Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,660,679 |
T→C |
L879P (CTG→CCG) |
yhiV → |
putative transport system permease protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,660,679 | 0 | T | C | 100.0%
| 1352.1
/ NA
| 413 | L879P (CTG→CCG) | yhiV | putative transport system permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (217/196); total (217/196) |
Only 100 of 428 total aligned reads displayed.
TTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTG > NC_000913/3660589‑3660768
|
ttCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCgg > 1:9030251/1‑93 (MQ=255)
ttCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCgg > 2:3210271/1‑93 (MQ=255)
ttCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCgg < 2:8107342/93‑1 (MQ=255)
tCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGt < 2:6525772/93‑1 (MQ=255)
ccGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTc < 1:8608502/93‑1 (MQ=255)
ccGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTc < 2:7781038/93‑1 (MQ=255)
cGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTAACCGGTCg > 1:7208349/1‑93 (MQ=255)
cAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgtgg < 1:6643587/93‑1 (MQ=255)
ggCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgtggtg < 1:7490763/93‑1 (MQ=255)
ggCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgtggtg > 1:4932674/1‑93 (MQ=255)
gCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCTTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGgtgt < 2:4201029/93‑1 (MQ=255)
gCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGgtgt < 2:8271015/93‑1 (MQ=255)
gCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGgtgt < 1:4542774/93‑1 (MQ=255)
cGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGtt < 2:1617745/93‑1 (MQ=255)
gTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTc < 1:890086/93‑1 (MQ=255)
gTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTc < 2:6343313/93‑1 (MQ=255)
gTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGCTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTc > 1:434763/1‑93 (MQ=255)
tCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcc < 2:702184/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcc < 1:9544378/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcc < 2:9387764/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGCGTTcc > 2:2930362/1‑93 (MQ=255)
cGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcct < 2:3963611/93‑1 (MQ=255)
cGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcct < 1:9276253/93‑1 (MQ=255)
ggCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctc < 2:620599/93‑1 (MQ=255)
cTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgc > 2:2378479/1‑93 (MQ=255)
tACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgcc > 2:2488991/1‑93 (MQ=255)
tACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgcc > 2:2699610/1‑93 (MQ=255)
aCTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccc > 1:1018411/1‑93 (MQ=255)
cTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccct > 2:2059055/1‑93 (MQ=255)
cTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccct < 2:1815264/93‑1 (MQ=255)
tCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccctc < 2:9041054/93‑1 (MQ=255)
tCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccctc > 1:9691307/1‑93 (MQ=255)
tCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccctc > 1:2671337/1‑93 (MQ=255)
tCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGATCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccctc > 1:4271345/1‑93 (MQ=255)
tGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCctcgccctcgcc < 1:3929530/93‑1 (MQ=255)
tGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCACTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCctcgccctcgcc > 1:5494171/1‑93 (MQ=255)
ggACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCActc < 2:7086405/93‑1 (MQ=255)
ggACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCActc > 2:523760/1‑93 (MQ=255)
gACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCActct > 2:8898635/1‑93 (MQ=255)
gACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCActct < 1:8504648/93‑1 (MQ=255)
cTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTAt < 2:4588937/93‑1 (MQ=255)
cTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTAt < 1:6015631/93‑1 (MQ=255)
cTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTAt < 2:429333/93‑1 (MQ=255)
cTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTAt > 1:7670815/1‑93 (MQ=255)
tATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATg < 2:9139581/93‑1 (MQ=255)
tATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATg > 2:7625055/1‑93 (MQ=255)
tATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATg > 1:6589663/1‑93 (MQ=255)
aTCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATga < 1:411175/93‑1 (MQ=255)
aTCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATga > 1:9757358/1‑93 (MQ=255)
tCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATgag < 1:9616150/93‑1 (MQ=255)
tCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATgag < 1:6096084/93‑1 (MQ=255)
tATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGc < 2:3636022/93‑1 (MQ=255)
tATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGc < 2:5137295/93‑1 (MQ=255)
tCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTg > 1:943756/1‑93 (MQ=255)
tCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCACACTCTATGAGAGCTg > 1:2469130/1‑93 (MQ=255)
cAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTgg > 1:5115025/1‑93 (MQ=255)
gAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCa > 1:1726749/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCaa > 1:5598454/1‑93 (MQ=255)
aGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAt > 1:5224715/1‑93 (MQ=255)
cGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTc < 1:8039630/93‑1 (MQ=255)
gTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTcc < 2:6874879/93‑1 (MQ=255)
gTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTcc > 2:3088807/1‑93 (MQ=255)
gTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTcc > 2:1375955/1‑93 (MQ=255)
gTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTcc < 1:6694500/93‑1 (MQ=255)
ttATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCg > 1:1054133/1‑93 (MQ=255)
tATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGt > 1:3728372/1‑93 (MQ=255)
tATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGt > 2:5539569/1‑93 (MQ=255)
aTCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGtt > 1:1351613/1‑93 (MQ=255)
tCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTtc > 1:3341435/1‑93 (MQ=255)
ccTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTtct > 2:7481831/1‑93 (MQ=255)
ccTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTtct < 1:6979076/93‑1 (MQ=255)
cTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTtctc < 2:9461846/93‑1 (MQ=255)
tCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCg < 1:1598710/93‑1 (MQ=255)
aaaTCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGt > 2:9637069/1‑93 (MQ=255)
aaaTCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGt > 1:8364584/1‑93 (MQ=255)
aaaTCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGt > 1:8117889/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGTACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTg > 2:4901230/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTg > 2:8557863/1‑93 (MQ=255)
aTCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGa > 2:3874032/1‑93 (MQ=255)
tCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGAt > 1:4703447/1‑93 (MQ=255)
tCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGAt < 1:306640/93‑1 (MQ=255)
cAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATg < 1:2075967/93‑1 (MQ=255)
ggCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgtt > 2:5889055/1‑93 (MQ=255)
cTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttgg < 1:2134862/93‑1 (MQ=255)
tCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttggt < 1:7879886/93‑1 (MQ=255)
tCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttggt > 1:3535461/1‑93 (MQ=255)
ccTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttggtt < 2:5365060/93‑1 (MQ=255)
tGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGgttgt > 1:2787668/1‑93 (MQ=255)
gcTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTcc > 1:3848302/1‑93 (MQ=255)
gTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGtt > 2:1021829/1‑93 (MQ=255)
tATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTa < 1:3688448/93‑1 (MQ=255)
tATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTa < 1:4453156/93‑1 (MQ=255)
aTGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAg < 2:1216135/93‑1 (MQ=255)
aTGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAg > 2:1968688/1‑93 (MQ=255)
aTTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtc > 2:6656084/1‑93 (MQ=255)
tttCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCCCTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtcg > 2:4959036/1‑93 (MQ=255)
tttCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtcg < 2:6034281/93‑1 (MQ=255)
tCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGtt < 1:2372546/93‑1 (MQ=255)
tCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGtt < 1:1911466/93‑1 (MQ=255)
cACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTg < 1:3199315/93‑1 (MQ=255)
|
TTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTG > NC_000913/3660589‑3660768
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 238 total aligned reads displayed.
