Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,827,834 |
C→T |
G421G (GGC→GGT) |
yicE → |
putative transport protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,827,834 | 0 | C | T | 99.0%
| 1289.8
/ ‑5.5
| 388 | G421G (GGC→GGT) | yicE | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/1); new base T (196/185); total (202/186) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.24e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 412 total aligned reads displayed.
TCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC > NC_000913/3827743‑3827923
|
cgccgcCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGgtgt > 1:7633434/1‑93 (MQ=255)
gccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtct > 1:9101254/1‑93 (MQ=255)
ccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtctc < 2:2406660/93‑1 (MQ=255)
ccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtctc < 1:1399890/93‑1 (MQ=255)
cTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTca < 1:769316/93‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcag < 1:7959962/93‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcag < 2:4273807/93‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGGTGGTCTGGGTGTGTCTcag > 2:278941/1‑93 (MQ=255)
ccGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcagc < 1:5550077/93‑1 (MQ=255)
ccGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcagc < 1:8108061/93‑1 (MQ=255)
ggTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcagcag > 1:3335365/1‑93 (MQ=255)
gtgtGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCagcagc > 1:3701148/1‑93 (MQ=255)
gtgtGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCagcagc < 2:348739/93‑1 (MQ=255)
gtgtGCGTAAGGTTTCTCGTGAGCCGCGGAACCGTCGGGCGAGTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCagcagc < 1:6341982/93‑1 (MQ=255)
tgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGc < 2:5484873/93‑1 (MQ=255)
gTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGa > 1:4142829/1‑93 (MQ=255)
agcGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAtt < 2:9648723/91‑1 (MQ=255)
aTCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAtt > 1:6229273/1‑93 (MQ=255)
cGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAtttt < 1:2901154/93‑1 (MQ=255)
gTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTTATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTg > 1:1797161/1‑93 (MQ=255)
ttCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCa < 2:8646855/93‑1 (MQ=255)
ctcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGt < 2:6644287/93‑1 (MQ=255)
tcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGtt < 2:1732982/93‑1 (MQ=255)
tcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGtt > 1:1568275/1‑93 (MQ=255)
tcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGtt > 1:2117430/1‑93 (MQ=255)
tcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGtt < 1:3552546/93‑1 (MQ=255)
cGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGttt < 1:3081773/93‑1 (MQ=255)
cGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGttt < 2:3413714/93‑1 (MQ=255)
tGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGc > 1:4367296/1‑93 (MQ=255)
tGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGc < 2:7987531/93‑1 (MQ=255)
gAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGcc < 1:7276567/93‑1 (MQ=255)
cGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTg < 1:8152045/93‑1 (MQ=255)
gCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGTTGTCTCTGGCGGTTGCTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGa < 2:7046878/93‑1 (MQ=255)
gCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGa > 2:6924180/1‑93 (MQ=255)
cTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGaa > 1:952795/1‑93 (MQ=255)
cTGAACCATCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGCCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGaa < 2:4157556/93‑1 (MQ=255)
tGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt > 1:5846554/1‑93 (MQ=255)
aCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGc > 1:609893/1‑93 (MQ=255)
aCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGc < 1:1195176/93‑1 (MQ=255)
ccGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGCCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCt < 1:9673080/93‑1 (MQ=255)
gTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGa < 2:8277728/93‑1 (MQ=255)
gTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGa > 1:9180630/1‑93 (MQ=255)
gggCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaaa > 2:7428393/1‑93 (MQ=255)
ggCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaaaa > 1:1085243/1‑93 (MQ=255)
ggCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaaaa > 2:289375/1‑93 (MQ=255)
gCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAc > 2:3121924/1‑93 (MQ=255)
gATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTCTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCt > 2:5985013/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAACACCTg > 1:562717/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTg > 2:9782437/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTg > 2:2515657/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTg < 2:4926934/93‑1 (MQ=255)
ttCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGc < 2:6308244/93‑1 (MQ=255)
ttCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGc > 2:3268529/1‑93 (MQ=255)
tCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGct < 2:7549951/93‑1 (MQ=255)
tCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGct > 2:5012483/1‑93 (MQ=255)
tCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGct < 1:203969/93‑1 (MQ=255)
cTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctc > 2:5844217/1‑93 (MQ=255)
tGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctct > 2:225896/1‑93 (MQ=255)
tGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctct > 2:6472192/1‑93 (MQ=255)
aTTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcc > 1:2815379/1‑93 (MQ=255)
aTTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcc > 1:2390162/1‑93 (MQ=255)
ttATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcct > 1:2258874/1‑93 (MQ=255)
ttATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcct < 1:4440762/93‑1 (MQ=255)
tATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcctc < 1:7005685/93‑1 (MQ=255)
tATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcctc < 2:3585434/93‑1 (MQ=255)
tATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcctc < 1:5032425/93‑1 (MQ=255)
tATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcctc < 2:4735610/93‑1 (MQ=255)
aTCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCtcctcc > 2:1145729/1‑93 (MQ=255)
tCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCg > 2:6173300/1‑93 (MQ=255)
cgcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGa > 2:2668160/1‑93 (MQ=255)
gcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAt < 1:9275011/93‑1 (MQ=255)
cTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATc > 1:8501105/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgccg < 2:4444385/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgccg > 2:1276729/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgccg < 1:9781604/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgccgc < 1:2781367/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgccgc < 2:8535518/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgccgc < 2:9373323/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGCAAAACCTGCTCTCCTCCGGGCTCGCcgcg > 1:1844117/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCcgcg > 2:9074846/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcgg > 2:7627627/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcgg < 1:4839919/93‑1 (MQ=255)
ggCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcggg < 2:1899565/93‑1 (MQ=255)
gCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcgggc > 2:5708583/1‑93 (MQ=255)
gCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcgggc > 1:3853053/1‑93 (MQ=255)
ggTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcgggcgg > 2:8123578/1‑93 (MQ=255)
gTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGt > 1:7166413/1‑93 (MQ=255)
ttGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTa < 2:5211406/93‑1 (MQ=255)
ttGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTa < 2:206655/93‑1 (MQ=255)
tGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAt < 2:1447938/93‑1 (MQ=255)
tGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAt > 1:6789445/1‑93 (MQ=255)
tGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGGAt > 2:3894543/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa > 2:3987989/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa < 2:8813121/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACt < 1:6493551/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACt > 2:9544077/1‑93 (MQ=255)
cTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACt > 1:1039112/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTg < 1:935693/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTg > 2:2456394/1‑93 (MQ=255)
gggTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGc > 1:5122215/1‑93 (MQ=255)
|
TCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC > NC_000913/3827743‑3827923
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 225 total aligned reads displayed.
CATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC > NC_000913/3827741‑3827927
|
CATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGT < SRR4302540.2441143/94‑1 (MQ=60)
CATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGT < SRR4302540.7107246/94‑1 (MQ=60)
CATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGT < SRR4302540.5637630/94‑1 (MQ=60)
CATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGT < SRR4302540.5637629/94‑1 (MQ=60)
CATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGT > SRR4302540.1344352/1‑94 (MQ=60)
CATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGGGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGT < SRR4302540.9788590/94‑1 (MQ=60)
ctgcCCGCCTCCGGTTTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTG < SRR4302540.7449424/90‑1 (MQ=60)
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGAGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCG > SRR4302540.5167667/1‑94 (MQ=60)
TCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGT < SRR4302540.8188952/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGT > SRR4302540.7719313/1‑94 (MQ=60)
TCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGT < SRR4302540.4027/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTG < SRR4302540.3951176/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCTCCGGGGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGT < SRR4302540.4531876/94‑1 (MQ=60)
CCGCCTCCGGTTTGCGTATCGTTTCTCGTGACCCGCTGAGCCTTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTC < SRR4302540.5357158/94‑1 (MQ=60)
CCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTC > SRR4302540.644596/1‑94 (MQ=60)
GCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTC > SRR4302540.5571113/1‑94 (MQ=60)
CCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGGTTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCA < SRR4302540.9928131/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCA < SRR4302540.1414936/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCA < SRR4302540.230522/94‑1 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG < SRR4302540.777507/94‑1 (MQ=60)
TCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGC < SRR4302540.8052735/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCA < SRR4302540.8202166/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCA > SRR4302540.6082002/1‑94 (MQ=60)
CCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCA < SRR4302540.6609139/94‑1 (MQ=60)
CGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAG < SRR4302540.8191226/94‑1 (MQ=60)
CGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAG > SRR4302540.393433/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAG < SRR4302540.8860354/94‑1 (MQ=60)
CGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAG > SRR4302540.3371993/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAG < SRR4302540.7350310/94‑1 (MQ=60)
CGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGGGTGTCTCAGCAG > SRR4302540.2877672/1‑94 (MQ=60)
GGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGC < SRR4302540.1671225/94‑1 (MQ=60)
GGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGC > SRR4302540.3741553/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGACCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCC < SRR4302540.2192029/94‑1 (MQ=60)
GTGTGCGTAAGGTTTCTCGTGAGCCGCGGAACCGTCGGGCGAGTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCC < SRR4302540.6412604/94‑1 (MQ=60)
TGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGGGTGTCTCAGAAGCCC > SRR4302540.2713670/1‑94 (MQ=60)
GCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTG < SRR4302540.8232010/94‑1 (MQ=60)
CGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGA > SRR4302540.4187654/1‑94 (MQ=60)
CGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGA > SRR4302540.937514/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT > SRR4302540.9580911/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT > SRR4302540.6003207/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT < SRR4302540.1798663/94‑1 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT > SRR4302540.5499985/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCACTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT < SRR4302540.9890974/94‑1 (MQ=60)
TATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATT > SRR4302540.6298549/1‑94 (MQ=60)
TATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCAGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATT > SRR4302540.9797301/1‑94 (MQ=60)
ATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTT > SRR4302540.562801/1‑94 (MQ=60)
ATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGCTGGTCCTGGTGTGTCTCACCAGCCGCTtcttt > SRR4302540.85091/1‑89 (MQ=60)
TCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTT > SRR4302540.5636412/1‑94 (MQ=60)
TCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTT < SRR4302540.948961/94‑1 (MQ=60)
CGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTTATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTG > SRR4302540.1816711/1‑94 (MQ=60)
CGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTG < SRR4302540.2932816/94‑1 (MQ=60)
CGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTG < SRR4302540.8243400/94‑1 (MQ=60)
TTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCA < SRR4302540.1320929/94‑1 (MQ=60)
TTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCA > SRR4302540.9211438/1‑94 (MQ=60)
TTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAG > SRR4302540.7208903/1‑94 (MQ=60)
TTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAG > SRR4302540.380719/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTT > SRR4302540.7780124/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTT < SRR4302540.2370598/94‑1 (MQ=60)
CTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTT > SRR4302540.8518321/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTT > SRR4302540.2140153/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTT > SRR4302540.1585473/1‑94 (MQ=60)
CGCGTGAGTCGCTGAACCGTCGGACCATTCTGATTATCGCGATGTCGCTGGCGGTTGTTCGGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTT < SRR4302540.4097555/94‑1 (MQ=60)
TCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTT < SRR4302540.4922127/94‑1 (MQ=60)
TCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTT < SRR4302540.3591361/94‑1 (MQ=60)
TCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTT < SRR4302540.1732484/94‑1 (MQ=60)
TCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTT < SRR4302540.2373020/94‑1 (MQ=60)
TCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTT < SRR4302540.4426659/94‑1 (MQ=60)
CGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTG < SRR4302540.3115590/94‑1 (MQ=60)
CGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTG < SRR4302540.2280868/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGC > SRR4302540.4414755/1‑94 (MQ=60)
GTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGGGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGC > SRR4302540.107034/1‑94 (MQ=60)
TGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCC > SRR4302540.7836232/1‑94 (MQ=60)
GAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCC < SRR4302540.7357757/94‑1 (MQ=60)
GAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCC < SRR4302540.7357756/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCT > SRR4302540.2164522/1‑94 (MQ=60)
CGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGA < SRR4302540.8246685/94‑1 (MQ=60)
GCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGCA > SRR4302540.1940837/1‑94 (MQ=60)
GCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAA < SRR4302540.9415719/94‑1 (MQ=60)
GCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAA > SRR4302540.962687/1‑94 (MQ=60)
GCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGGGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAA > SRR4302540.5910372/1‑94 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT > SRR4302540.5911226/1‑94 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT < SRR4302540.7663378/94‑1 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT < SRR4302540.690050/94‑1 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGGGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCACTTTGCCCCcgaag > SRR4302540.321128/1‑89 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGCTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT > SRR4302540.321126/1‑94 (MQ=60)
TGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATG > SRR4302540.9609850/1‑94 (MQ=60)
TGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATG < SRR4302540.1111332/94‑1 (MQ=60)
TGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATG > SRR4302540.4298002/1‑94 (MQ=60)
TGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGGTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATG > SRR4302540.630905/1‑94 (MQ=60)
AACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGC > SRR4302540.616413/1‑94 (MQ=60)
ACCGTGCGGCGGTTCTGATTACCGCACTGTCGCTGCCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGAAGTTTGCCCCTGAATGGCT < SRR4302540.7100390/94‑1 (MQ=60)
ACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCT < SRR4302540.1207484/94‑1 (MQ=60)
ACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCT < SRR4302540.3596721/94‑1 (MQ=60)
ACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCT > SRR4302540.2927997/1‑94 (MQ=60)
ACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCT < SRR4302540.7100389/94‑1 (MQ=60)
ACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGGGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCCGAATGGCT > SRR4302540.2539773/1‑94 (MQ=60)
ACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCCGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCT < SRR4302540.9252227/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTG < SRR4302540.3598975/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTG > SRR4302540.1370892/1‑94 (MQ=60)
CCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGCCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTG < SRR4302540.9786904/94‑1 (MQ=60)
CGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGA > SRR4302540.9290739/1‑94 (MQ=60)
CGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAA > SRR4302540.1858857/1‑94 (MQ=60)
CGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAA < SRR4302540.5145738/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAA > SRR4302540.6382151/1‑94 (MQ=60)
CGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAA > SRR4302540.6137828/1‑94 (MQ=60)
GGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA > SRR4302540.7126541/1‑94 (MQ=60)
GGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA > SRR4302540.4422729/1‑94 (MQ=60)
GGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA > SRR4302540.1096369/1‑94 (MQ=60)
GGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA > SRR4302540.8237346/1‑94 (MQ=60)
GGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA > SRR4302540.9350616/1‑94 (MQ=60)
GGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAC > SRR4302540.8438697/1‑94 (MQ=60)
GGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTATGCCCCTGAATGGCTGAAAAAC > SRR4302540.693948/1‑94 (MQ=60)
GCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACC < SRR4302540.4962819/94‑1 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT > SRR4302540.4259057/1‑94 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT < SRR4302540.8193708/94‑1 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGACCCTGAATGGCTGAAAAAACT > SRR4302540.9404818/1‑94 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGGTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT > SRR4302540.2839988/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAACACCTG > SRR4302540.568838/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTG > SRR4302540.568837/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTG > SRR4302540.6675557/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTG < SRR4302540.7485884/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGC > SRR4302540.1086167/1‑94 (MQ=60)
TTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCT > SRR4302540.446267/1‑94 (MQ=60)
TCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTC < SRR4302540.205974/94‑1 (MQ=60)
TCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTC < SRR4302540.9834968/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT > SRR4302540.8908199/1‑94 (MQ=60)
TGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTC < SRR4302540.1963076/94‑1 (MQ=60)
TGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTC > SRR4302540.2953807/1‑94 (MQ=60)
GATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCC > SRR4302540.2845791/1‑94 (MQ=60)
GATTATCGCGCGGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCC < SRR4302540.8703880/94‑1 (MQ=60)
ATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCT > SRR4302540.7668454/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCT < SRR4302540.3940780/94‑1 (MQ=60)
ATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCT > SRR4302540.2283115/1‑94 (MQ=60)
TTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTC < SRR4302540.4488886/94‑1 (MQ=60)
TTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTC < SRR4302540.9225912/94‑1 (MQ=60)
TATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCC < SRR4302540.7083431/94‑1 (MQ=60)
TATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCC < SRR4302540.5086878/94‑1 (MQ=60)
ATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCG < SRR4302540.295457/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGG < SRR4302540.10108454/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGG > SRR4302540.2765088/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGC > SRR4302540.77189/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTCGCTGGCGGTTGGTCTGGCTGTGTCTCAGCAGCGGCTTATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAT < SRR4302540.9725330/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAT < SRR4302540.5382873/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATC > SRR4302540.8599885/1‑94 (MQ=60)
GCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATC < SRR4302540.7893461/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATC < SRR4302540.1835497/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATC > SRR4302540.2834798/1‑94 (MQ=60)
CTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCG < SRR4302540.6333731/94‑1 (MQ=60)
CTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCG > SRR4302540.2418000/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGC > SRR4302540.1312340/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGC < SRR4302540.8047373/94‑1 (MQ=60)
TCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCG < SRR4302540.4670501/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGC < SRR4302540.9896241/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGCAAAACCTGCTCTCCTCCGGGCTCGCCGCG > SRR4302540.1864323/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG > SRR4302540.1864594/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG < SRR4302540.2811413/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG > SRR4302540.9737436/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG > SRR4302540.6627138/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG > SRR4302540.3392473/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGG < SRR4302540.4891760/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGG > SRR4302540.1087109/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGC < SRR4302540.6183133/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGC > SRR4302540.3894942/1‑94 (MQ=60)
GCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCG > SRR4302540.3758872/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGG > SRR4302540.3197786/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGG > SRR4302540.3622761/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGT > SRR4302540.287834/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGT > SRR4302540.3046396/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGT > SRR4302540.7246309/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTCTGGGTTTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCACTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTA < SRR4302540.2108646/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTA > SRR4302540.1133156/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTA > SRR4302540.8933823/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTA > SRR4302540.580827/1‑94 (MQ=60)
TTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAT < SRR4302540.4648760/94‑1 (MQ=60)
TTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAT < SRR4302540.3451413/94‑1 (MQ=60)
TTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAT > SRR4302540.6864527/1‑94 (MQ=60)
TTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAT < SRR4302540.6190621/94‑1 (MQ=60)
TTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAT < SRR4302540.9292852/94‑1 (MQ=60)
TGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATT < SRR4302540.3671979/94‑1 (MQ=60)
TGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATT < SRR4302540.4899957/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAC < SRR4302540.210844/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAC < SRR4302540.6559305/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAC > SRR4302540.5445588/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAC < SRR4302540.146366/94‑1 (MQ=60)
TCTGGGTGTTTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACT < SRR4302540.6264511/94‑1 (MQ=60)
TCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACT > SRR4302540.1049678/1‑94 (MQ=60)
TCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACT < SRR4302540.3214630/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG < SRR4302540.6565766/94‑1 (MQ=60)
TGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC < SRR4302540.945499/94‑1 (MQ=60)
TGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC > SRR4302540.9318734/1‑94 (MQ=60)
TGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC > SRR4302540.5177674/1‑94 (MQ=60)
GGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCC < SRR4302540.1536207/94‑1 (MQ=60)
GGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCC > SRR4302540.1502958/1‑94 (MQ=60)
GGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCC > SRR4302540.1436123/1‑94 (MQ=60)
GGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCC > SRR4302540.6834720/1‑94 (MQ=60)
GGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCA > SRR4302540.3902148/1‑94 (MQ=60)
GTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCAT > SRR4302540.5641997/1‑94 (MQ=60)
GTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCAT < SRR4302540.4664710/94‑1 (MQ=60)
GTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCAT < SRR4302540.7312000/94‑1 (MQ=60)
TGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC > SRR4302540.7489333/1‑94 (MQ=60)
|
CATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC > NC_000913/3827741‑3827927
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |