Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,215,052 |
A→G |
E122G (GAG→GGG) |
aceA → |
isocitrate lyase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,215,052 | 0 | A | G | 100.0%
| 789.2
/ NA
| 244 | E122G (GAG→GGG) | aceA | isocitrate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (109/135); total (109/135) |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
GATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC > NC_000913/4214962‑4215141
|
gATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGc < 2:3511511/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCgg > 1:268315/1‑93 (MQ=255)
ggCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGa > 2:4877721/1‑93 (MQ=255)
ggCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGa < 1:830369/93‑1 (MQ=255)
gCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGAt < 1:3773167/93‑1 (MQ=255)
cAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATc < 1:932299/93‑1 (MQ=255)
ggTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaa > 1:4784233/1‑93 (MQ=255)
ggTAGCGGCGGACGATAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTAGCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaa < 1:6421121/93‑1 (MQ=255)
aGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaacaa < 1:1006359/93‑1 (MQ=255)
aGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATcaacaa < 2:6034783/93‑1 (MQ=255)
gcggcgGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCaacaac > 2:1972617/1‑93 (MQ=255)
ggcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAacac < 1:1599033/93‑1 (MQ=255)
ggcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAacac > 2:5514845/1‑93 (MQ=255)
gcggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACAcc < 1:1632374/93‑1 (MQ=255)
cggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCt > 1:5559672/1‑93 (MQ=255)
cggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCt < 2:4059320/93‑1 (MQ=255)
cggACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCt < 1:5739260/93‑1 (MQ=255)
aCGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTcc < 1:6201572/93‑1 (MQ=255)
cTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGTGGCGGATCAACAACACCTTCcgtc < 1:1476522/93‑1 (MQ=255)
cTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtc > 1:3419958/1‑93 (MQ=255)
cTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGACGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtc > 1:6553762/1‑93 (MQ=255)
tAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCcgtcg > 2:3792839/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTg > 1:1078475/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTg < 1:3005997/93‑1 (MQ=255)
aCCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTg > 2:6402931/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTg > 2:2808392/1‑93 (MQ=255)
aCCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTg > 2:2629606/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGcc > 1:2986471/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGTGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCg < 2:6327165/93‑1 (MQ=255)
ggcggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGa > 2:377835/1‑93 (MQ=255)
ggcggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGa > 2:6619766/1‑93 (MQ=255)
ggcggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGa > 2:1021253/1‑93 (MQ=255)
gccggcCAGCATGTATCCGGATCACTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGa < 1:1213245/91‑1 (MQ=255)
cggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATc > 1:1122936/1‑93 (MQ=255)
cggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATc < 1:591926/93‑1 (MQ=255)
ggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACCCCTTCCGTCGTGCCGATCa < 2:4437575/93‑1 (MQ=255)
ggcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCa < 1:2174563/93‑1 (MQ=255)
gcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAg > 1:6065485/1‑93 (MQ=255)
gcCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAg > 2:3741918/1‑93 (MQ=255)
aGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATc < 2:3243974/93‑1 (MQ=255)
aGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATc < 2:3676111/93‑1 (MQ=255)
gCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATcc < 2:3049544/93‑1 (MQ=255)
gCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATcc > 1:681471/1‑93 (MQ=255)
aTGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCaa > 1:215685/1‑93 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt > 2:1121508/1‑93 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt > 2:5596592/1‑93 (MQ=255)
tGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAt < 2:872285/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGt < 1:4385259/93‑1 (MQ=255)
aTCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGt < 1:2370555/93‑1 (MQ=255)
tCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTc > 2:733675/1‑93 (MQ=255)
tCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTc > 1:5333234/1‑93 (MQ=255)
tCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTc > 2:5614046/1‑93 (MQ=255)
ccGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc < 2:1630818/93‑1 (MQ=255)
ccGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc < 1:3594784/93‑1 (MQ=255)
ccGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc > 2:4936068/1‑93 (MQ=255)
ccGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTcc < 1:2803997/93‑1 (MQ=255)
cGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcg < 2:3093287/93‑1 (MQ=255)
cGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcg < 1:1840633/93‑1 (MQ=255)
gATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgcg < 1:4099917/93‑1 (MQ=255)
gATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgcg > 2:1370294/1‑93 (MQ=255)
gATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgcg < 2:3351278/93‑1 (MQ=255)
aTCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCgg < 2:624776/93‑1 (MQ=255)
aTCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCgg < 1:4751607/93‑1 (MQ=255)
tCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCggg > 2:655633/1‑93 (MQ=255)
tCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAtt < 1:4317448/93‑1 (MQ=255)
tCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAtt < 2:1940019/93‑1 (MQ=255)
tCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAtt < 2:1084902/93‑1 (MQ=255)
tCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAtt < 1:889527/93‑1 (MQ=255)
tCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAtt < 1:668617/93‑1 (MQ=255)
cGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTg < 1:4005666/93‑1 (MQ=255)
gCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGa < 2:3306745/93‑1 (MQ=255)
ctctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAg < 1:6171705/93‑1 (MQ=255)
ctctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAg < 2:3447767/93‑1 (MQ=255)
ctctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAg > 2:1787442/1‑93 (MQ=255)
tctATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGc > 1:1348788/1‑93 (MQ=255)
tATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCg < 2:2133300/93‑1 (MQ=255)
tCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTTGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCggg > 1:4733337/1‑93 (MQ=255)
tCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCggg > 2:4209552/1‑93 (MQ=255)
ccGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGc < 1:3544413/93‑1 (MQ=255)
cGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCg > 2:5558911/1‑93 (MQ=255)
ggCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGa > 1:6119497/1‑93 (MQ=255)
ggCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCAATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGa < 1:4910832/93‑1 (MQ=255)
gCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGAt < 2:3928739/93‑1 (MQ=255)
gCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGAt < 1:2486084/93‑1 (MQ=255)
cAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATc > 1:3432792/1‑93 (MQ=255)
aaaCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATcc < 2:2676844/93‑1 (MQ=255)
aaCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCcg > 2:747629/1‑93 (MQ=255)
aaCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGACGGGCGATCcg > 1:5980717/1‑93 (MQ=255)
cGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCt < 1:5294898/93‑1 (MQ=255)
ggTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTa > 2:2276781/1‑93 (MQ=255)
ggTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTa < 1:4617415/93‑1 (MQ=255)
tGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATg < 1:1863761/93‑1 (MQ=255)
gCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGt < 1:3893201/93‑1 (MQ=255)
ccAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGtg > 2:4978563/1‑92 (MQ=255)
ccAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTc < 1:1999631/93‑1 (MQ=255)
cAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCg < 2:5891743/93‑1 (MQ=255)
gCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGAt < 2:509023/93‑1 (MQ=255)
gCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGAt > 1:3162596/1‑93 (MQ=255)
cTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGAtt < 2:4703018/93‑1 (MQ=255)
gtggGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTc < 2:24314/93‑1 (MQ=255)
|
GATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC > NC_000913/4214962‑4215141
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCC > NC_000913/4214959‑4215145
|
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGG < SRR4302536.2315655/94‑1 (MQ=60)
GGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCTGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGC < SRR4302536.3034356/94‑1 (MQ=60)
GGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGC < SRR4302536.1519754/94‑1 (MQ=60)
GATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCG < SRR4302536.4630232/94‑1 (MQ=60)
ATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGG > SRR4302536.2237191/1‑94 (MQ=60)
ATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGG > SRR4302536.275468/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGA > SRR4302536.3587458/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGA < SRR4302536.2044851/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGA > SRR4302536.3817787/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGAT < SRR4302536.854811/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATC < SRR4302536.3885784/94‑1 (MQ=60)
CAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCA < SRR4302536.959760/94‑1 (MQ=60)
AGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAA > SRR4302536.4798535/1‑94 (MQ=60)
AGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAA > SRR4302536.4928269/1‑94 (MQ=60)
GGTAGCGGCGGACGATAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTAGCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAAC < SRR4302536.6613033/94‑1 (MQ=60)
AGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAAC > SRR4302536.804207/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAAC > SRR4302536.1342712/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAAC > SRR4302536.5702831/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAAC < SRR4302536.1036044/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGACGCTAACCTGGCCGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACAC > SRR4302536.3079616/1‑94 (MQ=60)
GGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACC < SRR4302536.1645726/94‑1 (MQ=60)
GGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACC < SRR4302536.3531579/94‑1 (MQ=60)
GCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCT < SRR4302536.1679908/94‑1 (MQ=60)
GCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCT > SRR4302536.5725246/1‑94 (MQ=60)
CGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTT < SRR4302536.5398174/94‑1 (MQ=60)
CGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTT < SRR4302536.5909990/94‑1 (MQ=60)
GGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTC > SRR4302536.2197950/1‑94 (MQ=60)
GACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCC < SRR4302536.1081454/94‑1 (MQ=60)
ACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCG < SRR4302536.6232119/94‑1 (MQ=60)
ACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCG < SRR4302536.2088835/94‑1 (MQ=60)
ACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCG < SRR4302536.6386289/94‑1 (MQ=60)
ACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCG > SRR4302536.912393/1‑94 (MQ=60)
GCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTC > SRR4302536.3521743/1‑94 (MQ=60)
GCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGACGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTC > SRR4302536.6748927/1‑94 (MQ=60)
CTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGTGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCG < SRR4302536.1520175/94‑1 (MQ=60)
TAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGT < SRR4302536.3777580/94‑1 (MQ=60)
TAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGT > SRR4302536.6148796/1‑94 (MQ=60)
AACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTG > SRR4302536.1110761/1‑94 (MQ=60)
AACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTG > SRR4302536.3961098/1‑94 (MQ=60)
AACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTG > SRR4302536.1781364/1‑94 (MQ=60)
AACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTG < SRR4302536.1479381/94‑1 (MQ=60)
ACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGC > SRR4302536.362352/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGC < SRR4302536.3094376/94‑1 (MQ=60)
CCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCC > SRR4302536.3074356/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCC > SRR4302536.2329658/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCG > SRR4302536.95313/1‑94 (MQ=60)
GCCGGCCAGCATGTATCCGGATCACTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGAT < SRR4302536.1249686/94‑1 (MQ=60)
GCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATC < SRR4302536.1643730/94‑1 (MQ=60)
GCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATC > SRR4302536.1156665/1‑94 (MQ=60)
CGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCA < SRR4302536.607732/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCATGTATCCGGATCATTCGCTCTATCCTGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTGCCGTCGTGCCGATCAG < SRR4302536.5480245/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAG > SRR4302536.6246433/1‑94 (MQ=60)
GGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAG < SRR4302536.2240055/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGA < SRR4302536.6899283/94‑1 (MQ=60)
AGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCC > SRR4302536.701449/1‑94 (MQ=60)
GCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCA < SRR4302536.2901728/94‑1 (MQ=60)
CATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAA > SRR4302536.221405/1‑94 (MQ=60)
ATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAAT < SRR4302536.4210960/94‑1 (MQ=60)
GTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGG < SRR4302536.4524169/94‑1 (MQ=60)
GTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGG > SRR4302536.6423778/1‑94 (MQ=60)
TATCCGTATCAGTCTCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGT < SRR4302536.3354289/94‑1 (MQ=60)
TATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGT < SRR4302536.99446/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTC < SRR4302536.2442398/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTC > SRR4302536.5492583/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTC > SRR4302536.4785484/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTC < SRR4302536.4516206/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTC < SRR4302536.162875/94‑1 (MQ=60)
TCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCC < SRR4302536.6668665/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG < SRR4302536.6696206/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG < SRR4302536.2887149/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG < SRR4302536.3702286/94‑1 (MQ=60)
CCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCG > SRR4302536.4507673/1‑94 (MQ=60)
CGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGC < SRR4302536.1896125/94‑1 (MQ=60)
GATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGG > SRR4302536.4903326/1‑94 (MQ=60)
GATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGG < SRR4302536.4221521/94‑1 (MQ=60)
ATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGG < SRR4302536.4894593/94‑1 (MQ=60)
ATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGG > SRR4302536.6827991/1‑94 (MQ=60)
CAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCA > SRR4302536.1900781/1‑94 (MQ=60)
AGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGCTCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAT > SRR4302536.2497430/1‑94 (MQ=60)
AGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAT < SRR4302536.5986378/94‑1 (MQ=60)
AGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCAT < SRR4302536.5182023/94‑1 (MQ=60)
GTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATT > SRR4302536.4882342/1‑94 (MQ=60)
TCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTG < SRR4302536.4446718/94‑1 (MQ=60)
TCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTG < SRR4302536.915727/94‑1 (MQ=60)
TCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTG < SRR4302536.301110/94‑1 (MQ=60)
TCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTG < SRR4302536.688224/94‑1 (MQ=60)
CGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGA < SRR4302536.4124529/94‑1 (MQ=60)
GCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAG > SRR4302536.942520/1‑94 (MQ=60)
CTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGC < SRR4302536.6355537/94‑1 (MQ=60)
CTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGC > SRR4302536.1389016/1‑94 (MQ=60)
CTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGC > SRR4302536.2649553/1‑94 (MQ=60)
TATCCGGCAATCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGG < SRR4302536.6683090/94‑1 (MQ=60)
TATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGTTCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGG > SRR4302536.6932900/1‑94 (MQ=60)
TATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGG < SRR4302536.1152220/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTTGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGG > SRR4302536.4875789/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGG > SRR4302536.3252271/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGG > SRR4302536.1151533/1‑94 (MQ=60)
TCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACGACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGC > SRR4302536.6098855/1‑94 (MQ=60)
TCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGC > SRR4302536.6378295/1‑94 (MQ=60)
CCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCG < SRR4302536.3650386/94‑1 (MQ=60)
CGGCAAGCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACGCCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGA < SRR4302536.4257823/94‑1 (MQ=60)
CGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGTCGATCACATCCCATGGTCTGCGGGCATTGAGCCGGGCGA > SRR4302536.4556577/1‑94 (MQ=60)
CGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGA < SRR4302536.17362/94‑1 (MQ=60)
CGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGA > SRR4302536.6301886/1‑94 (MQ=60)
GGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCAATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGAT < SRR4302536.5058456/94‑1 (MQ=60)
GCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATC < SRR4302536.2561095/94‑1 (MQ=60)
GCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATC > SRR4302536.3534976/1‑94 (MQ=60)
CAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCC < SRR4302536.1679340/94‑1 (MQ=60)
CAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCC < SRR4302536.6300255/94‑1 (MQ=60)
AAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCG > SRR4302536.3676952/1‑94 (MQ=60)
AAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCG > SRR4302536.2635808/1‑94 (MQ=60)
AAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGACGGGCGATCCG > SRR4302536.6159038/1‑94 (MQ=60)
TCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCT < SRR4302536.4092267/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTA < SRR4302536.5452784/94‑1 (MQ=60)
GGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTAT > SRR4302536.4444987/1‑94 (MQ=60)
GGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTAT < SRR4302536.4756118/94‑1 (MQ=60)
GTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATG < SRR4302536.1373675/94‑1 (MQ=60)
GTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATG < SRR4302536.4906595/94‑1 (MQ=60)
GTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATG < SRR4302536.636563/94‑1 (MQ=60)
TGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGT < SRR4302536.1919884/94‑1 (MQ=60)
TGCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGT > SRR4302536.4123770/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTC < SRR4302536.4008954/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTC < SRR4302536.5589298/94‑1 (MQ=60)
CCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCG < SRR4302536.3511415/94‑1 (MQ=60)
CCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCG < SRR4302536.2059809/94‑1 (MQ=60)
CCAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGCCGTGCCGATCAGACCCAATGGTCCGCGGGaatgcagccgggggatcggcggcatgtcg > SRR4302536.3326006/1‑65 (MQ=60)
CAGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGA < SRR4302536.4983683/94‑1 (MQ=60)
AGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACCCCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGAT < SRR4302536.3190508/94‑1 (MQ=60)
AGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGAT > SRR4302536.3255239/1‑94 (MQ=60)
AGCTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGAT < SRR4302536.5918593/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGTGGGGCGGATCACCAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTA < SRR4302536.1974416/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGTGGGGCGGATCAACAACGCCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTA < SRR4302536.122379/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTA < SRR4302536.876577/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTAC > SRR4302536.6278592/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACT < SRR4302536.2781945/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTT < SRR4302536.6341662/94‑1 (MQ=60)
GTGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCC < SRR4302536.5792830/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCT < SRR4302536.2277369/94‑1 (MQ=60)
GGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTG < SRR4302536.2465668/94‑1 (MQ=60)
GGGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTG < SRR4302536.1103620/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGC < SRR4302536.5846733/94‑1 (MQ=60)
GGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCC < SRR4302536.4463021/94‑1 (MQ=60)
|
CGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGATCAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCC > NC_000913/4214959‑4215145
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
