Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,463,677 |
C→T |
G166G (GGC→GGT) |
hofD → |
leader peptidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,463,677 | 0 | C | T | 99.1%
| 815.3
/ NA
| 226 | G166G (GGC→GGT) | hofD | leader peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (104/120); minor base G (1/1); total (105/121) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
GGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCA > NC_000913/3463587‑3463766
|
gTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCa < 1:6072991/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCa > 1:946065/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCa < 2:6017310/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCa < 2:4068350/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCAt < 1:5703393/93‑1 (MQ=255)
tgtgGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATggg > 2:1550880/1‑92 (MQ=255)
tgtgGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgt < 1:1134931/93‑1 (MQ=255)
tgtgGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgt < 2:1859289/93‑1 (MQ=255)
gtggtgTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgtg > 2:693175/1‑93 (MQ=255)
ggtgTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGtgtg > 1:3645788/1‑93 (MQ=255)
gtgtgtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtgg > 1:2514036/1‑93 (MQ=255)
tgtgtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggc < 2:3563159/93‑1 (MQ=255)
tgtgtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggc < 1:6298118/93‑1 (MQ=255)
tgtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTTGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctg > 1:6211053/1‑93 (MQ=255)
tgtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAATCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctg > 1:4218084/1‑93 (MQ=255)
tgtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctg > 2:5520472/1‑93 (MQ=255)
tgtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctg > 2:6600785/1‑93 (MQ=255)
ttACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCa < 1:6180034/93‑1 (MQ=255)
tACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCAAGGTGtggctggcca > 2:5004089/1‑91 (MQ=255)
aCTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCaaa < 1:5230613/93‑1 (MQ=255)
aCTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCaaa < 2:3123285/93‑1 (MQ=255)
cTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAAc < 1:2380535/93‑1 (MQ=255)
ggggCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGt < 2:1963206/93‑1 (MQ=255)
ggggCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGt < 2:3233721/93‑1 (MQ=255)
gCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGGAAACGTTGc > 1:5150206/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCa > 2:1274663/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCaa < 2:6359886/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCaa < 1:6461759/93‑1 (MQ=255)
cTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAAt < 1:1516704/93‑1 (MQ=255)
tGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATg > 2:6466134/1‑93 (MQ=255)
gTTCGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGAt < 2:2369505/93‑1 (MQ=255)
gTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGAt < 1:34522/93‑1 (MQ=255)
ttAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATa < 2:474930/93‑1 (MQ=255)
ttAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATa > 2:5170868/1‑93 (MQ=255)
ttAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGGTGCCAATGATa > 1:4151157/1‑93 (MQ=255)
tAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATAc < 2:1095529/93‑1 (MQ=255)
gTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATActg > 1:3190355/1‑93 (MQ=255)
tttGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATActgc > 2:1615202/1‑93 (MQ=255)
tttGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATActgc < 2:4802930/93‑1 (MQ=255)
ttGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGGTGCCAATGATActgct > 2:4485244/1‑93 (MQ=255)
gTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGa < 2:1601240/93‑1 (MQ=255)
tCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAt < 1:4071008/93‑1 (MQ=255)
tCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAt < 2:1767432/93‑1 (MQ=255)
tCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAt < 2:4540841/93‑1 (MQ=255)
tCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAt > 2:4549057/1‑93 (MQ=255)
acaAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGGCAATGATACTGCTGATTg > 1:6390758/1‑93 (MQ=255)
acaAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTTATTg > 1:6089073/1‑93 (MQ=255)
acaAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTg > 1:4492708/1‑93 (MQ=255)
acaAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTg > 2:3654255/1‑93 (MQ=255)
aaaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTTATTGcc > 1:5605526/1‑93 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGccc > 2:5464572/1‑92 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCt < 2:4724515/93‑1 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCt < 1:2235879/93‑1 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCt < 2:2575405/93‑1 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCt > 2:2447868/1‑93 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCt < 2:2130731/93‑1 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCt < 2:6670433/93‑1 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCt > 2:133521/1‑93 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCt < 1:4290603/93‑1 (MQ=255)
gagGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTcc > 2:6088230/1‑92 (MQ=255)
gagGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCg > 1:3772129/1‑93 (MQ=255)
gggATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCt < 1:3578721/93‑1 (MQ=255)
gATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTgg > 1:5499251/1‑93 (MQ=255)
ttGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTgggg > 2:3086759/1‑92 (MQ=255)
gggCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTgg > 1:3742401/1‑93 (MQ=255)
ggCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGc > 1:6527273/1‑93 (MQ=255)
tACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCAtt < 1:6281888/93‑1 (MQ=255)
tACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCAtt > 2:4862848/1‑93 (MQ=255)
tACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCAtt > 1:1618813/1‑93 (MQ=255)
cGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTgg > 2:288906/1‑93 (MQ=255)
cGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTgg < 2:2017090/93‑1 (MQ=255)
cGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTgg < 1:443552/93‑1 (MQ=255)
cGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTgg < 1:5880650/93‑1 (MQ=255)
ggTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGt < 1:1063752/93‑1 (MQ=255)
tGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTTGTTa > 1:2656196/1‑93 (MQ=255)
tGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTa > 2:325156/1‑93 (MQ=255)
tGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTa < 2:2615308/93‑1 (MQ=255)
gATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTAc < 1:2833556/93‑1 (MQ=255)
gATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTAc < 1:2447534/93‑1 (MQ=255)
gATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTAc < 1:4724994/93‑1 (MQ=255)
tttCAGGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGc < 1:779724/93‑1 (MQ=255)
tttCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATCGGTTACGc > 1:4788709/1‑93 (MQ=255)
tCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCa < 1:5322639/93‑1 (MQ=255)
cAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGG‑ATTTGTTAAGCCATc > 1:6604861/1‑93 (MQ=255)
aaGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATc > 2:4918858/1‑93 (MQ=255)
aaGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATc < 1:3155060/93‑1 (MQ=255)
gCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGt < 2:5960375/93‑1 (MQ=255)
cTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGtt < 1:5036848/93‑1 (MQ=255)
cTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGtt < 2:3423797/93‑1 (MQ=255)
tACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGttt > 2:2301365/1‑93 (MQ=255)
aCTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATAATGCTGATTGCGTCGCTGGGGGGCATTGGTTACGCCATCGCTTc > 1:2023770/1‑93 (MQ=255)
tGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTcac > 2:2754413/1‑93 (MQ=255)
ggCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTcaca > 2:3438706/1‑93 (MQ=255)
gCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACaa < 2:4455303/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGGTTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAAc < 1:974283/93‑1 (MQ=255)
cGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACt > 2:5790856/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCt < 1:4622348/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCt > 2:767686/1‑93 (MQ=255)
cAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGc > 1:18974/1‑93 (MQ=255)
aGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCa > 2:5304071/1‑93 (MQ=255)
|
GGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCA > NC_000913/3463587‑3463766
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAACG > NC_000913/3463584‑3463769
|
TGGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGT < SRR4302536.2426516/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTG < SRR4302536.5252872/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTAGCCGCTGCAGGTG < SRR4302536.4314841/94‑1 (MQ=60)
GGGGCGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTG > SRR4302536.1113427/1‑94 (MQ=60)
GGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGC < SRR4302536.637107/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCA > SRR4302536.974008/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCA < SRR4302536.2167069/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCAT < SRR4302536.4867690/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCAT < SRR4302536.6254153/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATG < SRR4302536.5872986/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTG > SRR4302536.845251/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTG < SRR4302536.1169057/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTG < SRR4302536.5836036/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGT > SRR4302536.5644678/1‑94 (MQ=60)
TGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTG > SRR4302536.3754782/1‑94 (MQ=60)
GGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGG > SRR4302536.2589839/1‑94 (MQ=60)
GGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTGTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGG < SRR4302536.4605521/94‑1 (MQ=60)
TGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCT < SRR4302536.6485734/94‑1 (MQ=60)
TGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCT < SRR4302536.2444748/94‑1 (MQ=60)
TGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCT < SRR4302536.6520895/94‑1 (MQ=60)
GTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTTGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTG > SRR4302536.6396105/1‑94 (MQ=60)
GTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAATCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTG > SRR4302536.4343553/1‑94 (MQ=60)
TTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCA > SRR4302536.4993187/1‑94 (MQ=60)
TTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCA > SRR4302536.3378097/1‑94 (MQ=60)
TTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAA < SRR4302536.6364104/94‑1 (MQ=60)
TACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAA < SRR4302536.1994885/94‑1 (MQ=60)
ACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAAC < SRR4302536.4636927/94‑1 (MQ=60)
ACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAAC < SRR4302536.6486503/94‑1 (MQ=60)
ACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAAC < SRR4302536.5386460/94‑1 (MQ=60)
CTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACG < SRR4302536.2452647/94‑1 (MQ=60)
GGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCTCTGCAGGGGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTT < SRR4302536.5461022/94‑1 (MQ=60)
GGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTT < SRR4302536.100429/94‑1 (MQ=60)
GGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTG < SRR4302536.3876421/94‑1 (MQ=60)
GGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGGAAACGTTGC > SRR4302536.5303874/1‑94 (MQ=60)
CGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCA < SRR4302536.6414606/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAAT > SRR4302536.341542/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAAT < SRR4302536.2390914/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAAT < SRR4302536.6654657/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGAGGCTGGCAAACGTTGCCAAT < SRR4302536.6727295/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATG < SRR4302536.1561356/94‑1 (MQ=60)
TGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGA > SRR4302536.4807331/1‑94 (MQ=60)
GGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGAT < SRR4302536.1926292/94‑1 (MQ=60)
GTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATA < SRR4302536.4312799/94‑1 (MQ=60)
GTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATA > SRR4302536.2573378/1‑94 (MQ=60)
GTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATA < SRR4302536.35484/94‑1 (MQ=60)
GTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGGTGCCAATGATA > SRR4302536.4274358/1‑94 (MQ=60)
TAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACT < SRR4302536.991413/94‑1 (MQ=60)
AGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTG > SRR4302536.3283895/1‑94 (MQ=60)
AGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTG > SRR4302536.3868064/1‑94 (MQ=60)
AGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTG < SRR4302536.6256333/94‑1 (MQ=60)
GTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGC < SRR4302536.5248427/94‑1 (MQ=60)
GTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGC > SRR4302536.585712/1‑94 (MQ=60)
TGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGA < SRR4302536.6642472/94‑1 (MQ=60)
TCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATT < SRR4302536.4191658/94‑1 (MQ=60)
TCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATT < SRR4302536.4191659/94‑1 (MQ=60)
CACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGGCAATGATACTGCTGATTG > SRR4302536.6581438/1‑94 (MQ=60)
CACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTTATTG > SRR4302536.6270662/1‑94 (MQ=60)
CACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTG > SRR4302536.4627602/1‑94 (MQ=60)
CAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTTATTGCC > SRR4302536.5772083/1‑94 (MQ=60)
CAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCC < SRR4302536.2866302/94‑1 (MQ=60)
AAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCT < SRR4302536.6778298/94‑1 (MQ=60)
AAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTC < SRR4302536.2303516/94‑1 (MQ=60)
AAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTC < SRR4302536.4418836/94‑1 (MQ=60)
AAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTC > SRR4302536.4403962/1‑94 (MQ=60)
AGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCG < SRR4302536.4436426/94‑1 (MQ=60)
AGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCG < SRR4302536.5733/94‑1 (MQ=60)
AGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCG > SRR4302536.3884725/1‑94 (MQ=60)
AGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCT > SRR4302536.3706764/1‑94 (MQ=60)
GGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTG < SRR4302536.3685740/94‑1 (MQ=60)
GGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGG > SRR4302536.5663331/1‑94 (MQ=60)
ATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGT < SRR4302536.3129589/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTG < SRR4302536.5172121/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGG > SRR4302536.3854276/1‑94 (MQ=60)
GGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGC > SRR4302536.6721686/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATT > SRR4302536.1257874/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATT > SRR4302536.1665977/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTG < SRR4302536.6469090/94‑1 (MQ=60)
TACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTG > SRR4302536.3916160/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGCGGGATTG > SRR4302536.3258878/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGATATCAACATACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTG < SRR4302536.282435/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTTG > SRR4302536.6480483/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGG > SRR4302536.3641865/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGGGGCATTGG > SRR4302536.1114787/1‑94 (MQ=60)
CGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGT < SRR4302536.455232/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGT < SRR4302536.6055822/94‑1 (MQ=60)
GGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTT < SRR4302536.6380331/94‑1 (MQ=60)
GGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTT < SRR4302536.1095568/94‑1 (MQ=60)
GGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGGGCCTGGTGTGGCTGCCAACCGATGACCATGATATTGCTGATTGCCGCGCTGGGAGGCATTGGTT > SRR4302536.6364140/1‑94 (MQ=42)
GTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTTGTTA > SRR4302536.2735707/1‑94 (MQ=60)
GTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTA < SRR4302536.1619834/94‑1 (MQ=60)
TGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTAC < SRR4302536.6287094/94‑1 (MQ=60)
GATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACG < SRR4302536.2521487/94‑1 (MQ=60)
GATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACG < SRR4302536.2917424/94‑1 (MQ=60)
GATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACG < SRR4302536.4867151/94‑1 (MQ=60)
ATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATCGGTTACGC > SRR4302536.4932868/1‑94 (MQ=60)
TTTCAGGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCC < SRR4302536.802570/94‑1 (MQ=60)
TTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCA > SRR4302536.5342958/1‑94 (MQ=60)
TCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCAT > SRR4302536.3804269/1‑94 (MQ=60)
TCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCAT < SRR4302536.5481640/94‑1 (MQ=60)
TCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGG‑ATTTGTTAAGCCATC > SRR4302536.6801288/1‑94 (MQ=60)
CAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATC < SRR4302536.2498289/94‑1 (MQ=60)
AAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCG > SRR4302536.586838/1‑94 (MQ=60)
AAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCG < SRR4302536.3247458/94‑1 (MQ=60)
CTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTT < SRR4302536.5187843/94‑1 (MQ=60)
TACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATAATGCTGATTGCGTCGCTGGGGGGCATTGGTTACGCCATCGCTTC > SRR4302536.2084712/1‑94 (MQ=60)
ACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCA < SRR4302536.63121/94‑1 (MQ=60)
CTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCAC < SRR4302536.743859/94‑1 (MQ=60)
TGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACA > SRR4302536.4321402/1‑94 (MQ=60)
TGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACA > SRR4302536.2722858/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGGTTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACT < SRR4302536.1003035/94‑1 (MQ=60)
GCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTC < SRR4302536.461256/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCT > SRR4302536.1770357/1‑94 (MQ=60)
TGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTG < SRR4302536.4761238/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGC > SRR4302536.6660853/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGC > SRR4302536.19501/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAGTGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCA > SRR4302536.5502978/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCA < SRR4302536.6236723/94‑1 (MQ=60)
AGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAA > SRR4302536.41167/1‑94 (MQ=60)
GTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAACG < SRR4302536.4126844/94‑1 (MQ=60)
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TGGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAACG > NC_000913/3463584‑3463769
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
