Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,544,360 |
+G |
coding (166/1314 nt) |
gntT → |
gluconate permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,544,358 | 1 | . | G | 98.6%
| 1374.4
/ 7.1
| 363 | coding (164/1314 nt) | gntT | gluconate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/3); new base G (182/175); total (184/179) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.81e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 |
Only 100 of 374 total aligned reads displayed.
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GC‑GGAC‑G‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGT > NC_000913/3544280‑3544440
|
tCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGcc < 2:11008892/96‑1 (MQ=255)
ccTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCt < 1:3252996/96‑1 (MQ=255)
ccTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCt > 2:12977310/1‑96 (MQ=255)
ccTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCt < 2:4662697/96‑1 (MQ=255)
cTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCtt < 1:5661220/96‑1 (MQ=255)
cTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCtt > 1:710230/1‑96 (MQ=255)
cTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCtt < 1:12048727/96‑1 (MQ=255)
cTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCtt > 1:12461378/1‑96 (MQ=255)
tCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTg < 1:7624404/96‑1 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGc > 1:8492973/1‑96 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGc > 1:449597/1‑96 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGc < 2:7985317/96‑1 (MQ=255)
gaggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGcc > 1:8829938/3‑96 (MQ=255)
gTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGcc < 1:2281616/96‑1 (MQ=255)
tGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGccc > 1:5389463/1‑96 (MQ=255)
tGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGccc > 2:3558267/1‑96 (MQ=255)
ggCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCt > 1:5268949/1‑96 (MQ=255)
ggCGCTTGCTCTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCt < 2:10729356/96‑1 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTg > 1:13235647/1‑96 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTg > 2:1942500/1‑96 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTg < 2:3776203/96‑1 (MQ=255)
gcgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGGGGCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGccccg > 2:9505353/1‑94 (MQ=255)
gagcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTg > 1:10573567/3‑96 (MQ=255)
cgcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGGC‑GCTCGTTAGCCTTGCCCTGa > 1:5969881/1‑96 (MQ=255)
gcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGAt > 2:2553920/1‑96 (MQ=255)
gcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGAt < 2:6871313/96‑1 (MQ=255)
gcTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGAt > 2:10005167/1‑96 (MQ=255)
cTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGCATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATc < 2:13485075/96‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 2:114683/96‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa > 1:9760592/1‑96 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa < 2:7061962/96‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCa > 1:11175121/1‑96 (MQ=255)
tGCTGTTGGATTAATACAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt > 1:8162212/1‑96 (MQ=255)
gCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAtt > 1:10186256/1‑95 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATgg < 2:2420842/96‑1 (MQ=255)
cTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCGCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATgg > 2:6587944/1‑96 (MQ=255)
tGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATggg > 2:4565357/1‑96 (MQ=255)
tGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAGAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGGC‑GCTCCGTAGCCTTGCCCTGCTCATGGGttt > 2:5252159/1‑96 (MQ=255)
tGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGttt < 2:10527834/96‑1 (MQ=255)
ggATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtttt < 2:13186885/96‑1 (MQ=255)
ggATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtttt < 2:9843810/96‑1 (MQ=255)
gATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTg < 1:11711303/96‑1 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCATGATCATGGGTTTTgg > 1:12794623/1‑96 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCa > 2:9367048/1‑96 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCa > 2:14361416/1‑96 (MQ=255)
tGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa > 2:1195723/1‑96 (MQ=255)
tGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGCTTTGGCGCaa > 1:10958287/1‑96 (MQ=255)
gCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCTGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt < 1:4076300/96‑1 (MQ=255)
cAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATg < 1:8706031/96‑1 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGc > 2:7474504/1‑96 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt < 1:12247778/96‑1 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt < 2:14039280/96‑1 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTgg < 1:13792329/96‑1 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTgg > 1:9153000/1‑96 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTgg < 2:13771322/96‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTggg < 1:6457721/96‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTggg < 1:13551112/96‑1 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGc < 1:5503250/96‑1 (MQ=255)
aTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGc < 1:392021/96‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCa < 1:1716749/96‑1 (MQ=255)
ccGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCGAAGCCGGTGTCGGCGGGACGG‑CCGGGAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaa > 2:12711520/1‑96 (MQ=255)
ccGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaa > 1:433977/1‑96 (MQ=255)
ccGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTGGGCGATATGCTGGGCaaa > 1:14272702/1‑96 (MQ=255)
cGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGGCTTGCCCTGGTCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaaa > 2:5482624/1‑96 (MQ=255)
gCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt < 1:12910662/96‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt > 1:1580429/1‑96 (MQ=255)
cTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATg < 2:400897/96‑1 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGTCCTGATCTTGGGTTTTTGCGCAATGCTGGGCACAATGc > 1:2647804/1‑96 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc < 2:9223522/96‑1 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc < 2:12427413/96‑1 (MQ=255)
tGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc > 2:582205/1‑96 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt < 1:13019358/96‑1 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt > 1:7263944/1‑96 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg > 1:7922512/1‑96 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCa > 1:4595415/1‑96 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGAGCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCa > 2:12246082/1‑96 (MQ=255)
gTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAA‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAc > 1:9879887/1‑96 (MQ=255)
ttATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACt < 2:5660297/96‑1 (MQ=255)
ttATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACt < 1:2526751/96‑1 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTg < 1:10050557/96‑1 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTg > 1:3752637/1‑96 (MQ=255)
aTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGc < 2:3186326/96‑1 (MQ=255)
aTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGc < 1:5044688/96‑1 (MQ=255)
aTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGc < 1:11966714/96‑1 (MQ=255)
tGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTATCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCGGGGCAAAATGCTGACGGACCGCgg > 1:6291391/1‑96 (MQ=255)
ggCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGt < 1:2023770/96‑1 (MQ=255)
gCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTg < 1:6684923/96‑1 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgc > 2:811131/1‑96 (MQ=255)
cgaTCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcg > 1:10718722/3‑96 (MQ=255)
ccATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGGTCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcg > 2:2071964/1‑96 (MQ=255)
ccATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcg > 1:276779/1‑96 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGgcgc > 2:8802691/1‑96 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGca > 1:3061271/1‑96 (MQ=255)
tCAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGcac < 2:6254962/96‑1 (MQ=255)
cAAAGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGGGGCGcaca > 1:4912648/1‑96 (MQ=255)
aaGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAc < 2:8574210/96‑1 (MQ=255)
aGCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACg > 2:4934978/1‑96 (MQ=255)
gCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGt > 1:14126119/1‑96 (MQ=255)
gCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGGGGCGCACAACGt > 2:10325846/1‑96 (MQ=255)
gCCGGTGTCGGCGGGAC‑GCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGGGGCGCACAACGt > 2:4198212/1‑96 (MQ=255)
|
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GC‑GGAC‑G‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGT > NC_000913/3544280‑3544440
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 218 total aligned reads displayed.
GAACGGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑C‑G‑G‑‑AC‑G‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTG > NC_000913/3544260‑3544459
|
GAACGGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑N‑N‑N > SRR4302518.8124497/1‑101 (MQ=60)
NNNGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCT < SRR4302518.9567977/101‑1 (MQ=60)
NNNGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCT < SRR4302518.13943656/101‑1 (MQ=60)
CTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCT < SRR4302518.3404156/101‑1 (MQ=60)
TCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGGTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGATATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT > SRR4302518.6639907/1‑101 (MQ=60)
TCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT < SRR4302518.1817463/101‑1 (MQ=60)
TCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT < SRR4302518.5948624/101‑1 (MQ=60)
NNNTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT < SRR4302518.7510372/101‑1 (MQ=60)
NNNTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT < SRR4302518.12622319/101‑1 (MQ=60)
NNNTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTT < SRR4302518.12877312/101‑1 (MQ=60)
NNNCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTG < SRR4302518.10377756/101‑1 (MQ=60)
NNNCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTG < SRR4302518.8013337/101‑1 (MQ=60)
CGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTG < SRR4302518.5866152/101‑1 (MQ=60)
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCC < SRR4302518.3489429/101‑1 (MQ=60)
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCC > SRR4302518.6742110/1‑101 (MQ=60)
TCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCC < SRR4302518.6142453/101‑1 (MQ=60)
GCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCC < SRR4302518.2392369/101‑1 (MQ=60)
NNNCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCTGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCC < SRR4302518.12765533/101‑1 (MQ=60)
CTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCT > SRR4302518.737952/1‑101 (MQ=60)
TCGTTGCGCTTGCTGTGGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTG < SRR4302518.2865660/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTG < SRR4302518.13653864/101‑1 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGA > SRR4302518.467387/1‑101 (MQ=60)
CGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCNNN > SRR4302518.8907894/1‑101 (MQ=60)
CGTAGCGCTTGCTGTAGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGA < SRR4302518.5829635/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGAT < SRR4302518.10834871/101‑1 (MQ=60)
GTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGAT > SRR4302518.2868898/1‑101 (MQ=60)
GAGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTNNN > SRR4302518.9258310/1‑101 (MQ=60)
TGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATC > SRR4302518.5665093/1‑101 (MQ=60)
NNNCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATC < SRR4302518.8118986/101‑1 (MQ=60)
NNNGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGACTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCA < SRR4302518.12923679/101‑1 (MQ=60)
GGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCA > SRR4302518.5539633/1‑101 (MQ=60)
GCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATNNN > SRR4302518.13845934/1‑101 (MQ=60)
GCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCAT < SRR4302518.6928575/101‑1 (MQ=60)
GAGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATNNN > SRR4302518.11069683/1‑101 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑GC‑GC‑TCGTTAGCCTTGCCCTGATCATG > SRR4302518.6272730/1‑101 (MQ=60)
CGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCNNN > SRR4302518.14868719/1‑101 (MQ=60)
gttggTGTTGGATTAACGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑ACTC‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG < SRR4302518.3441121/96‑1 (MQ=60)
NNNGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG < SRR4302518.10426300/101‑1 (MQ=60)
CTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG > SRR4302518.5116535/1‑101 (MQ=60)
CTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGG > SRR4302518.4257673/1‑101 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGNNN > SRR4302518.10228958/1‑101 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGNNN > SRR4302518.11698344/1‑101 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGT > SRR4302518.5582908/1‑101 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGT < SRR4302518.839830/101‑1 (MQ=60)
TTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCCTGCCCTGATCATGGGT > SRR4302518.5141022/1‑101 (MQ=60)
TGCTGTTGTATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGNNN > SRR4302518.13555848/1‑101 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGNNN > SRR4302518.9630949/1‑101 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGNNN > SRR4302518.12778691/1‑101 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTT < SRR4302518.6432029/101‑1 (MQ=60)
TGCTGTTGGATTAATACAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATagnnn > SRR4302518.8566456/1‑96 (MQ=60)
NNNGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCGATCAAAGCCGGTGTC‑GGTG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATAATGGGTTT < SRR4302518.13548414/101‑1 (MQ=60)
NNNTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302518.10020409/101‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGACTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT < SRR4302518.4063301/101‑1 (MQ=60)
CTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTT > SRR4302518.1155899/1‑101 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG > SRR4302518.4429767/1‑101 (MQ=60)
TGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302518.7175612/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTG < SRR4302518.12264771/101‑1 (MQ=60)
TTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTNNN > SRR4302518.8945555/1‑101 (MQ=60)
NNNGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGC < SRR4302518.14863746/101‑1 (MQ=60)
NNNTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGC < SRR4302518.11398409/101‑1 (MQ=60)
NNNTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGC < SRR4302518.13261743/101‑1 (MQ=60)
NNNTAATTCAAGGAATGACGCTTGTTAAAGTTATTTGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTTGCGTA < SRR4302518.7939860/101‑1 (MQ=39)
NNNTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCA < SRR4302518.13440826/101‑1 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCTGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCA > SRR4302518.3789060/1‑101 (MQ=60)
GATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCNNN > SRR4302518.9126688/1‑101 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTTCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAA > SRR4302518.6078486/1‑101 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAA > SRR4302518.5676284/1‑101 (MQ=60)
ATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCATGATCATGGGTTTTGGCGNNN > SRR4302518.13390439/1‑101 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCTG‑‑CGG‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT < SRR4302518.4273517/101‑1 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATGATGGGTTTTGGCGCAAT > SRR4302518.3124883/1‑101 (MQ=60)
TTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAT < SRR4302518.5302528/101‑1 (MQ=60)
TGAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAGGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCNNN > SRR4302518.11058097/1‑101 (MQ=60)
TAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCANNN > SRR4302518.10282099/1‑101 (MQ=60)
TAATGCAAGGAAGGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302518.279591/101‑1 (MQ=60)
NNNTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATG < SRR4302518.9129302/101‑1 (MQ=60)
ACTGCAAGGACTGCCGCTTGATAAAGTTATCGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGC < SRR4302518.1405868/101‑1 (MQ=60)
AATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGC < SRR4302518.4321916/101‑1 (MQ=60)
NNNCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCT < SRR4302518.12827652/101‑1 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGNNN > SRR4302518.12780769/1‑101 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGNNN > SRR4302518.14899542/1‑101 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302518.1319322/101‑1 (MQ=60)
TGCAAGGAATGCCGCGGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTG < SRR4302518.2694132/101‑1 (MQ=60)
TCCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGNNN > SRR4302518.11582282/1‑101 (MQ=60)
NNNAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG < SRR4302518.14423734/101‑1 (MQ=60)
GCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGG > SRR4302518.157720/1‑101 (MQ=60)
NNNGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG < SRR4302518.14173103/101‑1 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTNNN > SRR4302518.12548314/1‑101 (MQ=60)
CAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGG < SRR4302518.6788212/101‑1 (MQ=60)
NNNGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGT < SRR4302518.11857094/101‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC < SRR4302518.407374/101‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC < SRR4302518.858383/101‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC > SRR4302518.5542993/1‑101 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC < SRR4302518.2505374/101‑1 (MQ=60)
AAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGC < SRR4302518.5783156/101‑1 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCCATGCTGGNNN > SRR4302518.8893191/1‑101 (MQ=60)
AGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCA > SRR4302518.1357016/1‑101 (MQ=60)
AAGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑C‑G‑G‑‑GC‑GGCTCGGTAGCCTTGGCCTGATCATGGGTTTTGGCGGAATGCTtgnnn > SRR4302518.12284984/1‑96 (MQ=60)
GGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGNNN > SRR4302518.9143647/1‑101 (MQ=60)
NNNTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAA < SRR4302518.12583236/101‑1 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTTGCGCAATGCTGGGCAAA > SRR4302518.3355211/1‑101 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCNNN > SRR4302518.9594458/1‑101 (MQ=60)
GAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCNNN > SRR4302518.7821249/1‑101 (MQ=60)
NNNGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAGA < SRR4302518.11992247/101‑1 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAA > SRR4302518.4015955/1‑101 (MQ=60)
AATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGGAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAA > SRR4302518.4795580/1‑101 (MQ=60)
NNNCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302518.9211953/101‑1 (MQ=60)
NNNCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302518.13509721/101‑1 (MQ=60)
NNNCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAT < SRR4302518.7579274/101‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG < SRR4302518.219687/101‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATG > SRR4302518.6673277/1‑101 (MQ=60)
GCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑GC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAANNN > SRR4302518.9340377/1‑101 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT < SRR4302518.5198965/101‑1 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT < SRR4302518.2030943/101‑1 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTGGGCGATATGCTGGGCAAAATNNN > SRR4302518.14931669/1‑101 (MQ=60)
CCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCT > SRR4302518.451028/1‑101 (MQ=60)
NNNTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302518.7805173/101‑1 (MQ=60)
NNNTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302518.12063833/101‑1 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302518.2420163/101‑1 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG > SRR4302518.6130185/1‑101 (MQ=60)
CGCTGGATAAAGTTATTGGCCCCATCCAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑GC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTG < SRR4302518.3977736/101‑1 (MQ=60)
GCTGGATAAATTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGGC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCGCTGCTCATGGGGTTTGGCGCTATGCTAGGCAAAATGCTGG > SRR4302518.4425256/1‑101 (MQ=37)
GCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG > SRR4302518.1289872/1‑101 (MQ=60)
GCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG > SRR4302518.1649147/1‑101 (MQ=60)
GCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGG > SRR4302518.3356263/1‑101 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑GC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC > SRR4302518.5480479/1‑101 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC < SRR4302518.660426/101‑1 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC > SRR4302518.3012552/1‑101 (MQ=60)
CTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGC > SRR4302518.1719432/1‑101 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGTCCTGATCTTGGGTTTTTGCGCAATGCTGGGCACAATGCTGGCG > SRR4302518.2774397/1‑101 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGNNN > SRR4302518.14616680/1‑101 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGNNN > SRR4302518.14196983/1‑101 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA > SRR4302518.4803888/1‑101 (MQ=60)
TGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGGGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGNNN > SRR4302518.11011730/1‑101 (MQ=60)
NNNATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA < SRR4302518.15102606/101‑1 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGNNN > SRR4302518.7643238/1‑101 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAG < SRR4302518.4215084/101‑1 (MQ=60)
GGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAG > SRR4302518.6804158/1‑101 (MQ=60)
GGATAAAGTTAGTGGCTCCATTAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑GC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGACAAAATGCTGGCAG > SRR4302518.4160228/1‑101 (MQ=58)
GATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGATTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGA > SRR4302518.2362504/1‑101 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑C‑GAG‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGGGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCANNN > SRR4302518.13541604/1‑101 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCANNN > SRR4302518.8319381/1‑101 (MQ=60)
ATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCANNN > SRR4302518.8783839/1‑101 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑C‑G‑GC‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302518.1241101/101‑1 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGNNN > SRR4302518.10665943/1‑101 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302518.2648373/101‑1 (MQ=60)
TAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302518.5422543/101‑1 (MQ=60)
NNNAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACT < SRR4302518.13094239/101‑1 (MQ=60)
NNNGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTG < SRR4302518.10527341/101‑1 (MQ=60)
AAAGTTATTGGCTCCCTCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTG < SRR4302518.4573655/101‑1 (MQ=60)
AAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTG > SRR4302518.5515867/1‑101 (MQ=60)
AAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTG > SRR4302518.4837261/1‑101 (MQ=60)
NNNTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGC < SRR4302518.12537509/101‑1 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGC < SRR4302518.1432682/101‑1 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGC < SRR4302518.316408/101‑1 (MQ=60)
AAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCA < SRR4302518.4752965/60‑1 (MQ=42)
AGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCG > SRR4302518.1106435/1‑101 (MQ=60)
GTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑C‑G‑GGAAG‑C‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACagnnn > SRR4302518.10351705/1‑96 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑GC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAGGCTGGCAGACTGCNNN > SRR4302518.9373661/1‑101 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGannn > SRR4302518.10528492/1‑97 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302518.6396875/101‑1 (MQ=60)
TTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGG > SRR4302518.4948038/1‑101 (MQ=60)
NNNTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302518.14675228/101‑1 (MQ=60)
NNNTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302518.10250213/101‑1 (MQ=60)
GTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGT < SRR4302518.2117099/101‑1 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTG > SRR4302518.3929404/1‑101 (MQ=60)
TATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTG < SRR4302518.7031078/101‑1 (MQ=60)
NNNGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGG < SRR4302518.8449295/101‑1 (MQ=60)
TGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTATCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCGGGGCAAAATGCTGACGGACCGCGGTGGCG > SRR4302518.6612070/1‑101 (MQ=58)
GGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGNNN > SRR4302518.13396371/1‑101 (MQ=60)
GGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGNNN > SRR4302518.10392017/1‑101 (MQ=60)
GGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGC > SRR4302518.1697023/1‑101 (MQ=60)
CTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGNNN > SRR4302518.7433992/1‑101 (MQ=60)
TGCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCNNN > SRR4302518.11106296/1‑101 (MQ=60)
TGCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCATGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTTGGCAAAATGCTGGCAGtatgaggaggcgcnnn > SRR4302518.11067301/1‑85 (MQ=60)
TCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAGTGCGGTGGCGgnnn > SRR4302518.11692282/1‑97 (MQ=60)
TCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACA < SRR4302518.2216501/101‑1 (MQ=60)
NNNTCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGTACAA < SRR4302518.14990711/101‑1 (MQ=60)
CGATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCANNN > SRR4302518.11222214/1‑101 (MQ=60)
CCATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAA > SRR4302518.287965/1‑101 (MQ=60)
NNNCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC < SRR4302518.13686540/101‑1 (MQ=60)
NNNCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC < SRR4302518.11107964/101‑1 (MQ=60)
CATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAAC < SRR4302518.4750251/101‑1 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACANNN > SRR4302518.11385573/1‑101 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACG > SRR4302518.5724453/1‑101 (MQ=60)
ATCAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACG > SRR4302518.188298/1‑101 (MQ=60)
CAAAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGGGGCGCACAACGTA > SRR4302518.5168638/1‑101 (MQ=60)
AAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATC < SRR4302518.1066455/101‑1 (MQ=60)
AAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATC < SRR4302518.5626737/101‑1 (MQ=60)
AAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATC > SRR4302518.5595123/1‑101 (MQ=60)
AAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATC < SRR4302518.1838132/101‑1 (MQ=60)
AAGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATC < SRR4302518.410476/101‑1 (MQ=60)
AGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGCGGCGCACAACGTANNN > SRR4302518.7487062/1‑101 (MQ=60)
AGCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGGAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTGGGCGCAATGCTGGTCAAAATGCTGTCAGACTGCGGTGGCGCCCAACGcannn > SRR4302518.9308543/1‑96 (MQ=56)
GCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATNNN > SRR4302518.14773270/1‑101 (MQ=60)
GCCGGTGTC‑GGCG‑G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGC > SRR4302518.4630546/1‑101 (MQ=60)
G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAGAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACATCGTATCGCCACCACGCTGATT > SRR4302518.1231543/1‑101 (MQ=60)
G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATT > SRR4302518.5940336/1‑101 (MQ=60)
G‑G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATT > SRR4302518.2836921/1‑101 (MQ=60)
G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTG > SRR4302518.758584/1‑101 (MQ=60)
G‑‑AC‑GC‑TCGGTAGCCTTCCCTTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGAAAAATGCTGGCAGACGGGGGTGGCGCACAACGAATCGCCACCACGCTGATTG < SRR4302518.5348616/101‑1 (MQ=60)
|
GAACGGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑C‑G‑G‑‑AC‑G‑‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTG > NC_000913/3544260‑3544459
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
