Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,826,476 |
T→C |
N428S (AAC→AGC) |
b1746 ← |
putative aldehyde dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,826,476 | 0 | T | C | 100.0%
| 618.5
/ NA
| 186 | N428S (AAC→AGC) | b1746 | putative aldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (83/103); total (83/103) |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
GCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGT > NC_000913/1826386‑1826564
|
gCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGGTTGTTCCAGCTa > 2:5241799/1‑93 (MQ=255)
aTACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAAc < 1:5969365/93‑1 (MQ=255)
ccAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAAt > 1:6478457/1‑93 (MQ=255)
aGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcc < 2:4508530/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATccc < 2:4970468/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGAAAGAGGTTTGTTCCAGATAACAATcgc > 1:5211583/1‑91 (MQ=255)
gcgcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcccc < 1:1096701/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcccc < 2:3971438/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcccc > 1:4835378/1‑93 (MQ=255)
gcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgc < 1:787071/93‑1 (MQ=255)
gcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgc > 2:4943040/1‑93 (MQ=255)
cTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgcc < 1:1063949/93‑1 (MQ=255)
tGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgccc < 1:3911947/93‑1 (MQ=255)
tGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgccc > 2:542330/1‑93 (MQ=255)
tGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgccc < 2:6185180/93‑1 (MQ=255)
ggggCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCcccgcccg > 1:62162/1‑93 (MQ=255)
gggCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCccgcccgc > 2:4329173/1‑93 (MQ=255)
gggCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCccgcccgc > 2:3237871/1‑93 (MQ=255)
cGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGcc < 1:409076/93‑1 (MQ=255)
gATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTCAGCGGGTTGTTCCAGCTAACCATCCCCGCCCGCGCCt > 2:3740833/1‑93 (MQ=255)
gATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCt > 2:4655707/1‑93 (MQ=255)
gATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCt > 2:4174740/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTc < 2:4016487/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTc < 1:5876917/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTc < 1:3735497/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTc > 2:1239886/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGGTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTc > 1:3042179/1‑93 (MQ=255)
tgtttACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACTGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTcc < 1:6605213/90‑1 (MQ=255)
tGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTcc > 2:4626433/1‑93 (MQ=255)
tGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTcc < 2:120094/93‑1 (MQ=255)
ggTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCa > 2:1982172/1‑93 (MQ=255)
gTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAg > 2:5739871/1‑93 (MQ=255)
ttACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCTCCGCCCGCGCCTCCAGc > 2:1167480/1‑93 (MQ=255)
ttACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGc < 1:1760614/93‑1 (MQ=255)
tACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCa > 1:2039117/1‑93 (MQ=255)
ccGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACGGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAAc < 1:3235823/93‑1 (MQ=255)
ccGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAAc < 2:799905/93‑1 (MQ=255)
ggAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATGCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAg > 1:4722433/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAg > 2:446572/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAg > 2:4210233/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAg > 1:5536476/1‑93 (MQ=255)
gAAGCACCAAGGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAACCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGt < 2:2364541/93‑1 (MQ=255)
aaGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGtt < 2:4809832/93‑1 (MQ=255)
cACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGAt < 2:4123555/93‑1 (MQ=255)
cACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGAt < 1:365423/93‑1 (MQ=255)
aCCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGATGATc > 1:2977350/1‑93 (MQ=255)
ccAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCg < 1:5703185/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGaa > 1:353509/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACt < 1:5234633/93‑1 (MQ=255)
gccgccGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACtt > 2:4375454/1‑93 (MQ=255)
gccgccGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACtt < 2:2915246/93‑1 (MQ=255)
gccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTc < 1:4189494/93‑1 (MQ=255)
gccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTc > 2:728739/1‑93 (MQ=255)
cgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTccc > 2:6426149/1‑93 (MQ=255)
cgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTccc < 2:1665678/93‑1 (MQ=255)
cgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTccc > 1:4320039/1‑93 (MQ=255)
gAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCg > 2:3785247/1‑93 (MQ=255)
aTGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCt < 2:3079611/93‑1 (MQ=255)
aTGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCt < 2:3550919/93‑1 (MQ=255)
cggCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAACTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTc < 2:2002361/92‑1 (MQ=255)
gcgcGGTACTGTCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCAAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTGCCCGCTCgg < 1:3363796/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCgg < 2:3890014/93‑1 (MQ=255)
gcgGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCgggg < 1:5362286/93‑1 (MQ=255)
gtgTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCggggg < 2:2592868/91‑1 (MQ=255)
ggTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGa < 2:2464854/93‑1 (MQ=255)
gTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGaa < 2:873871/93‑1 (MQ=255)
gTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGaa > 1:5487087/1‑93 (MQ=255)
tACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGaaa < 2:551167/93‑1 (MQ=255)
tACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGaaa < 1:6296658/93‑1 (MQ=255)
aCTGGCAGCACCGGTAAGCGTTTGGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAAc < 2:1498294/93‑1 (MQ=255)
cTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAAcc > 1:2771107/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCa < 1:1194899/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCa < 1:4392019/93‑1 (MQ=255)
gcagcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCATCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGa < 2:607812/93‑1 (MQ=255)
gcagcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGa < 1:868839/93‑1 (MQ=255)
cagcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAc < 2:3669241/93‑1 (MQ=255)
gcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCg > 2:5906222/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCa > 1:1893981/1‑93 (MQ=255)
cGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAag < 2:4231909/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAaga < 1:2344170/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAaga < 1:2209361/93‑1 (MQ=255)
ggTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAaga > 1:2392088/1‑93 (MQ=255)
ggTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAaga < 1:3418379/93‑1 (MQ=255)
gTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagag > 2:1774495/1‑93 (MQ=255)
taggCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagaga < 1:4542733/90‑1 (MQ=255)
tAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagaga > 2:5136811/1‑93 (MQ=255)
aaGCGATTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAagagag < 2:6346533/93‑1 (MQ=255)
aGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGt < 2:3903762/93‑1 (MQ=255)
gCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTc > 1:35949/1‑93 (MQ=255)
gCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTc < 1:1594861/93‑1 (MQ=255)
ggTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCg > 2:3930779/1‑93 (MQ=255)
tttGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGaa > 1:4174263/1‑93 (MQ=255)
tttGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGaa < 2:296320/93‑1 (MQ=255)
gTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCg > 1:4257322/1‑93 (MQ=255)
ttCCAGCTAACAGTCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGa < 1:4765787/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGGAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGa > 1:5797649/1‑93 (MQ=255)
ttCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGa < 2:6583893/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGa < 2:4048291/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGAGCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGa > 2:3565951/1‑93 (MQ=255)
tCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAg < 2:3005204/93‑1 (MQ=255)
|
GCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGT > NC_000913/1826386‑1826564
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTA > NC_000913/1826387‑1826568
|
CATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAAC > SRR4302536.5687474/1‑94 (MQ=60)
ATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACA > SRR4302536.4957282/1‑94 (MQ=60)
ATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACA > SRR4302536.3695472/1‑94 (MQ=60)
ATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACA < SRR4302536.6147289/94‑1 (MQ=60)
ACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAAT > SRR4302536.6671741/1‑94 (MQ=60)
CCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAAAAATC > SRR4302536.6075017/1‑94 (MQ=60)
AGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGAAAGAGGTTTGTTCCAGATAACAATCGC > SRR4302536.5366907/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCC < SRR4302536.3025804/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCC > SRR4302536.4980921/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTGGCGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCC < SRR4302536.6114010/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCG < SRR4302536.1129598/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCG < SRR4302536.4761841/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCC < SRR4302536.810117/94‑1 (MQ=60)
CTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCC < SRR4302536.1095773/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCG > SRR4302536.63863/1‑94 (MQ=60)
TGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCG < SRR4302536.4028232/94‑1 (MQ=60)
GGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCG < SRR4302536.539262/94‑1 (MQ=60)
GGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGC > SRR4302536.3408212/1‑94 (MQ=60)
CGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCT < SRR4302536.419863/94‑1 (MQ=60)
CGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCT > SRR4302536.1777693/1‑94 (MQ=60)
GATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGGTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTC > SRR4302536.3131607/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCC < SRR4302536.3847140/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCC < SRR4302536.6051966/94‑1 (MQ=60)
TGTTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACTGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCA < SRR4302536.6801646/94‑1 (MQ=60)
TGGTTACCGAAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCA < SRR4302536.3106097/94‑1 (MQ=60)
GGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAA > SRR4302536.4894939/1‑94 (MQ=60)
TTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCA > SRR4302536.2100532/1‑94 (MQ=60)
TTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCA < SRR4302536.1813489/94‑1 (MQ=60)
CCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACGGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACA < SRR4302536.3330675/94‑1 (MQ=60)
CGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATGCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAG > SRR4302536.4864526/1‑94 (MQ=60)
CGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAG > SRR4302536.5701485/1‑94 (MQ=60)
CGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAG < SRR4302536.457319/94‑1 (MQ=60)
CGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAG > SRR4302536.6502045/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGCGCCAAGGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAG < SRR4302536.5058075/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGT < SRR4302536.6848681/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGT > SRR4302536.3748049/1‑94 (MQ=60)
AAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTG < SRR4302536.4449155/94‑1 (MQ=60)
AAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGAACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACACTTG > SRR4302536.2289907/1‑94 (MQ=60)
AGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGA > SRR4302536.6190565/1‑94 (MQ=60)
CACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATC < SRR4302536.375086/94‑1 (MQ=60)
CACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATC < SRR4302536.4271177/94‑1 (MQ=60)
CACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGATGATC > SRR4302536.3064992/1‑94 (MQ=60)
CCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGA < SRR4302536.5872768/94‑1 (MQ=60)
CAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAA > SRR4302536.362868/1‑94 (MQ=60)
CAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAA > SRR4302536.3478397/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACT > SRR4302536.376298/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACT < SRR4302536.5764333/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTT < SRR4302536.5390602/94‑1 (MQ=60)
GCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCC < SRR4302536.4313977/94‑1 (MQ=60)
CCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCC > SRR4302536.4449381/1‑94 (MQ=60)
CGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCG > SRR4302536.5939170/1‑94 (MQ=60)
CGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCG < SRR4302536.6687919/94‑1 (MQ=60)
CGAATGGCGCGGGACTGGCAGCACCGGTAAGCGGCTTGTTTCAGCTAACAATACCCGCCCGCCCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCG > SRR4302536.831168/1‑94 (MQ=60)
AAGGGCGCTGTACTGCCAGCACCGGTCAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAACCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCT < SRR4302536.5550678/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTC > SRR4302536.190313/1‑94 (MQ=60)
GCGCGGTACTGTCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCAAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTGCCCGCTCGGG < SRR4302536.3463712/94‑1 (MQ=60)
GCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGG < SRR4302536.5522267/94‑1 (MQ=60)
GGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAA > SRR4302536.5650900/1‑94 (MQ=60)
TACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAAC < SRR4302536.6484234/94‑1 (MQ=60)
ACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACC > SRR4302536.2853470/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCA < SRR4302536.2302586/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAG < SRR4302536.2087628/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAG < SRR4302536.6409669/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAG < SRR4302536.1230821/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAG < SRR4302536.4523210/94‑1 (MQ=60)
GCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAC < SRR4302536.894409/94‑1 (MQ=60)
CACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCA > SRR4302536.1950963/1‑94 (MQ=60)
CCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAG < SRR4302536.161889/94‑1 (MQ=60)
CCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAG < SRR4302536.884396/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGA > SRR4302536.2464507/1‑94 (MQ=60)
CGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTACCGCTCCGGGCACACCAGACCGCAAGA > SRR4302536.82713/1‑94 (MQ=60)
GGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAG < SRR4302536.3520119/94‑1 (MQ=60)
GGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAG < SRR4302536.2276079/94‑1 (MQ=60)
GGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAG < SRR4302536.2415261/94‑1 (MQ=60)
TAGGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAG < SRR4302536.4678948/94‑1 (MQ=60)
AGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTC > SRR4302536.4094360/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTC > SRR4302536.36959/1‑94 (MQ=60)
GCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCC < SRR4302536.1641463/94‑1 (MQ=60)
GCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCC < SRR4302536.2248920/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCG > SRR4302536.3586843/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAAACAGACCGCAAGAGAGTCCG > SRR4302536.2776150/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTGTTCCAGCTAACAACCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCG < SRR4302536.4353403/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGA > SRR4302536.2448946/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGA > SRR4302536.5374156/1‑94 (MQ=60)
GTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAA > SRR4302536.4298264/1‑94 (MQ=60)
TTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGC > SRR4302536.4310951/1‑94 (MQ=60)
TGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCG > SRR4302536.4384155/1‑94 (MQ=60)
TGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCG < SRR4302536.4023485/94‑1 (MQ=60)
GTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGGAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGA > SRR4302536.5970279/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCTAACAGTCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAG < SRR4302536.4909313/94‑1 (MQ=60)
AGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTT < SRR4302536.4965941/94‑1 (MQ=60)
GCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCTAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTA < SRR4302536.2102770/94‑1 (MQ=60)
GCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTA < SRR4302536.2787345/94‑1 (MQ=60)
GCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTA > SRR4302536.1022243/1‑94 (MQ=60)
|
CATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGTGTTA > NC_000913/1826387‑1826568
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
