Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1357 |
179.3 |
9500450 |
96.1% |
9129932 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,236,786 |
A→G |
Y525C (TAC→TGC) |
yjbH → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,236,786 | 0 | A | G | 96.8%
| 572.2
/ 3.7
| 186 | Y525C (TAC→TGC) | yjbH | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/4); new base G (91/89); total (93/93) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.82e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
GCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG > NC_000913/4236697‑4236875
|
gcgcGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACgg < 2:1551024/93‑1 (MQ=255)
gcgAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCggtg < 1:2155779/93‑1 (MQ=255)
gAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCggtggt < 2:47897/93‑1 (MQ=255)
gAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCggtggt < 2:3659527/93‑1 (MQ=255)
aTGTGCAGAACGATGTGTATGTGGATAACCTTCAAGCCAACTACTCCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACCTTCAGGTCTGCGGTGGTTaac < 2:1657056/93‑3 (MQ=255)
aTGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAtc < 1:1087111/93‑1 (MQ=255)
aTGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAtc < 1:1493485/93‑1 (MQ=255)
aTGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAtc > 1:2557328/1‑93 (MQ=255)
gtgCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAtctc < 1:1154063/93‑1 (MQ=255)
aGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGaac > 1:746833/1‑92 (MQ=255)
aGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGaaa < 1:2572081/93‑1 (MQ=255)
gAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAc < 2:1952367/93‑1 (MQ=255)
aCGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCa < 1:3177683/93‑1 (MQ=255)
aCGATGTCTATGTGAATAACCTGAAAGCAAACTACTTCCAGAATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAACTCGAAACCa < 1:4196468/93‑1 (MQ=255)
cGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAt > 2:937357/1‑93 (MQ=255)
cGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAt > 2:4426153/1‑93 (MQ=255)
gATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATg > 2:3462718/1‑93 (MQ=255)
gATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATg > 1:3879771/1‑93 (MQ=255)
gATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATg > 1:327962/1‑93 (MQ=255)
gATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGCCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATg < 1:333381/93‑1 (MQ=255)
aTGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGt < 1:1793281/93‑1 (MQ=255)
aTGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGt > 2:2545912/1‑93 (MQ=255)
tCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTg < 2:3566433/93‑1 (MQ=255)
tgtgAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCgg > 1:3833901/1‑93 (MQ=255)
gtgAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCggg > 1:2507427/1‑92 (MQ=255)
gtgAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGt < 2:2533332/93‑1 (MQ=255)
taaTAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGc < 1:1173888/92‑1 (MQ=255)
gAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGc < 1:856172/93‑1 (MQ=255)
gAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGc < 1:4534548/93‑1 (MQ=255)
aTACCCTGCAAGCCAACTCCTTCCAGCCGCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGTCGGTGCgg < 1:4636025/93‑1 (MQ=255)
aTAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCgg < 2:4743140/93‑1 (MQ=255)
aTAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCgg < 1:4636024/93‑1 (MQ=255)
aTAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCgg > 2:2132339/1‑93 (MQ=255)
tAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGgcggggcggg > 2:1870168/1‑93 (MQ=255)
tAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggg < 1:3467758/93‑1 (MQ=255)
tAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggg < 1:2335044/93‑1 (MQ=255)
aaaCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggg < 1:3167456/92‑1 (MQ=255)
aaCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCgggg < 1:3215793/93‑1 (MQ=255)
aCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggggg < 1:3524089/93‑1 (MQ=255)
aCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggggg < 1:4055984/93‑1 (MQ=255)
aCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggggg > 1:3950346/1‑93 (MQ=255)
ccTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGc < 1:3440566/93‑1 (MQ=255)
ccTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGc < 2:1969707/93‑1 (MQ=255)
cTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCa < 2:3770747/93‑1 (MQ=255)
cTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCa < 2:3099802/93‑1 (MQ=255)
tGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAg > 1:4206546/1‑93 (MQ=255)
tGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAg > 2:1077990/1‑93 (MQ=255)
cAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGaa > 2:2031527/1‑93 (MQ=255)
cAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGaa < 1:2014302/93‑1 (MQ=255)
aaGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAg < 1:2640293/93‑1 (MQ=255)
aaGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAg > 2:4507636/1‑93 (MQ=255)
aaGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAg < 1:1428123/93‑1 (MQ=255)
gCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgtg < 1:1577759/93‑1 (MQ=255)
ccACCTACTTCGAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAGCTCGAAACCATGTTTGGCAGTGCGGGGGCAGAAgtct < 2:4407248/93‑3 (MQ=255)
ccAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgtgt < 1:4615739/93‑1 (MQ=255)
cAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgtt < 1:4714953/93‑1 (MQ=255)
cAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgtt < 1:138940/93‑1 (MQ=255)
cAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTAAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgtt > 2:1212487/1‑93 (MQ=255)
aaCTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgttg > 1:2287875/1‑93 (MQ=255)
aaCTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgttg > 1:3762442/1‑93 (MQ=255)
actactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgttgt > 2:2988117/1‑93 (MQ=255)
tactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAt > 1:1006817/1‑93 (MQ=255)
tactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAt > 1:4317346/1‑93 (MQ=255)
ctTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATcc > 2:3453110/1‑92 (MQ=255)
ttCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGc < 2:4177403/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGCATCTGGGCAACGGCTTATACGGTCAGGTCTGCAGCGGTTATCTCGAAACCATGCTTGGCGGTGGGGGGGCAGAAGCGTTGTATCGc > 2:1611148/1‑93 (MQ=255)
tCCAGCATCTGGGCCACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGcc < 1:860273/93‑1 (MQ=255)
ccAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGccc > 2:1371525/1‑93 (MQ=255)
aTCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTgg > 2:1310191/1‑93 (MQ=255)
tGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACa < 1:4365899/93‑1 (MQ=255)
tGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACa < 2:2176145/93‑1 (MQ=255)
gggCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAg > 2:4647362/1‑93 (MQ=255)
ggCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGc < 1:1291833/93‑1 (MQ=255)
cAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAGCCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCaa < 2:112621/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAAc < 1:4481931/93‑1 (MQ=255)
aCGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAACTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGCATCGCCCGCTGGACAGCAACt > 2:562881/1‑93 (MQ=255)
cgtcTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTg < 1:2087660/90‑1 (MQ=255)
tCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGt > 1:4738624/1‑93 (MQ=255)
tACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGttt < 1:2049987/93‑1 (MQ=255)
tACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGttt > 2:4019531/1‑93 (MQ=255)
aCGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTGTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTg < 2:261890/93‑1 (MQ=255)
aCGGTCAGGTCTGAGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTg < 1:4235063/93‑1 (MQ=255)
cGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGTGCGTTTgg > 2:2147317/1‑93 (MQ=255)
gTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGTGCGCTTGGTc > 2:3179099/1‑93 (MQ=255)
gTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTc < 1:2803596/93‑1 (MQ=255)
gTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTc > 2:3179098/1‑93 (MQ=255)
gTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTc < 2:3033814/93‑1 (MQ=255)
gTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTc > 2:1146483/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCt > 2:1380555/1‑93 (MQ=255)
cAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTg < 2:1698424/93‑1 (MQ=255)
aGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTgg > 1:1878510/1‑93 (MQ=255)
aGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTgg > 2:243906/1‑93 (MQ=255)
ggTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTggt > 2:2367659/1‑92 (MQ=255)
ggTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGa < 2:4568131/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGa > 1:2723591/1‑93 (MQ=255)
ggTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGCCTGGa > 2:1346822/1‑93 (MQ=255)
gTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAt > 1:783853/1‑93 (MQ=255)
gTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAt < 2:79369/93‑1 (MQ=255)
tCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATg > 2:2740178/1‑93 (MQ=255)
tCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATg > 1:2919151/1‑93 (MQ=255)
|
GCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG > NC_000913/4236697‑4236875
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG > NC_000913/4236694‑4236875
