Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,772,157 |
T→C |
V36A (GTA→GCA) |
mtlD → |
mannitol‑1‑phosphate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,772,157 | 0 | T | C | 99.8%
| 1550.1
/ NA
| 477 | V36A (GTA→GCA) | mtlD | mannitol‑1‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (243/233); total (243/234) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 509 total aligned reads displayed.
TTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTG > NC_000913/3772067‑3772246
|
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ttGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCAc < 1:1870171/93‑1 (MQ=255)
tGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACt < 1:1344759/93‑1 (MQ=255)
tGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACt < 1:7132875/93‑1 (MQ=255)
ggcATGTAAGATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAATCTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACGTGa < 2:1762555/92‑1 (MQ=255)
gcAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAt < 2:1654722/93‑1 (MQ=255)
cAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATg < 2:8550454/93‑1 (MQ=255)
cAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATg < 2:6482136/93‑1 (MQ=255)
cAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGGGGCACTTGATg > 2:3647442/1‑93 (MQ=255)
aGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGc < 2:4298897/93‑1 (MQ=255)
ggTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTNAATCAGGTGGCACTTGATGcc > 1:1569568/1‑93 (MQ=255)
ggTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGcc > 1:8948488/1‑93 (MQ=255)
ggTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGcc > 1:5335978/1‑93 (MQ=255)
ggTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGcc < 1:1118217/93‑1 (MQ=255)
gTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATgact > 1:4424912/1‑90 (MQ=255)
gTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGccc > 1:9531452/1‑93 (MQ=255)
aaTATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTg < 2:6603699/93‑1 (MQ=255)
aaTATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTg > 2:2526955/1‑93 (MQ=255)
atatCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGa < 2:9619722/93‑1 (MQ=255)
tatTGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGaa < 1:5510053/93‑1 (MQ=255)
tatCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGaa < 2:8039603/93‑1 (MQ=255)
tatCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGaa < 2:8828665/93‑1 (MQ=255)
tatCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGaa < 2:3934037/93‑1 (MQ=255)
tatCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGaa > 2:6893038/1‑93 (MQ=255)
tatCGGTCGTGGCTTTATCAGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGaa < 2:9258883/93‑1 (MQ=255)
atCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAt > 1:6241686/1‑93 (MQ=255)
atCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAt > 1:7410830/1‑93 (MQ=255)
tCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATg > 1:7676117/1‑93 (MQ=255)
gTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGACTGccc > 1:5713355/1‑93 (MQ=255)
gTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGccc > 2:6697044/1‑93 (MQ=255)
gTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGccc < 1:3340849/93‑1 (MQ=255)
cGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGt > 1:3201524/1‑93 (MQ=255)
gTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGCTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTc < 2:3224751/93‑1 (MQ=255)
tGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCa > 1:7792687/1‑93 (MQ=255)
ggCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCAt < 2:8299619/93‑1 (MQ=255)
gCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATa < 2:3159960/93‑1 (MQ=255)
cTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAg > 2:7383758/1‑93 (MQ=255)
tttATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGc < 1:9059081/93‑1 (MQ=255)
ttATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCt > 1:8666524/1‑93 (MQ=255)
aTCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTAt < 2:9449322/93‑1 (MQ=255)
aTCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTAt > 2:2260723/1‑93 (MQ=255)
aTCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTAt < 2:1148277/93‑1 (MQ=255)
tCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATc < 2:5138778/93‑1 (MQ=255)
tCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATc > 1:1744217/1‑93 (MQ=255)
cGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCa < 2:5834404/93‑1 (MQ=255)
cGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCa > 2:7155394/1‑93 (MQ=255)
gTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAgg > 2:1983161/1‑93 (MQ=255)
gTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAgg > 1:4833775/1‑93 (MQ=255)
tAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGt < 1:5017718/93‑1 (MQ=255)
ctgctgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACAt < 1:803359/93‑1 (MQ=255)
ctgctgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACAt < 1:2625760/93‑1 (MQ=255)
tgctgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACAtg > 1:2007311/1‑93 (MQ=255)
gctgGCAGACGCCGGAATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAGTTAGGTGTCACTTGGTGTCCTGAATGGCCGTCATAGCTATCAGGGACAtgt > 2:5403610/1‑93 (MQ=255)
ctgGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACAtgtg < 2:7836165/93‑1 (MQ=255)
ggCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggt > 2:7619698/1‑93 (MQ=255)
ggCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggt > 2:7695819/1‑93 (MQ=255)
gCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggtt > 2:4722131/1‑93 (MQ=255)
aGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAAGCCCTGAATGCCCGGCATAGCTATCAGGTACATGtggttgg < 2:3010626/93‑1 (MQ=255)
gACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggttggt > 1:4097122/1‑93 (MQ=255)
gACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggttggt < 2:9028363/93‑1 (MQ=255)
gACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGtggttggt > 2:3355335/1‑93 (MQ=255)
gcgGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGaa > 2:5974031/1‑93 (MQ=255)
ggTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAAcc < 2:820726/93‑1 (MQ=255)
tATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGa < 2:131402/93‑1 (MQ=255)
tATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGa > 1:4646062/1‑93 (MQ=255)
aTCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAg < 1:1515395/93‑1 (MQ=255)
tCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGc > 2:4155930/1‑93 (MQ=255)
tCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGc < 1:9703109/93‑1 (MQ=255)
tCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGc < 2:10004979/93‑1 (MQ=255)
ccAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCa < 1:6407659/93‑1 (MQ=255)
cAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAg > 1:4709592/1‑59 (MQ=255)
cAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAg > 2:9810908/1‑93 (MQ=255)
cAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAg > 2:2937443/1‑93 (MQ=255)
cAACTGACGTTTGCCGATGTCAACCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAg < 2:5514950/93‑1 (MQ=255)
aCTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGt < 1:9303207/93‑1 (MQ=255)
cTGACGTGTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTa < 2:3436611/93‑1 (MQ=255)
tGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAg < 1:2845858/93‑1 (MQ=255)
gACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGa > 2:9409736/1‑93 (MQ=255)
gACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGa < 1:5149414/93‑1 (MQ=255)
tttGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACAGAGAAGGTAGATAcg > 1:2250459/1‑92 (MQ=255)
gCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGtt < 2:7929671/93‑1 (MQ=255)
gCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGtt < 2:4517457/93‑1 (MQ=255)
cGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTc > 1:205205/1‑93 (MQ=255)
cGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTc < 1:8117633/93‑1 (MQ=255)
cGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTc < 2:8074836/93‑1 (MQ=255)
cGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTc < 1:3657057/93‑1 (MQ=255)
cGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATACCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTc > 1:9759013/1‑93 (MQ=255)
aTGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCg < 2:1569568/93‑1 (MQ=255)
aTGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCg > 2:6271809/1‑93 (MQ=255)
aTGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCg < 1:3057032/93‑1 (MQ=255)
tGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCgg < 1:853382/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTc > 2:6107556/1‑93 (MQ=255)
aTCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCa < 1:3957538/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCaa < 2:2618455/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAAt < 2:5659590/93‑1 (MQ=255)
ggtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGc < 1:4541127/93‑1 (MQ=255)
ggtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGc < 1:5899874/93‑1 (MQ=255)
ggtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGc < 1:6762695/93‑1 (MQ=255)
ggtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGc < 1:6890653/93‑1 (MQ=255)
gtggcACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCt > 1:2506388/1‑93 (MQ=255)
|
TTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTG > NC_000913/3772067‑3772246
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 249 total aligned reads displayed.
ATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTCAG > NC_000913/3772064‑3772250
|
ATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACNTNTGCNGATGTCAATNAGGTNGN > SRR4302540.8705706/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGGCGCAGGTAATATCTGTCGTGGCTGTATCGGTAAACTGCTGGCAGATGCGGGTAACCAACTGATTGTTGCCGATGTCAATCAGGTGGC > SRR4302540.9063301/1‑94 (MQ=60)
TTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCAC < SRR4302540.4652600/94‑1 (MQ=60)
TTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACT < SRR4302540.7855911/94‑1 (MQ=60)
TTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACT < SRR4302540.1890666/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTT < SRR4302540.1358875/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTT < SRR4302540.7212333/94‑1 (MQ=60)
CGTAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAT < SRR4302540.4867220/94‑1 (MQ=60)
CGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGAT > SRR4302540.2604935/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATG > SRR4302540.5292341/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATG < SRR4302540.2021109/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATG < SRR4302540.1739208/94‑1 (MQ=60)
CAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGC < SRR4302540.9171526/94‑1 (MQ=60)
AGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTNAATCAGGTGGCACTTGATGCC > SRR4302540.1586774/1‑94 (MQ=60)
AGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCC > SRR4302540.5394465/1‑94 (MQ=60)
AGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCC > SRR4302540.9053856/1‑94 (MQ=60)
AGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCC > SRR4302540.5689440/1‑94 (MQ=60)
AGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCC < SRR4302540.4939544/94‑1 (MQ=60)
GGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGact > SRR4302540.4472853/1‑91 (MQ=60)
GGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCC > SRR4302540.9644289/1‑94 (MQ=60)
GGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCC < SRR4302540.1129811/94‑1 (MQ=60)
GGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCC < SRR4302540.8007471/94‑1 (MQ=60)
GTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCT > SRR4302540.2511530/1‑94 (MQ=60)
TAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTG < SRR4302540.7416855/94‑1 (MQ=60)
TAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTG > SRR4302540.249183/1‑94 (MQ=60)
TAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTCGCCGATGTCTATCAGTCGGCACTTGATGCCCTG > SRR4302540.9100748/1‑94 (MQ=60)
AGTATCGGTCGTCGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCACTCAGGTGGTACTTGATGCCCTGA < SRR4302540.9868855/94‑1 (MQ=60)
AATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGA > SRR4302540.7289255/1‑94 (MQ=60)
ATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAA > SRR4302540.9152152/1‑94 (MQ=60)
TATTGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAT < SRR4302540.5570739/94‑1 (MQ=60)
TATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAT < SRR4302540.3510609/94‑1 (MQ=60)
TATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAT < SRR4302540.3002684/94‑1 (MQ=60)
TATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAT < SRR4302540.1444096/94‑1 (MQ=60)
TATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAT > SRR4302540.6311149/1‑94 (MQ=60)
TATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGGATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAAT < SRR4302540.498986/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATG > SRR4302540.7762854/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATG > SRR4302540.6009733/1‑94 (MQ=60)
TCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGC < SRR4302540.442571/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCACTCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCC > SRR4302540.1798446/1‑94 (MQ=60)
GGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGCCGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCC < SRR4302540.4110493/94‑1 (MQ=60)
GGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGACTGCCC > SRR4302540.5776247/1‑94 (MQ=60)
GGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCC > SRR4302540.9726490/1‑94 (MQ=60)
GGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCC < SRR4302540.8179160/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGTCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCG < SRR4302540.9365341/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCG > SRR4302540.4849552/1‑94 (MQ=60)
GTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCG < SRR4302540.3377516/94‑1 (MQ=60)
TCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGT < SRR4302540.1300458/94‑1 (MQ=60)
TCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGT > SRR4302540.3236288/1‑94 (MQ=60)
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GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA < SRR4302540.6387248/94‑1 (MQ=60)
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GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA < SRR4302540.8683190/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA > SRR4302540.4689578/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA > SRR4302540.4689577/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA < SRR4302540.2073879/94‑1 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATA > SRR4302540.2471291/1‑94 (MQ=60)
GGCTTTATCGGTAAAATGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGTCCGTCATG > SRR4302540.204440/1‑94 (MQ=60)
GCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAG < SRR4302540.2918422/94‑1 (MQ=60)
GCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAG < SRR4302540.7703256/94‑1 (MQ=60)
CTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGC > SRR4302540.1165819/1‑94 (MQ=60)
CTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGC < SRR4302540.6434153/94‑1 (MQ=60)
TTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCT < SRR4302540.9167843/94‑1 (MQ=60)
TTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCT < SRR4302540.4039696/94‑1 (MQ=60)
