Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,892,514 |
T→C |
intergenic (+58/+62) |
b1810 → / ← b1811 |
hypothetical protein/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,892,514 | 0 | T | C | 100.0%
| 615.1
/ NA
| 189 | intergenic (+58/+62) | b1810/b1811 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (106/83); total (106/83) |
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
TATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGTCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCC > NC_000913/1892424‑1892603
|
tatatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGccc > 2:859446/1‑93 (MQ=255)
tatatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGccc < 2:2522503/93‑1 (MQ=255)
atatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCt < 2:2826621/93‑1 (MQ=255)
atatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCt > 2:5465756/1‑93 (MQ=255)
atatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCt < 2:6328008/93‑1 (MQ=255)
acatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCt < 1:916707/91‑1 (MQ=255)
tatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAATTGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCtt < 1:5434706/93‑1 (MQ=255)
tatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCtt < 2:596904/93‑1 (MQ=255)
tatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCtt > 1:6062459/1‑93 (MQ=255)
atGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCttt < 1:4349378/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCtttt < 2:5334936/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCtttt < 2:3362581/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCtttt > 1:5963722/1‑93 (MQ=255)
gCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCttttt > 1:2662529/1‑93 (MQ=255)
cAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTtc < 2:3625539/93‑1 (MQ=255)
aGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTtct > 1:3520658/1‑93 (MQ=255)
ggAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTtctc > 1:2023058/1‑93 (MQ=255)
ggAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTtctc > 2:3833341/1‑93 (MQ=255)
gaagaaCTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTca > 2:395215/1‑93 (MQ=255)
agaaCTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCGTAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTcaca > 1:3464738/1‑93 (MQ=255)
agaaCTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTcaca > 2:1749162/1‑93 (MQ=255)
agaaCTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTcaca > 1:1927908/1‑93 (MQ=255)
gaaCTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACaa < 2:4113825/93‑1 (MQ=255)
gaaCTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACaa > 2:1593884/1‑93 (MQ=255)
gaaCTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACaa > 2:6451172/1‑93 (MQ=255)
aaCTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAAt < 2:4410659/93‑1 (MQ=255)
cTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCa > 2:119255/1‑93 (MQ=255)
tAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCaa > 2:5803425/1‑93 (MQ=255)
aaGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATg > 2:4871848/1‑93 (MQ=255)
aGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGa > 1:5490613/1‑93 (MQ=255)
gCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGat > 2:4925412/1‑93 (MQ=255)
aCTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGatca > 2:2148229/1‑93 (MQ=255)
aCTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGatca < 2:1665396/93‑1 (MQ=255)
tGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGatcatc < 2:6240675/93‑1 (MQ=255)
tGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGatcatc > 2:6048573/1‑93 (MQ=255)
ggTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCg > 2:5586185/1‑93 (MQ=255)
ggTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCg > 2:1111134/1‑93 (MQ=255)
cTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCt < 1:1510043/93‑1 (MQ=255)
cTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCt < 2:3019722/93‑1 (MQ=255)
cTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCt < 1:2359327/93‑1 (MQ=255)
tGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCtt < 1:1993993/93‑1 (MQ=255)
gAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTc > 1:84353/1‑93 (MQ=255)
gTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCta < 2:2779259/93‑1 (MQ=255)
gTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCta > 2:1846858/1‑93 (MQ=255)
ttAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCtat > 1:3271842/1‑93 (MQ=255)
ttAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCtat < 2:4476434/93‑1 (MQ=255)
tAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCtata < 1:6196046/93‑1 (MQ=255)
tAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCtata < 1:5755335/93‑1 (MQ=255)
tAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCtata > 1:4866656/1‑93 (MQ=255)
aaaTTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATaa < 1:1291911/93‑1 (MQ=255)
aaTTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAAc > 1:725915/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAAc > 2:656165/1‑93 (MQ=255)
atcatatCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGa < 2:2139333/90‑1 (MQ=255)
tataTCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGaaa < 2:3690574/93‑1 (MQ=255)
atatCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAAt < 1:2288846/93‑1 (MQ=255)
atatCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAAt < 1:6323526/93‑1 (MQ=255)
atatCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAAt < 1:4167025/93‑1 (MQ=255)
atatCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAAt < 2:5919904/93‑1 (MQ=255)
atatCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAAt < 1:6103051/93‑1 (MQ=255)
tCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGa > 1:2454071/1‑93 (MQ=255)
tcATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATAc > 2:2450938/2‑93 (MQ=255)
gCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATAc < 1:1198921/93‑1 (MQ=255)
aTAAATGGTTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACgg > 1:6529810/1‑93 (MQ=255)
tAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGa > 1:1809838/1‑93 (MQ=255)
tAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGa > 1:5712860/1‑93 (MQ=255)
aaaTGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGAt > 1:2387419/1‑93 (MQ=255)
aaTGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGAtt < 1:1089899/93‑1 (MQ=255)
ggTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAgtg > 2:4613233/1‑93 (MQ=255)
ggTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAgtg < 1:5853238/93‑1 (MQ=255)
tCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAgtgtg > 2:2323145/1‑93 (MQ=255)
tCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAgtgtg < 2:769534/93‑1 (MQ=255)
aGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGtt < 2:4746374/93‑1 (MQ=255)
ggACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTa > 2:1246588/1‑93 (MQ=255)
ggACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATAAGGATTAGTGTGTTa > 2:35172/1‑93 (MQ=255)
ggACGATTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTa > 2:2686354/1‑93 (MQ=255)
gACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTAc < 2:1396721/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACt > 1:5058218/1‑93 (MQ=255)
aCGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACt > 2:2175005/1‑93 (MQ=255)
aCGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACt < 2:5639703/93‑1 (MQ=255)
gCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCg < 1:213892/93‑1 (MQ=255)
cTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGt > 1:2942644/1‑93 (MQ=255)
ttttAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTc < 2:724777/93‑1 (MQ=255)
ttttAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTc > 2:5364617/1‑93 (MQ=255)
tAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAATGTGTTACTCGTCTTc > 1:3617454/1‑93 (MQ=255)
acaTATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATccc > 2:1293034/1‑92 (MQ=255)
caTATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTc > 2:911362/1‑93 (MQ=255)
caTATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTc < 1:4836781/93‑1 (MQ=255)
atatAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCa > 2:5051265/1‑93 (MQ=255)
tataAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCaa > 1:3939085/1‑93 (MQ=255)
tataAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGAGTTACTCGTCTTCATCCTCaa > 1:2200120/1‑93 (MQ=255)
taAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCaaaa < 2:5877976/93‑1 (MQ=255)
taAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCaaaa < 1:4638328/93‑1 (MQ=255)
taAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCaaaa < 1:4921353/93‑1 (MQ=255)
aaaaaGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAAc < 1:3561029/93‑1 (MQ=255)
aaaaGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAAcg > 2:6528716/1‑93 (MQ=255)
aaaaGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAAcg > 2:3767917/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAAcgc < 2:5159322/93‑1 (MQ=255)
aGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACgcgc < 1:2708036/93‑1 (MQ=255)
gcgcCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGcc > 2:4689029/1‑93 (MQ=255)
gcgcCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGcc > 1:554911/1‑93 (MQ=255)
|
TATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGTCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCC > NC_000913/1892424‑1892603
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGTCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCACGA > NC_000913/1892421‑1892607
|
ACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGC > SRR4302536.4938899/1‑94 (MQ=60)
ATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCC > SRR4302536.5798182/1‑94 (MQ=60)
ATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTT > SRR4302536.6243318/1‑94 (MQ=60)
ACATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTT < SRR4302536.943728/94‑1 (MQ=60)
TATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAATTGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTT < SRR4302536.5597211/94‑1 (MQ=60)
ATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTT < SRR4302536.4479528/94‑1 (MQ=60)
ATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTT > SRR4302536.6141464/1‑94 (MQ=60)
TGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTT > SRR4302536.2742199/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCT > SRR4302536.4779317/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCT > SRR4302536.3625841/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGCCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGTCCTTTTTCT > SRR4302536.1883653/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTC > SRR4302536.2078568/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTC > SRR4302536.2083979/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTC > SRR4302536.2245232/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTC > SRR4302536.5652258/1‑94 (MQ=60)
AAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCGTAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACA > SRR4302536.3567988/1‑94 (MQ=60)
AAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACA > SRR4302536.1985910/1‑94 (MQ=60)
AACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATC > SRR4302536.5657574/1‑94 (MQ=60)
AAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAAT < SRR4302536.2151956/94‑1 (MQ=60)
AAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATG < SRR4302536.1531317/94‑1 (MQ=60)
AAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGA > SRR4302536.2012398/1‑94 (MQ=60)
AAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGA > SRR4302536.1728350/1‑94 (MQ=60)
AAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGA > SRR4302536.5654494/1‑94 (MQ=60)
AGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGAT > SRR4302536.4396342/1‑94 (MQ=60)
CACTGGTCTGAGTTAAATTTGTATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCA > SRR4302536.5178046/1‑94 (MQ=60)
CACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCA < SRR4302536.6427046/94‑1 (MQ=60)
CACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCA > SRR4302536.273521/1‑94 (MQ=60)
CACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCA < SRR4302536.61221/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATC < SRR4302536.232189/94‑1 (MQ=60)
GTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGC > SRR4302536.4674516/1‑94 (MQ=60)
CTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTT < SRR4302536.2430841/94‑1 (MQ=60)
CTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTT < SRR4302536.1554531/94‑1 (MQ=60)
TGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTC > SRR4302536.86611/1‑94 (MQ=60)
TGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTC < SRR4302536.2053984/94‑1 (MQ=60)
GAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCT > SRR4302536.1241648/1‑94 (MQ=60)
GTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTAT > SRR4302536.3367934/1‑94 (MQ=60)
TTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATA > SRR4302536.5013106/1‑94 (MQ=60)
TAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAA < SRR4302536.6380598/94‑1 (MQ=60)
TAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAA < SRR4302536.5926541/94‑1 (MQ=60)
AAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAAC < SRR4302536.1330536/94‑1 (MQ=60)
AAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAAC > SRR4302536.747165/1‑94 (MQ=60)
AATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACG < SRR4302536.6573148/94‑1 (MQ=60)
TATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAAT < SRR4302536.3086640/94‑1 (MQ=60)
TATATAAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAAT < SRR4302536.5913821/94‑1 (MQ=60)
ATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATC > SRR4302536.498438/1‑94 (MQ=60)
ATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATC > SRR4302536.5023976/1‑94 (MQ=60)
ATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATC < SRR4302536.4290828/94‑1 (MQ=60)
ATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATC < SRR4302536.2854680/94‑1 (MQ=60)
ATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATC < SRR4302536.6285000/94‑1 (MQ=60)
ATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATC < SRR4302536.2358267/94‑1 (MQ=60)
ATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATC < SRR4302536.6511870/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGA > SRR4302536.2528183/1‑94 (MQ=60)
CAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATA > SRR4302536.2621791/1‑94 (MQ=60)
AGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATAC < SRR4302536.906864/94‑1 (MQ=60)
GCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACG < SRR4302536.1234963/94‑1 (MQ=60)
CATAAATGGTTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGG > SRR4302536.6724307/1‑94 (MQ=60)
CATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGG > SRR4302536.3623412/1‑94 (MQ=60)
ATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGA > SRR4302536.5882762/1‑94 (MQ=60)
ATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGA > SRR4302536.1864447/1‑94 (MQ=60)
TAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGAT > SRR4302536.2459712/1‑94 (MQ=60)
AAATGGGTCAGGACACTATTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATT < SRR4302536.5532595/94‑1 (MQ=60)
AATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTA < SRR4302536.1122579/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGT < SRR4302536.6027627/94‑1 (MQ=60)
GTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTG > SRR4302536.1234031/1‑94 (MQ=60)
GTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTG < SRR4302536.3785025/94‑1 (MQ=60)
CAGGACGCTTTTAATCACATATAAGAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTT < SRR4302536.6788217/94‑1 (MQ=60)
AGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTA > SRR4302536.3640930/1‑94 (MQ=60)
GACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACT > SRR4302536.5209734/1‑94 (MQ=60)
GACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACT < SRR4302536.3707639/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCG > SRR4302536.2380667/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGT < SRR4302536.219564/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGT > SRR4302536.3029406/1‑94 (MQ=60)
CTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTC > SRR4302536.6268209/1‑94 (MQ=60)
TTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAATGTGTTACTCGTCTTC > SRR4302536.3725601/1‑94 (MQ=60)
AATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCAT > SRR4302536.837032/1‑94 (MQ=60)
ATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCTATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATC > SRR4302536.6196363/1‑94 (MQ=60)
CACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCT < SRR4302536.3447632/94‑1 (MQ=60)
CACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCT > SRR4302536.2512948/1‑94 (MQ=60)
CATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCA < SRR4302536.4982368/94‑1 (MQ=60)
CATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCA > SRR4302536.6003295/1‑94 (MQ=60)
ATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAA > SRR4302536.4056117/1‑94 (MQ=60)
ATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGAGTTACTCGTCTTCATCCTCAA > SRR4302536.2266529/1‑94 (MQ=60)
TATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAA > SRR4302536.6365314/1‑94 (MQ=60)
TAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAAC < SRR4302536.958110/94‑1 (MQ=60)
TAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAAC < SRR4302536.5069245/94‑1 (MQ=60)
TAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAAC < SRR4302536.4777728/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACG < SRR4302536.3667496/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACG < SRR4302536.2445491/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCC > SRR4302536.569040/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCC > SRR4302536.4072499/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCC < SRR4302536.2788826/94‑1 (MQ=60)
GCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCA > SRR4302536.209238/1‑94 (MQ=60)
CGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCAC > SRR4302536.6581490/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCACGA > SRR4302536.418286/1‑94 (MQ=60)
|
ACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGTCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCACGA > NC_000913/1892421‑1892607
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