|
TGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGC > SRR4302544.2303655/1‑94 (MQ=60)
TGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGC < SRR4302544.149172/94‑1 (MQ=60)
CGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTG < SRR4302544.2550918/94‑1 (MQ=60)
GCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGG < SRR4302544.2176271/94‑1 (MQ=60)
CGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGT < SRR4302544.2028508/94‑1 (MQ=60)
TATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATC > SRR4302544.2581886/1‑94 (MQ=60)
TATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATC > SRR4302544.1173402/1‑94 (MQ=60)
ATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCT < SRR4302544.1097921/94‑1 (MQ=60)
ATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCT < SRR4302544.1508255/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCG < SRR4302544.1165538/94‑1 (MQ=60)
GCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAA > SRR4302544.4043872/1‑94 (MQ=60)
CAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAC > SRR4302544.754149/1‑94 (MQ=60)
AGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAC < SRR4302544.2596795/94‑1 (MQ=60)
ACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAT < SRR4302544.3207920/94‑1 (MQ=60)
ACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAT < SRR4302544.326393/94‑1 (MQ=60)
ACGATGTCTATGTGAATAACCTGAAAGCAAACTACTTCCAGAATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAACTCGAAACCAT < SRR4302544.4238167/94‑1 (MQ=60)
CGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATG > SRR4302544.3918295/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATG > SRR4302544.331371/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATG > SRR4302544.4395489/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCTATGTGAATAACCTGAAAGCCAAATACTTCCAGCATCTGGGCAACGGATTCTACGGTCAGGACAAAAGTGGTTATCTCGAAACAATG < SRR4302544.3632055/94‑1 (MQ=60)
GATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGCCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGT < SRR4302544.336845/94‑1 (MQ=60)
ATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTT < SRR4302544.1810813/94‑1 (MQ=60)
ATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTT < SRR4302544.3222054/94‑1 (MQ=60)
ATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGG > SRR4302544.3871914/1‑94 (MQ=60)
TGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTTGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGT > SRR4302544.860309/1‑94 (MQ=60)
TGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGT > SRR4302544.4695113/1‑94 (MQ=60)
TGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGG > SRR4302544.2531468/1‑94 (MQ=60)
GTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTG < SRR4302544.2665434/94‑1 (MQ=60)
TGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGC < SRR4302544.3476795/94‑1 (MQ=60)
TAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCG < SRR4302544.1185600/94‑1 (MQ=60)
GAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCG < SRR4302544.864642/94‑1 (MQ=60)
GAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCG < SRR4302544.4579891/94‑1 (MQ=60)
GAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCG < SRR4302544.4249960/94‑1 (MQ=60)
AATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCCAAACCATGTTTGGCGGTGCGG > SRR4302544.2383102/1‑94 (MQ=60)
ATACCCTGCAAGCCAACTCCTTCCAGCCGCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGTCGGTGCGGG < SRR4302544.4681960/94‑1 (MQ=60)
ATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGG < SRR4302544.4681958/94‑1 (MQ=60)
ATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGG > SRR4302544.1215053/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGG < SRR4302544.4681959/94‑1 (MQ=60)
TAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGG < SRR4302544.2357177/94‑1 (MQ=60)
TAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGG < SRR4302544.3500835/94‑1 (MQ=60)
AAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGG < SRR4302544.3197602/94‑1 (MQ=60)
AACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGG > SRR4302544.3989605/1‑94 (MQ=60)
AACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGG < SRR4302544.3246470/94‑1 (MQ=60)
ACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGC < SRR4302544.3000476/94‑1 (MQ=60)
ACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGC < SRR4302544.4096381/94‑1 (MQ=60)
ACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGC < SRR4302544.3557757/94‑1 (MQ=60)
ACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGC < SRR4302544.3557755/94‑1 (MQ=60)
CCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCA < SRR4302544.3473452/94‑1 (MQ=60)
CTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGGAG > SRR4302544.1464127/1‑94 (MQ=60)
CTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAG > SRR4302544.4248766/1‑94 (MQ=60)
CAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAG < SRR4302544.2033875/94‑1 (MQ=60)
AAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGT < SRR4302544.1442326/94‑1 (MQ=60)
AAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGT < SRR4302544.2665601/94‑1 (MQ=60)
AGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTG < SRR4302544.3986793/94‑1 (MQ=60)
AGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTG < SRR4302544.2192989/94‑1 (MQ=60)
GCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGT < SRR4302544.1593350/94‑1 (MQ=60)
CCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTT < SRR4302544.4661563/94‑1 (MQ=60)
CAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTG > SRR4302544.3799778/1‑94 (MQ=60)
CAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTG < SRR4302544.140257/94‑1 (MQ=60)
CAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTG > SRR4302544.2309445/1‑94 (MQ=60)
CAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTG < SRR4302544.4761528/94‑1 (MQ=60)
AACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGGCTGCGGTGGGTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGT < SRR4302544.513029/94‑1 (MQ=60)
CTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAT > SRR4302544.4361323/1‑94 (MQ=60)
CTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAT > SRR4302544.1016826/1‑94 (MQ=60)
TACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATC < SRR4302544.3204787/94‑1 (MQ=60)
TACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATC > SRR4302544.2831288/1‑94 (MQ=60)
TCCAGCATCTGGGCCACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCC < SRR4302544.868781/94‑1 (MQ=60)
TCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCC > SRR4302544.2090618/1‑94 (MQ=60)
TCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCC < SRR4302544.4473459/94‑1 (MQ=60)
CCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCG > SRR4302544.1153722/1‑94 (MQ=60)
CGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCT < SRR4302544.1432561/94‑1 (MQ=60)
ATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGGCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGA > SRR4302544.2128818/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACA < SRR4302544.463986/94‑1 (MQ=60)
TGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAG < SRR4302544.4410181/94‑1 (MQ=60)
GGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCA < SRR4302544.1304546/94‑1 (MQ=60)
CAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAAC < SRR4302544.893748/94‑1 (MQ=60)
AACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACT < SRR4302544.4281795/94‑1 (MQ=60)
AACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACT < SRR4302544.4526977/94‑1 (MQ=60)
CGTCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGG < SRR4302544.2107745/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGG > SRR4302544.1528166/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGG < SRR4302544.2335082/94‑1 (MQ=60)
CTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCG > SRR4302544.3888207/1‑94 (MQ=60)
TTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGT > SRR4302544.4785329/1‑94 (MQ=60)
TACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTG > SRR4302544.4247621/1‑94 (MQ=60)
TACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTG < SRR4302544.786398/94‑1 (MQ=60)
TACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTG < SRR4302544.2069728/94‑1 (MQ=60)
TACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAGCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTG < SRR4302544.2762436/94‑1 (MQ=60)
ACGGTCAGGTCTGAGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGG < SRR4302544.4278229/94‑1 (MQ=60)
CGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGT < SRR4302544.4771173/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTC < SRR4302544.867211/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTC > SRR4302544.1363471/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCT < SRR4302544.2830622/94‑1 (MQ=60)
GTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCT < SRR4302544.1729660/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTG > SRR4302544.3835689/1‑94 (MQ=60)
CAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGG > SRR4302544.1896672/1‑94 (MQ=60)
AGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGA > SRR4302544.3462332/1‑94 (MQ=60)
AGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGA > SRR4302544.2749814/1‑94 (MQ=60)
AGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGA > SRR4302544.2749816/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAT > SRR4302544.205479/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAT > SRR4302544.791443/1‑94 (MQ=60)
GTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG < SRR4302544.4549834/94‑1 (MQ=60)
GTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG > SRR4302544.2947220/1‑94 (MQ=60)
|
TGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG > NC_000913/4236694‑4236875
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
