302:11497:16812/1‑41 (MQ=60)
CGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCT < NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21602:24143:14207/114‑1 (MQ=60)
ACAACGTCTTAATGGTATTAAGATGACAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTAGGGTTTAACGTTGATATAAAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGTGCTTACGCTAAATATTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGaggggaa > NB501016:230:HFVJLAFXY:2:11208:1432:2086/1‑143 (MQ=60)
CAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTG > NB501016:230:HFVJLAFXY:3:11504:11526:5357/1‑76 (MQ=60)
CAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTGGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCA < NB501016:230:HFVJLAFXY:4:21405:7497:18831/83‑1 (MQ=60)
AACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTG < NB501016:230:HFVJLAFXY:2:11102:1674:4651/151‑1 (MQ=60)
ACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGG < NB501016:230:HFVJLAFXY:2:21104:19163:5806/151‑1 (MQ=60)
CGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGG > NB501016:230:HFVJLAFXY:4:11611:24319:16759/1‑150 (MQ=60)
GTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGA > NB501016:230:HFVJLAFXY:4:21408:12140:4358/1‑150 (MQ=60)
GAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAATCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGT < NB501016:230:HFVJLAFXY:2:11207:20455:2989/140‑1 (MQ=60)
GAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGANATGT > NB501016:230:HFVJLAFXY:3:11407:18875:20386/1‑151 (MQ=60)
ATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGTAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTG < NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21609:13919:8843/151‑1 (MQ=60)
ATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGATCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTG < NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21409:6562:8994/151‑1 (MQ=60)
GGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAACTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGG < NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21605:4557:15144/83‑1 (MQ=60)
TATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAG < NB501016:230:HFVJLAFXY:2:11108:26563:4257/118‑1 (MQ=60)
ATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGAT < NB501016:230:HFVJLAFXY:3:21509:26118:5711/83‑1 (MQ=60)
|
CGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTG > NC_000913/2722348‑2722633
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
