Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,660,679 |
T→C |
L879P (CTG→CCG) |
yhiV → |
putative transport system permease protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,660,679 | 0 | T | C | 100.0%
| 893.8
/ NA
| 275 | L879P (CTG→CCG) | yhiV | putative transport system permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (164/111); total (164/111) |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
TTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTG > NC_000913/3660589‑3660768
|
cGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCg > 1:498465/1‑93 (MQ=255)
ggCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgg > 2:127179/1‑92 (MQ=255)
ggCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgg > 1:909259/1‑92 (MQ=255)
gCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgtg < 1:6052440/93‑1 (MQ=255)
gCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgtg > 2:4579113/1‑93 (MQ=255)
gCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgtg > 1:196183/1‑93 (MQ=255)
ggCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCgtggtg > 1:3521920/1‑93 (MQ=255)
gCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGgtgt < 2:3516712/93‑1 (MQ=255)
gTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTc > 2:1695718/1‑93 (MQ=255)
gTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTc > 1:1109698/1‑93 (MQ=255)
gTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTc > 2:3772645/1‑93 (MQ=255)
tCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGttac > 1:1772978/1‑91 (MQ=255)
tCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcc > 1:1808738/1‑93 (MQ=255)
tCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcc < 2:5424444/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcc > 2:2307570/1‑93 (MQ=255)
tCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcc < 1:4516404/93‑1 (MQ=255)
cGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcct < 2:5001732/93‑1 (MQ=255)
gCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcg > 2:3169781/1‑93 (MQ=255)
tACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgcc < 2:5531937/93‑1 (MQ=255)
cTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccct < 1:5144412/93‑1 (MQ=255)
tCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTtctcgccctc > 1:382715/1‑93 (MQ=255)
cATGGACCGGACTATCTTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccctcg < 2:3063431/93‑1 (MQ=255)
cATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccctcg > 1:5926721/1‑93 (MQ=255)
cATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTcctcgccctcg < 2:1807025/93‑1 (MQ=255)
aCCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCa > 2:5970702/1‑93 (MQ=255)
ccGGACTATCATATCAGGAAGCGTTCTCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCTTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCAc < 2:3884758/93‑1 (MQ=255)
ggACTATGGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCActc > 2:6198392/1‑93 (MQ=255)
ggACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCActc < 2:4414149/93‑1 (MQ=255)
ggACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCActc < 2:4817393/93‑1 (MQ=255)
ggACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCActc < 2:3433470/93‑1 (MQ=255)
cTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTAt < 2:3656709/93‑1 (MQ=255)
tATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATg > 2:162575/1‑93 (MQ=255)
tATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATg > 1:2155955/1‑93 (MQ=255)
tATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATg > 2:4672827/1‑93 (MQ=255)
cGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTTGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATgaga < 1:6166852/93‑1 (MQ=255)
cGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATgaga < 2:2742710/93‑1 (MQ=255)
cGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATgaga > 2:6067870/1‑93 (MQ=255)
gTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGagag > 1:4164963/1‑93 (MQ=255)
tATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGc < 2:260784/93‑1 (MQ=255)
aTCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCt < 1:1838439/93‑1 (MQ=255)
aTCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCt > 2:2106853/1‑93 (MQ=255)
cAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTgg < 1:2351742/93‑1 (MQ=255)
aGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGt > 2:175356/1‑93 (MQ=255)
aGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGt > 1:3069304/1‑93 (MQ=255)
gAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCa < 2:2926713/93‑1 (MQ=255)
aaGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCaa < 1:5194925/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAt < 2:2360254/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAt > 1:5418789/1‑93 (MQ=255)
aGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAt < 2:5879704/93‑1 (MQ=255)
gCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAtt > 1:1008572/1‑93 (MQ=255)
cGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTc < 1:1073900/93‑1 (MQ=255)
gTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTcc > 2:3290255/1‑93 (MQ=255)
ttATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCCGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCg > 1:481266/1‑93 (MQ=255)
tATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGt > 1:3363484/1‑93 (MQ=255)
aTCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGtt > 2:3328850/1‑93 (MQ=255)
aTCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGtt < 2:687293/93‑1 (MQ=255)
tCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTtc > 1:4197391/1‑93 (MQ=255)
tCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTtc > 1:5758361/1‑93 (MQ=255)
ccTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTtct < 2:4622357/93‑1 (MQ=255)
cTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTtctc < 1:6068512/93‑1 (MQ=255)
tCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCg < 1:323154/93‑1 (MQ=255)
tCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCg > 1:3736906/1‑93 (MQ=255)
cAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCgg < 2:6094012/93‑1 (MQ=255)
cAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCgg < 1:1373007/93‑1 (MQ=255)
aTCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGa > 2:5736479/1‑93 (MQ=255)
ggCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgtt > 2:1988055/1‑93 (MQ=255)
ggCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgtt < 2:5322602/93‑1 (MQ=255)
cTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttgg > 1:4395070/1‑93 (MQ=255)
tCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttggt < 1:1335319/93‑1 (MQ=255)
tCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttggt < 2:4362936/93‑1 (MQ=255)
cTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATgttggttg > 2:5844548/1‑93 (MQ=255)
tGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGgttgt > 2:144399/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGgttgtt > 2:107354/1‑93 (MQ=255)
gcTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTcc < 2:279985/93‑1 (MQ=255)
gcTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTcc > 1:904864/1‑93 (MQ=255)
cTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCg < 1:1796387/93‑1 (MQ=255)
cTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCg > 2:4210812/1‑93 (MQ=255)
cTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCg > 2:5360813/1‑93 (MQ=255)
cTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTACCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCg < 1:966513/93‑1 (MQ=255)
tGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGt > 2:786574/1‑93 (MQ=255)
tGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGt > 2:548240/1‑93 (MQ=255)
tGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGt > 1:2017211/1‑93 (MQ=255)
tGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGt < 1:2745644/93‑1 (MQ=255)
tATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTa > 1:2447727/1‑93 (MQ=255)
tATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTa > 1:3936927/1‑93 (MQ=255)
tATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTa < 1:3596587/93‑1 (MQ=255)
tGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAgg > 1:2254626/1‑93 (MQ=255)
tGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAgg > 1:1205210/1‑93 (MQ=255)
gCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGc < 1:172429/93‑1 (MQ=255)
gCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGc < 1:5355724/93‑1 (MQ=255)
cGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcg > 1:3436687/1‑93 (MQ=255)
cGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcg > 2:3119570/1‑93 (MQ=255)
gATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgt > 1:4506375/1‑93 (MQ=255)
aTTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtc > 1:203900/1‑93 (MQ=255)
tttCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtcg > 2:4457098/1‑93 (MQ=255)
tttCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtcg > 1:5532028/1‑93 (MQ=255)
ttCACCGCTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGcgtcgt < 1:709474/93‑1 (MQ=255)
tCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGtt > 2:4092520/1‑93 (MQ=255)
tCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGtt < 2:2230294/93‑1 (MQ=255)
cACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTg < 2:5183655/93‑1 (MQ=255)
|
TTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTG > NC_000913/3660589‑3660768
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTGGCG > NC_000913/3660586‑3660771
|
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACC > SRR4302533.5311613/1‑94 (MQ=60)
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACC < SRR4302533.850414/94‑1 (MQ=60)
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACC > SRR4302533.2108817/1‑94 (MQ=60)
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACC < SRR4302533.5451205/94‑1 (MQ=60)
ACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCG > SRR4302533.2021527/1‑94 (MQ=60)
ACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCG < SRR4302533.5077899/94‑1 (MQ=60)
ACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCG > SRR4302533.4528225/1‑94 (MQ=60)
ACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCG < SRR4302533.4522387/94‑1 (MQ=60)
CTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGG > SRR4302533.4213532/1‑94 (MQ=60)
CTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGG > SRR4302533.4688255/1‑94 (MQ=60)
TCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTC < SRR4302533.3795922/94‑1 (MQ=60)
TCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTC < SRR4302533.4331415/94‑1 (MQ=60)
CCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCG < SRR4302533.6000268/94‑1 (MQ=60)
CCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCG > SRR4302533.501433/1‑94 (MQ=60)
CGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGG > SRR4302533.914592/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTG > SRR4302533.197422/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTG < SRR4302533.2356454/94‑1 (MQ=60)
GCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGG < SRR4302533.6089099/94‑1 (MQ=60)
CAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGT > SRR4302533.1804978/1‑94 (MQ=60)
AGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTG > SRR4302533.5407898/1‑94 (MQ=60)
AGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTG > SRR4302533.61314/1‑94 (MQ=60)
AGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTG > SRR4302533.3543628/1‑94 (MQ=60)
AGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTG > SRR4302533.1032112/1‑94 (MQ=60)
AGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTG > SRR4302533.1571513/1‑94 (MQ=60)
GCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTT < SRR4302533.5195930/94‑1 (MQ=60)
CGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTC < SRR4302533.6178555/94‑1 (MQ=60)
CGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTC > SRR4302533.1116282/1‑94 (MQ=60)
GTCGGCTACTCATGGTCCGGACTATCGTATCAGGAAGAGTTATCCTGAAATCAGGCTCCTTCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTCGTGTTCC < SRR4302533.2004633/94‑1 (MQ=60)
GTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCC > SRR4302533.1819743/1‑94 (MQ=60)
GTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTAC > SRR4302533.1783777/1‑94 (MQ=60)
TCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCT < SRR4302533.4543752/94‑1 (MQ=60)
CTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCC > SRR4302533.813505/1‑94 (MQ=60)
ACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCT > SRR4302533.3437007/1‑94 (MQ=60)
CTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTTCTCGCCCTC > SRR4302533.385025/1‑94 (MQ=60)
CTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTC < SRR4302533.5175500/94‑1 (MQ=60)
CTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTC > SRR4302533.5079318/1‑94 (MQ=60)
TCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCG > SRR4302533.5962546/1‑94 (MQ=60)
TCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCG > SRR4302533.2745975/1‑94 (MQ=60)
GGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGC > SRR4302533.4541184/1‑94 (MQ=60)
GGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGC > SRR4302533.520908/1‑94 (MQ=60)
CCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACT < SRR4302533.2502303/94‑1 (MQ=60)
CGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTC > SRR4302533.3311909/1‑94 (MQ=60)
GGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCT < SRR4302533.2047915/94‑1 (MQ=60)
GACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATCCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTA < SRR4302533.3407081/94‑1 (MQ=60)
CTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATG > SRR4302533.2169228/1‑94 (MQ=60)
CTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATG < SRR4302533.2374468/94‑1 (MQ=60)
TATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGA > SRR4302533.1846117/1‑94 (MQ=60)
ATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAG < SRR4302533.5886039/94‑1 (MQ=60)
ATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAG < SRR4302533.2436566/94‑1 (MQ=60)
ATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAG > SRR4302533.448485/1‑94 (MQ=60)
TCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGA > SRR4302533.2291090/1‑94 (MQ=60)
CGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTTGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAG < SRR4302533.6203914/94‑1 (MQ=60)
CGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAG > SRR4302533.4190198/1‑94 (MQ=60)
CGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAG > SRR4302533.1899889/1‑94 (MQ=60)
GTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGC < SRR4302533.1743715/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTG < SRR4302533.3770608/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTG < SRR4302533.1849650/94‑1 (MQ=60)
TCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGG < SRR4302533.1107088/94‑1 (MQ=60)
CAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGGGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGT > SRR4302533.5043686/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGT < SRR4302533.2366291/94‑1 (MQ=60)
CAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGT > SRR4302533.913551/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGT < SRR4302533.1111361/94‑1 (MQ=60)
CAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGT > SRR4302533.2106539/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGT > SRR4302533.3088149/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGT > SRR4302533.277957/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCAGCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTC > SRR4302533.4684614/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTC > SRR4302533.4294728/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTC > SRR4302533.2221844/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCA < SRR4302533.1302495/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAA < SRR4302533.5312156/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAT < SRR4302533.5226257/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAT > SRR4302533.1811127/1‑94 (MQ=60)
AAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAAT > SRR4302533.5451386/1‑94 (MQ=60)
AGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATT < SRR4302533.1664939/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATT > SRR4302533.1014472/1‑94 (MQ=60)
GCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTC < SRR4302533.1819173/94‑1 (MQ=60)
CGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCC > SRR4302533.1322760/1‑94 (MQ=60)
CGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCC < SRR4302533.1080231/94‑1 (MQ=60)
GTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCCGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCG > SRR4302533.484141/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGT < SRR4302533.116570/94‑1 (MQ=60)
TTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGT > SRR4302533.3384267/1‑94 (MQ=60)
TTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGT > SRR4302533.3234332/1‑94 (MQ=60)
TATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTT > SRR4302533.974852/1‑94 (MQ=60)
TATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTT > SRR4302533.1747864/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTC > SRR4302533.4222800/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTC > SRR4302533.5793111/1‑94 (MQ=60)
CCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTC < SRR4302533.3071528/94‑1 (MQ=60)
CTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCG < SRR4302533.6105232/94‑1 (MQ=60)
CTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCG > SRR4302533.3759829/1‑94 (MQ=60)
TCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGG < SRR4302533.325125/94‑1 (MQ=60)
CAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGT < SRR4302533.1381268/94‑1 (MQ=60)
AATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGA < SRR4302533.655221/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGAT < SRR4302533.5455281/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGAT > SRR4302533.2074159/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGAT < SRR4302533.6025411/94‑1 (MQ=60)
AGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTT < SRR4302533.3874704/94‑1 (MQ=60)
GCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGG > SRR4302533.4421605/1‑94 (MQ=60)
GCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGG > SRR4302533.5265100/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGT > SRR4302533.3744235/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGT > SRR4302533.3492162/1‑94 (MQ=60)
TCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTT < SRR4302533.1343336/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTT > SRR4302533.1976911/1‑94 (MQ=60)
CCTGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTG > SRR4302533.5789138/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTT > SRR4302533.4538653/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTT > SRR4302533.5010328/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCC > SRR4302533.910168/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCC > SRR4302533.5695465/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATACCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCC < SRR4302533.3580440/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTATGCGATTTCAACGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCC > SRR4302533.912159/1‑94 (MQ=60)
GCTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCG < SRR4302533.3971301/94‑1 (MQ=60)
CTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGT > SRR4302533.1359548/1‑94 (MQ=60)
CTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGT > SRR4302533.2029638/1‑94 (MQ=60)
CTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGT > SRR4302533.5856521/1‑94 (MQ=60)
CTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGT < SRR4302533.928675/94‑1 (MQ=60)
CTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGT < SRR4302533.1807318/94‑1 (MQ=60)
CTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGT > SRR4302533.4106848/1‑94 (MQ=60)
CTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGACCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGT > SRR4302533.6099314/1‑94 (MQ=60)
CTGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTACCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGT < SRR4302533.972183/94‑1 (MQ=60)
TGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTT > SRR4302533.729692/1‑94 (MQ=60)
TGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTT < SRR4302533.2762479/94‑1 (MQ=60)
TGTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTT > SRR4302533.4504298/1‑94 (MQ=60)
GTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTA > SRR4302533.3960959/1‑94 (MQ=60)
GTATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTA > SRR4302533.2462831/1‑94 (MQ=60)
TATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAG > SRR4302533.3521208/1‑94 (MQ=60)
TATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAG < SRR4302533.3618718/94‑1 (MQ=60)
TATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAG < SRR4302533.2040403/94‑1 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG > SRR4302533.2268570/1‑94 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG > SRR4302533.1212453/1‑94 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG > SRR4302533.3327339/1‑94 (MQ=60)
ATGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGG > SRR4302533.1801488/1‑94 (MQ=60)
TGCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCGCTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGC < SRR4302533.2006566/94‑1 (MQ=60)
GCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCGTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCG < SRR4302533.542218/94‑1 (MQ=60)
GCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCG > SRR4302533.3457917/1‑94 (MQ=60)
GCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCG < SRR4302533.173518/94‑1 (MQ=60)
GCGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCG < SRR4302533.5387873/94‑1 (MQ=60)
CGATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGT > SRR4302533.4533670/1‑94 (MQ=60)
GATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTC > SRR4302533.205197/1‑94 (MQ=60)
GATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGCTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTC > SRR4302533.3679099/1‑94 (MQ=60)
ATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCG > SRR4302533.1933240/1‑94 (MQ=60)
ATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCG > SRR4302533.3904144/1‑94 (MQ=60)
ATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCG > SRR4302533.5565428/1‑94 (MQ=60)
ATTTCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCG < SRR4302533.1208197/94‑1 (MQ=60)
TTCACCGCTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTT < SRR4302533.713664/94‑1 (MQ=60)
TCACCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTG < SRR4302533.6309670/94‑1 (MQ=60)
CCGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTGGCG > SRR4302533.1989354/1‑94 (MQ=60)
|
AACTTCCGGCAGGCGTCGGCTACTCATGGACCGGACTATCGTATCAGGAAGCGTTATCCTCAAATCAGGCTCCTGCGCTGTATGCGATTTCACTGGTCGTGGTGTTCCTCGCCCTCGCCGCACTCTATGAGAGCTGGTCAATTCCGTTCTCGGTGATGTTGGTTGTTCCGTTAGGCGTCGTTGGCG > NC_000913/3660586‑3660771
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