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TTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTACCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCGCGTCATAGCT > SRR4302540.7122864/1‑94 (MQ=60)
TTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTA < SRR4302540.473842/94‑1 (MQ=60)
TTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTA > SRR4302540.8929921/1‑94 (MQ=60)
TATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTAT > SRR4302540.3579293/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATC > SRR4302540.253929/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATC > SRR4302540.1763095/1‑94 (MQ=60)
CGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGGTGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAG < SRR4302540.8737736/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAG < SRR4302540.1644622/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAG < SRR4302540.7543568/94‑1 (MQ=60)
CGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAG > SRR4302540.30111/1‑94 (MQ=60)
CGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAG < SRR4302540.4737731/94‑1 (MQ=60)
GGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGG > SRR4302540.1596950/1‑94 (MQ=60)
GGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGG < SRR4302540.9511394/94‑1 (MQ=60)
GGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGG > SRR4302540.10049917/1‑94 (MQ=60)
GGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGG > SRR4302540.2235393/1‑94 (MQ=60)
GGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGG > SRR4302540.2194147/1‑94 (MQ=60)
TAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTA > SRR4302540.7263819/1‑94 (MQ=60)
TAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTA < SRR4302540.5072038/94‑1 (MQ=60)
AAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTAC < SRR4302540.3212443/94‑1 (MQ=60)
AACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACA < SRR4302540.3139966/94‑1 (MQ=60)
ACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACAT < SRR4302540.3325661/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATG < SRR4302540.2654159/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATG < SRR4302540.811892/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATG < SRR4302540.4963194/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATG > SRR4302540.2029026/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATG < SRR4302540.7822634/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGT < SRR4302540.8170655/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGT > SRR4302540.6769448/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGG < SRR4302540.5945803/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGT < SRR4302540.2844920/94‑1 (MQ=60)
GGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTT < SRR4302540.4564902/94‑1 (MQ=60)
GGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTT > SRR4302540.7569315/1‑94 (MQ=60)
GCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTG < SRR4302540.1923251/94‑1 (MQ=60)
CAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGG > SRR4302540.2960572/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGT > SRR4302540.4141321/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGT > SRR4302540.2633424/1‑94 (MQ=60)
GACGCGGGTATCCAGCTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTG < SRR4302540.4640600/94‑1 (MQ=60)
GACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTG > SRR4302540.5124138/1‑94 (MQ=60)
ACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGA < SRR4302540.9649225/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGA > SRR4302540.5666442/1‑94 (MQ=60)
CGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAA < SRR4302540.4511895/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAA > SRR4302540.8354963/1‑94 (MQ=60)
CGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAAC < SRR4302540.2824165/94‑1 (MQ=60)
CGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAAC > SRR4302540.3886850/1‑94 (MQ=60)
GGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACC < SRR4302540.3989334/94‑1 (MQ=60)
GGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACC > SRR4302540.153901/1‑94 (MQ=60)
GGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACC > SRR4302540.7173284/1‑94 (MQ=60)
GGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCG < SRR4302540.1357376/94‑1 (MQ=60)
GGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCG > SRR4302540.5907847/1‑94 (MQ=60)
GGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCG > SRR4302540.4545619/1‑94 (MQ=60)
TATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAG < SRR4302540.9773950/94‑1 (MQ=60)
ATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGC > SRR4302540.9933386/1‑94 (MQ=60)
ATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGC > SRR4302540.10095179/1‑94 (MQ=60)
ATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGC > SRR4302540.4790679/1‑94 (MQ=60)
ATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGC < SRR4302540.1532155/94‑1 (MQ=60)
TCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCG > SRR4302540.2776948/1‑94 (MQ=60)
TCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCA < SRR4302540.9817172/94‑1 (MQ=60)
CCAACTGACGTTTGGCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAG < SRR4302540.6879108/94‑1 (MQ=60)
CCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAG < SRR4302540.6478976/94‑1 (MQ=60)
CAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGG > SRR4302540.6322200/1‑94 (MQ=60)
CAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGG > SRR4302540.9862638/1‑94 (MQ=60)
ACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTA < SRR4302540.9414325/94‑1 (MQ=60)
CTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAG > SRR4302540.4850278/1‑94 (MQ=60)
CTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAG < SRR4302540.2261241/94‑1 (MQ=60)
CTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAA > SRR4302540.5233627/1‑94 (MQ=60)
TGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGA > SRR4302540.1768748/1‑94 (MQ=60)
TGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGA < SRR4302540.2876661/94‑1 (MQ=60)
GACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGAT < SRR4302540.5286577/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACC > SRR4302540.8179837/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACC > SRR4302540.7952870/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACAGAGAAGGTAGATACG > SRR4302540.2274618/1‑94 (MQ=60)
TTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCG > SRR4302540.9643897/1‑94 (MQ=60)
TTTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTCATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCG < SRR4302540.51304/94‑1 (MQ=60)
TTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGT > SRR4302540.2069980/1‑94 (MQ=60)
TTGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGT < SRR4302540.8622796/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTT < SRR4302540.1563830/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTT > SRR4302540.4740873/1‑94 (MQ=60)
CCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTC > SRR4302540.9828552/1‑94 (MQ=60)
CCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTC > SRR4302540.3779345/1‑94 (MQ=60)
CCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTC > SRR4302540.207217/1‑94 (MQ=60)
CCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTC > SRR4302540.5860167/1‑94 (MQ=60)
CCGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATACCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTC > SRR4302540.9873487/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC > SRR4302540.4711856/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC > SRR4302540.9443278/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC > SRR4302540.3247736/1‑94 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC < SRR4302540.150163/94‑1 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC < SRR4302540.8211834/94‑1 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC < SRR4302540.5536768/94‑1 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC < SRR4302540.3697104/94‑1 (MQ=60)
CGATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCC < SRR4302540.1580804/94‑1 (MQ=60)
GATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCG > SRR4302540.6929254/1‑94 (MQ=60)
GATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCG < SRR4302540.3337227/94‑1 (MQ=60)
GATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCG < SRR4302540.3573813/94‑1 (MQ=60)
GATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGAAGAAACCGTTTCCG > SRR4302540.7711532/1‑94 (MQ=60)
ATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGG < SRR4302540.3090573/94‑1 (MQ=60)
ATGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGG < SRR4302540.5221065/94‑1 (MQ=60)
TGTCAATCAGGTGGCTCGTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGC < SRR4302540.862448/94‑1 (MQ=60)
TGTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGC < SRR4302540.862447/94‑1 (MQ=60)
GTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCG > SRR4302540.805993/1‑94 (MQ=60)
GTCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCG < SRR4302540.5047606/94‑1 (MQ=60)
TCAATCAGGTTGCTCTTGATGCCCTGAATCCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAACCCGAGCAGGTAGATCCCGTTTCCGGCGT < SRR4302540.6790336/94‑1 (MQ=60)
TCAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGT < SRR4302540.9031182/94‑1 (MQ=60)
CAATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTC > SRR4302540.9222497/1‑94 (MQ=60)
AATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCA < SRR4302540.8924847/94‑1 (MQ=60)
AATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCA > SRR4302540.684465/1‑94 (MQ=60)
AATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCA < SRR4302540.1861585/94‑1 (MQ=60)
AATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCA > SRR4302540.4436898/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAA < SRR4302540.4000232/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAAT < SRR4302540.7767901/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAAT < SRR4302540.71986/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATG < SRR4302540.5683594/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATG < SRR4302540.8932307/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATG > SRR4302540.5203266/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGC > SRR4302540.6561192/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGC > SRR4302540.5098383/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302540.9137164/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302540.6967074/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302540.4590273/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302540.6837431/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT > SRR4302540.2533452/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCT < SRR4302540.5965028/94‑1 (MQ=60)
GGTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCCGCGTCCATGCT > SRR4302540.9787743/1‑94 (MQ=60)
GTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTG > SRR4302540.5556083/1‑94 (MQ=60)
GTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTG > SRR4302540.4121729/1‑94 (MQ=60)
GTGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTG > SRR4302540.4277545/1‑94 (MQ=60)
TGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGT < SRR4302540.6137952/94‑1 (MQ=60)
TGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGT < SRR4302540.7379389/94‑1 (MQ=60)
TGGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGT > SRR4302540.2004327/1‑94 (MQ=60)
GGCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTC < SRR4302540.5850458/94‑1 (MQ=60)
GCACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTCA < SRR4302540.1495294/94‑1 (MQ=60)
CACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTCAG < SRR4302540.6967692/94‑1 (MQ=60)
|
ATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTCAG > NC_000913/3772064‑3772250
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
