Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,827,834 |
C→T |
G421G (GGC→GGT) |
yicE → |
putative transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,827,834 | 0 | C | T | 99.6%
| 867.7
/ NA
| 249 | G421G (GGC→GGT) | yicE | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (120/127); total (122/127) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC > NC_000913/3827744‑3827923
|
cgccgcCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGgtgt < 1:1315756/93‑1 (MQ=255)
cgccgcCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGgtgt < 1:838712/93‑1 (MQ=255)
cgccgcCTCCGGTATGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGgtgt < 1:3600859/93‑1 (MQ=255)
ccgccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGgtgtgt > 2:2113729/1‑93 (MQ=255)
cgccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtc > 2:1629579/1‑93 (MQ=255)
gccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtct > 2:1849248/1‑93 (MQ=255)
ccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtctc > 1:4641940/1‑93 (MQ=255)
cTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTca < 2:3728548/93‑1 (MQ=255)
cTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTca < 2:71344/93‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcag > 1:3219761/1‑93 (MQ=255)
tCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcag < 1:2671675/93‑1 (MQ=255)
ccGGTGTGCGTATCGTTGCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcagc < 2:2859602/93‑1 (MQ=255)
gtgtGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCagcagc < 2:5857372/93‑1 (MQ=255)
gtgtGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCagcagc < 2:4312253/93‑1 (MQ=255)
tgtgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGcc > 2:2060934/1‑93 (MQ=255)
tgtgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGGTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGcc > 2:6211922/1‑93 (MQ=255)
tgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGc < 2:5053510/93‑1 (MQ=255)
tgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGc > 1:510688/1‑93 (MQ=255)
gTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTTGGTGTGTCTCTGCCGCCGCTgc > 2:3469837/1‑92 (MQ=255)
gTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGa < 1:2693504/93‑1 (MQ=255)
tATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAt > 2:766553/1‑93 (MQ=255)
aTCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAtt > 1:726263/1‑93 (MQ=255)
aTCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAtt > 2:814273/1‑93 (MQ=255)
tCGTTTCTGGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAttt > 2:6151564/1‑93 (MQ=255)
tCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAttt < 1:418233/93‑1 (MQ=255)
tttCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGc < 2:2164491/93‑1 (MQ=255)
tttCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGc > 2:2412887/1‑93 (MQ=255)
tttCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGc > 1:449908/1‑93 (MQ=255)
ttCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCa < 1:6233693/93‑1 (MQ=255)
ttCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCa > 1:6026723/1‑93 (MQ=255)
ttCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCa < 1:257222/93‑1 (MQ=255)
tcctcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGGTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCa < 1:4892704/91‑1 (MQ=255)
ctcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGt < 2:525807/93‑1 (MQ=255)
ctcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGt < 2:5426309/93‑1 (MQ=255)
cGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGttt < 2:156503/93‑1 (MQ=255)
gTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTg < 1:4106877/93‑1 (MQ=255)
gTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTg > 1:2955065/1‑93 (MQ=255)
tGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAtt > 2:4652234/1‑82 (MQ=255)
gAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGcc > 1:2061771/1‑93 (MQ=255)
cTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGaa < 1:2997363/93‑1 (MQ=255)
cTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGaa < 1:6094274/93‑1 (MQ=255)
aaCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATgg > 2:4532262/1‑93 (MQ=255)
ccGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCt > 1:5242130/1‑93 (MQ=255)
gTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGa > 2:3995540/1‑93 (MQ=255)
gTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGa > 2:12862/1‑93 (MQ=255)
gggCGATTCTGCTTATCGCGATGTCGCTGGCGTTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCACGTCGCCCCTGCAAGTCTCaaaa > 2:4198583/1‑93 (MQ=255)
gggCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaaa > 1:1242185/1‑93 (MQ=255)
ggCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaaaa < 1:5951891/93‑1 (MQ=255)
ggCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaaaa > 2:1197281/1‑93 (MQ=255)
ggCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaaaa > 1:140400/1‑93 (MQ=255)
cGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAcc < 2:2922632/93‑1 (MQ=255)
cGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAcc < 2:3955660/93‑1 (MQ=255)
cGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAcc < 2:5583662/93‑1 (MQ=255)
cGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAcc < 1:1043467/93‑1 (MQ=255)
ttCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGc > 1:5633287/1‑93 (MQ=255)
tCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGct > 2:914023/1‑93 (MQ=255)
cTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctc > 1:2133615/1‑93 (MQ=255)
cTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctc < 1:3507485/93‑1 (MQ=255)
tGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctct > 1:334275/1‑93 (MQ=255)
gATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCtctc > 1:4460451/1‑93 (MQ=255)
aTTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcc < 2:1835592/93‑1 (MQ=255)
aTTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGGCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGTATGGCTGAAAAACATGCTctcc > 1:5846469/1‑93 (MQ=255)
ttATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcct < 2:6175197/93‑1 (MQ=255)
ttATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcct > 1:5049631/1‑93 (MQ=255)
tATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcctc < 2:2300267/93‑1 (MQ=255)
tATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcctc < 2:2728425/93‑1 (MQ=255)
tATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcctc < 1:3560220/93‑1 (MQ=255)
aTCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTGtcctcc < 2:3759070/93‑1 (MQ=255)
aTCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCtcctcc > 2:1071893/1‑93 (MQ=255)
tCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCg > 1:1491024/1‑93 (MQ=255)
tCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGGTTCCCCCTGAATGGCTGCACAACCTGCTCTCCTCCg > 2:1504467/1‑93 (MQ=255)
cgcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGa < 2:3233459/93‑1 (MQ=255)
cgcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGa < 2:4398688/93‑1 (MQ=255)
cgcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGa < 1:2461229/93‑1 (MQ=255)
gcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAt > 2:3578100/1‑93 (MQ=255)
ccTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAt < 1:1682394/92‑1 (MQ=255)
gTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgc < 2:4934170/93‑1 (MQ=255)
tCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgcc < 2:4905550/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgccg < 1:2400986/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgccgg > 1:5681138/1‑92 (MQ=255)
cTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCcgcg > 1:5510188/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCcgcg < 2:5730941/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCcgcg < 1:2504567/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCcgcg > 2:3059412/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcgg < 1:3360037/93‑1 (MQ=255)
gCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCGGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcgggc < 1:3754444/93‑1 (MQ=255)
ggTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcgggcgg > 2:5537881/1‑93 (MQ=255)
ggTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcgggcgg < 2:3321044/93‑1 (MQ=255)
ttGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTa > 2:3790644/1‑93 (MQ=255)
ttGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTa < 1:5528300/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa > 1:938169/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa > 1:2946645/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa > 1:4009295/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa > 1:4782651/1‑93 (MQ=255)
tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:5124046/93‑1 (MQ=255)
tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc > 1:694696/1‑93 (MQ=255)
cTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACt > 2:5977409/1‑93 (MQ=255)
cTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACt < 1:4962921/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTg > 2:2574417/1‑93 (MQ=255)
gggTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGc < 1:3889424/93‑1 (MQ=255)
|
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC > NC_000913/3827744‑3827923
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC > NC_000913/3827741‑3827927
|
CATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGT < SRR4302533.4949672/94‑1 (MQ=60)
CATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGT < SRR4302533.1726875/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTG > SRR4302533.261629/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTG < SRR4302533.5081793/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTG > SRR4302533.2969419/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTG > SRR4302533.1772193/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGCTGGTCTGGGTG > SRR4302533.368510/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTG < SRR4302533.1323649/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTG > SRR4302533.407581/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTG < SRR4302533.843625/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCCTCCGGTATGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTG < SRR4302533.3623015/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGATGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGT < SRR4302533.2141209/94‑1 (MQ=60)
GCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTC > SRR4302533.4670064/1‑94 (MQ=60)
GCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTC > SRR4302533.3412402/1‑94 (MQ=60)
GCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTC > SRR4302533.67956/1‑94 (MQ=60)
CCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCA > SRR4302533.2612841/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG < SRR4302533.5938113/94‑1 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG > SRR4302533.3239613/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGC < SRR4302533.5586955/94‑1 (MQ=60)
TCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGC > SRR4302533.5076208/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGC > SRR4302533.4731385/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGC < SRR4302533.2688065/94‑1 (MQ=60)
CGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAG > SRR4302533.2995143/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAG > SRR4302533.481728/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAG < SRR4302533.6257686/94‑1 (MQ=60)
GGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGC > SRR4302533.1667213/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCC > SRR4302533.3074992/1‑94 (MQ=60)
GTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGC > SRR4302533.513724/1‑94 (MQ=60)
TGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCT > SRR4302533.3882607/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT > SRR4302533.5226992/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT < SRR4302533.2710006/94‑1 (MQ=60)
TATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATT > SRR4302533.730553/1‑94 (MQ=60)
tctgctgtatGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTT < SRR4302533.4680425/84‑1 (MQ=60)
TCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTT < SRR4302533.420739/94‑1 (MQ=60)
CGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTG > SRR4302533.5410916/1‑94 (MQ=60)
GTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGC > SRR4302533.3977639/1‑94 (MQ=60)
GTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGC > SRR4302533.452596/1‑94 (MQ=60)
TTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCA > SRR4302533.6063244/1‑94 (MQ=60)
TTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCA > SRR4302533.4644771/1‑94 (MQ=60)
TTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAG > SRR4302533.5017380/1‑94 (MQ=60)
TTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAG < SRR4302533.258788/94‑1 (MQ=60)
TTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAG < SRR4302533.6271016/94‑1 (MQ=60)
TTCTCGTGAGCCGCTGAAACGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAG < SRR4302533.4169075/94‑1 (MQ=60)
TCCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGGTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAG < SRR4302533.4922361/94‑1 (MQ=60)
TCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGT < SRR4302533.4500371/94‑1 (MQ=60)
CTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTT < SRR4302533.2694090/94‑1 (MQ=60)
TCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTT < SRR4302533.511956/94‑1 (MQ=60)
CGTGAGCCGGTGATCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGCTTGGTCTGGGTGTGTCCCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTG < SRR4302533.1253455/94‑1 (MQ=60)
CGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTG > SRR4302533.2973135/1‑94 (MQ=60)
CGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTG > SRR4302533.2487354/1‑94 (MQ=60)
GTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGC < SRR4302533.4131849/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGC > SRR4302533.1361362/1‑94 (MQ=60)
TGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCC > SRR4302533.2074485/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCC < SRR4302533.2916334/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCT < SRR4302533.4938203/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGGACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG < SRR4302533.3543850/94‑1 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGTCCCTGAAT > SRR4302533.3379253/1‑94 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT < SRR4302533.6131094/94‑1 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT < SRR4302533.3015690/94‑1 (MQ=60)
TGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATG < SRR4302533.1279012/94‑1 (MQ=60)
TGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGCCGCTGGCGGTTGGCCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATG > SRR4302533.4729441/1‑94 (MQ=60)
GAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTAGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGG > SRR4302533.3406286/1‑94 (MQ=60)
GAACCGTCGGGCGATTCTGATTAACGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCTCTTATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGG < SRR4302533.881291/94‑1 (MQ=60)
ACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCT > SRR4302533.1773923/1‑94 (MQ=60)
ACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCT > SRR4302533.5273639/1‑94 (MQ=60)
CCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTG < SRR4302533.4955096/94‑1 (MQ=60)
CCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGCGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTG > SRR4302533.4298367/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGA < SRR4302533.763112/94‑1 (MQ=60)
GTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAA > SRR4302533.3546984/1‑94 (MQ=60)
GTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGGTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAA > SRR4302533.359690/1‑94 (MQ=60)
TCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAA > SRR4302533.715129/1‑94 (MQ=60)
CGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAA > SRR4302533.1249605/1‑94 (MQ=60)
GGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA > SRR4302533.1578489/1‑94 (MQ=60)
GGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA > SRR4302533.141294/1‑94 (MQ=60)
GGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAC > SRR4302533.522613/1‑94 (MQ=60)
GGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAC < SRR4302533.5987895/94‑1 (MQ=60)
GCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACC < SRR4302533.602179/94‑1 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT < SRR4302533.3783461/94‑1 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT < SRR4302533.1049601/94‑1 (MQ=60)
GATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTG > SRR4302533.3768380/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGC > SRR4302533.5667353/1‑94 (MQ=60)
TTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCT > SRR4302533.695495/1‑94 (MQ=60)
TTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCT < SRR4302533.3726095/94‑1 (MQ=60)
TTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGGTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCT > SRR4302533.845308/1‑94 (MQ=60)
TTCTGATGATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCT < SRR4302533.3226765/94‑1 (MQ=60)
TCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTC > SRR4302533.2146773/1‑94 (MQ=60)
TCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTC > SRR4302533.4528626/1‑94 (MQ=60)
TCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTC > SRR4302533.5695753/1‑94 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT < SRR4302533.5917960/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT < SRR4302533.3529115/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT < SRR4302533.2446125/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT > SRR4302533.336318/1‑94 (MQ=60)
TGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTC > SRR4302533.4487433/1‑94 (MQ=60)
TGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTC > SRR4302533.6113422/1‑94 (MQ=60)
GATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGGCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGTATGGCTGAAAAACATGCTCTCC > SRR4302533.5881815/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCT > SRR4302533.5080174/1‑94 (MQ=60)
TTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTC < SRR4302533.2361241/94‑1 (MQ=60)
TATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCC > SRR4302533.6245423/1‑94 (MQ=60)
TATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCC > SRR4302533.2971237/1‑94 (MQ=60)
TATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCC < SRR4302533.5608950/94‑1 (MQ=60)
TATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCC < SRR4302533.3582154/94‑1 (MQ=60)
TATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCC < SRR4302533.6043801/94‑1 (MQ=60)
TATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCC < SRR4302533.1737884/94‑1 (MQ=60)
ATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCG > SRR4302533.1500016/1‑94 (MQ=60)
ATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCG < SRR4302533.145614/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAT < SRR4302533.5849480/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAT < SRR4302533.5698749/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAT > SRR4302533.5311254/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAT > SRR4302533.806126/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAT < SRR4302533.2476415/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAT > SRR4302533.2911145/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAT < SRR4302533.3324052/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATC < SRR4302533.5555161/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATC < SRR4302533.4200802/94‑1 (MQ=60)
CCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATC < SRR4302533.1692584/94‑1 (MQ=60)
CTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCG > SRR4302533.2426877/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGC > SRR4302533.1206760/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGG > SRR4302533.5715453/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGC < SRR4302533.2415814/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG > SRR4302533.5543451/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGG < SRR4302533.2520008/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGG < SRR4302533.3264080/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGG > SRR4302533.4279504/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGG < SRR4302533.3380796/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGC < SRR4302533.4008058/94‑1 (MQ=60)
GCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCGGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCG < SRR4302533.3777456/94‑1 (MQ=60)
GCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCG < SRR4302533.2548278/94‑1 (MQ=60)
GCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCG < SRR4302533.26405/94‑1 (MQ=60)
GCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCG < SRR4302533.2966782/94‑1 (MQ=60)
TTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAT < SRR4302533.5561677/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTA > SRR4302533.2964666/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTA > SRR4302533.4033706/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTA > SRR4302533.943680/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTA > SRR4302533.4811627/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAC > SRR4302533.698803/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGGGGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAC < SRR4302533.1385202/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG < SRR4302533.4993010/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG < SRR4302533.2288731/94‑1 (MQ=60)
TGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC < SRR4302533.2554472/94‑1 (MQ=60)
GGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCC < SRR4302533.3913156/94‑1 (MQ=60)
GTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTCCCAT > SRR4302533.1404070/1‑94 (MQ=60)
TGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC < SRR4302533.418159/94‑1 (MQ=60)
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CATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC > NC_000913/3827741‑3827927
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
