Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1357 |
179.3 |
9500450 |
96.1% |
9129932 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,259,162 |
A→G |
intergenic (+277/‑86) |
yjbM → / → yjbN |
hypothetical protein/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,259,162 | 0 | A | G | 97.5%
| 743.3
/ 4.8
| 236 | intergenic (+277/‑86) | yjbM/yjbN | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/2); new base G (117/113); total (121/115) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.84e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
TTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATAGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAATGC > NC_000913/4259072‑4259251
|
ttattTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTatggtatggt < 1:4178662/93‑1 (MQ=255)
ttattTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTatggtatggt < 1:3768458/93‑1 (MQ=255)
ttattTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTatggtatggt > 1:171658/1‑93 (MQ=255)
ttattTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTatggtatggt < 2:4538043/93‑1 (MQ=255)
tattTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTAtggtatggta < 1:2244532/93‑1 (MQ=255)
tattTCCATCACTTCGAGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTAtggtatggta > 2:2504145/1‑93 (MQ=255)
attTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTAc < 1:1113928/93‑1 (MQ=255)
attTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTAc < 2:383135/93‑1 (MQ=255)
ttCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTAccc < 1:3433980/93‑1 (MQ=255)
tCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTAcccc > 2:3192405/1‑93 (MQ=255)
tCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGAGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTAcccc > 2:3377828/1‑93 (MQ=255)
cATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGc < 2:1491586/93‑1 (MQ=255)
cATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGc > 1:1592570/1‑93 (MQ=255)
aTCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCt > 2:2386532/1‑93 (MQ=255)
aTCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGGATGGTACCCCGCt > 2:2199385/1‑93 (MQ=255)
tCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTa > 1:697687/1‑93 (MQ=255)
cACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTAt > 2:1076148/1‑93 (MQ=255)
aCTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTAtt > 1:2548059/1‑93 (MQ=255)
aCTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTAtt > 2:2708675/1‑93 (MQ=255)
aCTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTAtt > 2:2816013/1‑93 (MQ=255)
cTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTg > 1:3038357/1‑93 (MQ=255)
gTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGcc < 2:846556/93‑1 (MQ=255)
gTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGcc < 1:4211995/93‑1 (MQ=255)
gagCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGcctcct > 1:3472749/1‑93 (MQ=255)
agCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTg < 2:4715854/93‑1 (MQ=255)
agCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTg < 2:423873/93‑1 (MQ=255)
cTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGaa < 2:3070477/93‑1 (MQ=255)
tCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATa > 1:4596724/1‑93 (MQ=255)
cATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAg < 1:2178235/93‑1 (MQ=255)
cATGCATTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGTTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTTCTGAATAg > 2:2134933/1‑93 (MQ=255)
gCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGa < 2:114838/93‑1 (MQ=255)
ccTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGAt > 2:2932746/1‑93 (MQ=255)
ccTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGAt < 1:2340543/93‑1 (MQ=255)
cTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATg > 1:603475/1‑93 (MQ=255)
ttGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGc > 1:2024212/1‑93 (MQ=255)
gagaGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTg > 2:829671/1‑93 (MQ=255)
gagaGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATAGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTg < 2:3670089/93‑1 (MQ=255)
gagGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGaa > 1:399068/1‑93 (MQ=255)
ggATCTCAATTTTCTTTTGCACTGAGACTGTCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCGGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAata < 1:3354837/93‑1 (MQ=255)
gATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataa < 2:3417067/93‑1 (MQ=255)
tctcAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataaca > 2:3499946/1‑93 (MQ=255)
tctcAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataaca < 1:2501461/93‑1 (MQ=255)
ctcAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataacat < 2:3267581/93‑1 (MQ=255)
tcAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataacata < 2:2338003/93‑1 (MQ=255)
cAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGGATAGTGATGCTGAataacataa < 2:2992347/93‑1 (MQ=255)
aaTTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataacataac > 2:3196175/1‑93 (MQ=255)
aaTTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataacataac > 1:2135116/1‑93 (MQ=255)
aTTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAAcc > 2:1538481/1‑93 (MQ=255)
ttttCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTTAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAAccc < 1:606339/93‑1 (MQ=255)
tttCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAAcccc > 2:3394634/1‑93 (MQ=255)
tttCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAAcccc > 2:2400171/1‑93 (MQ=255)
ttCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCa > 2:4453056/1‑93 (MQ=255)
ttCTATTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCa < 1:3216151/93‑1 (MQ=255)
tCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCAt > 2:4551776/1‑93 (MQ=255)
tCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCAt < 1:4398526/93‑1 (MQ=255)
tCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCAt < 1:935429/93‑1 (MQ=255)
ttttGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGa > 2:3332335/1‑93 (MQ=255)
ttttGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGa > 2:2352788/1‑93 (MQ=255)
ttttGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGa < 2:4279254/93‑1 (MQ=255)
gCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGatata > 2:3941819/1‑93 (MQ=255)
cAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGatatat < 2:3625488/93‑1 (MQ=255)
cAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGatatat < 2:1886379/93‑1 (MQ=255)
aaTGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATc > 1:3254617/1‑93 (MQ=255)
aTGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCg > 2:777418/1‑93 (MQ=255)
tGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGa < 2:2843088/93‑1 (MQ=255)
tGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGa > 1:790697/1‑93 (MQ=255)
gaCAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATaa < 1:3924419/93‑1 (MQ=255)
cAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATaaaa > 1:1002959/1‑93 (MQ=255)
aGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAaat < 1:4533769/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAaat > 1:2861620/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAaata > 2:3707265/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAaata > 2:917937/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAaata < 2:1480628/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAaata < 1:3677850/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTTCCTGTTGTTATGGTAAGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAaata < 1:4249955/93‑1 (MQ=255)
gcTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAGATAAtc > 2:663478/1‑93 (MQ=255)
gcTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAAtc < 1:2443835/93‑1 (MQ=255)
cTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAAtct > 2:2551400/1‑93 (MQ=255)
ttCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAAtctc > 1:479341/1‑93 (MQ=255)
ttCCTGTTGTTATGGTATAGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAAtctc < 2:3811308/93‑1 (MQ=255)
tCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATctct > 1:1553659/1‑93 (MQ=255)
tCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATctct > 2:3786203/1‑93 (MQ=255)
tCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATctct < 1:1944456/93‑1 (MQ=255)
tCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATctct > 1:2887441/1‑93 (MQ=255)
ccTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTa < 1:1233899/93‑1 (MQ=255)
ccTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTa > 1:1337265/1‑93 (MQ=255)
cTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTAc < 1:2672145/93‑1 (MQ=255)
ttgttATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACAtt > 1:437910/1‑93 (MQ=255)
ttgttATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACAtt > 2:2514065/1‑93 (MQ=255)
tgttATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACAttt < 2:549878/93‑1 (MQ=255)
tgttATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACAttt < 2:683783/93‑1 (MQ=255)
gttATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTg > 2:849271/1‑93 (MQ=255)
gttATGGTATGGTACCCCACTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTg > 2:4312412/1‑93 (MQ=255)
tggtatggtaCCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGaaaa < 2:1951167/93‑1 (MQ=255)
tggtatggtaCCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGaaaa < 1:1399285/93‑1 (MQ=255)
tggtatggtaCCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGaaaa < 2:2703970/93‑1 (MQ=255)
ggTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAAt < 1:4256526/93‑1 (MQ=255)
ggTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTCAAAAt < 2:4436051/93‑1 (MQ=255)
gTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAATg < 2:488367/93‑1 (MQ=255)
tatgGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAATGc < 2:4078252/93‑1 (MQ=255)
|
TTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATAGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAATGC > NC_000913/4259072‑4259251
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATAGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAATGCACGG > NC_000913/4259069‑4259255
|
AGATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATG > SRR4302544.4131184/1‑94 (MQ=60)
AGATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATG > SRR4302544.113071/1‑94 (MQ=60)
AGATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATG > SRR4302544.2043330/1‑94 (MQ=60)
AGATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATG > SRR4302544.4131185/1‑94 (MQ=60)
GATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGG < SRR4302544.3762835/94‑1 (MQ=60)
ATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGT < SRR4302544.283564/94‑1 (MQ=60)
ATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGT > SRR4302544.173351/1‑94 (MQ=60)
TTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTA < SRR4302544.4220053/94‑1 (MQ=60)
TTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTA < SRR4302544.4220054/94‑1 (MQ=60)
TTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTA < SRR4302544.3805826/94‑1 (MQ=60)
TATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTAC < SRR4302544.2265642/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACC < SRR4302544.1125038/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTAAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATAGTACC > SRR4302544.3362206/1‑94 (MQ=60)
TTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCC < SRR4302544.3466804/94‑1 (MQ=60)
CCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGC > SRR4302544.1608264/1‑94 (MQ=60)
CCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGC > SRR4302544.2914880/1‑94 (MQ=60)
CATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCT > SRR4302544.3400837/1‑94 (MQ=60)
ATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTA > SRR4302544.704635/1‑94 (MQ=60)
TCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTAT > SRR4302544.1373473/1‑94 (MQ=60)
CACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATT > SRR4302544.2572529/1‑94 (MQ=60)
ACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTG > SRR4302544.3067435/1‑94 (MQ=60)
TTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAG < SRR4302544.3281744/94‑1 (MQ=60)
CGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCC < SRR4302544.1495986/94‑1 (MQ=60)
CGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCC < SRR4302544.1967633/94‑1 (MQ=60)
GTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCT < SRR4302544.4254419/94‑1 (MQ=60)
GAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCC > SRR4302544.3783006/1‑94 (MQ=60)
AGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCT > SRR4302544.3505866/1‑94 (MQ=60)
AGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCT > SRR4302544.3505867/1‑94 (MQ=60)
GAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTG > SRR4302544.2481621/1‑94 (MQ=60)
AGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGA < SRR4302544.1042095/94‑1 (MQ=60)
ACTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAA < SRR4302544.2749275/94‑1 (MQ=60)
TTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATA > SRR4302544.4642438/1‑94 (MQ=60)
TCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAG < SRR4302544.364070/94‑1 (MQ=60)
CATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGT < SRR4302544.2326200/94‑1 (MQ=60)
CATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGT < SRR4302544.2198868/94‑1 (MQ=60)
GCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGAT < SRR4302544.669657/94‑1 (MQ=60)
CCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATG < SRR4302544.2362716/94‑1 (MQ=60)
CCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATG > SRR4302544.609401/1‑94 (MQ=60)
CTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGC > SRR4302544.2043843/1‑94 (MQ=60)
AGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAA > SRR4302544.403114/1‑94 (MQ=60)
AGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAA > SRR4302544.3796171/1‑94 (MQ=60)
GAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACTCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAAT > SRR4302544.2196284/1‑94 (MQ=60)
GAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAAT > SRR4302544.2196283/1‑94 (MQ=60)
GAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAAT > SRR4302544.2528667/1‑94 (MQ=60)
AGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATA < SRR4302544.4272388/94‑1 (MQ=60)
AGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATA > SRR4302544.11622/1‑94 (MQ=60)
AGGATCTCAATTGTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATA < SRR4302544.47843/94‑1 (MQ=60)
GGATCTCAATTTTCTTTTGCACTGAGACTGTCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCGGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAA < SRR4302544.3386850/94‑1 (MQ=60)
ATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACA > SRR4302544.452401/1‑94 (MQ=60)
tagCAATTTTCTTTTGCAATTAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTCTGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACAT < SRR4302544.2525442/91‑1 (MQ=60)
TCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACAT < SRR4302544.2525441/94‑1 (MQ=60)
TCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACAT > SRR4302544.399528/1‑94 (MQ=60)
CTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATA < SRR4302544.2853051/94‑1 (MQ=60)
CAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAAC > SRR4302544.2155533/1‑94 (MQ=60)
AATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCTGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACC > SRR4302544.2234155/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCC < SRR4302544.2579419/94‑1 (MQ=60)
TTTTCTTTTGCAATGAGACATGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATAGTACACTTCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCT > SRR4302544.2103207/1‑94 (MQ=60)
TTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTTAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCC < SRR4302544.612291/94‑1 (MQ=60)
TTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCAT < SRR4302544.3246835/94‑1 (MQ=60)
TTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCAT < SRR4302544.4439363/94‑1 (MQ=60)
TTCTATTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCAT < SRR4302544.3246834/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATG < SRR4302544.4280337/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATG < SRR4302544.4442989/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATG < SRR4302544.944644/94‑1 (MQ=60)
CAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGATCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATC > SRR4302544.685225/1‑94 (MQ=60)
CAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATC > SRR4302544.3285740/1‑94 (MQ=60)
CAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATC > SRR4302544.2306997/1‑94 (MQ=60)
CAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATC > SRR4302544.1787747/1‑94 (MQ=60)
CAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATC < SRR4302544.1607310/94‑1 (MQ=60)
CAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATC > SRR4302544.3321923/1‑94 (MQ=60)
AATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCG < SRR4302544.4446692/94‑1 (MQ=60)
AATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCG < SRR4302544.2509558/94‑1 (MQ=60)
AATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCG > SRR4302544.1996677/1‑94 (MQ=60)
ATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGA > SRR4302544.798353/1‑94 (MQ=60)
ATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGA > SRR4302544.324424/1‑94 (MQ=60)
ATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGA < SRR4302544.4341813/94‑1 (MQ=60)
TAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATA < SRR4302544.770895/94‑1 (MQ=60)
GAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATA > SRR4302544.294632/1‑94 (MQ=60)
AGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAA < SRR4302544.3994481/94‑1 (MQ=60)
GACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAA < SRR4302544.3963400/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAA > SRR4302544.1012924/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAAT > SRR4302544.2889239/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAAT < SRR4302544.3840661/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGCTGCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAAT < SRR4302544.1296405/94‑1 (MQ=60)
AGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATA > SRR4302544.864750/1‑94 (MQ=60)
AGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATA < SRR4302544.4579108/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAA < SRR4302544.3714533/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAA < SRR4302544.1923500/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAA < SRR4302544.4293287/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTTCCTGTTGTTATGGTAAGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAA < SRR4302544.4293286/94‑1 (MQ=60)
CGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATC > SRR4302544.1383595/1‑94 (MQ=60)
GCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCT < SRR4302544.2467134/94‑1 (MQ=60)
CTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTC > SRR4302544.3030257/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTC > SRR4302544.552236/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTC > SRR4302544.484039/1‑94 (MQ=60)
CTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATAACGATAAAATAATCTC > SRR4302544.160810/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCT > SRR4302544.1569119/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCT > SRR4302544.1158502/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCT > SRR4302544.2915284/1‑94 (MQ=60)
TCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTA > SRR4302544.4307454/1‑94 (MQ=60)
TCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTA < SRR4302544.1963282/94‑1 (MQ=60)
TCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTA > SRR4302544.819598/1‑94 (MQ=60)
TCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTA > SRR4302544.1350456/1‑94 (MQ=60)
CCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTAC > SRR4302544.3481272/1‑94 (MQ=60)
CCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTAC < SRR4302544.1246103/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACA < SRR4302544.2697759/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACA < SRR4302544.4615637/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACAT > SRR4302544.2395374/1‑94 (MQ=60)
TGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACAT > SRR4302544.1612132/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATT > SRR4302544.442310/1‑94 (MQ=60)
TTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTT < SRR4302544.460571/94‑1 (MQ=60)
ATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAA > SRR4302544.547728/1‑94 (MQ=60)
ATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAA < SRR4302544.4121462/94‑1 (MQ=60)
TGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAAT < SRR4302544.1413230/94‑1 (MQ=60)
GGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAATG < SRR4302544.4299922/94‑1 (MQ=60)
GGTATAGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGTTAAAATAATCTCTAAATTTGAAAATG > SRR4302544.4083479/1‑94 (MQ=60)
GTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAATGC < SRR4302544.610347/94‑1 (MQ=60)
ATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAATGCAC < SRR4302544.4010761/94‑1 (MQ=60)
TGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGGTAAAATAATCTCTACATTTGAAAATGCACG < SRR4302544.1504483/94‑1 (MQ=60)
GGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAATGCACGG < SRR4302544.3694772/94‑1 (MQ=60)
|
AGATTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATAGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAATGCACGG > NC_000913/4259069‑4259255
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
