Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,207,023 |
A→G |
D346G (GAC→GGC) |
yehP → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,207,023 | 0 | A | G | 99.5%
| 656.1
/ ‑4.7
| 203 | D346G (GAC→GGC) | yehP | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (114/87); total (114/89) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.36e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.06e-01 |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
TACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGACCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATC > NC_000913/2206933‑2207112
|
aCTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCcg > 1:565020/1‑93 (MQ=255)
cTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCcgc > 2:1200805/1‑93 (MQ=255)
cGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATa < 1:3955043/93‑1 (MQ=255)
cGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATa > 2:4882009/1‑93 (MQ=255)
cGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATa < 2:145131/93‑1 (MQ=255)
gCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATAc < 2:2053360/93‑1 (MQ=255)
cATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACg < 1:5911376/93‑1 (MQ=255)
aTCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACgg > 2:5164388/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGc > 1:5168857/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGc > 1:242198/1‑93 (MQ=255)
agatGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGccc < 1:2120637/90‑1 (MQ=255)
aGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGccc > 1:1770816/1‑93 (MQ=255)
aGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGccc < 2:4960489/93‑1 (MQ=255)
aGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGccc < 2:2297811/93‑1 (MQ=255)
ggTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCa > 2:1857019/1‑93 (MQ=255)
ggTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCa > 1:877116/1‑93 (MQ=255)
tGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAgg > 2:5085883/1‑93 (MQ=255)
gAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGgc > 2:2187672/1‑93 (MQ=255)
aaaaaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGgcg < 2:905139/93‑1 (MQ=255)
aaaaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGgcgc > 2:2973195/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCt < 1:1085837/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCt < 1:561063/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCt > 2:4428432/1‑93 (MQ=255)
aaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTg > 2:546860/1‑93 (MQ=255)
aGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTgg < 2:5316197/93‑1 (MQ=255)
gtgtgtCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGt < 2:3290405/93‑1 (MQ=255)
gtgtgtCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGt < 1:3019427/93‑1 (MQ=255)
gtgtgtCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGACCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGt < 1:5395713/93‑1 (MQ=255)
atgtgtCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGt < 1:2824651/92‑1 (MQ=255)
tgtCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTaa > 2:642333/1‑93 (MQ=255)
tgtCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTaa < 2:2021774/93‑1 (MQ=255)
gtCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAAt > 1:3163452/1‑93 (MQ=255)
cAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTc < 2:5535725/93‑1 (MQ=255)
cAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTc < 1:4909468/93‑1 (MQ=255)
agagCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCg < 1:2583520/93‑1 (MQ=255)
gagCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCgg < 2:4807989/93‑1 (MQ=255)
gagCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCgg > 2:3614060/1‑93 (MQ=255)
agCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGgc > 1:3326404/1‑93 (MQ=255)
ggCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGca > 2:5873205/1‑93 (MQ=255)
gCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGcac > 2:1346860/1‑93 (MQ=255)
cATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGcaca > 1:6691818/1‑93 (MQ=255)
aacAAAGTGCTGGGACGGTCAGCTCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGTCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACaa < 1:4732913/91‑1 (MQ=255)
aTCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACaa > 2:6047601/1‑93 (MQ=255)
aTCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACaa > 1:2723094/1‑93 (MQ=255)
tCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACaaa > 1:4021049/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACCCCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCCGGCGCTGGTTAATGGCGGCGCACAAATa > 1:1594694/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATa < 1:3670024/93‑1 (MQ=255)
aaGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAg > 1:2297898/1‑93 (MQ=255)
aaGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAg > 2:4079244/1‑93 (MQ=255)
aaGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAg < 2:2542110/93‑1 (MQ=255)
aGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAgc < 1:314106/93‑1 (MQ=255)
gCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAgccgc < 1:1613866/93‑1 (MQ=255)
tGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCa > 2:2363808/1‑93 (MQ=255)
tGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCa > 2:2934516/1‑93 (MQ=255)
tGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCa > 1:2865871/1‑93 (MQ=255)
tGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCa > 2:6225621/1‑93 (MQ=255)
gggACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCAt < 2:4621180/93‑1 (MQ=255)
gACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGa < 2:3192905/93‑1 (MQ=255)
gACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGa > 2:4484015/1‑93 (MQ=255)
gACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGa < 2:4525216/93‑1 (MQ=255)
gACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGa < 2:67469/93‑1 (MQ=255)
gcTGGCACGGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGAc < 2:2684525/92‑1 (MQ=255)
tGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGc > 2:150652/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGc < 1:6115165/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGcc < 1:4521598/93‑1 (MQ=255)
cAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCgg < 1:6498368/93‑1 (MQ=255)
aGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCggg < 1:1891695/93‑1 (MQ=255)
gcgcTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGc > 2:70189/1‑93 (MQ=255)
gcgcTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGc > 2:1592880/1‑93 (MQ=255)
gcgcTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGc > 2:56544/1‑93 (MQ=255)
cgcTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCg > 1:222533/1‑93 (MQ=255)
cTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAg > 2:432906/1‑93 (MQ=255)
cGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCt < 1:2452668/93‑1 (MQ=255)
gATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTg > 1:4092081/1‑93 (MQ=255)
tAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGc > 1:2173855/1‑93 (MQ=255)
tAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGc > 1:2023884/1‑93 (MQ=255)
aGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGca < 2:6638912/93‑1 (MQ=255)
gCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGcat > 1:1130884/1‑93 (MQ=255)
cACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGcatc < 1:3282876/93‑1 (MQ=255)
cACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGcatc < 1:6430042/93‑1 (MQ=255)
cccGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGcatca < 1:5064296/92‑1 (MQ=255)
cccGCAACACCTTGCGATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGcatca < 1:4355051/92‑1 (MQ=255)
aCCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGcatca < 2:1294936/93‑1 (MQ=255)
aCCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGcatca > 1:6235607/1‑93 (MQ=255)
cGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATg > 1:2200259/1‑93 (MQ=255)
cGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATg < 2:5795208/93‑1 (MQ=255)
gCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCCTCATgg > 1:1494161/1‑93 (MQ=255)
cAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGc < 2:2780474/93‑1 (MQ=255)
cAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGc < 1:4581647/93‑1 (MQ=255)
aaCACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCt < 2:6510197/93‑1 (MQ=255)
aaCACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCt > 2:6179326/1‑93 (MQ=255)
acCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCtttt > 2:3437067/1‑91 (MQ=255)
acCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCtttt > 1:6088064/1‑91 (MQ=255)
acCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGc < 2:1596110/93‑1 (MQ=255)
ccTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCttttg > 1:2523698/1‑90 (MQ=255)
cTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCttttgg > 1:5439506/1‑89 (MQ=255)
ttGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGga < 2:6464913/93‑1 (MQ=255)
cTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGaa < 2:3637154/93‑1 (MQ=255)
aTGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATc < 2:1093048/93‑1 (MQ=255)
aTGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATc < 2:2431592/93‑1 (MQ=255)
|
TACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGACCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATC > NC_000913/2206933‑2207112
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CATTACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGACCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCTTCA > NC_000913/2206930‑2207116
|
CATTACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGG > SRR4302536.89691/1‑94 (MQ=60)
ATTACTGACGCAGCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTTCTATGGC < SRR4302536.4107814/94‑1 (MQ=60)
TGACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCC < SRR4302536.5289003/94‑1 (MQ=60)
TACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCG > SRR4302536.2935071/1‑94 (MQ=60)
TACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCG > SRR4302536.579408/1‑94 (MQ=60)
TACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCG < SRR4302536.962265/94‑1 (MQ=60)
CGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATAC < SRR4302536.4072486/94‑1 (MQ=60)
CATCAGGTGTAAAAGTGTGTTCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGG > SRR4302536.6713740/1‑94 (MQ=60)
CATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGG < SRR4302536.6087450/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGC > SRR4302536.248657/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGC > SRR4302536.5323077/1‑94 (MQ=60)
TCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCC < SRR4302536.437219/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCC > SRR4302536.1824395/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCC > SRR4302536.4077728/1‑94 (MQ=60)
AGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCA < SRR4302536.624257/94‑1 (MQ=60)
AGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCA > SRR4302536.902953/1‑94 (MQ=60)
AGATGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCA < SRR4302536.2184360/94‑1 (MQ=60)
GGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAG < SRR4302536.892062/94‑1 (MQ=60)
GTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGG > SRR4302536.3019974/1‑94 (MQ=60)
TGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGC > SRR4302536.1830227/1‑94 (MQ=60)
TGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATAAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGC < SRR4302536.4905688/94‑1 (MQ=60)
GAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCG < SRR4302536.6655876/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGGGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTTGGACTGGCAGCGCTTGATAGCAACGCAACACCTTGCTATGGCCCCGATACGGCCCACGCGC > SRR4302536.1406086/1‑94 (MQ=60)
AAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCT > SRR4302536.231220/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTG < SRR4302536.1118378/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTG < SRR4302536.575356/94‑1 (MQ=60)
AAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGG > SRR4302536.270065/1‑94 (MQ=60)
GTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTT < SRR4302536.3108159/94‑1 (MQ=60)
GTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGACCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTT < SRR4302536.5556825/94‑1 (MQ=60)
ATGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTT < SRR4302536.2908281/94‑1 (MQ=60)
TGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTA < SRR4302536.2371921/94‑1 (MQ=60)
TGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAAT > SRR4302536.3256123/1‑94 (MQ=60)
GTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATG > SRR4302536.1995500/1‑94 (MQ=60)
TCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGT > SRR4302536.4877831/1‑94 (MQ=60)
CAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCG < SRR4302536.5057053/94‑1 (MQ=60)
AGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGG < SRR4302536.2661153/94‑1 (MQ=60)
GAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGGTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGGCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGC > SRR4302536.5789548/1‑94 (MQ=60)
GAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGC < SRR4302536.2525182/94‑1 (MQ=60)
GAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGC > SRR4302536.3424833/1‑94 (MQ=60)
CGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCA > SRR4302536.3255403/1‑94 (MQ=60)
GCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACA < SRR4302536.3450055/94‑1 (MQ=60)
GCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACA > SRR4302536.5614594/1‑94 (MQ=60)
GCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACA > SRR4302536.6890566/1‑94 (MQ=60)
CATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAA > SRR4302536.2804301/1‑94 (MQ=60)
ATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAA > SRR4302536.4140355/1‑94 (MQ=60)
AACAAAGTGCTGGGACGGTCAGCTCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGTCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAA < SRR4302536.4875350/94‑1 (MQ=60)
TCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAAT < SRR4302536.164664/94‑1 (MQ=60)
CAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACCCCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCCGGCGCTGGTTAATGGCGGCGCACAAATA > SRR4302536.1641294/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAG < SRR4302536.2902572/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAG > SRR4302536.6404199/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAG > SRR4302536.2367628/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAG < SRR4302536.3779746/94‑1 (MQ=60)
AGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCC < SRR4302536.322431/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCG > SRR4302536.1127814/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCG > SRR4302536.275555/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCC < SRR4302536.1660911/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCC < SRR4302536.4662956/94‑1 (MQ=60)
CTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCA > SRR4302536.2950547/1‑94 (MQ=60)
tggcacgaGCAGCGCTCGATAGCACCGAAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCAAAAATAGCCGCCAT < SRR4302536.809630/86‑1 (MQ=60)
TGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCAT > SRR4302536.2245088/1‑94 (MQ=60)
ACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGGCGGCGCGCAAATAGCCGCCATGAGG > SRR4302536.1587869/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGACGCCATGACGC > SRR4302536.4184067/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCC < SRR4302536.6297423/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCG < SRR4302536.2280241/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCG < SRR4302536.4657190/94‑1 (MQ=60)
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CAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGG < SRR4302536.6692081/94‑1 (MQ=60)
AGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGC > SRR4302536.2116982/1‑94 (MQ=60)
AGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGC < SRR4302536.1948586/94‑1 (MQ=60)
GCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCG > SRR4302536.228438/1‑94 (MQ=60)
CGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGA > SRR4302536.3412230/1‑94 (MQ=60)
CTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGC > SRR4302536.4792298/1‑94 (MQ=60)
CGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTG > SRR4302536.4213414/1‑94 (MQ=60)
CGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTG < SRR4302536.5473063/94‑1 (MQ=60)
CGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTG < SRR4302536.2526751/94‑1 (MQ=60)
CGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTG > SRR4302536.3258119/1‑94 (MQ=60)
ATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGC > SRR4302536.2239325/1‑94 (MQ=60)
ATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGC < SRR4302536.5952950/94‑1 (MQ=60)
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AGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCAT > SRR4302536.1164868/1‑94 (MQ=60)
CACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCA > SRR4302536.6421380/1‑94 (MQ=60)
CACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCA > SRR4302536.2235116/1‑94 (MQ=60)
CACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCA < SRR4302536.3379423/94‑1 (MQ=60)
CACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCA < SRR4302536.6622226/94‑1 (MQ=60)
CCCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCAT < SRR4302536.5215969/94‑1 (MQ=60)
CCCGCAACACCTTGCGATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCAT < SRR4302536.4485317/94‑1 (MQ=60)
ACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCAT < SRR4302536.5559495/94‑1 (MQ=60)
CCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATG > SRR4302536.2266673/1‑94 (MQ=60)
CGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCCTCATGG > SRR4302536.1538281/1‑94 (MQ=60)
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GCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGC > SRR4302536.6552189/1‑94 (MQ=60)
GCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGC > SRR4302536.3166125/1‑94 (MQ=60)
GCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGC > SRR4302536.1804766/1‑94 (MQ=60)
CAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCT < SRR4302536.4719169/94‑1 (MQ=60)
AACGCCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTT < SRR4302536.264509/94‑1 (MQ=60)
AACACCTTGCTATGGCGGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTT < SRR4302536.5308716/94‑1 (MQ=60)
CACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTtt > SRR4302536.6269640/1‑92 (MQ=60)
ACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTttg > SRR4302536.2599778/1‑91 (MQ=60)
CCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTttgg > SRR4302536.5602181/1‑90 (MQ=60)
CCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTTCGG > SRR4302536.4586902/1‑94 (MQ=60)
TTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAG < SRR4302536.2535681/94‑1 (MQ=60)
GCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTtgcggtga > SRR4302536.1696919/1‑86 (MQ=60)
CTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTtcctgggat > SRR4302536.1866410/1‑85 (MQ=60)
TATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGaggagat > SRR4302536.3344801/1‑87 (MQ=60)
ATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTTCGGAGAATAT > SRR4302536.2109590/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCT < SRR4302536.5071466/94‑1 (MQ=60)
TGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCTT < SRR4302536.5975049/94‑1 (MQ=60)
TGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCTT < SRR4302536.5183227/94‑1 (MQ=60)
GCCGCGAGACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCTTCA < SRR4302536.4597704/94‑1 (MQ=60)
|
CATTACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGACCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCTTCA > NC_000913/2206930‑2207116
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
