Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,874,785 |
T→C |
G363G (GGT→GGC) |
yeaN → |
putative amino acid/amine transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,874,785 | 0 | T | C | 100.0%
| 693.9
/ NA
| 210 | G363G (GGT→GGC) | yeaN | putative amino acid/amine transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (88/122); total (88/122) |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
GCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGTAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCG > NC_000913/1874696‑1874874
|
gcACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTgg < 2:5360388/93‑1 (MQ=255)
gcACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTgg > 2:2925487/1‑93 (MQ=255)
cACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGt < 1:1586945/93‑1 (MQ=255)
cACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGt < 1:5651538/93‑1 (MQ=255)
aCTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTc < 2:5521370/93‑1 (MQ=255)
aCTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTGGGCAGCCTGTGGGCCTCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTc < 2:6184063/93‑1 (MQ=255)
ctctCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCt < 2:397242/93‑1 (MQ=255)
tctcGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTg > 2:2382089/1‑93 (MQ=255)
tctcGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTg < 2:4075346/93‑1 (MQ=255)
tctcGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTg > 2:2623166/1‑93 (MQ=255)
tcGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGtc > 2:6459237/1‑92 (MQ=255)
tcGGGGATGGCACAATCCGTCGGGGATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGCCTGTa > 1:4243949/1‑93 (MQ=255)
cGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTAc < 2:2202895/93‑1 (MQ=255)
gggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCa > 2:1288172/1‑93 (MQ=255)
ggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCAc < 2:1564721/93‑1 (MQ=255)
ggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCAc > 1:2387672/1‑93 (MQ=255)
gATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACt < 1:4946058/93‑1 (MQ=255)
ggCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTAt < 1:6237927/93‑1 (MQ=255)
ggCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTAt < 2:683634/93‑1 (MQ=255)
ggCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTAt > 2:3568024/1‑93 (MQ=255)
cacaATCGGTCGGGTATTTGTTGGCAGCATGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATgg < 2:1444623/93‑1 (MQ=255)
acaATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATggg < 1:6682290/93‑1 (MQ=255)
acaATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATggg < 2:5905706/93‑1 (MQ=255)
acaATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATggg > 1:1275016/1‑93 (MQ=255)
acaATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATggg > 2:5219727/1‑93 (MQ=255)
acaATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATggg < 2:5011333/93‑1 (MQ=255)
caATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgt < 1:673417/93‑1 (MQ=255)
aaTCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgtg < 2:1936171/93‑1 (MQ=255)
aTCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgtgt < 2:4730811/93‑1 (MQ=255)
aTCCGTCGGGTATTTGTGGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgtgt < 2:2058319/93‑1 (MQ=255)
tcggTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGtt < 1:5124609/90‑1 (MQ=255)
ccGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTg > 2:6030540/1‑93 (MQ=255)
ccGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTg > 2:1003183/1‑93 (MQ=255)
cGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGc > 1:4490219/1‑93 (MQ=255)
cGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGc < 1:3740127/93‑1 (MQ=255)
gTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGcc > 1:3461967/1‑93 (MQ=255)
tCGGTTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCa < 2:1880994/93‑1 (MQ=255)
tCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCa > 1:6488247/1‑93 (MQ=255)
gggTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATa > 2:3179913/1‑93 (MQ=255)
tATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACtt > 2:148130/1‑93 (MQ=255)
tttGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTc > 1:2084584/1‑93 (MQ=255)
tttGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTc < 1:2955239/93‑1 (MQ=255)
ttgttgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCa < 2:4908196/93‑1 (MQ=255)
tgttgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCac < 1:5708550/93‑1 (MQ=255)
gttgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCact > 2:3630609/1‑93 (MQ=255)
gttgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCact > 1:4820435/1‑93 (MQ=255)
ttgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCacta > 1:4847885/1‑93 (MQ=255)
tgccAGCTTGTGGGCCGCCGCTGATGGATAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCactac < 1:398576/90‑1 (MQ=255)
tgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCactac < 1:5374210/93‑1 (MQ=255)
tgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCactac < 2:33656/93‑1 (MQ=255)
tgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCactac < 1:1515689/93‑1 (MQ=255)
aGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGAt < 2:310878/93‑1 (MQ=255)
gCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTTCCATACTTTCACTACTGATg < 1:2235029/93‑1 (MQ=255)
gCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATg > 2:4872193/1‑93 (MQ=255)
gCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATg < 2:305403/93‑1 (MQ=255)
cTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATggg > 1:4656516/1‑92 (MQ=255)
tgtgGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCg < 1:3581521/93‑1 (MQ=255)
tgGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGAt < 2:1354477/93‑1 (MQ=255)
gggCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGAtt > 2:4424720/1‑93 (MQ=255)
ggCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGAttt < 2:625430/93‑1 (MQ=255)
ggCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGAttt > 1:2011859/1‑93 (MQ=255)
ccgccgCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTc < 2:4335220/93‑1 (MQ=255)
cgccgcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCg < 2:4149048/93‑1 (MQ=255)
ccgcTGATGTGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGa < 1:6660750/93‑1 (MQ=255)
ccgcTGATGGGTAAAATACACGATGCTCACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGa > 1:1014974/1‑93 (MQ=255)
cgcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGAc < 2:3256821/93‑1 (MQ=255)
gcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACt < 1:5508753/93‑1 (MQ=255)
gcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACt > 2:3857088/1‑93 (MQ=255)
cTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACtt < 2:4711981/93‑1 (MQ=255)
tGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACttt > 2:6200222/1‑93 (MQ=255)
tGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACttt > 1:4042929/1‑93 (MQ=255)
tGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACttt < 2:5457898/93‑1 (MQ=255)
gATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTg < 1:5888303/93‑1 (MQ=255)
aTGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTgc < 1:3839751/93‑1 (MQ=255)
tGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTgcg < 2:4054878/93‑1 (MQ=255)
tGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTgcg > 1:4154342/1‑93 (MQ=255)
gggTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTgcgc > 2:747074/1‑93 (MQ=255)
gggTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTgcgc > 1:2600651/1‑93 (MQ=255)
gTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCg > 1:2354627/1‑93 (MQ=255)
aTACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGgaga < 1:1830164/93‑1 (MQ=255)
aTACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGgaga > 1:4426097/1‑93 (MQ=255)
tACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGgagag < 2:5659559/93‑1 (MQ=255)
acacGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTGCCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGgagaga < 1:1402924/93‑1 (MQ=255)
acacGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGgagaga > 1:3052917/1‑93 (MQ=255)
cacGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAc < 2:1600235/93‑1 (MQ=255)
acGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACa > 2:499231/1‑93 (MQ=255)
gATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACaaa < 1:3152576/93‑1 (MQ=255)
gATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACaaa < 2:2993058/93‑1 (MQ=255)
gATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACaaa > 2:6322268/1‑93 (MQ=255)
aTGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAg > 1:2762802/1‑93 (MQ=255)
aTGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAg > 1:5835966/1‑93 (MQ=255)
aTGCTAACGGCAACTGGACTGTACCACTTATGGGCGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACgaaa > 1:3655369/1‑92 (MQ=255)
tGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGa > 2:5861014/1‑93 (MQ=255)
tGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGa < 2:5985415/93‑1 (MQ=255)
tGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGa > 2:3284409/1‑93 (MQ=255)
tAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAt < 1:2524565/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAtt > 1:367584/1‑93 (MQ=255)
aaCGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAtt < 2:6278975/93‑1 (MQ=255)
aCGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTc < 2:1104882/93‑1 (MQ=255)
cGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCg < 2:5306265/93‑1 (MQ=255)
|
GCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGTAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCG > NC_000913/1874696‑1874874
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGTAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC‑AAAGAAATTCGCTAA > NC_000913/1874693‑1874878
|
GCGGCGGGACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTGGAGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCA < SRR4302536.4395800/94‑1 (MQ=60)
CGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAA < SRR4302536.4076028/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAAC > SRR4302536.3065851/1‑94 (MQ=60)
GGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAAC > SRR4302536.4973934/1‑94 (MQ=60)
CACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTC < SRR4302536.1633385/94‑1 (MQ=60)
CACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTC < SRR4302536.5819476/94‑1 (MQ=60)
ACCCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCT < SRR4302536.4191822/94‑1 (MQ=60)
CTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGGATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGCCTGTA > SRR4302536.4370337/1‑94 (MQ=60)
GGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCA > SRR4302536.1557987/1‑94 (MQ=60)
GGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCA < SRR4302536.4483604/94‑1 (MQ=60)
GGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCAC > SRR4302536.2459970/1‑94 (MQ=60)
GGGATGGCACAATCCGTCGGGGATTTGTTGCCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGCGGCTAACGGCAACTGGCTTGTACCAC > SRR4302536.2815603/1‑94 (MQ=60)
GGGATGGCACAATCCGTCGGGCATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCAC > SRR4302536.3319374/1‑94 (MQ=60)
GGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACT > SRR4302536.194983/1‑94 (MQ=60)
GATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTT < SRR4302536.5094689/94‑1 (MQ=60)
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GATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTT > SRR4302536.5164694/1‑94 (MQ=60)
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GCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGG < SRR4302536.5021787/94‑1 (MQ=60)
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ACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC > SRR4302536.3979356/1‑94 (MQ=60)
ACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC < SRR4302536.2109132/94‑1 (MQ=60)
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GATGCTAACGGCAACTGGACTGTACCACTTATGGGCGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACGAAA > SRR4302536.3764643/1‑94 (MQ=60)
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TAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC‑AAAGAAATT > SRR4302536.377300/1‑94 (MQ=60)
TAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC‑AAAGAAATT < SRR4302536.2600669/94‑1 (MQ=60)
AACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC‑AAAGAAATTC < SRR4302536.2335947/94‑1 (MQ=60)
ACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC‑AAAGAAATTCG < SRR4302536.4160198/94‑1 (MQ=60)
CGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC‑AAAGAAATTCGC > SRR4302536.5082968/1‑94 (MQ=60)
GCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC‑AAAGAAATTCGCTA > SRR4302536.3322255/1‑94 (MQ=60)
CAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC‑AAAGAAATTCGCTAA > SRR4302536.2478067/1‑94 (MQ=60)
CAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC‑AAAGAAATTCGCTAA > SRR4302536.892790/1‑94 (MQ=60)
CAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC‑AAAGAAATTCGCTAA > SRR4302536.4755038/1‑94 (MQ=60)
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GCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGTAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC‑AAAGAAATTCGCTAA > NC_000913/1874693‑1874878
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
