Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,321,092 |
G→A |
A403T (GCC→ACC) |
atoC → |
ornithine decarboxylase antizyme |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,321,092 | 0 | G | A | 99.6%
| 803.8
/ NA
| 228 | A403T (GCC→ACC) | atoC | ornithine decarboxylase antizyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (120/107); minor base C (0/1); total (120/108) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
GTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAC > NC_000913/2321002‑2321181
|
tcgtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAccc > 2:5132871/1‑93 (MQ=255)
gtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCt > 1:6329550/1‑93 (MQ=255)
gtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCt > 1:315496/1‑93 (MQ=255)
gtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCt < 2:2298302/93‑1 (MQ=255)
atgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTc > 1:3467547/1‑93 (MQ=255)
tgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCg > 1:1990744/1‑93 (MQ=255)
tgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCg > 1:5820259/1‑93 (MQ=255)
aaTTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGt < 1:1399452/93‑1 (MQ=255)
aaTTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGt < 2:3682583/93‑1 (MQ=255)
atCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGa < 1:5076737/92‑1 (MQ=255)
tCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAg < 2:1654045/93‑1 (MQ=255)
tCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAg < 2:3261270/93‑1 (MQ=255)
aGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCg > 2:6612488/1‑93 (MQ=255)
aGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCg > 2:1003667/1‑93 (MQ=255)
ggCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACACCTGTCGGTGAGCGt > 2:2284084/1‑93 (MQ=255)
cccGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTaa < 1:1064915/93‑1 (MQ=255)
cggATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAt < 2:6316717/91‑1 (MQ=255)
ccGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAt < 1:6015906/93‑1 (MQ=255)
ccGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAt > 1:4555972/1‑93 (MQ=255)
aTCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTa > 1:4153012/1‑93 (MQ=255)
aTCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTa > 1:420548/1‑93 (MQ=255)
tCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTaa > 2:6659996/1‑93 (MQ=255)
tttttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTaaaa < 2:5194818/92‑1 (MQ=255)
aTTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTaaaa > 2:1703977/1‑93 (MQ=255)
aTTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTaaaa > 2:3868034/1‑93 (MQ=255)
aTTTTTTCTGAGGATCTCCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGGCGGTGAGCGTAATTTaaaa < 1:6554340/93‑1 (MQ=255)
ttttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAag < 1:6285067/93‑1 (MQ=255)
ttttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAag > 1:5800127/1‑93 (MQ=255)
tttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAaga < 1:4073663/93‑1 (MQ=255)
tttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAgg < 2:6007769/93‑1 (MQ=255)
ttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGa < 1:4860476/93‑1 (MQ=255)
ttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGa > 2:1911569/1‑93 (MQ=255)
tGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAAt > 1:3592977/1‑93 (MQ=255)
aGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTa > 2:285943/1‑93 (MQ=255)
gATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTaaa < 1:2271139/93‑1 (MQ=255)
accTTCCACCCTAGATTCGGCAGCCATTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAc < 1:5299060/91‑1 (MQ=255)
aTCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAc > 2:4703251/1‑93 (MQ=255)
aTCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAc < 2:3476181/93‑1 (MQ=255)
cTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCACTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgc > 2:4501068/1‑93 (MQ=255)
ttCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgcg > 1:5486249/1‑93 (MQ=255)
ttCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgcg > 1:5443403/1‑93 (MQ=255)
ttCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgcg > 1:1807125/1‑93 (MQ=255)
ttCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgcg > 1:2701203/1‑93 (MQ=255)
tCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGt < 2:6471393/93‑1 (MQ=255)
tCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGt > 2:377175/1‑93 (MQ=255)
tCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGt < 1:4421138/93‑1 (MQ=255)
ccGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTc > 1:3494275/1‑93 (MQ=255)
ccGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTc < 2:4770431/93‑1 (MQ=255)
cGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCg > 1:512287/1‑93 (MQ=255)
cGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAACCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGATACTAAACGCGTca > 1:949286/1‑92 (MQ=255)
ccACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaa > 2:5830328/1‑93 (MQ=255)
caGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaaaa < 2:5446664/93‑1 (MQ=255)
aGATTGGCCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAAc < 2:1478845/93‑1 (MQ=255)
aGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAAc > 1:4992109/1‑93 (MQ=255)
gATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAATAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACg > 2:6482615/1‑93 (MQ=255)
aTTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGc < 2:5565845/93‑1 (MQ=255)
ttCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGca > 1:4620384/1‑93 (MQ=255)
ttCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAAAAACCCCTGGCGGTAACGGTAATTTAAAAAAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAGCGca > 1:4264448/1‑93 (MQ=255)
tCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGcat < 2:5709059/93‑1 (MQ=255)
tCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGcat < 1:2608603/93‑1 (MQ=255)
gTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGcatca > 1:6138306/1‑93 (MQ=255)
gTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGcatca < 2:2568482/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGcatcat < 2:4962023/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGcatcat > 2:2535149/1‑93 (MQ=255)
aGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTa > 1:471041/1‑93 (MQ=255)
aGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTa > 1:5370628/1‑93 (MQ=255)
aGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTa < 1:2641476/93‑1 (MQ=255)
aGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTa < 1:2933225/93‑1 (MQ=255)
gCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAt < 2:4038324/93‑1 (MQ=255)
gCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAt > 2:302188/1‑93 (MQ=255)
ccAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATg > 2:4069859/1‑93 (MQ=255)
ccAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATg > 1:6681880/1‑93 (MQ=255)
aGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGa < 1:573087/93‑1 (MQ=255)
gTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAAAGCATCATTATGGaa > 2:2201215/1‑93 (MQ=255)
tCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAg < 2:504161/93‑1 (MQ=255)
cTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGTAAGt < 2:1841818/93‑1 (MQ=255)
cTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGt < 1:1334493/93‑1 (MQ=255)
tGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTg > 2:1556648/1‑93 (MQ=255)
gTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGc < 1:5235862/93‑1 (MQ=255)
gTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGc > 2:1932603/1‑93 (MQ=255)
gTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGc < 1:785235/93‑1 (MQ=255)
gTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATAGAAGTGc > 1:6176187/1‑93 (MQ=255)
tAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCt < 2:3440964/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGa > 2:3317876/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGaa > 1:3690572/1‑93 (MQ=255)
tGGCGAGGGAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGaaca > 1:6610675/1‑93 (MQ=255)
ggCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGaacaa > 2:3008574/1‑93 (MQ=255)
gCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGaacaac < 2:5860602/93‑1 (MQ=255)
cGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAacaaca < 2:4320954/93‑1 (MQ=255)
gAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAAcaacaa > 1:63465/1‑93 (MQ=255)
gAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAAcaacaa > 1:5164335/1‑93 (MQ=255)
aGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaag > 1:1176586/1‑93 (MQ=255)
ggTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGACATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaaga > 2:3564417/1‑93 (MQ=255)
gTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaagaa < 1:2041124/93‑1 (MQ=255)
tAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaagaag < 1:5642258/93‑1 (MQ=255)
aaaCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGaa > 1:3028495/1‑93 (MQ=255)
aacaacCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGaaa > 2:134/1‑93 (MQ=255)
aCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAc < 2:5240199/93‑1 (MQ=255)
aCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAc > 1:5001544/1‑93 (MQ=255)
aCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAc > 1:157076/1‑93 (MQ=255)
|
GTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAC > NC_000913/2321002‑2321181
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCGAA > NC_000913/2321000‑2321185
|
CCGTGGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAC < SRR4302536.1101194/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAC > SRR4302536.6428340/1‑94 (MQ=60)
CGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACC < SRR4302536.4910689/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCC > SRR4302536.6502237/1‑94 (MQ=60)
TCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCC > SRR4302536.5305659/1‑94 (MQ=60)
CGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCT > SRR4302536.6518061/1‑94 (MQ=60)
CGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCT > SRR4302536.323864/1‑94 (MQ=60)
TGATGAATTCAGGCGCGATCACTTTTTCTGAGGATGTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTCTGATGCTGGCGAGGGAAAAACAACCCCTGC > SRR4302536.4289326/1‑94 (MQ=60)
TGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGT > SRR4302536.4693680/1‑94 (MQ=60)
GATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTC > SRR4302536.3570893/1‑94 (MQ=60)
ATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCG > SRR4302536.5993649/1‑94 (MQ=60)
ATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCG > SRR4302536.5637979/1‑94 (MQ=60)
ATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCG > SRR4302536.2050601/1‑94 (MQ=60)
GAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGT > SRR4302536.1023750/1‑94 (MQ=60)
AATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTG < SRR4302536.1441091/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGA > SRR4302536.6127930/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAG < SRR4302536.5228690/94‑1 (MQ=60)
caggccgtatctttttttttggtgatccTCCGCCACAGTTTCGTCATCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCG < SRR4302536.5145417/66‑1 (MQ=60)
AGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGT > SRR4302536.688634/1‑94 (MQ=60)
AGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGT > SRR4302536.1011123/1‑94 (MQ=60)
AGGCCCGATCATTTTTTCTGAGCATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGT > SRR4302536.5956596/1‑94 (MQ=60)
CCCGATCTTTTTTTCTGAGAATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAT < SRR4302536.3064976/94‑1 (MQ=60)
CCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAT < SRR4302536.515956/94‑1 (MQ=60)
CCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAT < SRR4302536.1096759/94‑1 (MQ=60)
CCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAT > SRR4302536.4692625/1‑94 (MQ=60)
CCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATT > SRR4302536.2264677/1‑94 (MQ=60)
CCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATT > SRR4302536.6335018/1‑94 (MQ=60)
CCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATT < SRR4302536.6195246/94‑1 (MQ=60)
CCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATT > SRR4302536.5220698/1‑94 (MQ=60)
CGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTT < SRR4302536.5885754/94‑1 (MQ=60)
CGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTAAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTT < SRR4302536.3709033/94‑1 (MQ=60)
GATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTA < SRR4302536.6795692/94‑1 (MQ=60)
GATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTA > SRR4302536.431631/1‑94 (MQ=60)
GATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTA > SRR4302536.4276266/1‑94 (MQ=60)
CTCATTTTTTCGGAGGATCTTCCGCCACAGATTGGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAA < SRR4302536.5985709/94‑1 (MQ=60)
ATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAA > SRR4302536.2780609/1‑94 (MQ=60)
ATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAA > SRR4302536.5493362/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAG > SRR4302536.5972827/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAG > SRR4302536.4787523/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTTCTGAGGATCTCCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGGCGGTGAGCGTAATTTAAAAG < SRR4302536.6749513/94‑1 (MQ=60)
TTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGA < SRR4302536.6472373/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAG < SRR4302536.6396395/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAG < SRR4302536.4661913/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAG < SRR4302536.4194397/94‑1 (MQ=60)
TTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGG < SRR4302536.1903377/94‑1 (MQ=60)
TTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAA < SRR4302536.5006748/94‑1 (MQ=60)
CTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAAT > SRR4302536.3700448/1‑94 (MQ=60)
CTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAAT > SRR4302536.4403475/1‑94 (MQ=60)
TGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATT > SRR4302536.6842252/1‑94 (MQ=60)
GAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTA > SRR4302536.2459298/1‑94 (MQ=60)
GAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTA > SRR4302536.5381521/1‑94 (MQ=60)
GAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTA < SRR4302536.3425106/94‑1 (MQ=60)
GATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAC < SRR4302536.2339938/94‑1 (MQ=60)
GATCTCCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAC < SRR4302536.4964228/94‑1 (MQ=60)
accttccaccctAGATTCGGCAGCCATTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACG < SRR4302536.5457090/82‑1 (MQ=60)
ATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACG < SRR4302536.181999/94‑1 (MQ=60)
ATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACG > SRR4302536.3709702/1‑94 (MQ=60)
CTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCG > SRR4302536.1861661/1‑94 (MQ=60)
CTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCG > SRR4302536.5606232/1‑94 (MQ=60)
CTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCG > SRR4302536.2781796/1‑94 (MQ=60)
CTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCG > SRR4302536.5650052/1‑94 (MQ=60)
CTTCCGCCACAAATACGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCTTGGCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCG < SRR4302536.3803967/94‑1 (MQ=60)
tgcgggcgcagaggCGTCAGCCAGTCGGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGT < SRR4302536.3023755/80‑1 (MQ=60)
TCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTC > SRR4302536.3598526/1‑94 (MQ=60)
TCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTC < SRR4302536.4553530/94‑1 (MQ=60)
TCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTC < SRR4302536.5681712/94‑1 (MQ=60)
CCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCG > SRR4302536.6060737/1‑94 (MQ=60)
CCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCG < SRR4302536.2060619/94‑1 (MQ=60)
CCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCG > SRR4302536.525433/1‑94 (MQ=60)
CCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCG < SRR4302536.2047780/94‑1 (MQ=60)
CCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCG < SRR4302536.93811/94‑1 (MQ=60)
CCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAACCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGATACTAAACGCGTCA > SRR4302536.977346/1‑94 (MQ=60)
GCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAA > SRR4302536.5065839/1‑94 (MQ=60)
CAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAAC < SRR4302536.2623953/94‑1 (MQ=60)
CAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAAC > SRR4302536.5141941/1‑94 (MQ=60)
AGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGGAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACG > SRR4302536.1424275/1‑94 (MQ=60)
ATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCA < SRR4302536.1480847/94‑1 (MQ=60)
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ATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCA < SRR4302536.5266842/94‑1 (MQ=60)
ATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAAAAACCCCTGGCGGTAACGGTAATTTAAAAAAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAGCGCA > SRR4302536.4391553/1‑94 (MQ=60)
TTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGTTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCAT < SRR4302536.2697132/94‑1 (MQ=60)
TCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATC < SRR4302536.2686889/94‑1 (MQ=60)
TCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATC < SRR4302536.5333507/94‑1 (MQ=60)
TGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCA > SRR4302536.6321233/1‑94 (MQ=60)
CGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCA < SRR4302536.4637923/94‑1 (MQ=60)
GTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCAT < SRR4302536.4106708/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATT < SRR4302536.3679878/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATT < SRR4302536.5569563/94‑1 (MQ=60)
CAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTA > SRR4302536.483336/1‑94 (MQ=60)
CAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTA > SRR4302536.5530828/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAT < SRR4302536.3019780/94‑1 (MQ=60)
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AGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAT > SRR4302536.4928691/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAT < SRR4302536.5559588/94‑1 (MQ=60)
AGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTAT > SRR4302536.5820075/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATG > SRR4302536.6880354/1‑94 (MQ=60)
AGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAA > SRR4302536.30059/1‑94 (MQ=60)
AGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAA > SRR4302536.286363/1‑94 (MQ=60)
AGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAA < SRR4302536.587653/94‑1 (MQ=60)
GTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACACCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAG < SRR4302536.4281296/94‑1 (MQ=60)
CTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTG < SRR4302536.1374317/94‑1 (MQ=60)
TGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATAGAAGTGC > SRR4302536.6360140/1‑94 (MQ=60)
GTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCT < SRR4302536.808225/94‑1 (MQ=60)
GTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCT < SRR4302536.5391862/94‑1 (MQ=60)
GTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCT < SRR4302536.6522511/94‑1 (MQ=60)
GTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCT < SRR4302536.665852/94‑1 (MQ=60)
TAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTG > SRR4302536.1110134/1‑94 (MQ=60)
AATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGG < SRR4302536.5449858/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAA > SRR4302536.3800945/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGAGGGAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACA > SRR4302536.6807239/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGAGGAAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACA > SRR4302536.3130150/1‑94 (MQ=60)
GGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAAC < SRR4302536.6243237/94‑1 (MQ=60)
GGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAAC < SRR4302536.4239768/94‑1 (MQ=60)
GGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAAC > SRR4302536.3251809/1‑94 (MQ=60)
GCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACA < SRR4302536.1436972/94‑1 (MQ=60)
CGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAA > SRR4302536.65201/1‑94 (MQ=60)
CGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAA > SRR4302536.5318420/1‑94 (MQ=60)
GAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAG > SRR4302536.1212003/1‑94 (MQ=60)
AGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGA > SRR4302536.68000/1‑94 (MQ=60)
GGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGATCAACAAGAA < SRR4302536.6744294/94‑1 (MQ=60)
GGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAA < SRR4302536.4363127/94‑1 (MQ=60)
GTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAG < SRR4302536.1247584/94‑1 (MQ=60)
GTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAG < SRR4302536.2102589/94‑1 (MQ=60)
TAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGG < SRR4302536.5809896/94‑1 (MQ=60)
TAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGG < SRR4302536.6441664/94‑1 (MQ=60)
AAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAA < SRR4302536.3597612/94‑1 (MQ=60)
AAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAA > SRR4302536.3117481/1‑94 (MQ=60)
AACAACGCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAC > SRR4302536.967852/1‑94 (MQ=60)
AACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAC > SRR4302536.5151617/1‑94 (MQ=60)
AACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAC > SRR4302536.161141/1‑94 (MQ=60)
ACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACC > SRR4302536.229423/1‑94 (MQ=60)
CAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCG < SRR4302536.4298134/94‑1 (MQ=60)
CAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCG > SRR4302536.4399830/1‑94 (MQ=60)
CAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCG > SRR4302536.365323/1‑94 (MQ=60)
CAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCG > SRR4302536.4416412/1‑94 (MQ=60)
CAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCG > SRR4302536.3363892/1‑94 (MQ=60)
CAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCG > SRR4302536.735322/1‑94 (MQ=60)
AACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCGA > SRR4302536.975256/1‑94 (MQ=60)
ACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCGAA > SRR4302536.2251892/1‑94 (MQ=60)
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CCGTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAACCGAA > NC_000913/2321000‑2321185
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
