Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1475 |
266.7 |
13469680 |
98.2% |
13227225 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,137,208 |
A→G |
T27T (ACT→ACC) |
talC ← |
putative transaldolase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,137,208 | 0 | A | G | 100.0%
| 942.9
/ NA
| 293 | T27T (ACT→ACC) | talC | putative transaldolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (137/156); total (137/156) |
Only 100 of 318 total aligned reads displayed.
AAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCC > NC_000913/4137118‑4137297
|
aaaCAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGt < 2:1080811/93‑1 (MQ=255)
aaCAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGggttggtt < 2:2422515/93‑1 (MQ=255)
aaCAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGggttggtt > 2:5684873/1‑93 (MQ=255)
aCAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGgttggttg < 2:2566205/93‑1 (MQ=255)
aCAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGgttggttg > 1:1474589/1‑93 (MQ=255)
aCAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGgttggttg < 1:4130931/93‑1 (MQ=255)
aCAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGgttggttg < 1:4078497/93‑1 (MQ=255)
cAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGt < 1:2185515/93‑1 (MQ=255)
aGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTc < 2:6091258/93‑1 (MQ=255)
aTGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCAcc > 2:4603784/1‑93 (MQ=255)
aTGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCAcc < 2:4393368/93‑1 (MQ=255)
tGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCAccc < 2:1280223/93‑1 (MQ=255)
cccTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGTGTTGGTTGTCAccctg > 1:5537509/1‑91 (MQ=255)
cccTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCAccctg < 1:2813242/93‑3 (MQ=255)
ccTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTgg > 2:353548/1‑93 (MQ=255)
cTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGc > 1:1019442/1‑93 (MQ=255)
tcatcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCa > 2:5505338/1‑93 (MQ=255)
catcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCaa < 1:2379615/93‑1 (MQ=255)
atcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAt > 2:1694919/1‑93 (MQ=255)
atcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAt > 1:6603117/1‑93 (MQ=255)
atcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAt < 2:5834371/93‑1 (MQ=255)
tcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATg > 1:4749190/1‑93 (MQ=255)
tcaCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATg > 2:1548122/1‑93 (MQ=255)
caCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATgg < 2:143665/93‑1 (MQ=255)
caCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATgg < 2:1618285/93‑1 (MQ=255)
caCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATgg > 2:3439977/1‑93 (MQ=255)
caCCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCAGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATgg < 1:6513837/93‑1 (MQ=255)
cAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGa > 1:6360386/1‑93 (MQ=255)
aaTCGCTTTTTGTAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGaa > 1:587233/1‑93 (MQ=255)
aaTCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGaa > 1:3953743/1‑93 (MQ=255)
aaTCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGaa < 2:1006383/93‑1 (MQ=255)
aTCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAat > 2:6508501/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAat < 1:5263820/93‑1 (MQ=255)
tCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAata < 1:5955099/93‑1 (MQ=255)
cGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAatat < 2:2366750/93‑1 (MQ=255)
gCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATg > 1:1232292/1‑93 (MQ=255)
cTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGc > 2:5988541/1‑93 (MQ=255)
tttttGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCg < 1:6663056/93‑1 (MQ=255)
aGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGa < 2:2192659/93‑1 (MQ=255)
gACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGTGTGCCAGAc > 1:5406/1‑93 (MQ=255)
gACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGAc > 1:1330995/1‑93 (MQ=255)
cgGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTc > 2:4020963/1‑93 (MQ=255)
ggCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCg < 1:881497/93‑1 (MQ=255)
cagcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGAc < 1:1597587/93‑1 (MQ=255)
cagcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGAc < 1:2513759/93‑1 (MQ=255)
cagcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGAc < 1:2024876/93‑1 (MQ=255)
agcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACt > 2:3630762/1‑93 (MQ=255)
agcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACt < 1:2161553/93‑1 (MQ=255)
gcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACtt < 1:2926186/93‑1 (MQ=255)
gcaCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTAGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACtt > 1:2005331/1‑93 (MQ=255)
caCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTc < 1:2346123/93‑1 (MQ=255)
caCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTc < 1:2447307/93‑1 (MQ=255)
caCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTc < 2:4453634/93‑1 (MQ=255)
aCTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCt < 1:356209/93‑1 (MQ=255)
ctacccATATGGAGTCGTTGCTGGCAGAGATAATGCTCGGGTTGCTTGTCACACTGGCAATGGGCAATATGGCTGCCAGTCGTTGGACTTCTg < 1:4854704/90‑1 (MQ=255)
cTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTg > 2:3194247/1‑93 (MQ=255)
tCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCg < 1:5044820/93‑1 (MQ=255)
cccATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGa > 2:4097317/1‑93 (MQ=255)
cccATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGa < 2:2073954/93‑1 (MQ=255)
cccATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGa < 2:3844688/93‑1 (MQ=255)
cccATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGa < 1:2550105/93‑1 (MQ=255)
tatGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGtt < 2:652879/93‑1 (MQ=255)
tatGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGtt < 2:1227330/93‑1 (MQ=255)
tatGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTATGCGACGtt > 2:5040037/1‑93 (MQ=255)
atGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTa < 2:5118093/93‑1 (MQ=255)
gACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCg < 1:818936/93‑1 (MQ=255)
aCTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCgg < 2:6459225/93‑1 (MQ=255)
cTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGgt < 1:2711159/93‑1 (MQ=255)
tCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGgtg < 2:6286983/93‑1 (MQ=255)
tCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGgtg < 2:938936/93‑1 (MQ=255)
ccTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGgtgt > 2:4278252/1‑93 (MQ=255)
cTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTc > 1:4281208/1‑93 (MQ=255)
cTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTc > 1:2286808/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATGTGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTcc < 1:583454/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTcc > 2:1152600/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTcc < 2:5580561/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGAAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAg < 1:3279294/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGAtc > 2:5267230/1‑92 (MQ=255)
ggCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATa < 2:3897724/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATa < 2:468647/93‑1 (MQ=255)
gacAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATa < 1:4574222/91‑1 (MQ=255)
gCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATAc < 1:5693062/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATAc > 2:3675411/1‑93 (MQ=255)
cAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACa < 2:540326/93‑1 (MQ=255)
gCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGt > 1:1696569/1‑93 (MQ=255)
gCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGt < 2:2461677/93‑1 (MQ=255)
gCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGt > 1:3743508/1‑93 (MQ=255)
gATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTc > 2:4717960/1‑93 (MQ=255)
aaTGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCat < 1:4319873/93‑1 (MQ=255)
aaTGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCat > 2:4911059/1‑93 (MQ=255)
aTGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCatg > 1:5327707/1‑93 (MQ=255)
aTGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCatg > 1:6079616/1‑93 (MQ=255)
gCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCatgat > 1:562878/1‑93 (MQ=255)
tCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACTTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGt < 1:1910409/93‑1 (MQ=255)
tCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGt < 1:3148057/93‑1 (MQ=255)
tCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGt < 2:2697469/93‑1 (MQ=255)
tCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGCGCCAGACGTTCGACTTCTGTGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGt > 1:4368478/1‑93 (MQ=255)
cGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGtt < 1:2649105/93‑1 (MQ=255)
cGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGtt < 2:689583/93‑1 (MQ=255)
gggTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGttt < 2:2787433/93‑1 (MQ=255)
|
AAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCC > NC_000913/4137118‑4137297
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTT > NC_000913/4137115‑4137301
|
AGCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTG > SRR4302536.40095/1‑94 (MQ=60)
CAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGT < SRR4302536.6888842/94‑1 (MQ=60)
CAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGT < SRR4302536.1835787/94‑1 (MQ=60)
AAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTT > SRR4302536.2570161/1‑94 (MQ=60)
AACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTG > SRR4302536.1518180/1‑94 (MQ=60)
AACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTG < SRR4302536.1564692/94‑1 (MQ=60)
ACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGT < SRR4302536.4253396/94‑1 (MQ=60)
ACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGT < SRR4302536.4199384/94‑1 (MQ=60)
ACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGT > SRR4302536.5823632/1‑94 (MQ=60)
CAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTC < SRR4302536.2251392/94‑1 (MQ=60)
AGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCA < SRR4302536.1548059/94‑1 (MQ=60)
AGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCACATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGCTGTCA > SRR4302536.2430078/1‑94 (MQ=60)
AATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACC > SRR4302536.5540344/1‑94 (MQ=60)
AATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACC > SRR4302536.3408278/1‑94 (MQ=60)
TGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT > SRR4302536.5276188/1‑94 (MQ=60)
TGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCT > SRR4302536.2359175/1‑94 (MQ=60)
GCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGTGTTGGTTGTCACCCTG > SRR4302536.5702546/1‑94 (MQ=60)
GCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTG < SRR4302536.5662643/94‑1 (MQ=60)
GCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTG < SRR4302536.20800/94‑1 (MQ=60)
CCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGG < SRR4302536.2896611/94‑1 (MQ=60)
CCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGG > SRR4302536.2249936/1‑94 (MQ=60)
CCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATTGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGC > SRR4302536.5992242/1‑94 (MQ=60)
CCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGC > SRR4302536.1049612/1‑94 (MQ=60)
CCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGC < SRR4302536.1968246/94‑1 (MQ=60)
CTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCA > SRR4302536.4424930/1‑94 (MQ=60)
CATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAT > SRR4302536.5769719/1‑94 (MQ=60)
CATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAT < SRR4302536.2935299/94‑1 (MQ=60)
CATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAT < SRR4302536.2628594/94‑1 (MQ=60)
CATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAT < SRR4302536.2451707/94‑1 (MQ=60)
CATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAAT > SRR4302536.6799496/1‑94 (MQ=60)
ATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATG > SRR4302536.2780122/1‑94 (MQ=60)
ATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATG > SRR4302536.2486519/1‑94 (MQ=60)
ATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATG > SRR4302536.4892122/1‑94 (MQ=60)
CACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGG > SRR4302536.5973785/1‑94 (MQ=60)
CACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCAGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGG < SRR4302536.6707932/94‑1 (MQ=60)
ACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGG > SRR4302536.3861126/1‑94 (MQ=60)
ACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGG > SRR4302536.3920405/1‑94 (MQ=60)
ACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGG < SRR4302536.850949/94‑1 (MQ=60)
ACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGG > SRR4302536.1668625/1‑94 (MQ=60)
CCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGA > SRR4302536.6549883/1‑94 (MQ=60)
CCAATCGCTTGTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGA < SRR4302536.6160146/94‑1 (MQ=60)
CAATCGCTTTTTGTAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAA > SRR4302536.602384/1‑94 (MQ=60)
CAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAA < SRR4302536.4835904/94‑1 (MQ=60)
CAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAA > SRR4302536.4071154/1‑94 (MQ=60)
CAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAA < SRR4302536.94505/94‑1 (MQ=60)
CAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCACGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAA > SRR4302536.6878146/1‑94 (MQ=60)
AATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAAT > SRR4302536.5726980/1‑94 (MQ=60)
AATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAAT < SRR4302536.599501/94‑1 (MQ=60)
ATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATA < SRR4302536.5420705/94‑1 (MQ=60)
ATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATA > SRR4302536.2084667/1‑94 (MQ=60)
TCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATAT > SRR4302536.2333062/1‑94 (MQ=60)
TCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATAT < SRR4302536.6132536/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATG > SRR4302536.5124860/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATG > SRR4302536.1269304/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATG > SRR4302536.2913765/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGC > SRR4302536.227867/1‑94 (MQ=60)
TTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGT < SRR4302536.6861085/94‑1 (MQ=60)
GCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGGATATGCGTGCCAG > SRR4302536.5100411/1‑94 (MQ=60)
GCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAG < SRR4302536.3320712/94‑1 (MQ=60)
CAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGA > SRR4302536.89000/1‑94 (MQ=60)
CAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGA > SRR4302536.4556480/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGTGTGCCAGAC > SRR4302536.5547/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGAC > SRR4302536.1370730/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGAC > SRR4302536.5560093/1‑94 (MQ=60)
CGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTT < SRR4302536.674028/94‑1 (MQ=60)
CGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTT < SRR4302536.6115657/94‑1 (MQ=60)
GCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTC < SRR4302536.335857/94‑1 (MQ=60)
GCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTC < SRR4302536.427395/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGA < SRR4302536.1272975/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGA < SRR4302536.907449/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGA < SRR4302536.3779654/94‑1 (MQ=60)
CAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACT < SRR4302536.2632640/94‑1 (MQ=60)
CAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACT < SRR4302536.2085859/94‑1 (MQ=60)
CAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACT < SRR4302536.2589558/94‑1 (MQ=60)
CAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACT < SRR4302536.1644249/94‑1 (MQ=60)
CAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACT > SRR4302536.1184131/1‑94 (MQ=60)
CAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACT > SRR4302536.6830527/1‑94 (MQ=60)
CAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGGTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGGTCGACT > SRR4302536.4588267/1‑94 (MQ=60)
AGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTT < SRR4302536.2631479/94‑1 (MQ=60)
AGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTT < SRR4302536.2226570/94‑1 (MQ=60)
AGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTAGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTT > SRR4302536.2065673/1‑94 (MQ=60)
GCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTC < SRR4302536.3012543/94‑1 (MQ=60)
CACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCT > SRR4302536.372882/1‑94 (MQ=60)
CACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCT > SRR4302536.4926732/1‑94 (MQ=60)
CACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCT < SRR4302536.2417263/94‑1 (MQ=60)
CACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCT < SRR4302536.2521255/94‑1 (MQ=60)
CACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCT < SRR4302536.2564638/94‑1 (MQ=60)
CACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCT < SRR4302536.4349353/94‑1 (MQ=60)
CACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCT > SRR4302536.3384018/1‑94 (MQ=60)
ACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTG < SRR4302536.365643/94‑1 (MQ=60)
ACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTG > SRR4302536.3431311/1‑94 (MQ=60)
CTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGC < SRR4302536.4477785/94‑1 (MQ=60)
TCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGA > SRR4302536.4199405/1‑94 (MQ=60)
TCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGA < SRR4302536.5196004/94‑1 (MQ=60)
TCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGA > SRR4302536.316180/1‑94 (MQ=60)
TCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGAC < SRR4302536.446937/94‑1 (MQ=60)
CCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGAC < SRR4302536.2626905/94‑1 (MQ=60)
CCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGAC < SRR4302536.4899531/94‑1 (MQ=60)
CCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTCCGAC > SRR4302536.6407322/1‑94 (MQ=60)
CATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGT < SRR4302536.6172569/94‑1 (MQ=60)
CATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGT > SRR4302536.1148756/1‑94 (MQ=60)
TATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTA < SRR4302536.658027/94‑1 (MQ=60)
TATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTA < SRR4302536.5159851/94‑1 (MQ=60)
ATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAG > SRR4302536.2420298/1‑94 (MQ=60)
TGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGC < SRR4302536.2410946/94‑1 (MQ=60)
GGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCG < SRR4302536.1019953/94‑1 (MQ=60)
GACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGG < SRR4302536.2813693/94‑1 (MQ=60)
GACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGG < SRR4302536.843040/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG < SRR4302536.2792036/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTG < SRR4302536.1928147/94‑1 (MQ=60)
CCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTC > SRR4302536.4408958/1‑94 (MQ=60)
CCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTC > SRR4302536.2356158/1‑94 (MQ=60)
CTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCC > SRR4302536.1983877/1‑94 (MQ=60)
CTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCC > SRR4302536.5771373/1‑94 (MQ=60)
CTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCC > SRR4302536.1275912/1‑94 (MQ=60)
CTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCC < SRR4302536.3097425/94‑1 (MQ=60)
CTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCC > SRR4302536.5437447/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATGTGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCA < SRR4302536.598309/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCA < SRR4302536.4158896/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCA < SRR4302536.2248161/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGAAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGA < SRR4302536.3375704/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGAT < SRR4302536.2762436/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATA < SRR4302536.6458779/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATA > SRR4302536.2478596/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATA < SRR4302536.6016384/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATA < SRR4302536.1423768/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATA > SRR4302536.2396737/1‑94 (MQ=60)
GGCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATAC > SRR4302536.4295839/1‑94 (MQ=60)
GACAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATAC < SRR4302536.4711511/94‑1 (MQ=60)
GCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACA < SRR4302536.6717874/94‑1 (MQ=60)
GCAGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACA < SRR4302536.5862337/94‑1 (MQ=60)
AGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGT > SRR4302536.3855426/1‑94 (MQ=60)
AGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGT < SRR4302536.5702337/94‑1 (MQ=60)
AGCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGT > SRR4302536.1745675/1‑94 (MQ=60)
GCGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTT < SRR4302536.2618713/94‑1 (MQ=60)
CGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTC > SRR4302536.4440653/1‑94 (MQ=60)
CGATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTC > SRR4302536.21811/1‑94 (MQ=60)
GATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCC > SRR4302536.1813821/1‑94 (MQ=60)
GATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCC > SRR4302536.6591294/1‑94 (MQ=60)
GATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCC < SRR4302536.5269422/94‑1 (MQ=60)
GATAATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCC < SRR4302536.4230944/94‑1 (MQ=60)
TACTGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTTGCGGTGTCCAGATACAGCTCAAT > SRR4302536.6905361/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATG > SRR4302536.5486888/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATG < SRR4302536.5837709/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATG > SRR4302536.6260963/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATG < SRR4302536.4449211/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATG < SRR4302536.6534726/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCGGGTTGGTTCTCCCCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATG < SRR4302536.2121565/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGA > SRR4302536.1862662/1‑94 (MQ=60)
TGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGAT < SRR4302536.6838608/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGAT > SRR4302536.577216/1‑94 (MQ=60)
TGCTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGAT < SRR4302536.2598654/94‑1 (MQ=60)
CTCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGCGCCAGACGTTCGACTTCTGTGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGT > SRR4302536.4498995/1‑94 (MQ=60)
CTCGGGTTGGTTGTCAACCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTCGCGGTGTCGAGATACAGTTCCATGATGT > SRR4302536.6079796/1‑94 (MQ=60)
TCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACTTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTT < SRR4302536.1967900/94‑1 (MQ=60)
TCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTT > SRR4302536.2829243/1‑94 (MQ=60)
TCGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTT < SRR4302536.3240237/94‑1 (MQ=60)
CGGGTTTGTTGTCACCCTGGCAATGGCGAATATGCGTGCCAGATGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTT < SRR4302536.1514477/94‑1 (MQ=60)
CGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTT < SRR4302536.2728461/94‑1 (MQ=60)
CGGGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTT < SRR4302536.1666013/94‑1 (MQ=60)
GGTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCC < SRR4302536.4879006/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTTGTCACCCTTGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCT < SRR4302536.5454423/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCT < SRR4302536.881667/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCT < SRR4302536.413182/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTT < SRR4302536.2354433/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTT > SRR4302536.5415955/1‑94 (MQ=60)
TTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTT < SRR4302536.4289716/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTT < SRR4302536.1247280/94‑1 (MQ=60)
GGTTGTCACCCTGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTT < SRR4302536.3764997/94‑1 (MQ=60)
|
AGCAAACAGAATGCCCTCATCACCAATCGCTTTTTGCAGACGCGGCAGCACTTCCCATATGGACTCCTTGCTGGCAGCGATAATGCTCGGGTTAGTTGTCACCCCGGCAATGGGGAATATGCGTGCCAGACGTTCGACTTCTGCGACGTTAGCGGTGTCCAGATACAGTTCCATGATGTTTCCTTTT > NC_000913/4137115‑4137301
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
