Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1357 |
179.3 |
9500450 |
96.1% |
9129932 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,215,052 |
A→G |
E122G (GAG→GGG) |
aceA → |
isocitrate lyase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,215,052 | 0 | A | G | 98.7%
| 459.4
/ ‑3.4
| 148 | E122G (GAG→GGG) | aceA | isocitrate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); new base G (62/84); total (64/84) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.85e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
GATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC > NC_000913/4214962‑4215141
|
gATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGc > 1:2299076/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCgg > 1:1307988/1‑93 (MQ=255)
ggCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGa < 1:2403554/93‑1 (MQ=255)
gCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGAt < 1:421200/93‑1 (MQ=255)
gCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGAt < 1:421199/93‑1 (MQ=255)
gCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGAt < 1:3914323/93‑1 (MQ=255)
ggTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaa > 2:426414/1‑93 (MQ=255)
tAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaaca < 2:2693713/93‑1 (MQ=255)
tgcggcgGACGCTACCCTGGCGAACAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaacaa < 2:3395150/92‑1 (MQ=255)
aGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaacaa > 2:2641265/1‑93 (MQ=255)
cggcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAacaaca < 1:2113513/93‑1 (MQ=255)
ggcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAacac > 2:3798452/1‑93 (MQ=255)
gcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACAcc > 1:458656/1‑93 (MQ=255)
gcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACAcc > 2:3888103/1‑93 (MQ=255)
cggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCt > 2:3260479/1‑93 (MQ=255)
cggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCt < 1:999675/93‑1 (MQ=255)
gACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTc < 2:948897/93‑1 (MQ=255)
gACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTc < 1:377840/93‑1 (MQ=255)
gACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTc > 2:1622694/1‑93 (MQ=255)
cGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGGGGTGGGGCGTATCAACAACACCTTCcg < 2:4326602/93‑1 (MQ=255)
gCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgt < 2:1865246/93‑1 (MQ=255)
gCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgt < 1:4186071/93‑1 (MQ=255)
cTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtc < 1:1448375/93‑1 (MQ=255)
tAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtcg < 2:287911/93‑1 (MQ=255)
tAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtcg > 1:989368/1‑93 (MQ=255)
tAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtcg > 1:3469437/1‑93 (MQ=255)
aaCCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtcgt < 1:3554256/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGcc > 2:2546556/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCCTCCGTCGTGcc > 2:2777059/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCg > 2:4062449/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCg > 1:2625574/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCg > 2:3587553/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCg < 1:1593701/93‑1 (MQ=255)
ggcggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGa > 1:665852/1‑93 (MQ=255)
ggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCa > 1:2285120/1‑93 (MQ=255)
cAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGAt < 1:1397136/93‑1 (MQ=255)
cAGCATGTATCCAGATCATTCGCTCTATCCGGCAAACTCTGTTCCAGCTCTGGTAGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGAt < 1:747449/93‑1 (MQ=255)
aGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATc > 2:3852130/1‑93 (MQ=255)
aGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATc > 2:842636/1‑93 (MQ=255)
aGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATc > 1:2041506/1‑93 (MQ=255)
aGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATc > 1:1666653/1‑93 (MQ=255)
aTGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCaa < 1:717016/93‑1 (MQ=255)
aTGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCaa < 1:3501529/93‑1 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt < 1:2594670/93‑1 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt > 2:2178660/1‑93 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTATATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt < 1:3880304/93‑1 (MQ=255)
gTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATg < 2:2944728/93‑1 (MQ=255)
gTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATg < 1:17574/93‑1 (MQ=255)
gTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATg < 1:17573/93‑1 (MQ=255)
gTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATg < 1:4096807/93‑1 (MQ=255)
tATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATgg > 1:3081747/1‑93 (MQ=255)
tCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTc < 2:659653/93‑1 (MQ=255)
tCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTc < 2:659652/93‑1 (MQ=255)
ccGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc < 2:3809397/93‑1 (MQ=255)
ccGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc < 2:1467416/93‑1 (MQ=255)
cGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcg < 2:367542/93‑1 (MQ=255)
cGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcg > 1:3604664/1‑93 (MQ=255)
ggATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgc < 2:1605775/93‑1 (MQ=255)
gATCAGTCCATATATCCGGCAAACGCGGTGACAGCTGTGGTGGGGCGGACCACCAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgcg < 2:757809/93‑1 (MQ=255)
gATCAGTCACTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgcg > 2:604782/1‑93 (MQ=255)
aGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCa > 1:2093373/1‑93 (MQ=255)
aGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCa > 1:321688/1‑93 (MQ=255)
aGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGCCCCCGGGCa > 1:321686/1‑93 (MQ=255)
cGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTg < 2:921307/93‑1 (MQ=255)
gCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGa < 1:4682331/93‑1 (MQ=255)
gCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGa < 1:528758/93‑1 (MQ=255)
gCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGa < 2:4000365/93‑1 (MQ=255)
gCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGa > 1:1460466/1‑93 (MQ=255)
ctctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAg > 2:3103438/1‑93 (MQ=255)
tctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGc < 2:2383588/93‑1 (MQ=255)
tctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGGCCGCGGGCATTGAGc > 1:396994/1‑93 (MQ=255)
ctgtCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGcc < 2:492943/90‑1 (MQ=255)
ctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGcc < 1:2368069/93‑1 (MQ=255)
ctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGcc < 1:4242516/93‑1 (MQ=255)
tATCCGGCAAGCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCg < 2:2608866/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCgg > 2:13951/1‑93 (MQ=255)
aTCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCgg > 1:1043774/1‑93 (MQ=255)
tCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCggg > 2:3279857/1‑93 (MQ=255)
cGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCg > 1:4011234/1‑93 (MQ=255)
cGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCg < 1:1062788/93‑1 (MQ=255)
ggCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAAGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGa < 2:1274822/93‑1 (MQ=255)
gCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGAt < 1:3186749/93‑1 (MQ=255)
gCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGAt > 1:2252369/1‑93 (MQ=255)
aaaCTCGGTGCCAGCTGTGGTTGGGCGGATCAACAACCCCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATcc < 2:1170919/93‑1 (MQ=255)
aaCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcg > 1:4519479/1‑93 (MQ=255)
aCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcgc > 1:429375/1‑93 (MQ=255)
aCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcgc < 1:745297/93‑1 (MQ=255)
cGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCt > 2:2186504/1‑93 (MQ=255)
gTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTAt < 1:2953891/93‑1 (MQ=255)
gTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTAt > 2:3996835/1‑93 (MQ=255)
tGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATg < 1:1670133/93‑1 (MQ=255)
ccAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTc < 2:3490010/93‑1 (MQ=255)
aGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGa > 1:4438247/1‑93 (MQ=255)
gtggtgGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTAc < 2:2367084/93‑1 (MQ=255)
gtgctgGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGTCGGGCAATCCGCGCTATGTCGATTAc < 2:2538685/93‑1 (MQ=255)
tggtggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACt < 1:659569/93‑1 (MQ=255)
ggtggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACtt < 1:1490133/93‑1 (MQ=255)
ggtggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACtt > 2:923948/1‑93 (MQ=255)
tggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTcc < 1:726114/93‑1 (MQ=255)
tggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTcc > 1:1766050/1‑93 (MQ=255)
|
GATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC > NC_000913/4214962‑4215141
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCC > NC_000913/4214959‑4215145
|
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGG < SRR4302544.1873494/94‑1 (MQ=60)
GGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGC < SRR4302544.992442/94‑1 (MQ=60)
GGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGC > SRR4302544.2320775/1‑94 (MQ=60)
GATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCG < SRR4302544.3252584/94‑1 (MQ=60)
ATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGG > SRR4302544.1320852/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGAT < SRR4302544.2426367/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATC < SRR4302544.425502/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATC < SRR4302544.425503/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATC < SRR4302544.3953210/94‑1 (MQ=60)
AGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAA > SRR4302544.1074409/1‑94 (MQ=60)
GGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAAC > SRR4302544.1841363/1‑94 (MQ=60)
CGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACAC > SRR4302544.3932234/1‑94 (MQ=60)
CGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACAC < SRR4302544.2133827/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACAC < SRR4302544.1700829/94‑1 (MQ=60)
GGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACC > SRR4302544.463168/1‑94 (MQ=60)
CGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTT < SRR4302544.1009572/94‑1 (MQ=60)
GACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCC < SRR4302544.381692/94‑1 (MQ=60)
ACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCG > SRR4302544.1677405/1‑94 (MQ=60)
GCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAGCACCTTCCGTC < SRR4302544.4227525/94‑1 (MQ=60)
GCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTC < SRR4302544.4227526/94‑1 (MQ=60)
CTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCG > SRR4302544.999101/1‑94 (MQ=60)
CTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCG < SRR4302544.1462772/94‑1 (MQ=60)
CTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCG > SRR4302544.3502524/1‑94 (MQ=60)
CTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCG > SRR4302544.679978/1‑94 (MQ=60)
TAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGT < SRR4302544.4573358/94‑1 (MQ=60)
AACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTG < SRR4302544.3588307/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCG > SRR4302544.2650748/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGA > SRR4302544.672427/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGA < SRR4302544.1609399/94‑1 (MQ=60)
CGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCA > SRR4302544.2306660/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGA < SRR4302544.3575056/94‑1 (MQ=60)
CCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGCTCAGAC > SRR4302544.3834044/1‑94 (MQ=60)
CAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATC > SRR4302544.2061206/1‑94 (MQ=60)
CAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATC < SRR4302544.1411061/94‑1 (MQ=60)
CAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATC > SRR4302544.1683067/1‑94 (MQ=60)
CAGCATGTATCCAGATCATTCGCTCTATCCGGCAAACTCTGTTCCAGCTCTGGTAGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATC < SRR4302544.754768/94‑1 (MQ=60)
ATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAT < SRR4302544.3534934/94‑1 (MQ=60)
ATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAT < SRR4302544.724098/94‑1 (MQ=60)
TGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATG < SRR4302544.2619624/94‑1 (MQ=60)
TGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATG < SRR4302544.4246333/94‑1 (MQ=60)
TGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATG < SRR4302544.1453297/94‑1 (MQ=60)
TGTATCCGGATCAGTCGCTATATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATG < SRR4302544.3918833/94‑1 (MQ=60)
GTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGG < SRR4302544.17748/94‑1 (MQ=60)
GTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGG < SRR4302544.4137579/94‑1 (MQ=60)
GTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGG < SRR4302544.17747/94‑1 (MQ=60)
GTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGG > SRR4302544.3111103/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTC > SRR4302544.2356570/1‑94 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG > SRR4302544.746267/1‑94 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG > SRR4302544.3639627/1‑94 (MQ=60)
GATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTACCGGTCACATCCAATGGTCCGCGG > SRR4302544.2484821/1‑94 (MQ=60)
CAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCA > SRR4302544.2113526/1‑94 (MQ=60)
CAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCA > SRR4302544.325028/1‑94 (MQ=60)
CAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGCCCCCGGGCA > SRR4302544.325026/1‑94 (MQ=60)
GTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATT > SRR4302544.796793/1‑94 (MQ=60)
CGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGA < SRR4302544.2750379/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGA > SRR4302544.1474960/1‑94 (MQ=60)
GCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAG < SRR4302544.4728618/94‑1 (MQ=60)
GCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAG < SRR4302544.534008/94‑1 (MQ=60)
GCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAG < SRR4302544.1775848/94‑1 (MQ=60)
CTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGC > SRR4302544.3174050/1‑94 (MQ=60)
CTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGGCCGCGGGCATTGAGC > SRR4302544.401015/1‑94 (MQ=60)
CTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCG < SRR4302544.2390474/94‑1 (MQ=60)
CTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCG < SRR4302544.4285766/94‑1 (MQ=60)
CTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCG > SRR4302544.3241426/1‑94 (MQ=60)
TATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGG > SRR4302544.1054131/1‑94 (MQ=60)
CCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCG > SRR4302544.4051136/1‑94 (MQ=60)
CGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGA < SRR4302544.1073357/94‑1 (MQ=60)
GGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGAT > SRR4302544.2273543/1‑94 (MQ=60)
GGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGAT > SRR4302544.2273542/1‑94 (MQ=60)
GCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATC < SRR4302544.3217097/94‑1 (MQ=60)
AAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCG > SRR4302544.4564733/1‑94 (MQ=60)
AAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCG < SRR4302544.3694433/94‑1 (MQ=60)
AAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCG < SRR4302544.148867/94‑1 (MQ=60)
AACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGC > SRR4302544.433730/1‑94 (MQ=60)
ACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCG < SRR4302544.752590/94‑1 (MQ=60)
GGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTAT < SRR4302544.4459882/94‑1 (MQ=60)
GTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATG < SRR4302544.2982264/94‑1 (MQ=60)
TGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGT < SRR4302544.1686590/94‑1 (MQ=60)
CCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCCGGCACTGAGCCGGGCCGTCCGCGCTATATCG > SRR4302544.4166985/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGA > SRR4302544.4482998/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGTGGTGGGGCGGATAAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGA > SRR4302544.4283579/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTGGGGCTGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTAC < SRR4302544.480520/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTT < SRR4302544.666091/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTT < SRR4302544.666092/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGGGCGGACCAACAACGCCTTCCGTCGTGGCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTT < SRR4302544.2124885/94‑1 (MQ=60)
GGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTC < SRR4302544.1504864/94‑1 (MQ=60)
GTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC > SRR4302544.1783330/1‑94 (MQ=60)
TGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCT < SRR4302544.733242/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCT < SRR4302544.4025987/94‑1 (MQ=60)
GGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCC < SRR4302544.3301128/94‑1 (MQ=60)
|
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCC > NC_000913/4214959‑4215145
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
