Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 257 total aligned reads displayed.
ACGGTAAGCAACCTGCGGTTTACCTACGTTCGCTTCAACGTTGAATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAGACCCATTTTT > NC_000913/3469679‑3469865
|
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AACGTTGAATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTC > SRR4302540.6333813/1‑94 (MQ=60)
AACGTTGAATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTC > SRR4302540.8384346/1‑94 (MQ=60)
CGTTGAATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCA > SRR4302540.92054/1‑94 (MQ=60)
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GTTGAATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCAT > SRR4302540.4444711/1‑94 (MQ=60)
GTTGAATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCAT < SRR4302540.5866627/94‑1 (MQ=60)
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TTGAATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATA > SRR4302540.852225/1‑94 (MQ=60)
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TTGAATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATA < SRR4302540.3964019/94‑1 (MQ=60)
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TGAATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATAC < SRR4302540.775633/94‑1 (MQ=60)
TGAATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATAC < SRR4302540.7506219/94‑1 (MQ=60)
TGAATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATAC < SRR4302540.7245555/94‑1 (MQ=60)
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ATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACG < SRR4302540.9830867/94‑1 (MQ=60)
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TCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGA < SRR4302540.1461307/94‑1 (MQ=60)
TCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGACGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGA > SRR4302540.9528263/1‑94 (MQ=60)
CACGCTTCATGCGGTAAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAA < SRR4302540.2845667/94‑1 (MQ=60)
CACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAA > SRR4302540.7344911/1‑94 (MQ=60)
CCGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAA < SRR4302540.1388375/94‑1 (MQ=60)
CGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAG < SRR4302540.2489462/94‑1 (MQ=60)
CGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAG > SRR4302540.240613/1‑94 (MQ=60)
CGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAG < SRR4302540.3379295/94‑1 (MQ=60)
CGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAG < SRR4302540.4163932/94‑1 (MQ=60)
CGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAG < SRR4302540.1546853/94‑1 (MQ=60)
CGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAG > SRR4302540.4340529/1‑94 (MQ=60)
CGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAG < SRR4302540.9365158/94‑1 (MQ=60)
GCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGA < SRR4302540.6299685/94‑1 (MQ=60)
CTTCATAGGGTCAGCGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGAC < SRR4302540.6530678/94‑1 (MQ=60)
CTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGAC < SRR4302540.9548979/94‑1 (MQ=60)
TTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACT > SRR4302540.8011227/1‑94 (MQ=60)
TTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACG > SRR4302540.2856884/1‑94 (MQ=60)
TCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGG > SRR4302540.1818858/1‑94 (MQ=60)
TCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGG < SRR4302540.7003414/94‑1 (MQ=60)
CATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGTAAAGAGGGG > SRR4302540.4364290/1‑94 (MQ=60)
CATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGG > SRR4302540.9227140/1‑94 (MQ=60)
CATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGG < SRR4302540.6306545/94‑1 (MQ=60)
CATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGG > SRR4302540.2321431/1‑94 (MQ=60)
ATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGT > SRR4302540.6215715/1‑94 (MQ=60)
TACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTC < SRR4302540.9700907/94‑1 (MQ=60)
TACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGGTTGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGACTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGAC > SRR4302540.3174330/1‑94 (MQ=60)
GGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTT > SRR4302540.1167106/1‑94 (MQ=60)
GGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTC > SRR4302540.4755316/1‑94 (MQ=60)
GGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTC > SRR4302540.807532/1‑94 (MQ=60)
TCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTT > SRR4302540.1000818/1‑94 (MQ=60)
AACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTA > SRR4302540.8666992/1‑94 (MQ=60)
AACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTA < SRR4302540.5422466/94‑1 (MQ=60)
AACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTA > SRR4302540.1080147/1‑94 (MQ=60)
AACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTA > SRR4302540.2347074/1‑94 (MQ=60)
ACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAG < SRR4302540.6219834/94‑1 (MQ=60)
GATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCC < SRR4302540.4509830/94‑1 (MQ=60)
ATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCA < SRR4302540.8250655/94‑1 (MQ=60)
TGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAG > SRR4302540.5290189/1‑94 (MQ=60)
ATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGAC < SRR4302540.6236518/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGAC < SRR4302540.8857408/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGAC < SRR4302540.6729416/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGAC < SRR4302540.1605385/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTGGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGCGTTCTTTAGCagcag > SRR4302540.5503606/1‑89 (MQ=60)
ATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGAC > SRR4302540.5880617/1‑94 (MQ=60)
ATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGAC > SRR4302540.5880616/1‑94 (MQ=60)
TGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACG < SRR4302540.3910405/94‑1 (MQ=60)
TGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACG < SRR4302540.9078748/94‑1 (MQ=60)
TGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACG < SRR4302540.2968259/94‑1 (MQ=60)
TGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACG > SRR4302540.971939/1‑94 (MQ=60)
TTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGG < SRR4302540.8748862/94‑1 (MQ=60)
GTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGG < SRR4302540.6919023/94‑1 (MQ=60)
TCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGC < SRR4302540.6183075/94‑1 (MQ=60)
TCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGC > SRR4302540.416311/1‑94 (MQ=60)
TCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGC > SRR4302540.3173901/1‑94 (MQ=60)
CGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCC > SRR4302540.447297/1‑94 (MQ=60)
CGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCC < SRR4302540.5906286/94‑1 (MQ=60)
CGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCC > SRR4302540.6740196/1‑94 (MQ=60)
CGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCC < SRR4302540.1100886/94‑1 (MQ=60)
CGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCC < SRR4302540.10098889/94‑1 (MQ=60)
CGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCC < SRR4302540.10098888/94‑1 (MQ=60)
GAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCC > SRR4302540.6917043/1‑94 (MQ=60)
GAGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCC > SRR4302540.64596/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCA > SRR4302540.7124043/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCA < SRR4302540.4801360/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAG < SRR4302540.1139234/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAG > SRR4302540.3787806/1‑94 (MQ=60)
GGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAG < SRR4302540.4091932/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGA > SRR4302540.7905830/1‑94 (MQ=60)
TGCAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAG < SRR4302540.3769385/94‑1 (MQ=60)
TGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTGTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAG < SRR4302540.436137/94‑1 (MQ=60)
TGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAG > SRR4302540.7434076/1‑94 (MQ=60)
GCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGC > SRR4302540.4507061/1‑94 (MQ=60)
CAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCC < SRR4302540.5255924/94‑1 (MQ=60)
CAGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGGCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCC > SRR4302540.8505334/1‑94 (MQ=60)
CAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCC < SRR4302540.6104641/94‑1 (MQ=60)
AGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCA < SRR4302540.8737248/94‑1 (MQ=60)
AGTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCA < SRR4302540.10105353/94‑1 (MQ=60)
GTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAG > SRR4302540.9569273/1‑94 (MQ=60)
GTTCGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAG > SRR4302540.9569272/1‑94 (MQ=60)
GTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAG > SRR4302540.6397944/1‑94 (MQ=60)
GTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAG > SRR4302540.6342123/1‑94 (MQ=60)
GTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAG > SRR4302540.1635784/1‑94 (MQ=60)
CGCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCATACGGGCCGGCGCCAGACC > SRR4302540.3301298/1‑94 (MQ=60)
GCCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAGACCC > SRR4302540.8521967/1‑94 (MQ=60)
CCCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAGACCCA < SRR4302540.4837756/94‑1 (MQ=60)
CCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAGACCCA > SRR4302540.7073369/1‑94 (MQ=60)
CCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAGACCCAT > SRR4302540.7208867/1‑94 (MQ=60)
CCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAGACCCAT < SRR4302540.2681619/94‑1 (MQ=60)
CCAT‑GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAGACCCAT < SRR4302540.1546199/94‑1 (MQ=60)
CCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAGACCCAT > SRR4302540.8884926/1‑94 (MQ=60)
CAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAGACCCATT > SRR4302540.4603246/1‑94 (MQ=60)
GCCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAGACCCATTTTT > SRR4302540.2727822/1‑94 (MQ=60)
ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAGACCCATTTTT < SRR4302540.8446551/94‑1 (MQ=60)
ACCCGCGAGGAGGGTCTGGTGAGATTAGTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGACAGACCCATTTTT < SRR4302540.8446552/94‑1 (MQ=60)
|
ACGGTAAGCAACCTGCGGTTTACCTACGTTCGCTTCAACGTTGAATTCACGCTTCATACGGTCAACGATGATGTCGAGGTGCAGTTCGCCCAT‑ACCCGCGATGATGGTCTGGTTAGATTCTTCGTCAGTCCATACACGGAAAGACGGGTCTTCTTTAGCCAGACGGCCCAGAGCCAGACCCATTTTT > NC_000913/3469679‑3469865
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
