Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F81 I1 R1
|
22 |
78.8 |
2834210 |
97.1% |
2752017 |
142.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,722,492 |
C→A |
T847K (ACG→AAG) |
pka → |
protein lysine acetyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,722,492 | 0 | C | A | 98.9%
| 298.6
/ NA
| 88 | T847K (ACG→AAG) | pka | protein lysine acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (51/36); total (51/37) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.20e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGACC > NC_000913/2722347‑2722636
|
gCGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGAt > 1:253008/1‑149 (MQ=255)
gCGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGAt > 6:338230/1‑149 (MQ=255)
cGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGAt < 7:193686/148‑1 (MQ=255)
cGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGAt < 5:117763/148‑1 (MQ=255)
cGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATg > 5:74563/1‑149 (MQ=255)
gATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGACGACGCTTAATGGATAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGc > 7:132992/1‑149 (MQ=255)
ccGCTCCTGATAACATCGATGACGTATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATGTCTAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCaaa < 8:132992/148‑1 (MQ=255)
aTCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAAt < 3:316903/149‑1 (MQ=255)
gATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTTAATGGTATTAAGATGCCaa < 6:295382/139‑1 (MQ=255)
gATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCaa > 5:295382/1‑139 (MQ=255)
aTAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTg < 2:213610/147‑1 (MQ=255)
aaCATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAt > 8:30352/1‑149 (MQ=255)
aaCATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAt > 1:353435/1‑149 (MQ=255)
aaCATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAt > 4:122838/1‑149 (MQ=255)
aCATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtg < 5:201359/149‑1 (MQ=255)
cATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtgg > 1:43634/1‑149 (MQ=255)
gATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtggtgg < 4:110158/148‑1 (MQ=255)
aTGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGgcg > 5:317743/1‑149 (MQ=255)
gAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGc > 3:221432/1‑149 (MQ=255)
cTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCaa < 3:116039/148‑1 (MQ=255)
tACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTc > 2:310128/1‑149 (MQ=255)
tACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTc > 7:104722/1‑149 (MQ=255)
tGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCggg > 5:234727/1‑149 (MQ=255)
gTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATTGTTTTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGtt > 5:64407/1‑149 (MQ=255)
gTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGtt > 3:41000/1‑149 (MQ=255)
gTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGt < 1:218116/148‑1 (MQ=255)
tCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCCTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGt > 8:185069/1‑149 (MQ=255)
ggATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGtt > 4:227200/1‑148 (MQ=255)
ggATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGtt < 4:41000/148‑1 (MQ=255)
ggATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTg < 6:74563/149‑1 (MQ=255)
ggACCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGtt < 8:211623/148‑1 (MQ=255)
aaaGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATcc < 4:129094/148‑1 (MQ=255)
aaaGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATc > 3:79879/1‑147 (MQ=255)
aaGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAg > 8:225932/1‑149 (MQ=255)
aaGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAg < 2:353435/149‑1 (MQ=255)
gggTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACCACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCt > 1:283287/1‑149 (MQ=255)
gggTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCt < 4:221432/149‑1 (MQ=255)
gTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTc > 5:156310/1‑148 (MQ=255)
ttAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGa < 2:17018/149‑1 (MQ=255)
gCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAagag > 5:5848/1‑149 (MQ=255)
gCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAagag > 7:315320/1‑149 (MQ=255)
cTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCTCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAgg < 7:30352/149‑1 (MQ=255)
ttAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCa < 4:249411/137‑1 (MQ=255)
ttAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCa > 3:249411/1‑137 (MQ=255)
ttAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg > 3:136381/1‑149 (MQ=255)
ttAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg > 2:163347/1‑149 (MQ=255)
aGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg < 3:122838/147‑1 (MQ=255)
aGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg < 1:310128/147‑1 (MQ=255)
gACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGtt > 7:261930/1‑149 (MQ=255)
gCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTggg < 5:338230/149‑1 (MQ=255)
ttAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAgg < 1:292531/136‑1 (MQ=255)
ttAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAgg > 2:292531/1‑136 (MQ=255)
tGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACg > 2:14211/1‑149 (MQ=255)
tGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACg > 2:341986/1‑149 (MQ=255)
aaaGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGAGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGATGATATCCAGCACGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGcaa > 4:109911/1‑146 (MQ=255)
aaGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTaaa > 8:29499/1‑149 (MQ=255)
gTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATc < 1:264219/149‑1 (MQ=255)
aTTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGc > 7:342877/1‑149 (MQ=255)
ttACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCATCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGcc > 3:45811/1‑149 (MQ=255)
taCGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGGGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAgc > 3:320757/1‑146 (MQ=255)
taCGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGGGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAgc < 4:320757/146‑1 (MQ=255)
cgcgAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAACCAATCGTGGCATGGGGGCGCTAGCCCGCAAGCGCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAg < 2:253008/149‑1 (MQ=255)
cgcgAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGa < 6:156310/148‑1 (MQ=255)
cgcgAGATCACGGACTACAACGGCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGa < 6:64407/148‑1 (MQ=255)
gcgAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAgc < 3:45217/143‑1 (MQ=255)
gcgAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAgc > 4:45217/1‑143 (MQ=255)
cgAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAgg > 2:264886/1‑148 (MQ=255)
gagaTCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGaa > 4:129680/1‑149 (MQ=255)
cACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCAt > 4:25633/1‑148 (MQ=255)
aCGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCAt > 3:331865/1‑147 (MQ=255)
aCGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTAGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGa > 6:353252/1‑149 (MQ=255)
aCTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGt > 4:140689/1‑147 (MQ=255)
cTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAg < 8:315320/149‑1 (MQ=255)
aaCGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTAc > 4:157750/1‑149 (MQ=255)
aaCGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGAGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTAc > 1:221995/1‑149 (MQ=255)
cGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTg < 6:5848/149‑1 (MQ=255)
tCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTgg > 8:335179/1‑148 (MQ=255)
aTGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATg < 7:29499/148‑1 (MQ=255)
aTGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGt > 2:315755/1‑149 (MQ=255)
aTGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGt < 8:342877/149‑1 (MQ=255)
tGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTCACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGtt < 6:317743/149‑1 (MQ=255)
tGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGtt < 3:25633/149‑1 (MQ=255)
tGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGtt > 2:77115/1‑149 (MQ=255)
tATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGGTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGAc < 2:283287/149‑1 (MQ=255)
aTTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAgg < 7:134377/132‑1 (MQ=255)
aTTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAgg > 8:134377/1‑132 (MQ=255)
aTTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCGAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGGAAGGTACTGGAAATGTTGAcc > 8:141634/1‑149 (MQ=255)
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GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
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