Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,236,786 |
A→G |
Y525C (TAC→TGC) |
yjbH → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,236,786 | 0 | A | G | 100.0%
| 885.5
/ NA
| 270 | Y525C (TAC→TGC) | yjbH | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (138/132); total (138/132) |
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
GCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG > NC_000913/4236697‑4236875
|
gAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCggtggt < 1:494697/93‑1 (MQ=255)
gAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCggtggt > 1:4503359/1‑93 (MQ=255)
gAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACCGTCAGGTGTGCgctggt > 2:2887487/1‑93 (MQ=255)
aGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGtt > 2:6052234/1‑93 (MQ=255)
gTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTa < 2:6598008/93‑1 (MQ=255)
aTGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAtc < 1:3009276/93‑1 (MQ=255)
aTGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGCTAtc > 1:4100274/1‑93 (MQ=255)
tgtgCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAtct > 1:1993991/1‑93 (MQ=255)
tgtgCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGGTAtct > 1:3997433/1‑93 (MQ=255)
tgCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCg < 2:1339245/93‑1 (MQ=255)
tgCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCg > 1:6417337/1‑93 (MQ=255)
gCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGa > 2:5017006/1‑93 (MQ=255)
gCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGa > 1:3194463/1‑93 (MQ=255)
gCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGa < 1:1472350/93‑1 (MQ=255)
aaCGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAcc < 2:3547397/93‑1 (MQ=255)
aCGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCa > 1:1506728/1‑93 (MQ=255)
cGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAt < 1:5708911/93‑1 (MQ=255)
gATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAACCCATg < 1:4340796/93‑1 (MQ=255)
gATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATg > 2:816855/1‑93 (MQ=255)
aTGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGt > 2:6505859/1‑93 (MQ=255)
tGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGtt < 1:789389/93‑1 (MQ=255)
tGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGtt < 2:1485508/93‑1 (MQ=255)
cTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTgg > 2:3481294/1‑93 (MQ=255)
tATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTggg > 2:1209994/1‑92 (MQ=255)
aTGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCg > 2:3261024/1‑93 (MQ=255)
aTGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCg > 2:1819981/1‑93 (MQ=255)
tgtgAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCgg < 1:5232067/93‑1 (MQ=255)
tgAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTg > 2:3717032/1‑93 (MQ=255)
gAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGc < 2:6210924/93‑1 (MQ=255)
aaTAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCg > 1:5103428/1‑93 (MQ=255)
aaTAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCg > 2:2628732/1‑93 (MQ=255)
aCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggggg < 1:101396/93‑1 (MQ=255)
ccTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGc < 2:2486975/93‑1 (MQ=255)
cTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTTGCGGTGCGGGGGCa > 1:5208647/1‑93 (MQ=255)
cTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCa < 1:2783668/93‑1 (MQ=255)
cTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCa > 1:2107950/1‑93 (MQ=255)
tGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGGTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAg > 2:2478790/1‑93 (MQ=255)
cAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGaa > 2:6295984/1‑93 (MQ=255)
aGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgt > 2:5709019/1‑93 (MQ=255)
aGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGCTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgt < 2:3812609/93‑1 (MQ=255)
gCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgtg > 1:6615926/1‑93 (MQ=255)
ccAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgtgt < 1:5934423/93‑1 (MQ=255)
ccAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgtgt < 1:6021619/93‑1 (MQ=255)
ccAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgtgt > 2:6206053/1‑93 (MQ=255)
ccAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgtgt > 1:3462308/1‑93 (MQ=255)
ctactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTa > 2:3054033/1‑93 (MQ=255)
ctactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTa > 2:4062173/1‑93 (MQ=255)
tactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAt > 1:2414035/1‑93 (MQ=255)
actTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATc < 2:6381692/93‑1 (MQ=255)
actTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATc > 2:5960589/1‑93 (MQ=255)
actTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATc < 1:6068042/93‑1 (MQ=255)
ctTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCg > 2:1773372/1‑93 (MQ=255)
ctTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCg > 1:5055374/1‑93 (MQ=255)
ttCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGc < 2:6094836/93‑1 (MQ=255)
tCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGcc > 1:6486002/1‑93 (MQ=255)
ccAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGccc < 1:417045/93‑1 (MQ=255)
ccAGCATCTGGCCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGccc < 1:4397001/93‑1 (MQ=255)
aGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGc > 2:1989547/1‑93 (MQ=255)
aGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGc < 2:4557397/93‑1 (MQ=255)
aGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGc > 1:2294872/1‑93 (MQ=255)
gCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCt > 2:4814174/1‑93 (MQ=255)
gCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCt > 1:3085275/1‑93 (MQ=255)
gCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCt < 1:2697114/93‑1 (MQ=255)
gCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCt > 1:6318743/1‑93 (MQ=255)
aTCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTgg > 2:5259234/1‑93 (MQ=255)
aTCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTgg > 1:5797763/1‑93 (MQ=255)
aTCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTgg > 2:4328355/1‑93 (MQ=255)
tCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGa > 2:3403693/1‑93 (MQ=255)
tCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGa < 1:4787954/93‑1 (MQ=255)
tGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACa < 1:3299563/93‑1 (MQ=255)
tGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACa < 1:5506216/93‑1 (MQ=255)
tGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACa > 2:4106667/1‑93 (MQ=255)
gggCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAg > 2:2744787/1‑93 (MQ=255)
ggCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGc < 2:919248/93‑1 (MQ=255)
cAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCaa < 1:1825765/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAAc < 2:3870225/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCTTCTACGGTCAGGTCCGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAAc < 2:671121/93‑1 (MQ=255)
aCGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACt > 2:219472/1‑93 (MQ=255)
aCGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACt > 1:4900249/1‑93 (MQ=255)
cGGCTTCTACGGTCAGGTGTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTg < 1:6714904/93‑1 (MQ=255)
cGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTg < 2:3290270/93‑1 (MQ=255)
cGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTg < 2:309815/93‑1 (MQ=255)
ggCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTgg > 1:116547/1‑93 (MQ=255)
ttCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCg > 2:4969975/1‑93 (MQ=255)
cTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGtt < 2:4483337/93‑1 (MQ=255)
cTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGtt < 2:714781/93‑1 (MQ=255)
aCGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTg > 1:925564/1‑93 (MQ=255)
gTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTc < 2:3656798/93‑1 (MQ=255)
gTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTc < 2:2143378/93‑1 (MQ=255)
gTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTc < 2:1062448/93‑1 (MQ=255)
gTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTc < 1:5899721/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCt > 1:1940519/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCt > 1:6117376/1‑93 (MQ=255)
cAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTg > 1:3736358/1‑93 (MQ=255)
aGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTgg > 2:4041393/1‑93 (MQ=255)
ggTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGa < 2:1408981/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGa < 1:2520911/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGa < 2:2677010/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGa < 2:5504425/93‑1 (MQ=255)
tCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATg < 2:4891954/93‑1 (MQ=255)
|
GCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATG > NC_000913/4236697‑4236875
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCCA > NC_000913/4236693‑4236878
|
cgGTGCGCTAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATACCCTGCAAGCCACCTCGTTGCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTG < SRR4302536.261744/92‑1 (MQ=60)
TGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGC < SRR4302536.3598257/94‑1 (MQ=60)
GTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCG < SRR4302536.3078139/94‑1 (MQ=60)
GTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCG < SRR4302536.658063/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGG > SRR4302536.2054022/1‑94 (MQ=60)
TGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGG > SRR4302536.592074/1‑94 (MQ=60)
TGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGG > SRR4302536.5212819/1‑94 (MQ=60)
GCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGG > SRR4302536.2010566/1‑94 (MQ=60)
CGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGT > SRR4302536.4638500/1‑94 (MQ=60)
GAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTT < SRR4302536.507475/94‑1 (MQ=60)
AGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTA > SRR4302536.762060/1‑94 (MQ=60)
GTGTGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGTCCAGTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAAGTCTGCGGTTGGTAT > SRR4302536.2924848/1‑94 (MQ=60)
GTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAT < SRR4302536.4265227/94‑1 (MQ=60)
TATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTGTGCGGTGGTTATC > SRR4302536.1898995/1‑94 (MQ=60)
TATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATC < SRR4302536.5057647/94‑1 (MQ=60)
TATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATC < SRR4302536.2726591/94‑1 (MQ=60)
TATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGCTATC > SRR4302536.4221890/1‑94 (MQ=60)
ATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCT > SRR4302536.5283558/1‑94 (MQ=60)
ATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCT < SRR4302536.3097738/94‑1 (MQ=60)
ATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCT > SRR4302536.2053982/1‑94 (MQ=60)
ATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGGTATCT > SRR4302536.4116056/1‑94 (MQ=60)
GTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCG < SRR4302536.213453/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCG < SRR4302536.4519332/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCG > SRR4302536.6609104/1‑94 (MQ=60)
TGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGA > SRR4302536.3288105/1‑94 (MQ=60)
GCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAA < SRR4302536.1515890/94‑1 (MQ=60)
GCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAA < SRR4302536.2803275/94‑1 (MQ=60)
CAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAA > SRR4302536.6529975/1‑94 (MQ=60)
CAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAA > SRR4302536.858416/1‑94 (MQ=60)
AGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGGTATCTCGAAAC > SRR4302536.6284332/1‑94 (MQ=60)
GAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACC < SRR4302536.410551/94‑1 (MQ=60)
AACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCA > SRR4302536.1551128/1‑94 (MQ=60)
ACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAT > SRR4302536.2491736/1‑94 (MQ=60)
ACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAT < SRR4302536.6618915/94‑1 (MQ=60)
ACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAT < SRR4302536.3252410/94‑1 (MQ=60)
CGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATG < SRR4302536.5878690/94‑1 (MQ=60)
CGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATG > SRR4302536.6474272/1‑94 (MQ=60)
GATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAACCCATGT < SRR4302536.4470784/94‑1 (MQ=60)
GATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGT < SRR4302536.562643/94‑1 (MQ=60)
GATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGT < SRR4302536.5516024/94‑1 (MQ=60)
ATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTT > SRR4302536.1458892/1‑94 (MQ=60)
TGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTT < SRR4302536.812501/94‑1 (MQ=60)
TGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTT > SRR4302536.5333528/1‑94 (MQ=60)
TCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGG < SRR4302536.5720995/94‑1 (MQ=60)
TCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGG < SRR4302536.2428368/94‑1 (MQ=60)
TCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGG < SRR4302536.5952886/94‑1 (MQ=60)
CTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCCGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTctcgc > SRR4302536.3451156/1‑89 (MQ=60)
TATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCG < SRR4302536.3317264/94‑1 (MQ=60)
TATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCG > SRR4302536.2230292/1‑94 (MQ=60)
TATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCG < SRR4302536.1977853/94‑1 (MQ=60)
ATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGG > SRR4302536.400680/1‑94 (MQ=60)
TGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGT < SRR4302536.5387957/94‑1 (MQ=60)
TGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGACTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGG > SRR4302536.6693394/1‑94 (MQ=60)
TGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGC < SRR4302536.4488/94‑1 (MQ=60)
GAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCG > SRR4302536.5255999/1‑94 (MQ=60)
AATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGG > SRR4302536.2387255/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGGCAGGTCTGCGGTGGGTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGAG > SRR4302536.2784679/1‑94 (MQ=60)
TAACCTGCAAGCCAACTCCTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGG < SRR4302536.508839/94‑1 (MQ=60)
ACCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTCTTTATCTCGAAGCCATGTTTGGCGGTGCGGGCG < SRR4302536.1345019/94‑1 (MQ=60)
ACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGC < SRR4302536.104112/94‑1 (MQ=60)
CCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTTGCGGTGCGGGGGCA > SRR4302536.5363896/1‑94 (MQ=60)
CCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCA > SRR4302536.2171286/1‑94 (MQ=60)
CCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCA < SRR4302536.6026057/94‑1 (MQ=60)
cttcactccaactagcTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCTGGTCTGCTGCGGTTATCTCGAAACCATCTTTGGCGGTGtcggcgtgg > SRR4302536.1413905/17‑85 (MQ=56)
CTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAG < SRR4302536.3635980/94‑1 (MQ=60)
CTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAG < SRR4302536.2866350/94‑1 (MQ=60)
GCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAGCCATGTTTGGCGATGCGGGGGCAGAA < SRR4302536.6475851/94‑1 (MQ=60)
GCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAA < SRR4302536.1543100/94‑1 (MQ=60)
CAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAG > SRR4302536.318089/1‑94 (MQ=60)
CAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGATATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAG > SRR4302536.1591990/1‑94 (MQ=60)
AAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGG > SRR4302536.6838844/1‑94 (MQ=60)
AAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGGGGGTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAggg > SRR4302536.3848508/1‑91 (MQ=60)
AGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTG > SRR4302536.6812629/1‑94 (MQ=60)
GCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGT > SRR4302536.2992484/1‑94 (MQ=60)
GCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGT > SRR4302536.3565474/1‑94 (MQ=60)
CCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTT < SRR4302536.6201159/94‑1 (MQ=60)
CCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTT > SRR4302536.6410353/1‑94 (MQ=60)
CCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTT < SRR4302536.6111192/94‑1 (MQ=60)
CAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTG > SRR4302536.6148244/1‑94 (MQ=60)
CAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTG > SRR4302536.6098814/1‑94 (MQ=60)
CAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGGGGCTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGCAGTGTTC > SRR4302536.151779/1‑94 (MQ=60)
AACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGT > SRR4302536.6003238/1‑94 (MQ=60)
AACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGT < SRR4302536.4624998/94‑1 (MQ=60)
AACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGT > SRR4302536.4602843/1‑94 (MQ=60)
ACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTA < SRR4302536.6917019/94‑1 (MQ=60)
ACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTA > SRR4302536.3476866/1‑94 (MQ=60)
CTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAT > SRR4302536.1849945/1‑94 (MQ=60)
CTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAT > SRR4302536.2487065/1‑94 (MQ=60)
CTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAT > SRR4302536.6265327/1‑94 (MQ=60)
CTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAT < SRR4302536.6674397/94‑1 (MQ=60)
CTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAT > SRR4302536.3845557/1‑94 (MQ=60)
ACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCG < SRR4302536.6249055/94‑1 (MQ=60)
ACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCG > SRR4302536.5206816/1‑94 (MQ=60)
CTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTAAGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGTGGCGGAAGTGTTGTATCGG > SRR4302536.719967/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATTTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCC > SRR4302536.6244302/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCC > SRR4302536.6679427/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGAGGCAGAAGTGTTGTATCGCC < SRR4302536.6754517/94‑1 (MQ=60)
TCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCC < SRR4302536.6213031/94‑1 (MQ=60)
TCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCC < SRR4302536.4703301/94‑1 (MQ=60)
CCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCG < SRR4302536.428046/94‑1 (MQ=60)
CCAGCATCTGGCCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCG < SRR4302536.4528380/94‑1 (MQ=60)
CAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGC > SRR4302536.2364514/1‑94 (MQ=60)
AGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCT > SRR4302536.3175518/1‑94 (MQ=60)
AGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCT > SRR4302536.6506959/1‑94 (MQ=60)
GCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTG < SRR4302536.2777606/94‑1 (MQ=60)
GCATCTGGGCAACGGCTTCTACGCTCAGGTCGGCGGTGATTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTCCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTG < SRR4302536.3100370/94‑1 (MQ=60)
CATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCCGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGG > SRR4302536.2193336/1‑94 (MQ=60)
CATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGG > SRR4302536.5970395/1‑94 (MQ=60)
TCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGAC > SRR4302536.6877245/1‑94 (MQ=60)
TCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGAC < SRR4302536.4932100/94‑1 (MQ=60)
TGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAG < SRR4302536.5670477/94‑1 (MQ=60)
TGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAG < SRR4302536.3396818/94‑1 (MQ=60)
GGCAACGGCTTCTACGCACAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCA < SRR4302536.5840504/94‑1 (MQ=60)
CAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGATACCATGCTTGGCGGTGAGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGTACAGCAGC > SRR4302536.4433535/1‑94 (MQ=60)
CAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAAC < SRR4302536.1880828/94‑1 (MQ=60)
AACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACT > SRR4302536.5047606/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTCTACGGTCAGGTGTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGG < SRR4302536.6914244/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGG < SRR4302536.1127495/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGG > SRR4302536.119625/1‑94 (MQ=60)
GGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGG < SRR4302536.2515768/94‑1 (MQ=60)
CTTCTACGGCCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCG > SRR4302536.5236527/1‑94 (MQ=60)
TCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTT > SRR4302536.534809/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTT > SRR4302536.3168075/1‑94 (MQ=60)
TACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGTGGCTGAAGAGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTcggtgcttg > SRR4302536.3689026/1‑85 (MQ=60)
TACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTG > SRR4302536.952838/1‑94 (MQ=60)
TACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTG < SRR4302536.612087/94‑1 (MQ=60)
ACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGG < SRR4302536.1321406/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTC > SRR4302536.5095377/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCT < SRR4302536.6075384/94‑1 (MQ=60)
GTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCT > SRR4302536.1998880/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCT > SRR4302536.6299710/1‑94 (MQ=60)
TCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTG < SRR4302536.4420215/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTG > SRR4302536.3848030/1‑94 (MQ=60)
TCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTG < SRR4302536.3458803/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAT < SRR4302536.5029925/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAT < SRR4302536.4859060/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAT < SRR4302536.4191062/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAT < SRR4302536.2596905/94‑1 (MQ=60)
TCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGC < SRR4302536.5135401/94‑1 (MQ=60)
TCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGCTTGGTCTGGATGC > SRR4302536.6285084/1‑94 (MQ=60)
TCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGCTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGC > SRR4302536.4056682/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCC > SRR4302536.6909099/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCC > SRR4302536.3826217/1‑94 (MQ=60)
TGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCCA < SRR4302536.6224389/94‑1 (MQ=60)
|
ATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCCA > NC_000913/4236693‑4236878
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