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTGGC > NC_000913/3660586‑3660770
|
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACC > SRR4302540.9388333/1‑94 (MQ=60)
CTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGG < SRR4302540.3480869/94‑1 (MQ=60)
CTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGG > SRR4302540.9138619/1‑94 (MQ=60)
TCCCGCAGGCGTCGGCTACTCATTGACCCGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTC < SRR4302540.2133682/94‑1 (MQ=60)
CCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCG < SRR4302540.8708534/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGT < SRR4302540.4381822/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGT < SRR4302540.4381823/94‑1 (MQ=60)
GCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGG < SRR4302540.5231058/94‑1 (MQ=60)
GCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGG > SRR4302540.2140455/1‑94 (MQ=60)
GAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGT < SRR4302540.9854536/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGT < SRR4302540.6717096/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGT < SRR4302540.5315671/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGT < SRR4302540.8604340/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGT > SRR4302540.3896128/1‑94 (MQ=60)
CAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGG > SRR4302540.7184560/1‑94 (MQ=60)
AGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTG > SRR4302540.4985868/1‑94 (MQ=60)
AGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTG > SRR4302540.7896360/1‑94 (MQ=60)
GGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGT < SRR4302540.7574394/94‑1 (MQ=60)
GCGTCTGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTT < SRR4302540.2736403/94‑1 (MQ=60)
GCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTT < SRR4302540.7146481/94‑1 (MQ=60)
GCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTT < SRR4302540.3730790/94‑1 (MQ=60)
GCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGGGGTGTT > SRR4302540.7699465/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTC > SRR4302540.1166917/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTC > SRR4302540.4810072/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTC > SRR4302540.3282405/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGATCCTGCGCTGCATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTC > SRR4302540.6716695/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGCTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTC > SRR4302540.439368/1‑94 (MQ=60)
GTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCC > SRR4302540.3864337/1‑94 (MQ=60)
GTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCC > SRR4302540.9798025/1‑94 (MQ=60)
GTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCC < SRR4302540.899544/94‑1 (MQ=60)
TCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCT < SRR4302540.9657307/94‑1 (MQ=60)
TCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCT > SRR4302540.3844715/1‑94 (MQ=60)
CGGCTACTCATGGGCCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTC < SRR4302540.9040173/94‑1 (MQ=60)
CGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTC < SRR4302540.2354289/94‑1 (MQ=60)
CGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTC < SRR4302540.9387155/94‑1 (MQ=60)
CGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTC < SRR4302540.6414940/94‑1 (MQ=60)
CGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTC < SRR4302540.8156572/94‑1 (MQ=60)
GGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCG < SRR4302540.3531918/94‑1 (MQ=60)
GCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGC > SRR4302540.6697815/1‑94 (MQ=60)
TACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCACATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCC > SRR4302540.1028744/1‑94 (MQ=60)
TACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCC > SRR4302540.1028743/1‑94 (MQ=60)
TACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCC < SRR4302540.2968649/94‑1 (MQ=60)
CTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTC > SRR4302540.2700267/1‑94 (MQ=60)
CTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTC < SRR4302540.8185617/94‑1 (MQ=60)
CTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTC < SRR4302540.8057729/94‑1 (MQ=60)
CTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTC > SRR4302540.4576419/1‑94 (MQ=60)
CTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTC < SRR4302540.3407825/94‑1 (MQ=60)
CTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTAACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTC > SRR4302540.3946226/1‑94 (MQ=60)
ATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCACTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCC > SRR4302540.5554660/1‑94 (MQ=60)
ATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGCTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCCCCGGTCGTGGTGGTCCTCGCCCTCGCC > SRR4302540.1265930/1‑94 (MQ=60)
TGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCG < SRR4302540.3972026/94‑1 (MQ=60)
GGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAGGCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCGCCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGC < SRR4302540.9162871/94‑1 (MQ=60)
GACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCA > SRR4302540.7105729/1‑94 (MQ=60)
ACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCAC < SRR4302540.3328546/94‑1 (MQ=60)
ACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCAC < SRR4302540.166276/94‑1 (MQ=60)
CCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACT < SRR4302540.3481527/94‑1 (MQ=60)
CCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACT < SRR4302540.3795252/94‑1 (MQ=60)
CCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACT > SRR4302540.2548632/1‑94 (MQ=60)
CCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACT > SRR4302540.808317/1‑94 (MQ=60)
CCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACT > SRR4302540.837248/1‑94 (MQ=60)
CGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTC > SRR4302540.609793/1‑94 (MQ=60)
GGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCT < SRR4302540.1590516/94‑1 (MQ=60)
GGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCT > SRR4302540.860377/1‑94 (MQ=60)
GACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTA > SRR4302540.739638/1‑94 (MQ=60)
GACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTA > SRR4302540.4447485/1‑94 (MQ=60)
ACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTAT < SRR4302540.6741281/94‑1 (MQ=60)
ACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTAT > SRR4302540.6154594/1‑94 (MQ=60)
ACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTAT > SRR4302540.2416979/1‑94 (MQ=60)
ACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTAT > SRR4302540.7757334/1‑94 (MQ=60)
CTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATG > SRR4302540.5507157/1‑94 (MQ=60)
CTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATG < SRR4302540.6082342/94‑1 (MQ=60)
CTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATG < SRR4302540.6082343/94‑1 (MQ=60)
CTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATG > SRR4302540.6662646/1‑94 (MQ=60)
CTATCGTATCAGGAAGCGTTATACTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGAGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATG > SRR4302540.5205555/1‑94 (MQ=60)
TATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGA > SRR4302540.9651363/1‑94 (MQ=60)
TATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGA < SRR4302540.5615459/94‑1 (MQ=60)
TATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGA > SRR4302540.9871824/1‑94 (MQ=60)
TATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGA > SRR4302540.9871825/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAG < SRR4302540.556216/94‑1 (MQ=60)
ATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAG < SRR4302540.415489/94‑1 (MQ=60)
TCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGA < SRR4302540.6163934/94‑1 (MQ=60)
TCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGA < SRR4302540.9729520/94‑1 (MQ=60)
CGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAG < SRR4302540.3692858/94‑1 (MQ=60)
CGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAG > SRR4302540.4121502/1‑94 (MQ=60)
GTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGC > SRR4302540.7356185/1‑94 (MQ=60)
TATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCT < SRR4302540.1163841/94‑1 (MQ=60)
TATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCT < SRR4302540.353093/94‑1 (MQ=60)
TATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCT < SRR4302540.3174298/94‑1 (MQ=60)
TATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCT > SRR4302540.8969205/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTG > SRR4302540.162013/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTG > SRR4302540.1787578/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTG > SRR4302540.953604/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCACACTCTATGAGAGCTG > SRR4302540.2495707/1‑94 (MQ=60)
TCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGG > SRR4302540.2673475/1‑94 (MQ=60)
TCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGG > SRR4302540.5170398/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGT > SRR4302540.2785101/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGACCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGT < SRR4302540.927794/94‑1 (MQ=60)
AGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTC > SRR4302540.8318852/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCA > SRR4302540.4507444/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCA > SRR4302540.1745386/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAA > SRR4302540.5660048/1‑94 (MQ=60)
GAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAT < SRR4302540.7513061/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAT > SRR4302540.5281684/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCGGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGGTTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAT < SRR4302540.2185225/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATT > SRR4302540.9520521/1‑94 (MQ=60)
AGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATT > SRR4302540.2145058/1‑94 (MQ=60)
GCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTC < SRR4302540.6367489/94‑1 (MQ=60)
GCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTC < SRR4302540.867966/94‑1 (MQ=60)
GCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTC < SRR4302540.4225787/94‑1 (MQ=60)
ccgTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCAACGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCC < SRR4302540.7807689/91‑1 (MQ=60)
CGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCCCCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCC < SRR4302540.7807688/94‑1 (MQ=60)
CGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCC < SRR4302540.961370/94‑1 (MQ=60)
CGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCC > SRR4302540.2332344/1‑94 (MQ=60)
CGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCC < SRR4302540.3708998/94‑1 (MQ=60)
CGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCC < SRR4302540.8133057/94‑1 (MQ=60)
GTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCG > SRR4302540.2426190/1‑94 (MQ=60)
GTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCG > SRR4302540.1064865/1‑94 (MQ=60)
GTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCG < SRR4302540.6768404/94‑1 (MQ=60)
GTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCG > SRR4302540.1064864/1‑94 (MQ=60)
GTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCG > SRR4302540.5273136/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGT > SRR4302540.5139133/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGT > SRR4302540.8548606/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGT > SRR4302540.3769046/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGT < SRR4302540.9460397/94‑1 (MQ=60)
TATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTT > SRR4302540.1616529/1‑94 (MQ=60)
TATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTT > SRR4302540.1365827/1‑94 (MQ=60)
TATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTT < SRR4302540.4183317/94‑1 (MQ=60)
ttcctccaagcatGCTCCTGCGCTGTGTGCGATTTCGCCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTC < SRR4302540.1044330/81‑1 (MQ=60)
ATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTC < SRR4302540.9826798/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTC > SRR4302540.3970268/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTC < SRR4302540.5866298/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATGTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTC < SRR4302540.9826795/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATCTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGTTGGTCAATTCCGTTC > SRR4302540.9054327/1‑94 (MQ=60)
CCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTC < SRR4302540.3644447/94‑1 (MQ=60)
CCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTC < SRR4302540.7056606/94‑1 (MQ=60)
CTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCG < SRR4302540.6269711/94‑1 (MQ=60)
CTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCG > SRR4302540.5293094/1‑94 (MQ=60)
TCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGG < SRR4302540.1616190/94‑1 (MQ=60)
CAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGT < SRR4302540.9760435/94‑1 (MQ=60)
CAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGT > SRR4302540.8212095/1‑94 (MQ=60)
CAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGT > SRR4302540.8461649/1‑94 (MQ=60)
CAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGT > SRR4302540.9766728/1‑94 (MQ=60)
CAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGT < SRR4302540.3288337/94‑1 (MQ=60)
AAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTG < SRR4302540.925369/94‑1 (MQ=60)
AATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGT > SRR4302540.6686374/1‑94 (MQ=60)
AATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGA < SRR4302540.1933658/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGAT > SRR4302540.4753709/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGAT > SRR4302540.306501/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGACATCTGGTCCATTCCGTTCTCGGCGAT > SRR4302540.306503/1‑94 (MQ=60)
TCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATG < SRR4302540.1414236/94‑1 (MQ=60)
TCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATG < SRR4302540.309687/94‑1 (MQ=60)
CAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGT < SRR4302540.6856453/94‑1 (MQ=60)
CAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGT < SRR4302540.2098280/94‑1 (MQ=60)
AGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTT > SRR4302540.2357993/1‑94 (MQ=60)
AGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTT < SRR4302540.9410826/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTG < SRR4302540.4575321/94‑1 (MQ=60)
GGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTG < SRR4302540.5096411/94‑1 (MQ=60)
GCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGG > SRR4302540.4829378/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCCCTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCTTTCTCGGTGATGTGGGT > SRR4302540.8499013/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGT > SRR4302540.2779003/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGT > SRR4302540.8498687/1‑94 (MQ=60)
TCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTT < SRR4302540.7971910/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTT < SRR4302540.3804225/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTT > SRR4302540.7791849/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTG > SRR4302540.4361461/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTG < SRR4302540.2069019/94‑1 (MQ=60)
CTGCGCTGTATGCGGTTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGT < SRR4302540.4399773/94‑1 (MQ=60)
TGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTT < SRR4302540.4362782/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTC < SRR4302540.2472465/94‑1 (MQ=60)
GGCTGTATGCGCTGTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCGCTCGCAGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCC < SRR4302540.3212266/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCC < SRR4302540.4653685/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCC > SRR4302540.9685846/1‑94 (MQ=60)
GCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCG < SRR4302540.2301278/94‑1 (MQ=60)
TGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTT < SRR4302540.880293/94‑1 (MQ=60)
GTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTA < SRR4302540.2727948/94‑1 (MQ=60)
TATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAG < SRR4302540.1880750/94‑1 (MQ=60)
TATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAG < SRR4302540.4501430/94‑1 (MQ=60)
TATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAG < SRR4302540.3728747/94‑1 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG > SRR4302540.8019210/1‑94 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG > SRR4302540.3737362/1‑94 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG < SRR4302540.4726846/94‑1 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGGGCTGTTGGTTGTTCCTTTAGG > SRR4302540.5661644/1‑94 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAACTCCGATCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG > SRR4302540.9026989/1‑94 (MQ=60)
TGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGC > SRR4302540.7012988/1‑94 (MQ=60)
TGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGC < SRR4302540.6725/94‑1 (MQ=60)
GCGATTTCGCCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCG < SRR4302540.8459928/94‑1 (MQ=60)
GCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCG < SRR4302540.472305/94‑1 (MQ=60)
CGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGT > SRR4302540.9203720/1‑94 (MQ=60)
GATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTC < SRR4302540.7639865/94‑1 (MQ=60)
ATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCACTTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCG > SRR4302540.6916187/1‑94 (MQ=60)
TTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTT < SRR4302540.9648706/94‑1 (MQ=60)
TTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTT < SRR4302540.1832829/94‑1 (MQ=60)
TTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTT < SRR4302540.4723487/94‑1 (MQ=60)
TTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTT > SRR4302540.4162700/1‑94 (MQ=60)
TCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTG < SRR4302540.1932350/94‑1 (MQ=60)
TCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTG < SRR4302540.4024339/94‑1 (MQ=60)
TCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTG < SRR4302540.9724311/94‑1 (MQ=60)
CACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTGG < SRR4302540.3234064/94‑1 (MQ=60)
CACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTGG > SRR4302540.8439150/1‑94 (MQ=60)
ACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTGGC < SRR4302540.10149427/94‑1 (MQ=60)
|
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTGGC > NC_000913/3660586‑3660770
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
